Aminocidos y protenas

Aminocidos y protenasTransporteNutrientes y reservaMotilidad y contractilidadEstructura o soporteRegulacinRespuesta (defensa)EnzimasFunciones biolgicasAminocidos

Protenas conjugadas (gpo. Prosttico)Lipoprotenas GlucoprotenasFosfoprotenasHemoprotenasFlavoprotenas (succinato deshidrogenasa)Metaloprotenas (calmodulina)Componentes de una protenaPrimaria (secuencia de a.a.).Secundaria (a-hlice y b-plegada).Terciaria (relaciones espaciales entre a.a., estructura tridimensional).Cuaternaria (relacin espacial de los polipptidos o subunidades).

Estructura

1. Preparar la protena para la secuenciaDeterminacin de # de cadenas polipeptdicasRuptura de puentes disulfuro de la protenaSeparacin y purificacin de subunidades

2. Establecer la secuencia de las cadenas polipeptdicasFragmentar las subunidades en puntos especficosSeparacin y purificacin de fragmentosDeterminacin de la secuencia de a.a. de cada fragmento

3. Organizar la estructura completaComparar puntos de ruptura entre fragmentos peptdicosDilucidar las posiciones de los puentes disulfuroDeterminacin de la estructura primariaMtodos qumicoscidosBsicos

EnzimticosEndopeptidasasExopeptidasasReacciones para determinar la composicin de los a.a.

Cromatografa de intercambio inico

Cromatografa en fase inversaHPLC

Abs UVDada la conformacin plana de los grupos peptdicos, las interacciones estricas se restringen a ngulos especficos notorios en los diagramas de Ramachandran, por lo que se observan 2 conformaciones que se ajustan a los ngulos permitidos para los gpos. peptdicos.

a-hliceb- plegadaEstructura secundaria

Tipo de protenasFibrosasMolculas alargadas que funcionan como materiales estructurales, como proteccin, conexin, sostn y en el movimiento.

Rara vez cristalizan, por lo que su estructura no ha sido plenamente establecida por cristalografa de rayos X.

Colgeno (Triple helicoidal)Queratina (2 pares de a-hlices, unidas en espiral levgira)

Globulares

En estado nativo son molculas esferoidales compactas.

Se observan a-hlices y b- plegadas pero en proporciones y combinaciones variadas (aprox. 31% y 28% respectivamente).

Se encuentran empaquetadas de forma tan compacta que el agua queda excluida de la zona interna.

Por lo general se observan en agrupaciones o dominios, los cuales actan como unidades estructurales independientes.

Presentan estructura supersecundaria, o motivos de tipo a, b y a/b.

EnzimasProtenas de transporteReceptores

Estabilidad de una protenaInteracciones electrostticas

Puentes de H

Fuerzas hidrfobas

Puentes disulfuroMuchas protenas presentan agregados de subunidades unidos en forma no covalente en los que las unidades pueden ser idnticas o distintas.

OligmerosProtmerosEstructura cuaternariaLas protenas se pliegan de manera espontnea a sus conformaciones nativas en condiciones fisiolgicas.

La secuencia de una protena puede especificar la va de plegamiento y la estructura nativa.

Sin embargo, existen protenas que requieren protenas accesorias al plegamiento como la proteindisulfuroisomerasa (PDI), peptidilprolil-cis-trans-isomerasas, y chaperonas moleculares.Plegamiento