vigilancia epidemiológica de las infecciones respiratorias ......respiratorios en 2013: más de 100...
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Vigilancia epidemiológica de las Infecciones Respiratorias Agudas en Argentina
Dra. Elsa Baumeister Servicio Virosis Respiratorias Lab. Nac. Ref. Influenza y VR Centro Nacional de Influenza de OPS/OMS. INEI-ANLIS “Carlos G. Malbrán” Ministerio de Salud de la Nación Dra. Paula Couto Área de Vigilancia de la Salud Dirección de Epidemiología Ministerio de Salud de la Nación
Unidades Centinela •Hepatitis •IRAG •SUH •Neumonías •ETI
Módulo C2 (Vigilancia clínica) Más de 900 nodos y 6000 establecimientos
SIVILA (Vig. Laboratorial) Más de 600 laboratorios notificando
Sistema Nacional de Vigilancia de la Salud: De un sistema modular a un sistema integrado
Nuevo SNVS en el SISA: •Clínica •Laboratorio •Programas •Unidades Centinela
Sistema de Información en Red: Todos los actores comparten y analizan la información Referencia y contrarreferencia de laboratorios a través del sistema
Circuito de la Vigilancia Universal de Infecciones Respiratorias Agudas
LABORATORIO PROVINCIAL
DIREPI y Programas
Provinciales
Guardia
Atención
SNVS-SIVILA
SNVS – C2
Implementación de SIVILA para la vigilancia de Virus Respiratorios
En 2013: Más de 100 laboratorios distribuidos en las 24
jurisdicciones del país, incluyendo los laboratorios públicos y algunos grandes laboratorios privados.
Fueron estudiadas y notificadas más de 80000 muestras con 29738 positivos para algún virus respiratorio.
La tasa de positividad anual fue del 36,89%. El número de muestras en 2013 aumentó en 13,57%
respecto del promedio de los años 2010 – 2012.
Influenza y otros virus respiratorios 2008-201
Vigilancia Clínica de ETI y Bronquiolitis en relación con virus respiratorios
Corredor endémico semanal de bronquiolitis en menores de 2 años Argentina - 2013. Históricos 5 años: 2008 a 2012.
Corredor endémico semanal de IRAG – Argentina - 2013. Históricos 3 años: 2010 a 2012.
Vigilancia Clínica de IRAG en relación a Influenza
El exceso de casos guarda una cierta relación con la curva de Influenza con una subida abrupta a partir de la SE21 y un descenso lento hasta la SE 45
Difusión de la Información y toma de decisiones.
Informes técnicos de patologías de importancia estacional Informes para la comunidad Alertas epidemiológicos Disponibles en: www.msal.gov.ar
Principales logros del SNVS
Sostenimiento y Fortalecimiento de la vigilancia clínica y laboratorial de las IRA en Argentina de 2009 a la fecha.
Determinación semanal de la magnitud, distribución y características de las IRAs y los principales agentes virales involucrados.
Apoyo y apropiación del SNVS por parte de los principales socios
Identificación de los participantes con la visión y los objetivos
Difusión de información semanal de manera completa, con información de las 24 jurisdicciones, a través del Boletín Integrado de Vigilancia.
Utilización del sistema como forma de comunicación entre laboratorios y otros sectores
Utilización de la información para planificar recursos: la necesidad y distribución de insumos para la vigilancia y control (reactivos y antivirales), y gestión de servicios de salud.
Análisis de la información de manera integrada, siendo soporte de las medidas de prevención (lineamientos de vacunación)
Desafíos
Mejorar el alcance de la difusión de la información y continuar promoviendo el
análisis y difusión local y provincial.
Fortalecimiento de la Vigilancia por estrategia centinela de ETI e IRAG.
Mantener y fortalecer los logros alcanzados en términos de notificación y
usos de la información
17X 14 X
6X 6X
2013
65 Labs Provinciales IFI VR 35 Labs Provinticiales FLU rtRTPCR
1 Lab Provincial FLU convenc RTPCR
1 WHO-NIC y Lab Nacional de Referencia de Influenza y otros virus respiratorios
2 WHO-NIC
Red Nacional de Laboratorios de Influenza y otros Virus Respiratorios. Argentina 2014
Técnicas disponibles en el LNRIVR
• Inmunofluorescencia para VR
• RT-PCR en tiempo real: RSV, ADV, PARAI-III, FLU A, FLU B, RV y coronavirus
• RT-PCR: Bocavirus
• RT-PCR en tiempo real para la Subtipificación de FLU A H1/H3
• RT-PCR en tiempo real para diferenciación de linajes de FLU B: Victoria y Yamagata
• RT-PCR en tiempo real para la detección del cambio H275Y que confiere R a oseltamivir
• Aislamiento viral en células • Caracterización antigénica mediante IHA • Secuencia de distintos segmentos genómicos
Para virus con potencial pandémico • Influenza A(H7N9) y A(H5N1): RT-PCR en tiempo real para detectar la HA viral
• MERS-CoV: RT-PCR en tiempo real y RT-PCR de secuencia
Para virus estacionales
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Flu A(H1N1)pdm09 Flu A(H3N2) Flu B ETI
Muestras positivas para Influenza y ETI . Argentina 2010
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Epidemiological weeks
Flu A(H1N1)pdm09 Flu A(H3N2) Flu B ETI
Muestras positivas para Influenza y ETI . Argentina 2011
0
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0 3 6 9 12 15 18 21 24 27 30 33 36 39 42 45 48 51
Num
ber o
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Epidemiological weeks
Flu A(H1N1)pdm09 Flu A(H3N2) Flu B ETI
Muestras positivas para Influenza y ETI . Argentina 2012
0
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220
1 6 11 16 21 26 30 35 41 47
A no subtipificado
Flu B
H1N1pdm
H3
Negativo
A sin subtipificar
Muestras positivas para Influenza y ETI . Argentina 2013
N: 3193
FLU AH1= 1516, FLU AH3= 929, FLU B= 193, Ass= 30,
Virus de influenza detectados por la RNLIVR y caracterizados en el LNRIVR. Argentina 2010-13
0
500
1000
1500
2000
2500
3000
2010 2011 2012 2013
Byam
Bvic
H3
H1
0
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3000
4000
5000
6000
7000
8000
2010 2011 2012 2013
Muestras derivadas al LNRI
2151 1851 2859 7591 1147 1118 2212 3231
A/Chaco/28411/10
A/Tucumn/A363/11 R1021-11 S1
A/Argentina/28370/2010
A/Argentina/27891/2010
A/Chubut/281/11 R495-11 S1
A/Argentina/27895/2010
A/Buenos Aires/2720/10 28342 S1
A/Argentina/27893/2010
A/Argentina/28379/2010
A/Argentina/28378/2010
A/Neuquen/28499/10
A/Buenos Aires/2713/10 28341 S2
A/Buenos Aires/28457/10 28457 S1
A/Chaco/69025/10 28395 S1
A/Crdoba/2179/10 28430 S1
A/Argentina/27894/2010
A/Argentina/28306/2010
A/Tucumn/I2117/10 28024 S1
A/Chaco/28371/10
A/Buenos Aires/42/11 R8/11 S1
A/Chaco/68828/10 28371 S2
A/Tucuman/273/11 R561-11 S1
A/Mendoza/176711/2012 R823 S1
A/Argentina/198/2011
A/Buenos Aires/59663/11 R341-11 S1
A/Buenos Aires/10117308/11 R57-11 S1
A/Buenos Aires/10059765/11 R91-11 S1
A/Buenos Aires/10125312/11 R61-11 S1
A/Argentina/179/2011
A/Buenos Aires/10122164/11 R60-11 S1
A/Buenos Aires/R173/11 R173-11 S1
A/Tucumn/A396/11 R1032-11 S1
A/Tucumn/A362/11 R 1031-11 S1
A/Ro Negro/190/11 R1103-11 S1
A/Chaco/81602/11 R350-11 S1
A/Tucumn/I2240/11 R1018-11 S1
A/Buenos Aires/10156532/11 R237-11S1
A/Tierra del Fuego/108745/11 R1115-11...
A/Tucumn/I2297/2012 R672 S1
A/Tucumn/I2270/2012 R723 S1
A/Buenos Aires/27826/10
A/Buenos Aires/27827/10
A/Buenos Aires/19/11 R5/11 S1
A/Chubut/713/10 28307 S1
A/Chaco/68990/10 28402 S1
A/Iowa/19/2010
A/Buenos Aires/165833/11 R158-11 S1
A/Castilla La Mancha/RR8871/2011
A/Cordoba/28437/10
A/Crdoba/2187/10 28437 S2
A/Buenos Aires/65764/11 R144-11 S2
A/San Luis/R243/11 R243-11 S2
A/Argentina/676/2011
A/Buenos Aires/598/11 R153-11 S2
A/Salta/1312/11 R566-11 S1
A/Argentina/566/2011
A/Buenos Aires/490/11 R94-11 S1
A/Entre Ros/78/11 R376-11 S1
A/La Pampa/70/11 R391-11 S2
A/Hong Kong/3951/2011
Group 6 (A/Iowa/19/2010 and A/Hong Kong/3951/2011)
A/Perth/10/2010
A/Neuqun/1354922/11 R1/11 S1
A/Neuquen/28498/10
A/Neuqun/1359747/11 R2/11 S1
A/Hong Kong/2121/2010
A/Buenos Aires/10069665/11 R511-11S1
A/Buenos Aires/65427/11 R66-11 S2
A/Santa Fe/277947/11 R219-11 S2
A/Tucumn/I2042/12 R284-12 M1
A/Tucumn/I2259/2012 R718 S1
A/Buenos Aires/2508/2012 R1047 S2
A/Buenos Aires/1105/2012 R903 S2
A/Santa Fe/07066/2012 R640 S1
A/Stgo del Estero/1061/2012 R856 S2
A/Buenos Aires/998848/2012 R21-12 S1
A/Alabama/05/2010
A/Victoria/208/2009
A/Johannesburg/114/2011
A/Alabama/04/2011
A/Tanzania/45/2011
A/Trieste/32/2011
A/YOKOSUKA/170/2011
A/Norway/685/2011
Group 7 (A/Alabama/4/2011 and A/Johannesburg/114/2011)
A/Chaco/68335/10 28372 S1
A/Chaco/68336/10 28373 S1
A/Argentina/28372/2010
A/Argentina/28367/2010
A/Argentina/28342/2010
A/Chaco/28405/10
A/Serbia/71/2011
A/Iraq/7/2011
A/Arkansas/01/2010
A/Alberta/019/2011
Group 4 (A/Serbia/71/2011 and A/Iraq/7/2011)
A/Stockholm/18/2011
A/Japan/AF2826/2012
A/Tunisia/16992/2010
A/Pais Vasco/RR8864/2011
A/Ghana/FS117/2011
Group 3A (A/Stockholm/18/2011)
A/South Carolina/03/2012
A/Vladivostok/99/2012
A/England/259/2011
A/Washington/AF2768/2011
A/Pais Vasco/RR8867/2011
A/Madrid/RR8856/2011
A/Guam/AF2771/2011
Group 3B (A/England/259/2011)
A/Bratislava/31/2011
A/Slovenia/537/2011
A/Hong Kong/3969/2011
Vaccine Strain 2012-2013 Northern Hemisphere A/Victoria/361/2011
A/Buenos Aires/1004423/12 R103-12 S2
A/Nonthaburi/279/2011
A/Castilla La Mancha/RR8843/2011
A/Buenos Aires/10435982/12 R83-12 S2
Group 3C (A/Hong Kong/3969/2011)
A/Norway/1330/2010
A/South Carolina/03/2010
A/Argentina/28302/2010
A/Martinique/1441/2010
Group 2 (A/Norway/1330/2010)
Vaccine Strain 2012 Southern Hemisphere A/Perth/16/2009
A/Neuquen/27724/10
A/Victoria/210/2009
A/Thailand/CU-B106/2009
A/Singapore/GP586/2009
A/Sendai-H/N337/2010
A/YAMANASHI/195/2010
A/NIIGATA/510/2011
A/NIIGATA-C/1/2011
A/Stockholm/10/2010
A/Norway/1186/2011
A/IWATE/37/2010
Group 1 (A/Victoria/210/2009)
A/Brisbane/10/07
98
64
69
72
59
98
58
30
100
73
51
86
33
71
95
53
59
74
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87
61
59
71
89
23
20
21
59
31
64
60
17
11
15
65
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42
80
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88
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29
41
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30
55
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95
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47
92
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99
57
33
33
54
85
62
86
30
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88
54
86
66
39
62
99
45
58
44
63
61
50
43
15
6
36
36
7
36
0
431
9
838
11
0.002
A(H3N2) detectados en Argentina 2010 - 2012
Vaccine strains 2012 Strains 2011 Strains 2010 Strains
2012-2013 Vacc Northern Hemisph
2012 Vacc South Hemisph
Dra. Elsa G. Baumeister INEI-Malbrán , Argentina
A(H1N1)pdm detectados en Argentina 2010 - 2012
Detección de cepas A(H1N1)pdm09 resistentes a Oseltamivir rtRTPCR.
AÑO A(H1N1)pdm09
S R % 2009 54 1 1,8 2010 EC EC - 2011 77 2 2,53 2012 659 1 0,15 2013 1496 17 1,14
TOT 2286 21 -
AÑO MUESTRA
SEXO
EDAD (A)
CONDICIÓN ESPECIAL
MUESTRA TOMADA PROCEDENCIA
2013 R124 M 1 LEUCEMIA INTRA-TRAT CABA 2013 R280 F 31 NO PRE-TRAT BUENOS AIRES
2013 R636 M 2 NO PRE-TRAT BUENOS AIRES 2013 R861 F 27 EMBARAZ PRE-TRAT SANTA FE 2013 R1039 F 2 NO INTRA-TRAT BUENOS AIRES 2013 R1362 M 2 LEUCEMIA PRE-TRAT CABA 2013 R1530 F 40 NO PRE-TRAT CHACO 2013 R1534 M 60 NO PRE-TRAT CHACO 2013 R1539 F 1 NO PRE-TRAT CHACO 2013 R2166 F 4 sd sd CORRIENTES 2013 R2264 M <1 sd PRE-TRAT BUENOS AIRES 2013 R2266 F 5 sd PRE-TRAT BUENOS AIRES 2013 R2409 F 3 NO PRE-TRAT SGO DEL ESTERO 2013 R2463 M <1 NO PRE-TRAT MENDOZA 2013 R2646 M 4 LEUCEMIA PRE-TRAT BUENOS AIRES 2013 R2791 M 2 NEUROBLAST PRE-TRAT TUCUMÁN 2013 R2796 F 56 DIABETES PRE-TRAT TUCUMÁN
Caracteristicas de los pacientes con cepas A(H1N1)pdm09 resistentes a Oseltamivir
Identif
virus influenza
A Título original Dilución Título final
M 1 H1N1pd
m 4,10 4 UFP/ml 1,10-6 4.10-2 UFP/ml M 2 H3N2 9,10 5 UFP/ml 1,10-4 9.10 1 UFP/ml
M 3 H1N1pd
m 4,10 4 UFP/ml 1,10-2 4.10 2 UFP/ml
M 4 MEM NEG NC NC M 5 H3N2 9,10 5 UFP/ml 1,10-6 9.10-1 UFP/ml
M 6 H1N1pd
m 4,10 4 UFP/ml 1,10-4 4 UFP/ml
H1N1 pdm : A/Argentina/17/2009 (H1N1)pdm H3N2: A/NewYork/ 55/ 2004 (H3N2) MEM: medio esencial mínimo
Primer Panel de Control de Calidad interno distribuido a la RNLIVR. 2010
Resultados correspondientes a la detección de influenza A H1N1 pdm por RTPCR en tiempo real
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
M1 M2 M3 M4 M5 M6
Series1
% de concordancia. N° de labs : 20
Muestras M1 M2 M3 M4 M5 M6
Parámetro A (H1NI)
pdm A(H3N2) B NEG A (H1NI)
pdm A(H3N2)
nº copias 15000 ( A) 2000 ( A ) 200 ( A) 20000 (A)
A 28 30 NA NA 35 25
Asw 28 NA NA NA 35 NA
H1sw 31 NA NA NA 37 NA
H3 NA 30 NA NA NA 26
B NA NA 33 NA NA
Segundo panel de Control de Calidad distribuido a la RNIVR para diagnóstico de influenza A y B por rtRTPCR. 2012
80
82
84
86
88
90
92
94
96
M1 A(H1N1)pdm 17000
M2 A(H3N2) 2300
M3 influenza B M4 negativo M1 A(H1N1)pdm 300
M2 A(H3N2) 22000
%Labs respuesta correcta muestra
Resultados correspondientes a la detección de influenza A y B por RTPCR en tiempo real.
N° de labs participantes : 25
X Taller de la Red Nacional de
Laboratorios de Influenza y otros
virus respiratorios. 28 al 30 de abril
de 2014. “Anlis C.G.Malbrán”
Argentina
Muchas gracias !!!