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GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES Daniela Ocampo Cano Universidad Nacional de Colombia Facultad de Ciencias, Departamento de Biociencias Medellín, Colombia 2021

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GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN

DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora cinnamomi FRENTE AL

USO DE FORMULACIONES COMERCIALES

Daniela Ocampo Cano

Universidad Nacional de Colombia

Facultad de Ciencias, Departamento de Biociencias

Medellín, Colombia

2021

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GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL

RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora cinnamomi FRENTE AL USO

DE USO DE FORMULACIONES COMERCIALES

Daniela Ocampo Cano

Trabajo de investigación presentado como requisito parcial para optar al título de:

Magister en Ciencias - Biotecnología

Director:

PhD. Biotecnología, MSc. en Ciencias Químicas, Químico, Sinar David Granada García

Codirector:

Ph.D., Ciencias del Suelo, MSc. Fitopatología, Ingeniero Agrónomo, Juan Carlos Pérez

Naranjo

Línea de Investigación:

Phytophthora cinnamomi

Grupo de Investigación:

Fitosanidad y Control Biológico

Corporación para Investigaciones Biológicas (CIB)

Universidad Nacional de Colombia

Facultad de Ciencias, Departamento de Biociencias

Medellín, Colombia

2021

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A mi familia

Por siempre creer en mí. Por ser el apoyo

cuando quise caer

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Declaración de obra original

Yo declaro lo siguiente:

He leído el Acuerdo 035 de 2003 del Consejo Académico de la Universidad

Nacional. «Reglamento sobre propiedad intelectual» y la Normatividad Nacional

relacionada al respeto de los derechos de autor. Esta disertación representa mi

trabajo original, excepto donde he reconocido las ideas, las palabras, o materiales

de otros autores.

Cuando se han presentado ideas o palabras de otros autores en esta disertación,

he realizado su respectivo reconocimiento aplicando correctamente los esquemas

de citas y referencias bibliográficas en el estilo requerido.

He obtenido el permiso del autor o editor para incluir cualquier material con

derechos de autor (por ejemplo, tablas, figuras, instrumentos de encuesta o

grandes porciones de texto).

Por último, he sometido esta disertación a la herramienta de integridad académica,

definida por la universidad.

Daniela Ocampo Cano

Fecha 23/04/2021

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Agradecimientos

Primero a Dios por poner esta oportunidad en el camino.

A mi director el doctor Sinar David Granada por confiar en mí, dedicarme su tiempo

y brindarme todo su apoyo en el desarrollo de este trabajo y a mi codirector el

doctor Juan Carlos Pérez por el apoyo brindado para la culminación de este

proceso.

A la institución universitaria Colegio Mayor de Antioquia por el financiamiento de

este proyecto.

A la Corporación para Investigaciones Biológicas – CIB, especialmente a la unidad

de Fitosanidad y Control Biológico por abrirme las puertas y permitirme desarrollar

este trabajo en sus laboratorios donde pude crecer tanto profesional como

personalmente.

A todos mis compañeros de Fitosanidad y Control Biológico por su apoyo

incondicional y por su valiosa amistad que me ha permitido crecer y por todo el

apoyo en los momentos difíciles donde pensé no poder terminar este camino.

Y, por último, pero no menos importante a mi familia que son el motor que impulsa

mi vida, que con su apoyo y amor incondicional me han motivado a seguir

estudiando y a quererme superar cada día más.

Page 9: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

Resumen y Abstract IX

Resumen

El aguacate (Persea americana Mill.) es una fruta nativa de las regiones tropicales

y subtropicales de América Central y México, perteneciente a la familia Lauraceae.

Es una fruta que posee valiosas propiedades nutricionales, por su alto contenido

de ácidos grasos monoinsaturados, proteína, carbohidratos, vitaminas y minerales.

Además, tiene un gran potencial de exportación, ya que, tiene múltiples usos en

culinaria, y puede emplearse también en procesos agroindustriales y como insumo

en la industria farmacéutica y cosmética.

Sin embargo, en los últimos años, la productividad de este cultivo se ha visto

limitada por diferentes factores entre los que se encuentra la pudrición radicular

causada por Phytophthora cinnamomi. Algunos productos químicos han ofrecido

una respuesta favorable frente a P. cinnamomi. No obstante, no generan supresión

del fitopatógeno, sino un control temporal de síntomas. Por tanto, es importante

tener información sobre el rango de sensibilidad que presenta P. cinnamomi frente

a fungicidas de naturaleza sistémica y a protectantes, ya que el uso indiscriminado

de estos productos puede causar perdida de sensibilidad en el microorganismo con

la consecuente generación de aislamientos resistentes.

De acuerdo a lo estipulado por el Comité de Acción frente a la Resistencia a los

Fungicidas (FRAC, por sus siglas en inglés) es importante hacer un levantamiento

de información sobre el rango de sensibilidad que presenta P. cinnamomi frente a

fungicidas de naturaleza sistémica y protectante, ya que el uso continuo y poco

racionalizado de estos productos pueden causar pérdida de sensibilidad en el

microorganismo, generando poblaciones resistentes y por ende problemas

Page 10: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

Resumen y Abstract

sanitarios de grandes magnitudes. Adicionalmente, de acuerdo con el FRAC, es

posible establecer el riesgo que implica el uso de ciertos principios activos frente a

un patógeno por medio de la siembra consecutiva del microorganismo en niveles

subletales de los compuestos hasta obtener un mutante resistente. La comparación

entre el aislamiento silvestre y el obtenido luego del contacto con el fungicida

arrojará un índice denominado “Factor de riesgo”, el cual dará una idea del riesgo

futuro de la aplicación de dicho principio activo. Por lo anterior, el presente trabajo

tuvo como objetivo establecer una línea base de sensibilidad de P. cinnamomi

frente a tres (3) formulaciones comerciales, y determinar el factor de riesgo en la

generación de resistencia en el patógeno frente a cada una de las formulaciones

comerciales.

Palabras clave: (Costo de aptitud, Fosetil, Metalaxil, Mancozeb, Pyraclostrobin,

Phytophthora cinnamomi, Sensibilidad).

Page 11: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

Resumen y Abstract

Abstract

GENERATION OF A BASELINE OF SENSITIVITY AND ASSESSMENT OF

RESISTANCE RISK IN Phytophthora cinnamomi AGAINST THE USE OF

COMMERCIAL FORMULATIONS

Avocado (Persea americana Mill.) is a tropical and subtropical fruit from Central

America and Mexico, belonging to the Lauraceae family. It is a fruit with valuable

nutritional properties, due to its high content of monounsaturated fatty acids,

protein, carbohydrates, vitamins and minerals. In addition, it has great potential to

be exported for its multiple uses in cooking, in agro-industrial processes and in the

pharmaceutical and cosmetic industry.

However, in recent years, productivity has been limited by different factors,

including root rot caused by Phytophthora cinnamomi. Some products have offered

a favorable response to P. cinnamomi. However, they do not generate suppression

of the phytopathogen, but only a temporary symptom decrease. Therefore, it is

important to have information on the range of sensitivity of P. cinnamomi to

systemic fungicides, as well as protectants, since the indiscriminate use of these

products can cause loss of sensitivity in the microorganism, generating resistant

isolates.

According to the Fungicide Resistance Action Committee (FRAC), it is important to

collect information on the range of sensitivity of P. cinnamomi to systemic and

protectant fungicides, since the continuous and not rationalized use of these

products can cause loss of sensitivity in the microorganism, generating resistant

populations and therefore large-scale sanitary problems. Additionally, according to

the FRAC, it is possible to establish the risk involved in the use of certain active

ingredients against a pathogen by consecutive culture of the microorganism at

sublethal levels of the compounds until a resistant mutant is obtained. The

Page 12: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

Resumen y Abstract

comparison between the wild isolate and the one obtained after the treatments with

the fungicide will yield an index called "risk factor", which will give an idea of future

resistance risk of the application of that active ingredient. Therefore, the objective

of this study was to establish a baseline sensitivity of P. cinnamomi to three (3)

commercial fungicides, and to determine the resistance risk factor of the pathogen

in front of these commercial formulations.

Keywords: (Fitness cost, Fosetyl, Metalaxil, Mancozeb, Pyraclostrobin,

Phytophthora cinnamomi, Sensitivity).

Page 13: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

Contenido XIII

Contenido

Pág.

Contenido

Marco Teórico ........................................................................................................... 5 1.1. Generalidades del aguacate ............................................................................... 5 1.2. Generalidades de Phytophthora cinnamomi ....................................................... 7

1.2.1. Clasificación taxonómica ................................................................................. 7 1.2.2. Características morfológicas. ........................................................................... 8 1.2.3. Reproducción .................................................................................................. 9 1.2.4. Ciclo de vida de Phytophthora cinnamomi ..................................................... 10 1.2.5. Sintomatología de la pudrición radicular causada por Phytophthora cinnamomi en árboles de aguacate ............................................................................................ 11

1.3. Métodos de control de Phytophthora cinnamomi .............................................. 12 1.4. Línea base y factor de riesgo ........................................................................... 15

Objetivos ................................................................................................................. 19 2.1. Objetivo general ............................................................................................... 19 2.2 Objetivos específicos ....................................................................................... 19

Materiales y métodos ............................................................................................. 20 3.1. Colección de aislamientos de Phytophthora cinnamomi. .................................. 20 3.2. Evaluaciones de sensibilidad. .......................................................................... 20 3.3. Establecimiento de la línea base de sensibilidad para cada formulación comercial. ................................................................................................................... 21 3.4. Análisis de resistencia cruzada. ....................................................................... 22 3.5. Generación de aislamientos de P. cinnamomi tolerantes a pyraclostrobin 250g/L, Metalaxil - M 40g/kg + Mancozeb 640 g/kg y fosetil-Al 800 g/Kg y evaluación del factor de riesgo. .................................................................................................................... 22 3.6. Caracterización de aislamientos tolerantes a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al. .................................................................................................................. 23

3.6.1. Crecimiento micelial de P. cinnamomi. .......................................................... 23 3.6.2. Producción de zoosporangios y liberación de zoosporas. .............................. 23 3.6.3. Morfología micelial de aislamientos de P. cinnamomi tolerantes pyraclostrobin 250g/L, Metalaxil - M 40g/kg + Mancozeb 640 g/kg y fosetil-Al 800 g/Kg y sus respectivos aislamientos parentales. ........................................................................ 24 3.6.4. Permeabilidad de la membrana celular .......................................................... 25 3.6.5. Pruebas de virulencia de aislamientos tolerantes a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al y sus respectivos aislamientos parentales. ............. 26

3.7. Análisis estadístico. .......................................................................................... 27

Resultados .............................................................................................................. 28

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XIV GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN

Phytophthora cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES. Título de la tesis o trabajo de investigación

4.1. Evaluaciones de sensibilidad y establecimiento de la línea base de sensibilidad para cada fungicida comercial ..................................................................................... 28 4.2. Análisis de resistencia cruzada. ........................................................................ 31 4.3. Generación de aislamientos de P. cinnamomi tolerantes a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al y evaluación del factor de riesgo. ............................... 33 4.4. Caracterización de aislamientos tolerantes a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al. ................................................................................................................... 34

4.4.1. Crecimiento micelial de P. cinnamomi. .......................................................... 34 4.4.2. Producción de zoosporangios y liberación de zoosporas. ............................. 35 4.4.3. Morfología micelial de aislamientos de P. cinnamomi tolerantes a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al y sus respectivos aislamientos parentales. ............................................................................................................... 37 4.4.4. Permeabilidad de la membrana celular. ........................................................ 39 4.4.5. Pruebas de virulencia de aislamientos tolerantes a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al y sus respectivos aislamientos parentales. ............. 41

Discusión ................................................................................................................ 42 5.1 Perfiles y línea base de sensibilidad. ..................................................................... 42 5.2 Resistencia Cruzada.............................................................................................. 45 5.3 Evaluación del factor de riesgo. ............................................................................. 46 5.4 Caracterización biológica de aislamientos tolerantes a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al.................................................................................... 49

Conclusiones y recomendaciones ....................................................................... 53 6.1. Conclusiones .................................................................................................... 53 6.2. Recomendaciones ............................................................................................ 53

Bibliografía ............................................................................................................. 69

Page 15: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

Contenido XV

Lista de figuras

Pág.

Figura 1. Distribución de frecuencias de la sensibilidad al pyraclostrobin en

términos de concentración efectiva 50 (EC50) para 86 aislamientos de

Phytophthora cinnamomi. 29

Figura 2. Distribución de frecuencias de la sensibilidad al metalaxil + mancozeb en

términos de concentración efectiva 50 (EC50) para 86 aislamientos de

Phytophthora cinnamomi. 30

Figura 3. Distribución de frecuencias de la sensibilidad al fosetil-al para 86

aislamientos de Phytophthora cinnamomi.

Figura 4. Pruebas de correlación de spearman para resistencia cruzada entre

diferentes ingredientes activos: pyraclostrobin y metalaxil + mancozeb (a),

pyraclostrobin y fosetil-al (b) y metalaxil + mancozeb y fosetil-al (c). 32

Figura 5. Promedio de las tasas de crecimiento de los aislamientos de P.

cinnamomi tolerantes y sus respectivos aislamientos parentales. Tratamientos

con la misma letra no presentan diferencias significativas según el test de

comparaciones múltiples de tukey con un nivel de significancia de 0,05. 34

Figura 6. Producción de zoosporangios de los aislamientos de P. cinnamomi

tolerantes a los diferentes productos evaluados y sus respectivos aislamientos

parentales. Tratamientos con la misma letra no presentan diferencias

significativas según el test de comparaciones múltiples de tukey con un nivel

de significancia de 0,05. 35

Figura 7. Concentración de zoosporas de los aislamientos de P. cinnamomi

tolerantes a los diferentes productos evaluados y sus respectivos aislamientos

parentales. Tratamientos con la misma letra no presentan diferencias

Page 16: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

XVI GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN

Phytophthora cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES. Título de la tesis o trabajo de investigación

significativas según el test de comparaciones múltiples de tukey con un nivel

de significancia de 0,05. 36

Figura 8.características morfológicas del aislamiento de Phytophthora cinnamomi.

Anmalcfe1epc. A) aislamiento parental, B) tolerante a pyraclostrobin, C)

tolerante a fosetil-al y d) tolerante a metalaxil + mancozeb. 37

Figura 9. Características microscópicas del aislamiento de Phytophthora

cinnamomi. ANMALCFE1EPC. A) aislamiento parental, B) tolerante a

pyraclostrobin, C) tolerante a fosetil-al y D) tolerante a metalaxil + mancozeb. 38

Figura 10. Conductividad relativa de aislamientos parentales y aislamientos

tolerantes a los diferentes ingredientes activos. A) ANAMSJFE1EPC. B)

ANMALCFE1EPC y C) ANABCIFE3EPC. 40

Figura 11.Porcentaje de infección de los aislamientos de P. cinnamomi tolerantes

a los diferentes productos evaluados y sus respectivos aislamientos

parentales. Tratamientos con la misma letra no presentan diferencias

significativas según el test de comparaciones múltiples de tukey con un nivel

de significancia de 0,05. 41

Page 17: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

Contenido XVII

Lista de tablas

Pág.

TABLA 1. Características de los productos evaluados. 21

TABLA 2. Factor de riesgo para los aislamientos de P. cinnamomi frente a las

tres formulaciones evaluadas. 33

Page 18: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …
Page 19: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

Introducción

El aguacate (Persea Americana Mill) es un cultivo frutal que se produce

aproximadamente en 59 países en regiones tropicales y subtropicales (Ramirez Gil,

2013). Económicamente es la especie más importante de la familia Lauraceae

(Pérez, 2008). Es una fruta apetecida a nivel mundial ya que es rico en gran

variedad de nutrientes, como fibra dietética, sodio, magnesio, vitaminas (A, K, E, C

y B6) y ácidos grasos monoinsaturados lo que soporta una amplia gama de

posibles aspectos benéficos sobre la salud (Dreher & Davenport, 2013). Además,

tiene un agradable sabor, es de fácil preparación y sus subproductos son fuentes

viables de compuestos bioactivos con alto poder funcional utilizados en la industria

cosmética y farmacéutica (Araújo et al., 2018).

Debido a las bondades nutricionales que presenta la fruta se convierte en un

producto agrícola con un alto potencial de exportación, lo que genera un incremento

en la demanda del mismo. Teniendo en cuenta el aumento del consumo a nivel

mundial, las exportaciones colombianas han registrado un aumento significativo en

términos de valor y volumen en las ventas de la fruta. Por tal motivo, la superficie

sembrada de aguacate ha crecido de manera significativa en el país. En Colombia

se cultiva aguacate desde el nivel del mar hasta los 2.200 m de altura, siendo el

departamento de Antioquia el que tiene la mayor cantidad de área sembrada con

más de 29.400 hectáreas (Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural, 2020), ya

que en este departamento se cuenta con una gran diversidad en la composición

del suelo y en las condiciones climáticas, lo que hace que el aguacate sea un cultivo

con grandes oportunidades para esta región y en general para todo el país (Rios

& Tafur, 2003; Cañas et al., 2015).

Page 20: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

2 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

Sin embargo, al generarse un aumento en el área sembrada, también se presenta

un aumento en los problemas que limitan la producción, siendo uno de los más

notables los de naturaleza fitosanitaria (Ramírez et al., 2017) Dentro de estos

problemas se destaca la pudrición radicular causada por Phytophthora cinnamomi,

considerada una de las enfermedades económicamente más importante que limita

la producción y calidad de la fruta, causando pérdidas hasta del 90% (Pérez, 2008).

Este patógeno puede afectar la planta en todos los estados de desarrollo y los

síntomas se caracterizan por una marchitez generalizada, pérdida de hojas,

reducción del tamaño del fruto y muerte de raíces y ramas, con un impacto negativo

en la producción, que en estados avanzados de la enfermedad puede llegar a

causar la muerte del árbol (Gil et al., 2014; Granada et al., 2020).

Para efectuar un adecuado manejo de la enfermedad se requiere de una

combinación de varias prácticas diseñadas para reducir la actividad del patógeno

y aumentar la tolerancia del hospedero durante los periodos críticos de infección.

Las prácticas de control adecuado deben integrar, un control cultural del cultivo, un

control químico y la incorporación de portainjertos resistentes; siendo el control

químico la estrategia más utilizada para la protección de cultivos (Cohen & Coffey,

1986; Coffey, 1987; Hardy et al., 2001). Los fungicidas se han utilizado hace más

de 200 años para la protección de plantas hospederas en situación de riesgo. En

la actualidad existen más de 150 moléculas con actividad fúngica diferente que dan

origen a más de 150 productos patentados para el control de hongos y oomycotas.

Dentro de estos existen varios grupos de fungicidas con diferentes modos de

acción que se encuentran actualmente disponibles para el control de enfermedades

causadas por oomycotas, entre los que se encuentran las fenilamidas, los

inhibidores de quinona (QoI) y aminas del ácido carboxílico (CAA); también se han

empleado mezclas que incluyen metalaxil, mancozeb, fosetil aluminio y captan,

algunos fertilizantes ricos en fósforo y potasio, y productos a base de ácido

fosforoso, ácido fosfórico, fosfitos o fosfonatos (Cohen & Coffey,1986; Coffey,1987;

Dobrowolski et al., 2008; Pérez, 2008).

Page 21: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

3

Dentro de los productos más utilizados para el control de pudriciones por P.

cinnamomi se encuentran los alquilo fosfonatos como el fosetil – aluminio, que es

inyectado en el tronco y revierte rápidamente los síntomas en el árbol afectado, sin

embargo, entre 5 y 7 meses después de la aplicación, la sintomatología vuelve a

aparecer. La mala aplicación de productos, la falta de manejo cultural y el mal

diagnóstico conlleva a que se cree dependencia del agricultor hacia los productos

realizando una aplicación extensa y repetida de un número relativamente limitado

de fungicidas. El abuso de dichas moléculas representa un riesgo importante de

desarrollo de resistencia del patógeno hacia los productos y por ende problemas

fitosanitarios de gran magnitud (Jackson et al., 2000; Thomidis, 2001; Elliott et al.,

2015).

Según lo establecido en el FRAC el uso indiscriminado de productos químicos

conduce a pérdida de sensibilidad y a la aparición de microorganismos tolerantes,

lo cual se presenta cuando el patógeno ya no es lo suficientemente sensible para

ser controlado adecuadamente por un principio activo determinado. Por tal motivo,

realizar monitoreos continuos de sensibilidad a fungicidas en hongos y oomycotas

es de vital importancia para asegurar que los tratamientos que reducen la

esporulación, el crecimiento y la propagación de los patógenos en plantas

continúen siendo efectivos (Brent & Hollomon, 2007; Herrmann & Bucksch, 2014;

Avenot & Michailides, 2015; Huang et al., 2019).

La aparición de microrganismos tolerantes se ha evidenciado en los últimos años

en varios tipos de cultivo. Por ejemplo, la resistencia de Phytophthora infestans y

Phytophthora capsici al metalaxil ya ha sido extensamente reportada. Esta

resistencia se atribuye a la alta presión de selección ejercida por el uso continuo

de dichas moléculas (Coffey, 1984; Thomidis, 2001; Brent & Hollomon, 2007; Bi et

al., 2011; Sena et al., 2018). Por tal motivo es necesario realizar una búsqueda de

fungicidas que sirvan como alternativa para los productos que pierden efectividad

contra los patógenos, además de utilizar las herramientas establecidas por las

entidades reguladoras para prevenir la aparición de microorganismos resistentes.

Page 22: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

4 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

El manejo de la resistencia puede facilitarse mediante la evaluación previa del

riesgo de generar resistencia a un determinado producto. Cuando se conocen este

riesgo, la aplicación de prácticas anti resistencia como: la aplicación de fungicida

en riesgo mezclado con otra molécula diferente, limitar el número de aplicaciones

por temporada, la aplicación de las dosis recomendadas por el fabricante y el uso

de fungicidas con fin preventivo y no curativo, son indispensables para controlar la

aparición de microorganismos resistentes, además de alargar la vida útil del

producto (Brent & Hollomon, 2007; Lucas et al., 2015; Rossi et al., 2021).

El establecimiento de una línea base de sensibilidad y la evaluación del riesgo de

resistencia son necesarias antes de la aplicación de nuevas moléculas frente a

patógenos específicos, ya que proporcionan información importante para evaluar

el manejo que se le puede dar al producto. Por esto el FRAC determinó que estas

dos herramientas deben ser parte integral y obligatoria para el registro de una

nueva molécula frente a determinado patógeno (Russell, 2008; Herrmann &

Bucksch, 2014). Los estudios de pérdida de sensibilidad se han convertido en un

paso fundamental para el registro de cualquier pesticida que se vaya a introducir

en el mercado, además permiten desarrollar estrategias de manejo adecuadas que

contribuyan a la prevención de enfermedades (Brent & Hollomon, 2007; Zhang et

al., 2015; Mao et al., 2018). Por tales motivos, el presente trabajo tuvo como

objetivo establecer una línea base de sensibilidad de P. cinnamomi frente a tres

fungicidas comerciales, y determinar el factor de riesgo en la generación de

resistencia en el patógeno frente a cada uno sus principios activos.

Page 23: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

5

Marco Teórico

1.1. Generalidades del aguacate

La familia Lauraceae es una familia muy variable con alrededor de 50 géneros

descritos y un número indeterminado de especies, distribuidos principalmente en

las regiones tropicales y subtropicales de todo el mundo. Pocas especies de esta

familia tienen importancia económica, gracias a que son apetecidas para su

consumo, siendo las más destacadas Laurel (Laurus nobilis L.), Canela

(Cinnamomum verum J. Presl), Alcanfor (Cinnamomum camphora J. Presl) y

algunos árboles maderables, siendo el aguacate (Persea americana Mill.) la

especie más importante a nivel mundial (Araújo et al., 2018).

Los genotipos del aguacate (Persea americana Mill.) se han clasificado en tres

razas o subespecies hortícolas: la mexicana (P. americana var drymifolia), la

guatemalteca (P. americana var. guatemalensis) y la antillana (P. americana var.

Americana). Cada raza tiene un origen geográfico determinado y se encuentra

adaptado a diferentes condiciones ecoclimáticas. Los cultivares de raza antillana

son árboles de bosques húmedos y calurosos de tierras bajas de América central.

La raza mexicana se adapta mejor a regiones más frías, situadas a alturas de

1.400-2.500 m, siendo la raza guatemalteca la más sensible a las condiciones

extremas (zonas templadas húmedas) (Galindo et al., 2008; Alcaraz, 2009;

Talavera et al., 2019).

En su habitad natural el árbol alcanza de 10-12 m, con raíces laterales, hojas

simples, enteras, lisas, correosas y de color verde oscuro. Las flores son

Page 24: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

6 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

hermafroditas, simétricas y de color verde amarillento. La fruta no madura en el

árbol y pueden tener forma de pera oval, elíptica o globular oblonga, con

variaciones de colores de púrpura oscuro a negro, o verde, que varían dependiendo

de la variedad (Díaz, 2013; Wang et al., 2019).

El aguacate viene experimentando un aumento de la demanda en los mercados

internacionales debido a su aceptado consumo en fresco, no solo por su agradable

sabor, su consistencia cremosa y su textura suave, si no por la amplia gama de

beneficios que trae para la salud. El mesocarpio de la pulpa está constituido por

ideoblastos ricos en aceites monoinsaturados, beneficiosos para la salud cardiaca,

además de que contiene cantidades importantes de vitaminas A, B, C, minerales,

potasio, fosforo, hierro y magnesio, compuestos fitoquímicos, antioxidantes y

carotenoides. Todo esto se transforma en numerosos beneficios para la salud, sin

desmeritar las grandes cualidades que tiene para su procesamiento agroindustrial

( Dreher & Davenport, 2013; Fulgoni et al., 2013; Araújo et al., 2018).

Gracias al incremento en los hábitos de consumo, motivados por la promoción del

aguacate como un “super alimento”, el mercado del aguacate a nivel mundial ha

venido creciendo de una forma significativa. Actualmente se siembra en más de 59

países tropicales y subtropicales, siendo México el principal productor con un 49%

de la producción mundial. Actualmente en el ranking mundial del aguacate

Colombia es el tercer país en área cosechada con 63.859 ha y el cuarto en

producción con 639.000 t (Ramírez et al., 2017; Ministerio de Agricultura y

Desarrollo Rural, 2020).

Gracias a la diversidad agroclimática del país, el aguacate se puede cultivar desde

el nivel del mar hasta los 2.500 msnm, distribuidos en 18 departamentos, donde

Tolima, Antioquia, Caldas, Santander, Cesar, Valle del Cauca y Quindío los que

representan la mayor área sembrada en el país. Siendo Tolima el mayor productor

con un 18% del total nacional. Se estima que el 66% de la producción nacional se

destinada al mercado nacional y el 34% restante se entrega a los mercados

internacionales. Las exportaciones de aguate Hass son lideradas por Antioquia con

Page 25: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

7

una participación del 53% (Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural, 2020). Sin

embargo, a pesar del aumento en el área de siembra y a todo el potencial del cultivo

para la exportación, la producción nacional de aguacate se ve limitada debido a

factores limitantes tanto de tipo biótico como abiótico del sistema productivo. Entre

los factores bióticos se destaca P. cinnamomi, uno de los patógenos más severos

y que afecta considerablemente la producción y desarrollo de la planta (Rios &

Tafur, 2003; Instituto Colombiano Agropecuario ICA, 2009; Ministerio de Agricultura

y Desarrollo Rural, 2020).

1.2. Generalidades de Phytophthora cinnamomi

Phytophthora cinnamomi Rands es un oomycota transmitido por el suelo con

una distribución geográfica global. Infecta un gran número de plantas en

ecosistemas agrícolas, hortícolas y forestales. Phytophthora cinnamomi fue

descrito por primera vez en 1922 por Rands en plantas de canela y desde

entonces ha sido encontrado en más de 3.000 hospederos diferentes en 70

países en regiones tropicales y subtropicales. La incidencia de este patógeno

sobre las plantas de aguacate se describió por primera vez en 1927 en Puerto

Rico y actualmente se registra como agente causal de la pudrición radicular o

tristeza del aguacatero en casi todas las áreas del mundo donde se siembra este

cultivo (México, Estados Unidos, América del sur, América central, etc.) (Coffey,

1987; Medina, 2014; Sena et al., 2018).

1.2.1. Clasificación taxonómica

REINO: Chromista (Stramenopila)

PHYLLUM: Oomycota

CLASE: Peronosporea

ORDEN: Peronosporales

FAMILIA: Peronosporaceae

Page 26: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

8 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

GÉNERO: Phytophthora

ESPECIE: Phytophthora cinnamomi

1.2.2. Características morfológicas.

• Micelio

Phytophthora cinnamomi es un oomycota, diploide y heterotálico, tiene micelio

cenocítico. Sus hifas son moderadamente ramificadas, con nódulos redondos y

con hinchamientos vasculares, siendo esta la principal característica que existe

para diferenciar P. cinnamomi de otras especies de Phytophthora. El diámetro

de la hifa varia de 8 a 25 µm. Posee dilataciones hifales esféricas con racimos

de 42 a 60 µm de diámetro que le dan un aspecto botrioso a coraliforme. En

medio V8-A suelen ser colonias sin patrón distintivo y en medio papa dextrosa

agar (PDA) presenta un patrón de roseta (petaloide) (Coffey, 1987; Hüberli et

al. 2001; Gil et al., 2014; Ramírez et al., 2017).

• Zoosporangios

Los zooesporangióforos son simples. Los zoosporangios pueden ser ovoides,

obpiriformes o elipsoides, con un ápice no papilado. Su base es redonda y

estrecha, sujeta por una zona terminal, el tamaño promedio es de 75 x 40 µm de

largo y 25,9 - 47 µm de ancho, pero la forma y tamaño varían con las condiciones

ambientales y nutricionales (Castañeda, 2009).

• Zoosporas

Las zoosporas son el principal medio por el cual se infectan a los huéspedes,

son de vida libre y se pueden movilizar por medio del suelo, el agua o el viento.

Son atraídas a los sitios de infección de las raíces por quimiotaxis desde una

distancia de 3-4 mm y atacan la superficie más externa de las puntas de la raíz.

Las zoosporas se enquistan, se generan la germinación y las hifas se dirigen a

Page 27: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

9

las raíces emergentes donde la cutícula está rota y aún no está completamente

formada. (Castañeda, 2009)

• Clamidosporas

Las clamidosporas constituyen órganos de conservación y supervivencia.

Generalmente son de forma irregular o globosa, tienen diámetros de 16 a 43 µm

y pueden presentar grupos de dos a tres por hifa de forma terminal o intercaladas

en el micelio. Con frecuencia se encuentran en racimos. Al principio las

clamidosporas son de color hialino, tornándose de color amarillo a marrón con

la edad (Castañeda, 2009; Medina, 2014).

1.2.3. Reproducción

P. cinnamomi presenta dos tipos de apareamiento: tipo A1 y tipo A2, cada tipo

corresponde a una forma de apareamiento en la cual se producen células

sexuales masculinas (anteridios) y células sexuales femeninas (oogonios). Es

poco probable que ambos tipos de apareamiento se encuentren en el mismo

espacio geográfico siendo el tipo A2, el más predominante a nivel mundial, lo

cual indica que hay una limitación en la reproducción sexual dentro de esta

especie, por lo que la reproducción asexual es la más frecuente. El estado sexual

de P. cinnamomi se forma cuando los dos tipos de apareamiento se presentan

en los dos estados. La cepa con anteridios se une al individuo con oogonios y

se forma la oosfera. Los oogonios pueden medir entre 23 y 41 µm. Durante la

fertilización, un tubo del anteridio penetra el oogonio, las oosporas resultantes

son redondas, de color hialino a café-amarillo, pleróticas (una sola ocupa todo

el espacio disponible dentro del oogonio) y su diámetro promedio depende del

medio de cultivo, aunque el rango es de 22-36 µm. Permanecen viables más de

365 días (Medina, 2014; Sanchez, 2018).

Page 28: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

10 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

1.2.4. Ciclo de vida de Phytophthora cinnamomi

El oomycota P. cinnamomi es una de las 100 especies invasoras de plantas más

limitantes en la agricultura mundial. Es un patógeno con posible origen en Papua

Nueva Guinea y actualmente está presente en casi todo el mundo. Se ha

descrito en más de 3.000 especies vegetales, principalmente de tipo leñoso. P.

cinnamomi puede crecer de manera saprófita en el suelo. Cuando las

condiciones ambientales son favorables (alta humedad), las estructuras de

resistencia entran en el ciclo de esporulación asexual, las hifas somáticas forman

zoosporangios multinúcleares que se rompen y liberan de 20 a 30 zoosporas

uniflageladas. Las zoosporas sin pared se enquistan, formando quistes con

pared que germinan y penetran en la planta. Transcurridos dos a tres días, se

forman los zoosporangios en la superficie de la planta. El ciclo asexual puede

repetirse muchas veces, aumentando rápidamente el inóculo en el área

infectada (Castaño, 2013; Sanchez, 2018).

Las raíces estimulan la germinación de las clamidosporas mediante la secreción

de sustancias químicas (quimiotaxis), así como la atracción de las zoosporas a

las puntas de las mismas. Una vez que penetran, pudren las raíces y afecta la

absorción de agua y nutrientes. El oomycota se disemina por múltiples ciclos de

esporulación desde las raíces infectadas, produciendo más zoosporangios y

zoosporas, las cuales migran hacia la región subapical de nuevas raíces, hasta

que las condiciones ambientales del suelo no sean favorables (baja humedad) o

la raíz infectada muera, en este momento las clamidosporas (estructuras de

supervivencia), se liberan hacia el suelo o hacia los fragmentos de raíces no

degradados. Estas estructuras de supervivencia pueden tener una viabilidad de

varios meses y germinarán para producir nuevos zoosporangios y zoosporas,

una vez las condiciones ambientales del suelo vuelvan a ser favorables (Pérez,

2008; Castaño, 2013; Sanchez, 2018).

Page 29: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

11

1.2.5. Sintomatología de la pudrición radicular causada

por Phytophthora cinnamomi en árboles de aguacate

La pudrición de raíces o “tristeza del aguacatero “es una de las enfermedades

más importantes que afecta la productividad del aguacate en todo el mundo y en

Colombia. Esta enfermedad genera pérdidas económicas para los agricultores y

en general para la industria aguacatera. La pudrición de raíces puede

presentarse desde estado de invernadero hasta plantas desarrolladas en

campo. En las plantas de vivero, la pudrición se presenta en los almácigos, los

árboles afectados pueden llegar a morir prematuramente antes de que se

produzca el prendimiento del injerto, debido a la pudrición del cuello del patrón.

En otras ocasiones los árboles presentan crecimiento reducido, poco desarrollo

foliar y amarillamiento generalizado de las hojas. A medida que la infección

progresa se presenta la pudrición de la parte basal del tallo del patrón (Tamayo,

2007; Instituto Colombiano Agropecuario ICA, 2009).

En condiciones de campo, la enfermedad se presenta en focos, en las zonas

más húmedas. Los árboles afectados detienen su crecimiento, las hojas son de

tamaño reducido, pierden su color verde normal y son de apariencia pálida. Con

el transcurrir del tiempo, se presenta un amarillamiento leve pero generalizado

del árbol, acompañado o no, de rebrotes y floraciones excesivas a destiempo.

En ocasiones, los árboles presentan nuevos brotes, pero éstos son de menor

vigor y tamaño, y cuando hay frutos, éstos son numerosos y de tamaño pequeño.

A medida que el vigor del árbol es menor, se observa marchitez leve pero

progresiva del árbol, aún en condiciones de adecuada humedad, debido a la

pudrición de las raíces absorbentes, disminuyendo la toma de agua y de

nutrientes (Tamayo, 2007). Posteriormente, las ramas laterales muestran un

secamiento descendente, para luego presentar un secamiento generalizado del

árbol. Las hojas permanecen adheridas por algún tiempo, con una caída gradual

hasta que finalmente el árbol presenta una defoliación severa. Las raíces

secundarias o absorbentes del árbol presentan necrosis. El oomycota puede

Page 30: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

12 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

atacar la base del tallo y colonizarlo totalmente, produciendo marchitez,

secamiento y muerte repentina del árbol (Tamayo, 2007; Instituto Colombiano

Agropecuario ICA, 2009; Castaño, 2013).

1.3. Métodos de control de Phytophthora

cinnamomi

El manejo de la enfermedad ha requerido de una combinación de varias

prácticas diseñadas para reducir la actividad del patógeno y aumentar la

tolerancia del hospedero durante los periodos críticos de infección. El principal

método de control integra el control químico, el uso de porta injertos resistentes

y la aplicación de buenas prácticas de manejo del cultivo. No obstante, la

aplicación de agroquímicos es la estrategia más utilizada para controlar la

enfermedad. Varios grupos de fungicidas con diferentes modos de acción están

actualmente disponibles para el control de enfermedades causadas por

oomycotas ( Mccarren et al., 2009; Bi et al., 2011).

Entre los fungicidas utilizados para el control de enfermedades causadas por

oomycotas se encuentran las fenilamidas, los inhibidores del QoI y aminas del

ácido carboxílico (CAA). También se han empleado mezclas que incluyen

metalaxil, mancozeb, fosetil aluminio y captan, algunos fertilizantes ricos en

fósforo y potasio, y productos a base de ácido fosforoso, ácido fosfórico, fosfitos

o fosfonatos (Coffey, 1984; Cohen & Coffey, 1986; Coffey, 1987).

Las estrategias de control de P. cinnamomi han estado basadas

fundamentalmente en el uso de agroquímicos, entre los productos específicos

para el control de Phytophthora se destacan el metalaxyl + mancozeb y

productos a base de fosfitos. Además, el uso de prácticas culturales, como la

solarización del suelo afectado y la implementación de zanjas que facilitan el

drenaje, en menor medida. Igualmente, se han comenzado a realizar

aplicaciones de agentes biocontroladores como el hongo Trichoderma spp., de

Page 31: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

13

efectividad conocida sobre otros fitopatógenos. Algunas bacterias antagónicas

también han demostrado ser efectivas (Dobrowolski et al., 2008; Pérez, 2008;

Masikane et al., 2020).

El control químico sigue siendo el método más utilizado para el control de P.

cinnamomi. Dentro de los productos más utilizados se encuentran el

metalaxil/mefenoxam y mancozeb. El metalaxil es un fungicida sistémico que se

transloca en el xilema de las plantas, con efectividad selectiva frente varias

especies de Phytophthora. El modo de acción de metalaxil / mefenoxam es la

inhibición selectiva de la síntesis de ARN ribosómico al afectar la actividad de

las ARN polimerasas (Matheron & Porchas, 2000; Grimmer et al., 2015; Walker

& Leroux, 2015). Por su parte, el mancozeb es un ditiocarbamato no sistémico

protector y está clasificado por el FRAC en el grupo de modo de acción M (acción

en múltiples sitios). El efecto directo de mancozeb sobre los procesos

bioquímicos centrales dentro del oomycota da como resultado la inhibición de la

germinación de las esporas (More, 1963).

En la actualidad los fungicidas más utilizados son los productos a base de

fosfonatos o fosfitos comercializados como sales orgánicas e inorgánicas de

ácido fosforoso. Estos principios activos tienen un modo de acción complejo.

Pueden actuar directamente sobre el patógeno e indirectamente para estimular

las respuestas de defensa del huésped y así inhibir finalmente el crecimiento del

patógeno. Los fosfonatos de aluminio y ácido fosfórico son fungicidas con

actividad sistémica que actúan de dos formas para atenuar las enfermedades

causadas por Phytophthora: 1. reducen activamente el crecimiento y la

esporulación de oomycotas, al tiempo que 2. estimulan las respuestas de

defensa de las plantas para, en última instancia, prevenir la colonización de la

raíz por parte del patógeno (Coffey, 1985; King et al., 2010; Akinsanmi & Drenth,

2013).

Existen varios métodos de aplicación de fungicidas, donde se incluyen la

aspersión foliar o las inyecciones en el tronco; sin embargo, su uso se ha vuelto

Page 32: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

14 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

algo problemático, ya que cuando las moléculas no son móviles al interior de

la planta, éstas se translocan y llevan a problemas de acumulación en los frutos,

lo que conduce a que se superen los límites de residuos, restringiendo el uso de

estos productos (Masikane et al., 2020). Adicional a esto, el uso indiscriminado

de estos productos conduce a pérdida de sensibilidad y a la aparición de

microorganismos tolerantes, lo cual se presenta cuando el patógeno ya no es lo

suficientemente sensible para ser controlado adecuadamente por un principio

activo determinado. La aparición de microrganismos tolerantes se ha

evidenciado en los últimos años en varios tipos de cultivos. Por ejemplo, la

resistencia de Phytophthora infestans y Phytophthora capsici al metalaxil ya ha

sido extensamente reportada. Esta resistencia se atribuye a la alta presión de

selección ejercida por el uso continuo de dichas moléculas (Cohen & Coffey,

1986; Brent & Hollomon, 2007; Ramírez et al., 2017).

Para que el control químico continúe siendo efectivo, su uso técnico es vital para

prevenir el desarrollo de aislados de Phytophthora resistentes a los fungicidas.

Los estudios de pérdida de sensibilidad tienen gran importancia tanto para la

industria de los fungicidas como para los agricultores. Esto ha motivado la

creación de instituciones que reglamentan la utilización de pesticidas, como el

FRAC. Los estudios de sensibilidad permiten tener una base para el monitoreo

de la aparición de microorganismos tolerantes a determinados principios activos,

convirtiéndose en una herramienta esencial para la toma de decisiones y el

desarrollo de estrategias de manejo que permitan controlar la aparición de

organismos resistentes. Según lo establecido por el FRAC, el establecimiento

de una línea base de sensibilidad debería ser parte integral y obligatoria para el

registro de una nueva molécula frente a un determinado patógeno (Russell,

2008; Zhang et al., 2015).

Page 33: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

15

1.4. Línea base y factor de riesgo

El éxito en la lucha contra las enfermedades de los cultivos y la reducción del

daño que causan al rendimiento y la calidad de los productos, depende en gran

medida da la aplicación oportuna de los fungicidas; sin embargo, la aplicación

extensiva y repetitiva de un número limitado de moléculas aumenta la presión

de selección y reduce la presencia de las poblaciones más sensibles. Debido a

que el uso de fungicidas alternativos no químicos como agentes botánicos y

agentes de control biológico todavía es limitado, los fungicidas de sitio único

siguen siendo importantes para el manejo de las enfermedades. No obstante, el

uso repetido de estos fungicidas selecciona con frecuencia biotipos resistentes

de la población de patógenos (Rossi et al., 2021).

Según lo establecido por el FRAC, la resistencia a los fungicidas y su manejo es

de gran importancia para todos los interesados en la protección de cultivos. Por

ejemplo, cuando se introducen nuevas moléculas para el control de patógenos

específicos, se requiere que se establezca la línea de base de sensibilidad de

cada patógeno para poder diseñar las estrategias de uso del producto. Sin una

gestión eficaz de la sensibilidad, la resistencia podría surgir muy rápidamente y

el principio activo entraría en desuso (Brent & Hollomon, 2007; Russell, 2008;

Walker & Leroux, 2015).

La línea base de sensibilidad en el campo de la investigación y el manejo de

resistencia a fungicidas se puede definir como un perfil de sensibilidad del hongo

u oomycota objetivo al fungicida diseñado para su control. La línea base se

puede establecer utilizando técnicas biológicas o moleculares para evaluar la

respuesta de individuos o poblaciones previamente no expuestas a la molécula

en estudio. Es una herramienta fundamental para el establecimiento y

seguimiento posterior de las estrategias de manejo que puedan contribuir con la

prevención de la aparición de organismos menos sensibles. Con esta

información es posible monitorear el efecto del fungicida sobre el hongo para ver

Page 34: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

16 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

si la respuesta está cambiando hacia la resistencia en el tiempo (Brent &

Hollomon, 2007; Russell, 2008; Herrmann & Bucksch, 2014).

Así mismo el riesgo de resistencia es un elemento importante como parte del

proceso regulatorio, ya que la evaluación de este riesgo es esencial para

prevenir o retrasar el desarrollo de resistencia y así poder aplicar las estrategias

anti resistencia. Según el FRAC el riesgo de resistencia se define como “la

probabilidad de que se desarrolle resistencia hasta un punto que cause fallas o

una disminución significativa del control de enfermedades en la protección

comercial de cultivos, y no simplemente la probabilidad de detectar formas

resistentes en niveles bajos o de la resistencia que es inducible en situaciones

experimentales” (Herrmann & Bucksch, 2014). Así definida, la evaluación del

riesgo de resistencia es un asunto de gran importancia para el fabricante de

fungicidas. Estas evaluaciones influyen en las decisiones para desarrollar y

comercializar nuevas moléculas, en las estrategias de uso que se adoptan para

garantizar un rendimiento sostenido y ayudan a saber cuánto y qué tipo de

monitoreo de resistencia debe realizarse. También es reconocido cada vez como

un elemento importante de la evaluación de la eficacia, y como una guía para

seleccionar y programar tratamientos que sirven para dar vigilancia a los

productos (Brent & Hollomon, 2007; Russell, 2008; Wu et al., 2020).

Los riesgos de desarrollo de resistencia en un patógeno objetivo dependen no

solo de la naturaleza del producto, también se ven afectados por la naturaleza

del patógeno y por las condiciones agroclimáticas que se presentan en el cultivo.

Los factores relacionados directamente con la epidemiología de la enfermedad

e indirectamente con el manejo de la enfermedad se combinan con factores

genéticos para formar el riesgo de patógenos. Los factores más importantes que

determinan el riesgo en los patógenos incluyen el ciclo de vida del patógeno, la

abundancia de esporulación, la capacidad de las esporas para diseminarse entre

plantas, cultivos y regiones, la capacidad de infectar en todas las etapas del

cultivo y la capacidad para mutar o expresar genes mutantes (Russell, 2008;

Herrmann & Bucksch, 2014).

Page 35: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

17

La experiencia práctica, junto con algo de experimentación, indica que el riesgo

real de resistencia depende no solo del riesgo inherente de una combinación

particular de fungicida-patógeno, sino también de las condiciones de uso del

fungicida. Dentro de las condiciones de uso de los fungicidas se considera que

las más importantes que afectan el riesgo de resistencia son el modo de acción

del fungicida, el número de aplicaciones repetidas, la exclusividad del

tratamiento, la dosis utilizada para cada aplicación y la rotación con otro tipo de

productos (Brent & Hollomon, 2007; Russell, 2008; Bi et al., 2011).

Cualquier cambio que confiera resistencia a los fungicidas también puede

alterar o disminuir la eficiencia de importantes procesos fisiológicos y

bioquímicos. En consecuencia, cuando se presenta resistencia de un patógeno

objetivo a determinada molécula esto puede resultar en un costo de aptitud por

parte del patógeno. Se define el costo de aptitud como la diferencia en la

aptitud entre la cepa de patógeno resistente y la cepa de patógeno sensible en

ausencia del fungicida. Por lo tanto, para determinar los costos de aptitud, es

necesario medir la aptitud de las cepas de patógenos sensibles y resistentes

en el mismo entorno no selectivo (Herrmann & Bucksch, 2014; Walker &

Leroux, 2015).La aptitud general de los patógenos fúngicos de las plantas

puede constar de varios componentes que corresponden a diferentes etapas

del ciclo de vida del patógeno. Estos incluyen, entre otros, la producción de

esporas, la dispersión de esporas, la eficacia de la infección, el crecimiento de

micelios y la capacidad de sobrevivir entre estaciones (Walker & Leroux, 2015).

La evaluación de costos de aptitud asociados a la resistencia en campo suelen

ser bastantes demandantes en términos de recursos y mano de obra, por tal

motivo la evaluación experimental en erlenmeyers y placas de Petri son una

alternativa útil para inferir los costos de aptitud física asociados a resistencia

de fungicidas, ya que requiere mucho menos recursos y se pueden combinar

con análisis de genómica, dando resultados útiles que sirven como herramienta

en el monitoreo de resistencia de cultivos (Walker & Leroux, 2015).

Page 36: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

18 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

En general los estudios de pérdida de sensibilidad se han vuelto un tema de gran

importancia, no solo para la industria de los fungicidas sino también para los

agricultores, las autoridades que reglamentan el uso de fungicidas y todos los

interesados en la producción de cultivos; además, se ha convertido en un paso

fundamental para el registro de cualquier pesticida que quiera incursionar en el

mercado, por tanto el énfasis en este tipo de estudios es de gran valor para el

sector comercial y para los entes reguladores interesados en examinar el

componente de la evaluación del riesgo de resistencia de los nuevos productos.

De igual manera hay un gran impacto en el ámbito técnico/científico en los

estudios de gestión de la resistencia, ya que este tipo de enfoque permite tener

una base para el monitoreo de la aparición de microorganismos tolerantes a

determinadas moléculas y permiten desarrollar estrategias de manejo

adecuadas que contribuyan a la prevención (Russell, 2008; Lu et al., 2011;

Zhang et al., 2015).

Page 37: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

19

Objetivos

2.1. Objetivo general

Establecer una línea base de sensibilidad de P. cinnamomi frente a tres (3)

fungicidas comerciales, y determinar el factor de riesgo en la generación de

resistencia en el patógeno frente a cada una de las formulaciones

comerciales.

2.2 Objetivos específicos

• Evaluar in vitro el grado de sensibilidad de una colección de aislamientos

de Phytophthora cinnamomi frente a tres formulaciones comerciales.

• Determinar el factor de riesgo hacia la generación de resistencia de P.

cinnamomi frente a tres formulaciones comerciales.

• Determinar algunas características fenotípicas asociadas al costo de

aptitud de aislamientos de Phytophthora cinnamomi resistentes a alguna

de las tres formulaciones comerciales de interés.

Page 38: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

20 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

Materiales y métodos

3.1. Colección de aislamientos de Phytophthora

cinnamomi.

Los aislamientos de P. cinnamomi que se emplearon en este trabajo provienen de

la colección biológica MicroCIB (#223) del Registro Nacional de Colecciones

Biológicas del Instituto Von Humboldt. Esta colección fue generada dentro del

proyecto “Desarrollo tecnológico, productivo y comercial del aguacate en

Antioquia”. Los aislamientos seleccionados fueron identificados molecularmente

como Phytophthora cinnamomi en trabajos anteriores (Calle et al., 2020). Los

aislamientos se mantuvieron en papa dextrosa agar (PDA 39 g/L) a 21°C

comprobando su pureza antes de usarlos.

3.2. Evaluaciones de sensibilidad.

Se utilizó la metodología establecida por el FRAC (Broth, 2005) con algunas

modificaciones. El inóculo se obtuvo desde subcultivos frescos de los aislamientos

crecidos durante 10-15 días en medio PDA, el cual se incubó a 23°C ± 2 en

condiciones de oscuridad. Pasado el tiempo de incubación se tomaron discos de

agar de 5 mm de diámetro los cuales se llevaron a caldo papa dextrosa (PDB 24

g/L) y se incubaron por 5 días a temperatura ambiente. Transcurrido el tiempo de

incubación el micelio se maceró y se fragmento con perlas de vidrio en presencia

del medio PDB. La solución resultante se filtró para obtener fragmentos de micelio

uniformes y se ajustó a una concentración final de 5x105 fragmentos de micelio/mL,

luego del conteo en cámara de Neubauer. La evaluación de la sensibilidad de P.

cinnamomi se realizó por medidas de densidad óptica a 595 nm, empleando

microplacas estériles de 96 pozos (de fondo plano con tapa de baja evaporación)

Page 39: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

21

y un lector de microplacas BioRad modelo 680XR a tiempo cero y a los siete días

de haber establecido el ensayo (García et al., 2014). En cada pozo de la microplaca

se adicionaron 100 µL de medio de cultivo PDB, 50 µL de la solución del fungicida

comercial a evaluar y 50 µL de inóculo para un volumen total de 200 µL. Se utilizó

un control positivo el cual tenía 100 µL de medio de cultivo PDB, 50 μL de agua, en

lugar de la solución fúngica y 50 µL de inóculo, además de un blanco con 100 μL

de medio PDB, 50 μL de la solución fúngica y 50 μL de agua. Se realizaron

triplicados de todas las evaluaciones y las placas se incubaron a 23 ± 2 °C en

oscuridad durante 7 días. Los productos y las concentraciones evaluadas se

encuentran en la tabla 1.

Tabla 1. Características de los productos evaluados.

3.3. Establecimiento de la línea base de sensibilidad

para cada formulación comercial.

La línea de base de sensibilidad P. cinnamomi se generó a partir de las

concentraciones efectivas 50 (EC50) obtenidas para cada uno de los 86

aislamientos frente a cada producto. Se aplicó estadística descriptiva para analizar,

por medio de histogramas, el comportamiento poblacional de los aislamientos de

P. cinnamomi (mono o bimodal, curtosis o asimetrías) (Russell, 2008).

Formulaciones comerciales Concentraciones

evaluadas (mg/L)

Pyraclostrobin 250 g/L 100; 10; 1,0; 0,1; 0,01;

0,001; 0,0001 Fosetil Aluminio 800 g/Kg

Metalaxil - M 40g/kg + Mancozeb 640 g/kg

Page 40: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

22 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

3.4. Análisis de resistencia cruzada.

Para comprender los patrones de resistencia cruzada entre pyraclostrobin,

metalaxil/mancozeb y fosetil-Al, se utilizaron los perfiles de sensibilidad de 86

aislamientos de Phytophthora cinnamomi y la resistencia cruzada se analizó

mediante un análisis de correlación lineal de Spearman (Zhang et al., 2015; Hu et

al., 2019).

3.5. Generación de aislamientos de P. cinnamomi

tolerantes a pyraclostrobin 250g/L, Metalaxil - M

40g/kg + Mancozeb 640 g/kg y fosetil-Al 800 g/Kg y

evaluación del factor de riesgo.

Se seleccionaron cinco aislamientos al azar y se sembraron en PDB modificado

con concentraciones indicadas para alcanzar la concentración correspondiente a

la EC90 de cada aislamiento en cada formulación comercial (Fosetil Aluminio 800

g/Kg Metalaxil - M 40g/kg + Mancozeb 640 g/kg y Pyraclostrobin 250 g/L). Estos se

dejaron incubando en oscuridad a 23°C ± 2 durante 7 días, trascurrido este tiempo

los aislamientos se sembraron en PDB sin modificar y se dejaron incubando en

oscuridad a 23°C ± 2 durante 7 días. Cada aislamiento se sembró por triplicado y

este mismo proceso se repitió diez veces para cada uno de los aislamientos, con

el fin de obtener los aislamientos tolerantes a las tres formulaciones comerciales

evaluadas (Zhang et al., 2015; Hu et al., 2020)

Después de 10 transferencias sucesivas los cinco aislados evaluados se

sometieron a las pruebas de sensibilidad utilizando la metodología mencionada

anteriormente. El nivel de resistencia a fungicidas, denominado factor de

resistencia (RF), se calculó como la EC50 del fenotipo de resistencia dividida por

la EC50 del aislado parental sensible (Zhang et al., 2015; Hu et al., 2019).

Page 41: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

23

3.6. Caracterización de aislamientos tolerantes a

pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al.

Para la caracterización de los aislamientos tolerantes se seleccionaron dos

aislamientos por ingrediente activo teniendo en cuenta el valor obtenido para el

factor de riesgo (mayor y menor valor).

3.6.1. Crecimiento micelial de P. cinnamomi.

Se comparó el crecimiento micelial de los 6 aislamientos tolerantes seleccionados

y sus respectivos aislamientos parentales. Para esto se tomaron discos de 5 mm

de diámetro de medio PDA colonizados por cada aislamiento de siete días de

crecimiento y se llevaron al centro de una caja de Petri de 60 x 16 cm que contenían

10 mL de medio PDA. Las cajas se incubaron en oscuridad a 23 ± 2 °C, cada

aislamiento se sembró por triplicado y se midió el crecimiento micelial diariamente.

Para realizar la medición se trazó la margen de cada colonia con un marcador de

punta fina y el diámetro se midió empleando un pie de rey. La medición terminó

cuando el micelio alcanzo el margen de la caja (5 días).

3.6.2. Producción de zoosporangios y liberación de

zoosporas.

Para la producción de zoosporangios, los aislamientos de P. cinnamomi se

colocaron a crecer en agar V8 (50 mL de jugo V8 filtrado, 0,5 g CaCO3 y 15 g de

agar disueltos en un litro de agua destilada) durante 5 días a 23 ± 2 °C en oscuridad.

Se tomaron discos de 5 mm del borde la colonia crecida previamente y se

transfirieron a placas petri de 90 x 60 cm, estos se cubrieron con 25 mL de caldo

V8 al 2% (20 mL de jugo V8 filtrado y 0,2 g CaCO3 disueltos en un litro de agua

destilada). Estas placas se incubaron en oscuridad a una temperatura de 23 ± 2 °C

Page 42: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

24 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

durante tres días. Transcurrido este tiempo el jugo se removió y el micelio se

enjuagó tres veces con agua. Luego los discos se cubrieron con 25 mL de agua de

arroyo filtrada. Este montaje se incubó a temperatura ambiente bajo luz UV durante

2-3 días. Las placas se monitorearon hasta observar la presencia de los

zoosporangios. Los esporangios se contaron utilizando un microscopio óptico a

40x.

Para la liberación de zoosporas los zoosporangios obtenidos se sometieron a un

choque térmico mediante incubación a 4 °C durante 45 minutos. Transcurrido este

tiempo las placas se dejaron a temperatura ambiente por 1 hora para estimular la

liberación de las zoosporas. El conteo de las zoosporas se realizó en cámara de

Neubauer para determinar su concentración. Cada aislamiento evaluado se realizó

por triplicado.

3.6.3. Morfología micelial de aislamientos de P.

cinnamomi tolerantes pyraclostrobin 250g/L, Metalaxil -

M 40g/kg + Mancozeb 640 g/kg y fosetil-Al 800 g/Kg y sus

respectivos aislamientos parentales.

3.6.3.1. Características macroscópicas.

Para las comparaciones de la forma de la colonia, se tomaron discos de 5 mm de

PDA colonizados por cada aislamiento y se ubicaron en cajas de Petri con medio

PDA. Se incubaron a 23 ± 2 °C por 15 días y posteriormente se registró la

morfología como roseta (patrón similar a una flor), estrella (patrón similar a una

estrella) o sin patrón. Para cada aislamiento se hicieron tres repeticiones.

Page 43: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

25

3.6.3.2. Características microscópicas.

Se tomaron fragmentos miceliales de 5 mm del margen de cada colonia con tres

días de crecimiento y se transfirieron a portaobjetos que contenían 1 ml de medio

PDA. Los fragmentos se incubaron en oscuridad a 23 ± 2 °C. Después de 48 horas

se observó la morfología de las puntas de los micelios utilizando un microscopio

óptico a 40x. Se realizaron tres repeticiones por aislamiento.

3.6.4. Permeabilidad de la membrana celular

Se añadieron discos de 5 mm de diámetro de medio PDA colonizados por cada

aislamiento de dos días de crecimiento a 100 mL de medio PDB en un erlenmeyer

de 250 mL y se pusieron en agitación a 175 rpm en un agitador rotatorio. Después

de incubar a 25 °C durante 3 días. Las hifas se recogieron mediante filtración al

vacío a través de tres trozos de papel filtro y se lavaron tres veces con agua

bidestilada, se pesaron 0,3 g de hifas y se suspendieron en 20 mL de agua

bidestilada. Después de 0, 5, 10, 20, 40, 60, 80, 100, 120, 140, 160 y 180 min, se

midió la conductividad eléctrica del agua ultrapura con un medidor de

conductividad eléctrica para evaluar el alcance de la lixiviación del contenido celular

a través de membranas celulares . Después de 180 min, se llevó el micelio durante

5 min a agua en ebullición y se midió la conductividad final. Cada aislamiento se

midió por triplicado. La conductividad relativa (%) se calculó con la expresión: %CR

= (conductividad en cada punto de tiempo / conductividad final) * 100% (Hu et al.,

2020).

Page 44: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

26 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

3.6.5. Pruebas de virulencia de aislamientos tolerantes

a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al y sus

respectivos aislamientos parentales.

Se empleó la metodología de Botha (1989) con algunas modificaciones. Se

obtuvieron plántulas de aguacate Hass de 5 meses de edad. Posteriormente se

seleccionaron raíces nutricionales teniendo en cuenta el buen estado de su ápice.

Las raíces se cortaron en segmentos de 4 cm de largo y se sumergieron en 20 mL

de agua de grifo contenida en tubos plásticos. Se agitaron durante 15 min para

remover el exceso de suelo. Luego, se llevaron al sonicador por 2 min. El agua fue

descartada y se sumergieron en solución de hipoclorito de sodio al 1% durante 1

min. Finalmente, las raíces se lavaron con agua estéril y etanol al 70% durante 1

min, respectivamente. En el centro de una caja de petri que contenía agar agua

(agar-agar 2%) se sembró un fragmento circular de micelio de P. cinnamomi de 2

mm. El fragmento se tomó a partir de cada aislamiento tolerante y sus respectivos

aislamientos parentales crecidos por 10 días en medio de cultivo PDA. Los ápices

de las raíces se colocaron en contacto con el micelio y se incubaron a 23 ± 2°C

bajo condiciones de oscuridad. Se utilizaron cuatro raíces por placa y se realizaron

tres repeticiones por cada aislamiento. Cada caja de Petri fue considerada como

una unidad experimental. El porcentaje de avance de la infección de los

aislamientos de P. cinnamomi se midió a las 48 horas. Para esto, se tomaron todas

las raíces, se desinfectaron con etanol al 70% por 5 segundos y se lavaron con

agua estéril. Posteriormente, cada raíz se cortó en segmentos de 3 mm y sus

fragmentos se sembraron en orden de corte desde el extremo final hasta el ápice

en medio PDA (Merck®) modificado con antibióticos y fungicidas (PDA 39g,

enlate® 0.8 mg/L, Rifampicina SIGMA® 5 mg/L, Ampicilina SIGMA® 250 mg/L,

PCNB SIGMA® 20 mg/L, Hymexazol TACHIGAREN® 30 SL Sumimoto corporation

Colombia 25 mg/L y 1000 mL de agua destilada.) para favorecer en primera medida

el desarrollo de P. cinnamomi. Una vez observada la formación de micelio en cada

uno se los fragmentos de raíz se contaron y se expresaron como segmentos con

crecimiento de P. cinnamomi por raíz. Para cada fragmento de raíz, el porcentaje

Page 45: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

27

de infección fue calculado a partir de la estimación del número de segmentos

infectados respecto el número total de segmentos en la muestra. Posteriormente,

se estimó la media por unidad experimental, y finalmente la media por tratamiento.

Una vez obtenidos los porcentajes de infección se realizó un análisis de varianza y

una prueba de comparación de medias entre los porcentajes de infección de los

aislamientos.

3.7. Análisis estadístico.

Los datos se analizaron usando el software R STUDIO versión 3.5.1 (2018).

Los valores de EC50 para cada aislado se determinaron mediante una regresión

lineal de probit del porcentaje de inhibición relacionado con el control del

crecimiento micelial frente a la transformación log10 para cada una de las siete

concentraciones evaluadas de cada producto comercial. El efecto del desarrollo de

la resistencia a los fungicidas sobre el crecimiento micelial, la producción de

zoosporas y la permeabilidad de la membrana de los aislamientos tolerantes y sus

respectivos aislamientos parentales se estudiaron mediante un análisis de varianza

ANOVA.

Page 46: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

28 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

Resultados

4.1. Evaluaciones de sensibilidad y establecimiento

de la línea base de sensibilidad para cada fungicida

comercial

En este estudio se evaluaron las sensibilidades in vitro de 86 aislamientos de

Phytophthora cinnamomi recolectados de cultivos de aguacate del departamento

de Antioquia, frente a tres formulaciones comerciales: pyraclostrobin, metalaxil +

mancozeb y fosetil-Al.

Pyraclostrobin 250g/L: El valor medio de EC50 de los aislamientos evaluados fue

de 0,0147 ± 0,0046 mg/L; con valores de EC50 que variaron entre 0,00000147 y

0,13 mg/L; con un factor de variación de 88,3. La distribución de frecuencia de los

valores de EC50 para los 86 aislamientos de P. cinnamomi mostró una curva

unimodal con una cola a la derecha. La asimetría de la distribución se debió a la

alta sensibilidad de la mayoría de los aislamientos (Figura 1.).

Page 47: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

29

Figura 1.Distribución de frecuencias de la sensibilidad al pyraclostrobin en

términos de concentración efectiva 50 (EC50) para 86 aislamientos de

Phytophthora cinnamomi.

Mancozeb + Metalaxil: El valor medio de EC50 de los aislamientos

evaluados fue de 0,2703 ± 0,0928 mg/L; con valores de EC50 que variaron

entre 0,000044 y 1,9794 mg/L; con un factor de variación de 49.5 La

distribución de frecuencia de los valores de EC50 para los 86 aislamientos

de P. cinnamomi mostró una curva unimodal con una cola a la derecha

(Figura 2.)

Page 48: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

30 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

Figura 2.Distribución de frecuencias de la sensibilidad al metalaxil +

mancozeb en términos de concentración efectiva 50 (EC50) para 86

aislamientos de Phytophthora cinnamomi.

Fosetil Aluminio: La curva de sensibilidad inicial fue unimodal donde se

nota la disminución en los aislamientos sensibles. El valor medio de EC50

de los aislamientos evaluados fue de 1,992 ± 0,772 mg/L; con valores de

EC50 que variaron entre 0,010 y 22,03 mg/L y un factor de variación de

2138,7 (Figura 3).

Page 49: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

31

Figura 3.Distribución de frecuencias de la sensibilidad al fosetil-Al para 86

aislamientos de Phytophthora cinnamomi.

Estos datos de sensibilidad podrían utilizarse como línea de base para monitorear

el cambio de sensibilidad en aislamientos de Phytophthora cinnamomi frente a las

formulaciones evaluadas pyraclostrobin, metalaxil + mancozeb y fosetil-Al y de esta

manera monitorear cambios que se presentan en la sensibilidad de los aislamientos

a las formulaciones en mención.

4.2. Análisis de resistencia cruzada.

Con base en los valores de EC50 de los 86 aislamientos de P. cinnamomi se calculó

el coeficiente de correlación lineal de Spearman. Entre más cerca de 1 se considera

una correlación lineal. No se detectó resistencia cruzada entre los principios

activos: metalaxil + mancozeb y fosetil-al (R= 0.068); pyraclostrobin y fosetil (R= -

0,067) y pyraclostrobin y metalaxil + mancozeb (R= -0,058) (Figura 4.).

Page 50: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

32 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

Figura 4. Pruebas de correlación de Spearman para resistencia cruzada entre

diferentes ingredientes activos: pyraclostrobin y metalaxil + mancozeb (A),

pyraclostrobin y fosetil-al (B) y metalaxil + mancozeb y fosetil-al (C).

Page 51: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

33

4.3. Generación de aislamientos de P. cinnamomi

tolerantes a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y

fosetil-Al y evaluación del factor de riesgo.

Se seleccionaron cinco aislamientos para evaluar el factor de riesgo a los diferentes

productos evaluados. El factor de riesgo de resistencia (RF) se calculó como la

EC50 del aislamiento tolerante dividida por la EC50 del aislado parental sensible.

Todos los aislamientos seleccionados sobrevivieron a las 10 transferencias en

medio PDB modificado con pyraclostrobin, metalaxil + mancozeb y fosetil-Al. En

general la mayoría de los aislamientos presentaron una resistencia intermedia con

relación a los tres productos evaluados con excepción de ANACBIFE3EPC

metalaxil + mancozeb, ANAMSJFE1EPC pyraclostrobin y ANMALCFE1EPC

fosetil-Al que presentaron una resistencia alta. Según lo reportado por Wu y

colaboradores (Wu et al., 2020), se considera que se presenta resistencia

intermedia cuando el valor del factor de riesgo es inferior a 100 y es una resistencia

alta cuando el valor del factor de riesgo da mayor a 100 (Tabla 2).

Tabla 2.Factor de riesgo para los aislamientos de P. cinnamomi frente a las tres

formulaciones evaluadas

Factor de riesgo

Aislamiento Metalaxil +

mancozeb Pyraclostrobin Fosetil-AL

ANAMIMB3A7 8,53 7,92 2,49

ANAMSJFE1EPC 12,32 570,61 1,85

ANMALCFE1EPC 9,65 11,68 105,54

ANRILEB3A10 42,06 4,42 3,13

ANABCIFE3EPC 1077,50 7,88 6,55

Page 52: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

34 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

4.4. Caracterización de aislamientos tolerantes a

pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al.

4.4.1. Crecimiento micelial de P. cinnamomi.

Las tasas de crecimiento de los aislamientos tolerantes a los diferentes productos

evaluados oscilaron entre 0,33 y 0,41 cm/día, y las de sus respectivos aislamientos

parentales variaron entre 0,38 y 0,41 cm/día. Aunque las tasas de crecimiento de

los aislamientos parentales aparentemente fueron más rápidas, no se presentaron

diferencias significativas con respecto a las tasas de crecimiento de los

aislamientos tolerantes a los diferentes productos evaluados (Figura 5).

Figura 5. Promedio de las tasas de crecimiento de los aislamientos de P.

cinnamomi tolerantes y sus respectivos aislamientos parentales. Tratamientos con

la misma letra no presentan diferencias significativas según el test de

comparaciones múltiples de Tukey con un nivel de significancia de 0,05.

Page 53: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

35

4.4.2. Producción de zoosporangios y liberación de

zoosporas.

En general no se presentaron diferencias significativas entre los aislados

tolerantes a los ingredientes activos evaluados y sus respectivos

aislamientos parentales (Figura 6). En promedio los aislamientos parentales

produjeron alrededor de 31 zoosporangios/mm de agar y los aislamientos

tolerantes a los ingredientes activos evaluados 28 zoosporangios/mm de

agar (Figura 6).

Figura 6. Producción de zoosporangios de los aislamientos de P. cinnamomi

tolerantes a los diferentes productos evaluados y sus respectivos aislamientos

parentales. Tratamientos con la misma letra no presentan diferencias significativas

según el test de comparaciones múltiples de Tukey con un nivel de significancia de

0,05.

Page 54: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

36 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

Con respecto a la concentración de zoosporas, no se presentaron diferencias

significativas entre los aislamientos tolerantes y sus respectivos parentales. En

promedio los aislamientos parentales presentaron una concentración de 1,3x105

zoosporas/mL y los aislamientos parentales de 1,2x105 zoosporas/mL (Figura 7).

Figura 7.Concentración de zoosporas de los aislamientos de P. cinnamomi

tolerantes a los diferentes productos evaluados y sus respectivos aislamientos

parentales. Tratamientos con la misma letra no presentan diferencias significativas

según el test de comparaciones múltiples de Tukey con un nivel de significancia de

0,05.

Page 55: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

37

4.4.3. Morfología micelial de aislamientos de P.

cinnamomi tolerantes a pyraclostrobin,

metalaxil/mancozeb y fosetil-Al y sus respectivos

aislamientos parentales.

4.4.3.1. Características morfológicas

Se realizó la caracterización morfológica de los aislamientos de P.

cinnamomi tolerantes a los ingredientes activos evaluados y sus respectivos

aislamientos parentales. Los aislamientos parentales ANMALCFE1EPC y

ANAMSJFE1EPC presentaron un patrón de roseta (forma de flor) mientras

que el aislamiento ANABCIFE3EPC no presentó patrón. Los aislamientos

tolerantes a pyraclostrobin no presentaron un patrón definido mientras que

los aislamientos tolerantes a fosetil-Al presentaron patrón de roseta (Figura

8).

Figura 8. Características morfológicas del aislamiento de Phytophthora cinnamomi.

ANMALCFE1EPC. A) aislamiento parental, B) tolerante a pyraclostrobin, C)

tolerante a fosetil-al y D) tolerante a metalaxil + mancozeb.

4.4.3.2. Características microscópicas.

Las observaciones en el microscópico de luz indicaron que no se presentaron

cambios en las estructuras del micelio (Figura 9).

Page 56: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

38 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

Figura 9. Características microscópicas del aislamiento de Phytophthora cinnamomi.

ANMALCFE1EPC. A) aislamiento parental, B) tolerante a pyraclostrobin, C) tolerante a

fosetil-al y D) tolerante a metalaxil + mancozeb.

Page 57: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

39

4.4.4. Permeabilidad de la membrana celular.

La permeabilidad de la membrana celular estuvo representada por la conductividad

relativa del agua destilada que contenía micelios. En general los aislamientos

tolerantes a los diferentes ingredientes activos presentaron una reducción en la

permeabilidad de la membrana celular con respecto a lo aislamientos parentales.

Igualmente, la permeabilidad mostró que la fuga de electrolitos de la membrana

celular del micelio aumentó en los aislamientos tolerantes. Esto podría indicar

daños en la estructura de la membrana. Sin embargo, aunque existen diferencias

visuales no se observaron diferencias estadísticamente significativas en la

permeabilidad de la membrana celular de los aislamientos tolerantes frente a sus

respectivos aislamientos parentales (Figura 10).

Page 58: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

40 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

Figura 10. Conductividad relativa de aislamientos parentales y aislamientos

tolerantes de P. cinnamomi a los diferentes ingredientes activos. A)

ANAMSJFE1EPC. B) ANMALCFE1EPC y C) ANABCIFE3EPC.

Page 59: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

41

4.4.5. Pruebas de virulencia de aislamientos tolerantes

a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-Al y sus

respectivos aislamientos parentales.

En general para todos los aislados parentales se encontró una mayor colonización

de las raíces evaluadas con respecto a los tolerantes. Se presentaron diferencias

significativas entre los aislamientos parentales ANAMIMB3A7 y ANAMSJFE1EPC

y sus respectivos aislamientos tolerantes a metalaxil/mancozeb. Igualmente se

presentaron diferencias significativas entre los aislamientos parentales

ANMALCFE1EPC y ANRILEB3A10 y sus respectivos aislamientos tolerantes a

todos los ingredientes activos evaluados. Por otra parte, no se presentaron

diferencias significativas entre el aislamiento ANABCIFE3EPC y sus respectivos

aislamientos tolerantes. Todos los aislamientos evaluados tuvieron la capacidad de

infectar las raíces de aguacate, utilizando la metodología empleada (Figura 11.).

Figura 11. Porcentaje de infección de los aislamientos de P. cinnamomi tolerantes

a los diferentes productos evaluados y sus respectivos aislamientos parentales.

Tratamientos con la misma letra no presentan diferencias significativas según el

test de comparaciones múltiples de Tukey con un nivel de significancia de 0,05.

Page 60: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

42 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

Discusión

5.1. Perfiles y línea base de sensibilidad.

En este estudio se evaluaron las sensibilidades in vitro de 86 aislamientos de

Phytophthora cinnamomi recolectados de cultivos de aguacate del

departamento de Antioquia, frente a tres formulaciones comerciales:

pyraclostrobin, metalaxil + mancozeb y fosetil-Al. Se establecieron líneas bases

de sensibilidad para pyraclostrobin ya que es un ingrediente activo que no se

ha utilizado en el control de P. cinnamomi en cultivos de aguacate y para la

formulación de Metalaxil + mancozeb y la formulación de fosetil- AL, ya que a

pesar de que son formulaciones que se utilizan comúnmente para el control de

pudrición radicular causada por Phytophthora cinnamomi en cultivos de

aguacate, actualmente no hay reportes que nos permitan comparar sobre las

sensibilidades de estos productos. El número de aislamientos utilizados en este

estudio superó los límites (50 aislamientos) sugeridos para establecer la

sensibilidad inicial de una población de hongos (Russell, 2008).

En general se observó una distribución unimodal de las distribuciones de

frecuencia con una cola a la derecha. Las colas que se presentan en las

distribuciones de frecuencia muestran la tendencia del comportamiento del

fungicida y estas se pueden interpretar como la tendencia que tiene el producto

a generar cierta resistencia en el patógeno objetivo. Según Rusell y

colaboradores, (Russell, 2008) las colas de la derecha de las distribuciones de

sensibilidad de la línea base no necesariamente implican altos riesgos para el

desarrollo de resistencia. Esta tendencia a la derecha pueden reflejar las

distribuciones naturales de los valores de EC50 del fungicida (Russell, 2008;

Zhang et al., 2020).

Page 61: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

43

El valor medio de EC50 para el producto fosetil- AL fue de 1,992 mg/L, la

distribución de los valores de EC50 para los aislamientos tuvo un rango amplio

que se representó por un factor de variación de 2138,7. Además, se observaron

los valores de EC50 más altos (Figura 3). Esto podría deberse a que el fosetil-

AL es una molécula que aunque influye en el metabolismo de los aminoácidos

dentro del patógeno, su principal modo de acción es estimular las respuestas

de defensa en las plantas, lo que estaría llevando a que el efecto del producto

no sea directamente sobre el patógeno si no que tenga una participación mayor

dentro del sistema de la planta (Coffey, 1985; Thomidis, 2001; Brown et al.,

2004;). Sin embargo, otros estudios han demostrado que los aislados de P.

cinnamomi tienen una menor sensibilidad al fosfito después de una exposición

prolongada, es por esto que se debe dar seguimiento en el tiempo para evaluar

los cambios de sensibilidad ( Duvenhage, 1994; Dobrowolski et al., 2008; Ma &

McLeod, 2014). Idealmente, un seguimiento en el tiempo de un principio activo

sobre en un patógeno determinado debería realizarse cada año, dependiendo

del ciclo del cultivo, y en general de las características del patosistema (Brent &

Hollomon, 2007; Russell, 2008). Sin embargo, el cultivo sucesivo de un

microorganismo patógeno a concentraciones subletales de un determinado

principio activo se ha utilizado ampliamente en la literatura con el fin de estimar

que posible riesgo que podría presentar este principio activo en términos de

resistencia a futuro (Bi et al., 2011; Kuang et al., 2011; Billard et al., 2012;

Avenot & Michailides, 2015; Grimmer et al., 2015; Mao et al., 2018; Qu et al.,

2018; Avenot et al., 2019; Rossi et al., 2021)

Con respecto a la formulación de metalaxil + mancozeb se presentó un valor

medio de EC50 de 0,2703 ± 0,0928 mg/L. Los valores de EC50 variaron entre

0,000044 y 1,9794 mg/L y presentaron un factor de variación de 49,5. Aunque

la aparición de microrganismos resistentes a metalaxil se ha evidenciado en

otras especies de Phytophthora como P. infestans y P. capsici debido a la alta

presión de selección ejercida por el uso continuo de dicha molécula (Cohen &

Coffey, 1986; Brent & Hollomon, 2007), aún no se han encontrado reportes de

Page 62: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

44 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

aislamientos de P. cinnamomi resistentes a metalaxil en cultivos de aguacate.

Esto puede deberse a que gracias a estudios que han evaluado la aparición de

resistencia en otras especies de Phytophthora al metalaxil, se han podido tomar

decisiones sobre el uso de metalaxil en el control de oomycotas. Prueba de ello

es que actualmente el metalaxil no se aplica solo, si no que se aplica en una

mezcla con mancozeb, el cual tiene acción protectante y su modo de acción es

de múltiples sitios, lo que busca reducir el riesgo de la aparición de resistencia

(More, 1963).

Los 86 aislamientos presentaron los valores de EC50 más bajos a la

formulación compuesta por pyraclostrobin con un valor promedio de 0,0147

mg/L y un factor de variación de 88,3. La distribución de frecuencia mostró una

curva unimodal (Figura 1) con una cola a la derecha. La asimetría de la

distribución se debe a la alta sensibilidad de la mayoría de los aislamientos. Los

fungicidas QoI como azoxistrobina, kresoxim-metil, trifloxistrobina,

pyraclostrobin, picoxistrobina y metominostrobina son bien conocidos por sus

elevadas actividades frente a una amplia gama de patógenos pertenecientes a

los oomycotas, ascomicetos y basidiomicetos (Wang et al., 2014).

Pyraclostrobin es un fungicida sistémico perteneciente a las estrobilurinas, de

modo de acción en un único sitio. Este principio activo se une al complejo lll que

participa en la respiración mitocondrial y bloquea la trasferencia de electrones,

lo que resulta en la inhibición de la producción reducida de ATP. Desde que

está molécula se introdujo al mercado de los fungicidas, ha sido ampliamente

utilizada en la protección de cultivos ( Xu et al., 2014; Liang et al., 2015). Aunque

pyraclostrobin es una molécula considerada como de alto riesgo de resistencia,

se puede utilizar si se tiene un adecuado plan de control y de rotación, es por

esto que los valores obtenidos en este estudio se pueden utilizar como la línea

base de sensibilidad para monitorear el cambio de sensibilidad de P. cinnamomi

en Antioquia. La implementación de formulaciones a base de pyraclostrobin en

el control de la pudrición radicular es viable, pero se deben realizar monitoreos

Page 63: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

45

de sensibilidad periódicamente, rotar con productos que tengan un modo de

acción diferente y no exceder el número de aplicaciones por temporada,

además de la implementación de variedades de cultivos resistentes a

enfermedades, rotaciones de cultivos y agentes de control biológico. (Granados

& Valencia, 2018; Huang et al., 2019; Vitale et al., 2019; Rossi et al., 2021).

El establecimiento de la sensibilidad de referencia a los fungicidas sienta las

bases para diseñar estrategias de manejo de la resistencia y es esencial para

su posterior monitoreo. Aunque no se ha establecido el rango en el que una

población es sensible o resistente a determinado producto, las evaluaciones

iniciales de sensibilidad sirven como herramienta para monitorear los cambios

en la sensibilidad y establecer las estrategias de manejo que se deben dar a

determinadas moléculas. Además, la determinación de la sensibilidad y su

seguimiento en el tiempo permite evaluar el posible riesgo que existe en la

generación de resistencia. Por tal motivo, es importante realizar monitoreos de

sensibilidad en el tiempo para determinar los cambios que se presentan en la

población frente a determinado producto (Zhang et al., 2015; Di et al., 2016;

Huang et al., 2019; Chen et al., 2020).

5.2 Resistencia Cruzada.

Uno de los criterios importantes para implementar un adecuado plan de control

de enfermedades es evaluar la resistencia cruzada. La resistencia cruzada es

común entre fungicidas que pertenecen a la misma clase química y comparten

un modo de acción similar. A veces, esta es solo parcial, aunque las diferencias

generalmente no son lo suficientemente grandes como para causar problemas

en la evaluación de riesgos. La resistencia cruzada negativa es un factor

potencialmente importante en la evaluación de riesgos. La exposición de

patógenos a dos fungicidas que exhiben esta resistencia cruzada negativa

debería reducir en gran medida cualquier riesgo de resistencia asociado con

cualquiera de los componentes, ya que en caso de aparecer resistencia a una

Page 64: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

46 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

molécula en particular es poco probable que esas poblaciones resistentes sean

también al otro principio activo. (Gisi et al., 1997; Gisi et al., 2000; Xu et al.,

2014). En este estudio no se presentó resistencia cruzada entre

metalaxil/mancozeb y fosetil-al, pyraclostrobin y fosetil y pyraclostrobin y

metalaxil /mancozeb (Figura 4).

Cada una de los principios activos probados en este estudio tiene un modo de

acción único a nivel bioquímico. Pyraclostrobin inhibe la respiración mitocondrial

al bloquear la transferencia de electrones en el complejo citocromo bc1 (Liang

et al., 2015). El área objetivo bioquímica del fosetil-Al es el metabolismo de los

aminoácidos, al tiempo que estimula las respuestas de defensa de las plantas

(Coffey, 1985). Por su parte, las fenilamidas, incluido el metalaxil, interfieren con

la síntesis de ARN de los microorganismos objetivo (Thomidis, 2001). Cada

compuesto tiene un modo de acción diferente, por lo tanto, estas moléculas

podrían incorporarse en un programa de manejo de enfermedades que podría

minimizar el riesgo de desarrollo de resistencia por varias especies de

Phytophthora, incluida P. cinnamomi, y prolongar la vida efectiva de los

fungicidas. Al mismo tiempo se podría maximizar el control de enfermedades,

como en el caso de Phytophthora infestans donde la mezcla de un fluopicólido

y piraclostrobina ha mostraron una buena actividad protectora y curativa en

cultivos de papá, además de una larga duración de eficacia de estos productos

frente al patógeno (Matheron et al., 2000; Wang et al., 2014).

5.3 Evaluación del factor de riesgo.

Por muchos años la industria agrícola se viene enfrentando a problemas derivados

del desarrollo de resistencia en fitopatógenos de cultivos frente a los principios

activos empleados para su control. La evaluación del riesgo de resistencia a

fungicidas es esencial para prevenir o retrasar el desarrollo de resistencia a

fungicidas y se centra principalmente en el establecimiento de la línea base,

selección de mutantes resistentes y evaluación del nivel de resistencia de los

mutantes (O’Brien et al., 2020; Wu et al., 2020).

Page 65: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

47

En este estudio se buscó simular la presión de selección que se genera en el campo

cuando se realizan aplicaciones extensas del mismo producto lo que da como

resultado la supervivencia de los aislamientos resistentes. Se empleó la evolución

experimental, realizando subcultivos sucesivos en medios con concentraciones

subletales de cada formulación. El cultivo continuo es un contexto que sirve para el

modelamiento de cambios que se pueden presentar en determinados organismos,

en este caso nos ayuda a comprender cómo se podría comportar la población de

P. cinnamomi al ser sometida a la presión de los productos. Debido a que los cinco

aislamientos seleccionados para realizar estas pruebas sobrevivieron a las diez

transferencias en medio modificado, se pudo inferir que estos aislamientos son los

resistentes que podrían sobrevivir en campo a la aplicación de las formulaciones

evaluadas en este estudio y así poder determinar el riesgo de resistencia que

podrían tener los aislamientos de P. cinnamomi en el campo (Herring et al., 2006;

Buckling et al., 2009; Gresham & Dunham, 2014).

La evaluación del riesgo de resistencia a fungicidas es esencial para monitorear y

gestionar el desarrollo de resistencia a fungicidas en el campo. El primer paso es

establecer una sensibilidad de referencia para las poblaciones de patógenos que

contiene una gran cantidad de aislamientos (Lucas et al., 2015; Lucas, 2017; Zhou

et al., 2019). Hasta la fecha solo unos cuantos estudios relativamente completos

han descrito la sensibilidad de P. cinnamomi frente a los ingredientes activos

evaluados en este estudio. Lo anterior motivo la determinación del factor de riesgo

hacia la generación de resistencia de P. cinnamomi frente a pyraclostrobin,

metalaxil + mancozeb y fosetil-al. Según lo expresado por Wu y colaboradores

(Wu et al., 2020) se presenta una resistencia intermedia cuando el valor del factor

de riesgo es inferior a 100 y se considera resistencia alta cuando el valor del factor

de riesgo es mayor que 100 (Wu et al., 2020). Teniendo en cuenta esto, en general

todos los aislamientos presentaron una resistencia intermedia a los diferentes

ingredientes activos evaluados, con excepciones de ANACBIFE3EPC metalaxil +

Page 66: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

48 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

mancozeb, ANAMSJFE1EPC pyraclostrobin y ANMALCFE1EPC fosetil-Al que

presentaron una resistencia alta.

Aunque la mayoría de los aislamientos evaluados presentaron una resistencia

intermedia a los ingredientes activos evaluados se debe dar seguimiento al

comportamiento de estos, ya que, dichas moléculas tienen un único sitio de acción,

estas tienden a tener un mayor riesgo aumentar la resistencia que se puede

presentar por parte de los patógenos objetivos. Por ejemplo, la resistencia de

Phytophthora infestans y Phytophthora capsici al metalaxil ya ha sido reportada.

Esta resistencia se atribuye a la alta presión de selección ejercida por el uso

continuo de dichas moléculas que tienen un único sitio de acción, (Coffey, 1984;

Thomidis, 2001; Brent & Hollomon, 2007; Bi et al., 2011; Sena et al., 2018). De

igual manera Ma (2018) y colaboradores caracterizaron los aislados de campo

resistentes a la azoxistrobina de P. capsici detectados en invernaderos comerciales

de pimiento en el sur de China (Ma et al., 2018). La azoxistrobina es un fungicida

de tipo QoL este tiene un único mecanismo de acción, donde la molécula se unen

al centro del complejo citocromo bc1, que inhibe la respiración mitocondrial y

bloquea la cadena de transporte de electrones, resultando en el agotamiento del

trifosfato de adenosina (ATP). Sin embargo, el gen del citocromo b (cytb) codificado

por el ADN mitocondrial tiene una alta frecuencia de mutación, lo que facilita el

desarrollo de resistencia a los inhibidores externos de quinonas (QoI) (Ma et al.,

2018). Otro fungicida ampliamente utilizado es el benzimidazol (carbendazim),

empleado para el control de la antracnosis de la fresa y la uva, este ya ha reportado

resistencia e incluso hay países donde se ha prohibido su uso ( Xu et al., 2014; Di

et al., 2016). Otros fungicidas que han generado resistencia en varios

macroorganismos son los Inhibidores de la Succinato deshidrogenasa (SDHI). En

ese sentido, el FRAC clasificó a los fungicidas SDHI como de riesgo medio a alto

con respecto al desarrollo de resistencia. Por ejemplo estudios sobre Alternaria

alternata indican que el boscalid que es un fungicida de tipo SDHI es propenso al

desarrollo de resistencia (Avenot & Michailides, 2015; Avenot et al., 2019).

Page 67: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

49

5.4 Caracterización biológica de aislamientos

tolerantes a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y

fosetil-Al.

El desarrollo y la propagación de la resistencia a los fungicidas depende de la

idoneidad de los aislados resistentes y el conocimiento de procesos como la

diversidad, la evolución de procesos de apareamiento y la presión del fungicida

estos son fundamentales para intentar prevenir y controlar mejor las enfermedades.

Para ello, es importante comprender cómo la aptitud da forma a la selección de

individuos en la naturaleza bajo diferentes presiones de selección (Walker &

Leroux, 2015). En este estudio se determinaron las características que reflejan de

manera más completa la viabilidad biológica para competir en las mismas

condiciones. Se evaluaron las capacidades de crecimiento, producción de

zoosporangios y zoosporas, permeabilidad de la membrana y pruebas de virulencia

comparando los aislamientos tolerantes a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y

fosetil-Al y sus respectivos aislamientos parentales. En general no se presentaron

diferencias estadísticamente significativas entre la capacidad de los aislamientos

de P. cinnamomi tolerantes y sus respectivos parentales para crecer y generar

estructuras de resistencia. Esta adaptabilidad sugiere que los aislamientos

tolerantes tienen la capacidad de sobrevivir en una población de campo (Qu et al.,

2018; Mei et al., 2019; Wu et al., 2020). Estos resultados proponen que la tolerancia

a los diferentes ingredientes activos no tiene efecto sobre la capacidad de los

aislamientos para crecer y generar estructuras de reproducción en un ambiente

natural. Lu y colaboradores (2011) habían obtenido resultados similares cuando

evaluaron la aptitud biológica de aislamientos de Phytophthora capsici tolerantes a

fluopicolido, donde los mutantes resistentes de P. capsici mostraron una fuerte

adaptación en diferentes etapas del ciclo de vida incluido el crecimiento micelial, la

esporulación, la germinación y la virulencia (Lu et al., 2011). De igual manera Zhou

y su equipo (2016) determinaron que no había un costo de aptitud en mutantes

Page 68: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

50 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

resistentes a azoxistrobina de Peronophythora litchii, donde la aptitud in vitro se

comparó con la de sus aislamientos parentales sensibles, por lo cual se concluyó

en este caso que la resistencia a azoxistrobina no tenía efecto sobre la viabilidad

biológica de los mismos (crecimiento micelial, producción y germinación de

esporangios, libración y germinación de zoosporas). Otro caso similar se presentó

con Rhizoctonia cerealis donde no se observó ninguna penalización de aptitud

entre los mutantes resistentes a tifluzamida de R. cerealis y sus respectivos

aislamientos parentales (Zhang et al., 2015). Caso contrario se observa para

aislamientos resistentes a fludioxonil de Sclerotinia sclerotiorum donde la tasa de

crecimiento radial, la producción de esclerocios y la patogenicidad fueron menores

para los mutantes resistentes al fludioxonil que para los aislamientos parentales

sensibles por lo tanto, Hu y su equipo (2019) infirieron que si se llevan a campo,

las cepas resistentes al fludioxonil tendrán una viabilidad biológica reducida y es

posible que no sobrevivan (Hu et al., 2019).

El hecho de que los aislamientos tolerantes hayan presentado una aptitud similar

a la de sus aislamientos parentales indica que puede haber un riesgo de resistencia

inherente a los ingredientes activos aquí evaluados (metalaxil/mancozeb, fosetil-al

y pyraclostrobin). Ya que estos resultados sugieren que los mutantes resistentes

seguirán siendo competitivos y tendrán una buena capacidad para sobrevivir en

una población de campo.

Con respecto a la capacidad de generar infección, algunos aislamientos tolerantes

mostraron una aptitud más baja en comparación con los aislamientos parentales,

lo que podría sugerir que los aislamientos tolerantes que sobrevivan en condiciones

de campo, tendrán limitación para generar infección en las raíces como lo

describen Bardas y colaboradores (2008) en el concepto de fitness o costo de

aptitud (Bardas et al., 2008; Molaei et al., 2020). Los resultados del presente trabajo

indican que la tolerancia a los diferentes ingredientes activos tiene un efecto sobre

la capacidad de los aislamientos de generar infección. Esto sugiere que habría un

costo asociado a la generación de tolerancia a los diferentes ingredientes activos,

lo que conllevaría un menor riesgo en la generación de aislamientos resistentes en

Page 69: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

51

campo. Sin embargo, se debe considerar que está comprobado que los hongos, y

en general los microorganismos, pierden la capacidad de infectar sus determinados

hospederos cuando se subcultivan sucesivamente en medios artificiales, ya que

las cepas pueden diferir en la estabilidad cuando se mantienen en medios

artificiales, provocando en los aislamientos la disminución en la capacidad de

producción de esporas o la capacidad para producir infección en el hospedero

(Samsinakova & Kalalova, 1983; Butt et al., 2006).

Esta pérdida de virulencia ha sido ampliamente estudiada en hongos

entomopatógenos, ya que estos son utilizados principalmente para el control

biológico de plagas y enfermedades. Por ejemplo, se han reportado perdidas en la

capacidad de infectar y en la producción de conidios de aislamientos de Beauveria

bassiana, Verticillium Lecani y Metarhizium anisopliae luego de varios subcultivos

y sin la interacción con el hospedante ( Samsinakova & Kalalova, 1983;

Brownbridge et al., 2001)

De igual manera se ha evidenciado la perdida en la capacidad de infectar en

microorganismos fitópatogenos. Staub y colaboradores (1979) evaluaron la

capacidad de aislamientos de P. infestans para sobrevivir a fungicidas de

Acilalanina, 18 de los aislamientos evaluados tuvieron perdida de virulencia cuando

se habían realizado 7 subcultivos en concentraciones subletales del producto

(Graham, 1986). Igualmente se ha presentado la perdida de virulencia en

Phytophthora megasperma en las razas 2 y 3 donde se presentó variación en la

virulencia cuando se realizaron siembras sucesivas en medio artificial (Rutherford,

1985). Debido a que la perdida de virulencia ha sido ampliamente reportada se

debería esclarecer si la disminución en la capacidad de infectar raíces presentada

en los aislamientos tolerantes está en realidad asociada a un costo de aptitud o se

debe a una pérdida natural por las transferencias sucesivas que sufrieron los

aislamientos tolerantes.

En general los resultados obtenidos para las características de aptitud evaluadas

en los aislamientos tolerantes, indican que hay un riesgo de resistencia inherente

Page 70: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

52 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

al pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb y fosetil-al en P. cinnamomi, ya que estos

aislamientos tienen todas las capacidades de crecer, reproducirse y sobrevivir en

una población de campo (Billard et al., 2012; Bittner et al., 2017; Hu et al., 2019).

El conocimiento de los costos de aptitud es crucial para predecir la efectividad y

optimizar las estrategias de control de enfermedades basadas en combinaciones

de fungicidas, incluidas mezclas, alternancias y recambio dinámico de mezclas.

Estos resultados resaltan la necesidad de desarrollar e implementar estrategias de

manejo anti resistencia para retrasar la aparición de cepas resistentes en huertos

donde no se ha desarrollado resistencia o para retrasar o detener la selección y

evolución de aislamientos resistentes a diferentes fungicidas. Las moléculas

evaluadas en el presente trabajo se pueden utilizar en un plan integrado de manejo

de productos, donde se limite el uso de las dosis, número de aplicaciones por

temporada, aplicaciones preventivas, así como estrategias complementarias como

la implementación de material vegetal tolerante y agentes de control biológico

(Zhang et al., 2018; Zhou et al., 2019). Por tales motivos, es esencial realizar el

monitoreo independiente de las sensibilidades a metalaxil/mancozeb, fosetil-al y

pyraclostrobin en P. cinnamomi. Lo ideal para un monitoreo confiable es tomar

muestras dos veces al año antes del uso de productos sistémicos y después de su

múltiple uso mientras se considere que la sensibilidad esta estable. Posteriormente,

se puede realizar pruebas de monitoreo cada año, con el fin de detectar cualquier

variación en la sensibilidad que pueda resultar en fallas de control (Brent &

Hollomon, 2007; Russell, 2008).

Estos estudios de sensibilidad, evaluación del riesgo y aptitud son importantes para

futuros programas de monitoreo de la resistencia de Phytophthora cinnamomi y a

la vez que se profundizará en la comprensión de los efectos de los diferentes

ingredientes activos aquí evaluados sobre los aislamientos de Phytophthora

cinnamomi. Además, los resultados acá obtenidos sirven como herramientas de

apoyo para el agricultor a la hora de implementar sus planes de control.

Page 71: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

53

Conclusiones y recomendaciones

6.1. Conclusiones

• Los perfiles de sensibilidad podrían utilizarse como línea de base para

monitorear el cambio de sensibilidad en aislamientos de Phytophthora

cinnamomi frente a las formulaciones evaluadas pyraclostrobin, metalaxil +

mancozeb y fosetil-Al en el departamento de Antioquia.

• El pyraclostrobin puede utilizarse como una formulación complementaria para

el control de Phytophthora cinnamomi en aguacate, siempre y cuando se

acompañe con un programa de seguimiento a la posible pérdida de sensibilidad.

• No se encontró un costo de aptitud en relación con el crecimiento micelial,

producción de zoosporangios, producción de zoosporas y permeabilidad de la

membrana relacionado con la tolerancia a pyraclostrobin, metalaxil/mancozeb

y fosetil-al y sus respectivos aislamientos parentales.

6.2. Recomendaciones

Se recomienda hacer mediciones independientes de las sensibilidades a

metalaxil/mancozeb, fosetil-al y pyraclostrobin en Phytophthora cinnamomi en el

tiempo para evaluar los cambios que estos puedan presentar teniendo en cuenta

las líneas base de sensibilidad desarrolladas en este estudio. También sería

Page 72: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

54 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

importante investigar los mecanismos moleculares que gobiernan la resistencia a

los diferentes ingredientes activos evaluados. Otro aspecto que podría develar

información importante sería verificar variabilidad genética y su correlación con la

aparición de tolerancia. Entre otras perspectivas para dar continuidad al presente

trabajo se podría determinar otras características de crecimiento que puedan influir

en la aptitud del patógeno como el crecimiento a diferentes temperaturas y la

capacidad osmótica de la célula. Así mismo, sería útil evaluar los aislamientos

tolerantes en condiciones de vivero para determinar su comportamiento y

agresividad sobre plantas intactas.

Page 73: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

55

Anexo: Valores de EC50 obtenidos para los 86 aislamientos de Phytophthora cinnamomi frente a los tres ingredientes activos evaluados.

Metalaxil/Mancozeb.

Aislamiento EC50 SD

ANERECFE2EPC 0,000417 ± 0,0001

ANEPLAFE1EPC 0,4832 ± 0,0811

ANAMIMB4A6 0,0271 ± 0,0084

ANABCIFE3EPC 0,00029 ± 0,0001

ANSPEBB5A2 0,0011 ± 0,0003

ANJABVB3A10 0,0013 ± 0,0002

ANABTEF1EPC 1,2041 ± 0,3562

ANAMIMB5A2 0,0155 ± 0,0029

ANRILEB3A10 0,0028 ± 0,0005

ANMALCFE1EPC 0,0365 ± 0,0005

ANAMIMFE1EPCP 0,0023 ± 0,0159

ANAMIMB3A7 0,0274 ± 0,0250

ANAMSJFE3EPC 0,0245 ± 0,0015

ANAMIMB4A2 0,0183 ± 0,0035

ANEREGB2A4 0,0231 ± 0,0082

ANRILEB4A7 0,000044 ± 0,0000

ANAMIMB5A3 0,0000 ± 0,0000

ANEREGB3A2 0,0047 ± 0,0012

ANAMIMB4A7 0,0160 ± 0,0105

ANAMSJFE1EPC 0,0404 ± 0,0047

ANSVLMFE2EPC 0,0084 ± 0,0024

ANEPLAB3A1 0,0812 ± 0,0334

ANSPEBFE2EPC 0,2346 ± 0,1132

ANMALNFE3EPC 0,0676 ± 0,0184

ANJABVB6A1 0,2165 ± 0,0524

ANCVLCFS3EPC 0,3063 ± 0,2268

ANSVALFS1EPC 0,1401 ± 0,0358

ANJABVFE2EPC 0,0360 ± 0,0134

ANRILG4 0,0181 ± 0,0071

ANMAPEFE1EPC 0,3979 ± 0,1590

ANEPLAB2A9 0,0467 ± 0,0186

ANAMSJFS2EPC 0,1395 ± 0,1916

Page 74: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

56 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

ANAMIMB5A5 0,0156 ± 0,0026

ANSVVSFS1EPC 0,0591 ± 0,0143

ANRILEFE2EPC 0,1595 ± 0,0442

ANJABVFE3EPC 0,0316 ± 0,0077

ANSVALFE1EPC 0,0249 ± 0,0205

ANAMIMB4A10 0,0169 ± 0,0012

ANAMIMB6A3 0,1835 ± 0,0566

ANEREGB2A6 0,0866 ± 0,0456

ANSPEBB5A3 0,0900 ± 0,0454

ANERECFE3EPC 0,1291 ± 0,1291

ANJABVB2A2 0,0979 ± 0,0645

ANAMIMB6A6 0,1835 ± 0,0566

ANRR84 0,0194 ± 0,0119

ANAMSJFE2EPC 1,2607 ± 1,6844

ANEREGB2A9 0,2324 ± 0,0324

ANRILG3 0,0521 ± 0,0072

ANRILG2 0,7563 ± 0,1127

ANRILG1 1,0679 ± 0,1446

ANSS07 0,0022 ± 0,0011

ANRILGFE3EPC 0,0399 ± 0,0099

ANRILGFE2EPC 0,1986 ± 0,0389

ANAMIMB1A10 0,1152 ± 0,0427

ANRILEB2A6 0,9533 ± 0,2497

ANSPCSFE1EPC 1,1017 ± 0,2732

ANAMIMB3A1 0,1729 ± 0,0467

ANMA104 1,0885 ± 0,5389

ANSPCSFE3EPC 1,2258 ± 0,3530

ANMALCFE2EPC 0,1645 ± 0,0075

ANEREGFE2EPC 0,6363 ± 0,1235

ANSVMOFE2EPC 0,2836 ± 0,0544

ANSSLAFE1EPC 1,9794 ± 0,4729

ANERMAFE2EPC 1,0935 ± 0,4361

ANEREGB4A5 0,2282 ± 0,0419

ANCVLCFS2EPC 0,0201 ± 0,0024

ANRILG5 0,5469 ± 0,0853

ANSS007 0,2755 ± 0,0177

ANSPCSFE2EPC 0,1871 ± 0,0219

ANCVLCFS2EPC 0,0201 ± 0,0024

ANSVLEFS1EPC 1,0076 ± 0,0744

ANSVLEFE1EPC 0,6786 ± 0,0744

ANEREGB1A6 0,3015 ± 0,1882

ANEREGB4A3 1,1254 ± 0,5793

ANRILGFE2EPC 0,1986 ± 0,0389

Page 75: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

57

ANRILGFE3EPC 0,1418 ± 0,0199

ANEPLAB1A3 0,1482 ± 0,0270

ANEPLAB4A6 0,1396 ± 0,0205

ANAMIMB4A5 0,2078 ± 0,0871

ANABTEFE2EPC 0,1381 ± 0,0372

ANRN92 0,0980 ± 0,0148

ANRILEB6A9 0,1564 ± 0,0072

ANAMIMB1A7 0,1000 ± 0,0010

ANJABVFE1EPC 0,0640 ± 0,0079

ANAMIMB6A7 0,2078 ± 0,0871

ANEPLAB6A7 0,1137 ± 0,0233

Pyraclostrobin.

Aislamiento EC50 ± SD

ANERECFE2EPC 0,00072 ± 0,0003

ANEPLAFE1EPC 0,02190 ± 0,0086

ANAMIMB4A6 0,00153 ± 0,0012

ANABCIFE3EPC 0,00454 ± 0,0025

ANSPEBB5A2 0,00095 ± 0,0003

ANJABVB3A10 0,01224 ± 0,0017

ANABTEFE1EPC 0,00193 ± 0,0019

ANAMIMB5A2 0,00545 ± 0,0009

ANRILEB3A10 0,02687 ± 0,0041

ANMALCFE1EPC 0,08038 ± 0,0054

ANAMIMFE1EPCP 0,01559 ± 0,0055

ANAMIMB3A7 0,01853 ± 0,0095

ANAMSJFE3EPC 0,00386 ± 0,0017

ANAMIMB4A2 0,00049 ± 0,0003

ANEREGB2A4 0,13000 ± 0,0259

ANRILEB4A7 0,00015 ± 0,0001

ANAMIMB5A3 0,00234 ± 0,0022

ANEREGB3A2 0,00043 ± 0,0001

ANAMIMB4A7 0,00003 ± 0,0000

ANAMSJFE1EPC 0,00038 ± 0,0001

ANSVLMFE2EPC 0,00000147 ± 0,0000

ANSPEBFE2EPC 0,00329 ± 0,0020

ANMALNFE3EPC 0,02614 ± 0,0065

ANCVLCFS3EPC 0,02954 ± 0,0051

ANSVALFS1EPC 0,02640 ± 0,0070

ANJABVB6A1 0,01754 ± 0,0122

Page 76: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

58 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

ANCVLCFS3EPC 0,02954 ± 0,0051

ANSVALFS1EPC 0,02640 ± 0,0070

ANJABVFE2EPC 0,02289 ± 0,0016

ANRILG4 0,00159 ± 0,0012

ANMAPEFE1EPC 0,01190 ± 0,0085

ANEPLAB2A9 0,01268 ± 0,0046

ANAMSJFS2EPC 0,00672 ± 0,0080

ANAMIMB5A5 0,00471 ± 0,0029

ANSVVSFS1EPC 0,01021 ± 0,0006

ANRILEFE2EPC 0,03289 ± 0,0052

ANJABVFE3EPC 0,01183 ± 0,0033

ANSVALFE1EPC 0,04484 ± 0,0661

ANAMIMB4A10 0,00918 ± 0,0028

ANAMIMB6A3 0,01046 ± 0,0016

ANEREGB2A6 0,00022 ± 0,0001

ANSPEBB5A3 0,00050 ± 0,0003

ANERECFE3EPC 0,00059 ± 0,0001

ANJABVB2A2 0,00457 ± 0,0015

ANAMIMB6A6 0,00781 ± 0,0012

ANRR84 0,05540 ± 0,0360

ANAMSJFE2EPC 0,01001 ± 0,0006

ANEREGB2A9 0,00147 ± 0,0006

ANRILG3 0,00095 ± 0,0008

ANRILG2 0,00203 ± 0,0019

ANRILG1 0,00039 ± 0,0004

ANSS07 0,00046 ± 0,0001

ANRILGFE3EPC 0,00043 ± 0,0001

ANRILGFE2EPC 0,00075 ± 0,0005

ANAMIMB1A10 0,000091 ± 0,0001

ANRILEB2A6 0,00065 ± 0,0002

ANSPCSFE1EPC 0,00050 ± 0,0001

ANAMIMB3A1 0,00076 ± 0,0001

ANMA104 0,00024 ± 0,0001

ANSPCSFE3EPC 0,0007 ± 0,0002

ANMALCFE2EPC 0,0021 ± 0,0006

ANEREGFE2EPC 0,0087 ± 0,0024

ANSVMOFE2EPC 0,0068 ± 0,0070

ANSSLAFE1EPC 0,0001 ± 0,0000

ANERMAFE2EPC 0,0007 ± 0,0001

ANEREGB4A5 0,0031 ± 0,0012

ANCVLCFS2EPC 0,0008 ± 0,0006

Page 77: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

59

ANRILG5 0,0011 ± 0,0012

ANSPCSFE2EPC 0,0007 ± 0,0005

ANCVLCFS2EPC 0,0656 ± 0,0300

ANSVLEFE1EPC 0,0734 ± 0,0141

ANEREGB1A6 0,0018 ± 0,0002

ANEREGB4A3 0,0015 ± 0,0001

ANEPLAB1A3 0,0171 ± 0,0073

ANEPLAB4A6 0,0319 ± 0,0076

ANEPLAB3A1 0,0062 ± 0,0026

ANRILEB4A2 0,0012 ± 0,0001

ANMALNFE1EPC 0,0333 ± 0,0079

ANAMIMB4A5 0,0345 ± 0,0067

ANABTEFE2EPC 0,0118 ± 0,0032

ANRN92 0,0125 ± 0,0015

ANRILEB6A9 0,0987 ± 0,0150

ANAMIMB1A7 0,0116 ± 0,0024

ANJABVFE1EPC 0,0424 ± 0,0091

ANAMIMB6A7 0,0321 ± 0,0019

ANEPLAB6A7 0,0129 ± 0,0014

Fosetil-al:

Aislamiento EC50 ± SD

ANERECFE2EPC 0,359 ± 0,062

ANEPLAFE1EPC 3,164 ± 2,389

ANAMIMB4A6 0,373 ± 0,017

ANABCIFE3EPC 0,039 ± 0,015

ANSPEBB5A2 0,010 ± 0,004

ANJABVB3A10 0,605 ± 0,510

ANABTEFE1EPC 1,942 ± 1,610

ANAMIMB5A2 0,153 ± 0,089

ANRILEB3A10 0,889 ± 0,172

ANMALCFE1EPC 0,381 ± 0,204

ANAMIMFE1EPCP 0,443 ± 0,196

ANAMIMB3A7 2,445 ± 0,927

ANAMSJFE3EPC 1,717 ± 0,710

ANAMIMB4A2 0,297 ± 0,057

ANEREGB2A4 1,037 ± 1,202

ANRILEB4A2 0,061 ± 0,018

ANAMIMB5A3 0,107 ± 0,064

ANEREGB3A2 0,196 ± 0,047

Page 78: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

60 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

ANAMIMB4A7 0,123 ± 0,032

ANAMSJFE1EPC 0,701 ± 0,096

ANSVLMFE2EPC 0,701 ± 0,096

ANSPEBFE2EPC 0,363 ± 0,043

ANEPLAB3A1 1,588 ± 0,193

ANMALNFE3EPC 0,036 ± 0,008

ANJABVB6A1 0,089 ± 0,016

ANCVLVFS3EPC 0,562 ± 0,429

ANSVALFS1EPC 0,924 ± 0,708

ANJABVFE2EPC 0,024 ± 0,009

ANRILG4 0,638 ± 0,685

ANMAPEFE1EPC 7,288 ± 5,857

ANEPLAB2A9 1,909 ± 0,297

ANAMSJFS2EPC 0,467 ± 0,192

ANAMIMB5A5 1,019 ± 0,465

ANSVVSFS1EPC 4,609 ± 2,256

ANRILEFE2EPC 1,751 ± 1,196

ANJABVFE3EPC 0,965 ± 0,108

ANSVALFE1EPC 2,211 ± 0,860

ANAMIMB4A10 0,611 ± 0,241

ANAMIMB6A3 1,586 ± 0,500

ANEREGB2A6 0,350 ± 0,135

ANSPEBB5A3 0,952 ± 0,258

ANERECFE3EPC 2,676 ± 2,227

ANJABVB2A2 0,262 ± 0,218

ANAMIMB6A6 22,003 ± 11,850

ANRR84 3,689 ± 1,800

ANAMSJFE2EPC 1,236 ± 0,182

ANEREGB2A9 13,460 ± 4,633

ANRILG3 1,826 ± 0,731

ANRILG2 2,650 ± 1,219

ANRILG1 2,821 ± 1,133

ANSS07 3,999 ± 1,377

ANRILGFE3EPC 1,255 ± 1,008

ANRILGFE2EPC 1,872 ± 1,008

ANAMIMB1A10 1,242 ± 0,060

ANRILEB2A6 1,329 ± 0,955

ANSPCSFE1EPC 1,546 ± 0,385

ANAMIMB3A1 5,236 ± 0,756

ANMA104 1,836 ± 0,358

ANSPCSFE3EPC 3,487 ± 0,993

ANMALCFE2EPC 2,050 ± 0,468

ANEREGFE2EPC 2,162 ± 0,672

Page 79: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

61

ANSVMOFE2EPC 2,680 ± 1,864

ANSSLAFE1EPC 0,493 ± 0,066

ANERMAFE2EPC 4,127 ± 0,448

ANEREGB4A5 0,311 ± 0,119

ANCVLCFS2EPC 0,865 ± 0,337

ANRILG5 2,974 ± 2,982

ANMALNFE1EPC 1,016 ± 0,185

ANSPCSFE2EPC 1,912 ± 0,137

ANSVLEFS1EPC 2,100 ± 0,243

ANEREGB1A6 1,659 ± 0,201

ANEREGB4A3 1,365 ± 0,130

ANEPLAB1A3 1,365 ± 0,130

ANEPLAB4A6 1,410 ± 0,069

ANEPLAB3A3 3,092 ± 0,008

ANRILEB4A2 2,462 ± 0,465

ANRILEB4A4 1,858 ± 0,239

ANAMIMB4A5 2,393 ± 0,524

ANABTEFE2EPC 2,644 ± 0,296

ANRN92 1,094 ± 0,062

ANRILEB6A9 1,780 ± 0,282

ANAMIMB1A7 2,113 ± 0,374

ANJABVFE1EPC 1,339 ± 1,149

ANAMIMB6A7 4,640 ± 0,374

ANEPLAB6A7 1,891 ± 0,190

ANEPLAB6A7 3,190 ± 0,506

Anexo: Mediciones de sensibilidad para la evaluación del factor de

Page 80: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

62 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

riesgo. de los aislamientos de Phytophthora cinnamomi seleccionados.

• ANABCIFE3EPC

• ANAMIMB3A7

Ingrediente activo R EC50 final EC50 Inicial Factor de riesgo

Metalaxil/Mancozeb

1 0,230 0,0274 8,38

2 0,220 0,0274 8,04

3 0,262 0,0274 9,55

4 0,241 0,0274 8,78

5 0,200 0,0274 7,31

6 0,250 0,0274 9,11

Pyraclostrobin

1 0,098 0,0185 5,29

2 0,111 0,0185 5,99

3 0,113 0,0185 6,10

Ingrediente activo R EC50 final EC50 Inicial

Factor de riesgo

Metalaxil/Mancozeb

1 0,431 0,0003 1436,75

2 0,683 0,0003 2277,55

3 0,250 0,0003 832,68

4 0,294 0,0003 980,73

5 0,169 0,0003 564,26

6 0,112 0,0003 373,06

Pyraclostrobin

1 0,070 0,00454 15,36

2 0,020 0,00454 4,35

3 0,062 0,00454 13,74

4 0,020 0,00454 4,49

5 0,033 0,00454 7,17

6 0,010 0,00454 2,18

Fosetil-al

1 0,281 0,0388 7,25

2 0,123 0,0388 3,18

3 0,160 0,0388 4,13

4 0,265 0,0388 6,83

5 0,367 0,0388 9,45

6 0,329 0,0388 8,49

Page 81: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

63

4 0,145 0,0185 7,86

5 0,161 0,0185 8,72

6 0,252 0,0185 13,60

Fosetil-al

1 3,295 2,4454 1,35

2 4,909 2,4454 2,01

3 4,156 2,4454 1,70

4 9,016 2,4454 3,69

5 5,596 2,4454 2,29

6 9,626 2,4454 3,94

• ANAMSJFE1EPC

Producto EC50 final EC50 Inicial Factor de riesgo

Metalaxil/Mancozeb

1 0,089 0,042 2,13

2 0,059 0,042 1,40

3 0,090 0,042 2,15

4 0,049 0,042 1,16

5 0,087 0,042 2,08

6 0,212 0,042 5,04

Pyraclostrobin

1 0,360 0,0004 901,23

2 0,173 0,0004 431,97

3 0,147 0,0004 366,33

4 0,265 0,0004 662,65

5 0,246 0,0004 614,85

6 0,179 0,0004 446,60

Fosetil-al

1 1,089 0,701 1,55

2 1,177 0,701 1,68

3 1,184 0,701 1,69

4 1,304 0,701 1,86

5 1,083 0,701 1,54

6 1,934 0,701 2,76

• ANMALCFE1EPC

Producto EC50 final EC50 Inicial Factor de riesgo

Metalaxil/Mancozeb

1 0,215 0,036 5,98

2 0,328 0,036 9,12

3 0,208 0,036 5,78

4 0,961 0,036 26,68

5 0,093 0,036 2,57

6 0,280 0,036 7,78

Pyraclostrobin

1 0,096 0,08 1,19

2 0,101 0,08 1,26

3 0,088 0,08 1,10

Page 82: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

64 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

4 0,243 0,08 3,04

5 0,130 0,08 1,63

6 0,148 0,08 1,85

Fosetil-al

1 32,712 0,381 85,86

2 31,010 0,381 81,39

3 26,551 0,381 69,69

4 55,516 0,381 145,71

5 48,608 0,381 127,58

6 46,872 0,381 123,02

• ANRILEB3A10

Producto EC50 final EC50 Inicial Factor de riesgo

Metalaxil/Mancozeb

1 0,083 0,0028 29,77

2 0,156 0,0028 55,58

3 0,110 0,0028 39,19

4 0,117 0,0028 41,72

5 0,134 0,0028 47,73

6 0,107 0,0028 38,36

Pyraclostrobin

1 0,088 0,0269 3,27

2 0,100 0,0269 3,73

3 0,077 0,0269 2,85

4 0,105 0,0269 3,91

5 0,119 0,0269 4,43

6 0,225 0,0269 8,35

Fosetil-al

1 2,255 0,8895 2,53

2 3,494 0,8895 3,93

3 2,435 0,8895 2,74

4 3,042 0,8895 3,42

5 2,011 0,8895 2,26

6 3,461 0,8895 3,89

Page 83: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

65

Anexo: Medición radial de los aislamientos de Phytophthora cinnamomi seleccionados para las pruebas de aptitud.

Tratamiento

Día

1 2 3 4 5 6 7 8

Crecimiento radial cm

ANABCIFE3EPC 0,5 1,5 1,9 2,5 2,6 2,6 2,6 2,6

ANABCIFE3EPC 0,5 1,5 1,9 2,4 2,6 2,6 2,6 2,6

ANABCIFE3EPC 0,5 1,4 2 2,6 2,6 2,6 2,6 2,6

ANABCIFE3EPC 0,5 1,5 1,9 2,5 2,6 2,6 2,6 2,6

ANABCIFE3EPC 0,5 1,5 1,9 2,4 2,6 2,6 2,6 2,6

ANABCIFE3EPC 0,5 1,4 2 2,6 2,6 2,6 2,6 2,6

ANABCIFE3EPCRIDOEC90 0,4 0,9 1,3 1,7 2 2 2,1 2,5

ANABCIFE3EPCRIDOEC90 0,6 0,9 1,3 1,8 2 2 2,1 2,5

ANABCIFE3EPCRIDOEC90 0,5 0,8 1,4 1,8 2 2 2,2 2,5

ANABCIFE3EPCRIDOEC90 0,6 1,4 1,8 2,2 2,5 2,6 2,6 2,6

ANABCIFE3EPCRIDOEC90 0,7 1,6 1,9 2,3 2,6 2,6 2,6 2,6

ANABCIFE3EPCRIDOEC90 0,6 1,4 1,9 2,3 2,6 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPC 0,5 1,3 1,8 2,1 2,4 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPC 0,6 1,3 2 2,5 2,6 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPC 0,6 1,2 2 2,5 2,6 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPC 0,5 1,3 1,8 2,1 2,4 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPC 0,6 1,3 2 2,5 2,6 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPC 0,6 1,2 2 2,5 2,6 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPCPYRAEC90 0 0,8 1,1 1,5 1,6 1,8 2,1 2,1

ANAMSJFE1EPCPYRAEC90 0 0,9 1,3 1,5 1,6 1,9 2,1 2,1

ANAMSJFE1EPCPYRAEC90 0,4 0,9 1,3 1,5 1,7 2 2,3 2,6

ANAMSJFE1EPCPYRAEC90 0,4 1 1,3 1,5 1,8 2 2,4 2,5

ANAMSJFE1EPCPYRAEC90 0,4 1 1,3 1,6 1,7 1,9 2,3 2,5

ANAMSJFE1EPCPYRAEC90 0 0,7 1,2 1,5 1,6 1,8 2 2,1

ANAMSJFE1EPCFOSEEC90 0,5 1,4 1,8 2,4 2,5 2,5 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPCFOSEEC90 0,5 1,5 1,9 2,4 2,5 2,5 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPCFOSEEC90 0,5 1,5 1,8 2 2,3 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPCFOSEEC90 0,6 1,4 1,8 2 2,2 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPCFOSEEC90 0,5 1,3 1,8 2 2,3 2,6 2,6 2,6

Page 84: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

66 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

ANAMSJFE1EPCFOSEEC90 0,5 1,4 1,8 2,3 2,5 2,5 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPCRIDOEC90 0,6 1,2 1,7 2 2,5 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPCRIDOEC90 0,8 1,3 1,8 2 2,5 2,6 2,6 2,6

ANAMSJFE1EPCRIDOEC90 0 0 0,7 1,2 1,6 2 2,4 2,6

ANAMSJFE1EPCRIDOEC90 0 0,3 0,8 1,3 1,6 2,1 2,3 2,6

ANAMSJFE1EPCRIDOEC90 0 0,4 0,7 1,3 1,8 2,1 2,4 2,6

ANAMSJFE1EPCRIDOEC90 0,6 1,2 1,7 2 2,6 2,6 2,6 2,6

ANMALCFE1EPC 0,8 1,5 2,1 2,6 2,6 2,6 2,6 2,6

ANMALCFE1EPC 0,5 1,6 2,2 2,6 2,6 2,6 2,6 2,6

ANMALCFE1EPC 0,7 1,5 2,3 2,5 2,6 2,6 2,6 2,6

ANMALCFE1EPC 0,8 1,5 2,1 2,6 2,6 2,6 2,6 2,6

ANMALCFE1EPC 0,5 1,6 2,2 2,6 2,6 2,6 2,6 2,6

ANMALCFE1EPC 0,7 1,5 2,3 2,5 2,6 2,6 2,6 2,6

ANMALCFE1EPCFOSEEC90 0,7 1,2 1,8 2 2,4 2,4 2,5 2,6

ANMALCFE1EPCFOSEEC90 0,8 1,3 1,8 2,1 2,3 2,3 2,5 2,6

ANMALCFE1EPCFOSEEC90 0,8 1,4 1,7 2 2,4 2,4 2,5 2,6

ANMALCFE1EPCFOSEEC90 0 1 1,4 1,7 1,9 2,4 2,6 2,6

ANMALCFE1EPCFOSEEC90 0,9 0,8 1,3 1,9 2 2,5 2,6 2,6

ANMALCFE1EPCFOSEEC90 0,6 0,6 1,2 1,8 2 2,5 2,6 2,6

ANMALCFE1EPCPYRAEC90 0,4 1,3 1,3 1,5 2,1 2,4 2,5 2,5

ANMALCFE1EPCPYRAEC90 0,5 0,9 1,4 1,6 2 2,3 2,4 2,5

ANMALCFE1EPCPYRAEC90 0,3 1 1,3 1,5 1,9 2,2 2,4 2,5

ANMALCFE1EPCPYRAEC90 0,4 0,8 1,3 1,5 1,7 2 2,2 2,5

ANMALCFE1EPCPYRAEC91 0,4 0,9 1,4 1,5 1,8 2 2,1 2,5

ANMALCFE1EPCPYRAEC92 0,3 0,9 1,4 1,6 1,7 1,9 2,1 2,5

Page 85: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

67

Anexo: Imágenes microscópicas de Phytophthora cinnamomi seleccionados para las pruebas de aptitud.

Figura a. Características microscópicas del aislamiento de Phytophthora cinnamomi.

ANABCIFE3EPC. A) aislamiento parental, B) tolerante a pyraclostrobin, C) tolerante a

fosetil-al y D) tolerante a metalaxil + mancozeb.

Page 86: GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y …

68 GENERACIÓN DE UNA LÍNEA BASE DE SENSIBILIDAD Y VALORACIÓN DEL RIESGO DE RESISTENCIA EN Phytophthora

cinnamomi FRENTE AL USO DE FORMULACIONES COMERCIALES.

Figura b. Características microscópicas del aislamiento de Phytophthora cinnamomi.

ANAMSJFE1EPC. A) aislamiento parental, B) tolerante a pyraclostrobin, C) tolerante a

fosetil-al y D) tolerante a metalaxil + mancozeb.

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