experiencia panel gi filmarray · 2017-06-24 · •colitis izquierda inespecífica. •biopsia:...

Experiencia Panel GI FilmArray

Dr. Carlos Valenzuela

Gatroenterologo (PUC)

Hospital Las Higueras de Talcahuano

Universidad Católica de la Santísima Concepción

Temario

• Introducción.

• Resultados Trabajo Investigación diarrea aguda.

• Casos clínicos.

• Experiencia Calprotectina.

• Conclusiones.

INTRODUCCION: Nuevas técnicas biología molecular

• PCR Clostridium difficile

• PCR Yersinia enterocolitica

• PCR E. coli enterohemorrágica

• PCR Salmonella

• PANEL VIRAL GASTROINTESTINAL (Adenovirus, Astrovirus, Norovirus GI, Norovirus GII y/o Rotavirus)

Kits PCR múltiples Test FilmArray® GI

Panel xTAG® Gastrointestinal Pathogen Panel

Seeplex® Diarrhea ACE Detection

FTD Gastroenteritis

Gastroenteritis

Multiplex

Fabricante Biofire Diagnostics Inc.

Luminex Corporation

Seegene

Fast-track Diagnostics

Diagenode

Bacterias Nº 13 9 7 0 2

Virus Nº 5 4 4 5 4

Parásitos Nº 4 3 0 3 4

Total 22 16 11 8 10

Tiempo requerido

65 min 5 hrs 10 hrs 6 hrs 3 hrs

Detección automática

SI Semi automática

Semi automática

Semi automática

Semi automática

Gray et al. Epidemiol. Infect. (2014)

Trabajo de investigación: “Caracterización etiológica y clínica de las diarreas agudas”

• Estudio de corte transversal.

• Periodo de estudio: enero 2015 a marzo 2016.

• Criterios inclusión: • Paciente adulto (≥ 18 años) con diarrea aguda de la comunidad.

• Pacientes que consulten al servicio de urgencia de la red Salud UC, o a un especialista gastroenterólogo de la Red de Salud UC.

• Indicación de estudio microbiológico de deposiciones.

Diarrea aguda: 3 o más deposiciones líquidas por día, > 24 horas y < 14 días de duración

Indicaciones de estudio microbiológico

1. Diarrea grave

2. Fiebre

3. Disentería

4. Deshidratación

IDSA. 2013. A guide to utilization of the microbiology Laboratory for Diagnosis of Infectious Diseases. Clin Infect Dis;57(4):e22-e121

1. Diarrea grave

2. Fiebre

3. Disenteria

4. Presencia leucocitos fecales, lactoferrina o sangre oculta.

ACG. 1997. Guidelines on acute infectous diarrhea in adults. Am J Gastroenterol 92: 1962-1975.

Resultados Panel GI FilmArray

67%

33%

Total pacientes: 199

Positivos

Negativos

Microorganismos identificados por PCR

50%

75%

32%

15%

Bacterias Virus Parásitos

0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

Microorganismos identificados

100/133

42/133

20/133

Porc

enta

je d

e e

nte

rop

ató

gen

os

ide

nti

fica

do

s (%

de

los

po

siti

vos)

Caso clínico 1

• Paciente sexo femenino 21 años.

• Sin antecedentes mórbidos, estudiante.

• MC: SU PUC, dolor abdominal intenso 10/10, asociado a diarrea aguda 2 días evolución 8 episodios/día sin elementos patológicos, vómitos y con fiebre hasta 38ºC. Deshidratación moderada.

• Hospitalización

• Hidratación parenteral

• Inicio tratamiento antibiótico empírico

• ¿Hospitalización?

• Razonable, para hidratación parenteral, analgesia.

• ¿Uso de antibiótico empírico?

• Planteable por necesidad de Hospitalización.

Caso clínico 1

• Coprocultivo: negativo.

• Parasitológico: negativo.

• Panel viral Gastrointestinal: negativo (Adenovirus, Astrovirus, Norovirus GI, Norovirus

GII y/o Rotavirus).

• Panel GI FilmArray:

• Sapovirus.

• Suspensión tto. ATB.

Caso clínico 1

[VALOR] (18)

[VALOR] (9)

[VALOR] (9)

[VALOR] (6)

[VALOR] (2)

0%

2%

4%

6%

8%

10%

12%

14%

16%

Norovirus Sapovirus Rotavirus Astrovirus Adenovirus

Porcentajes de virus identificados

Porc

enta

je d

e v

iru

s id

en

tifi

cad

os

(% d

e lo

s p

osi

tivo

s)

Virus: 32%

de los

resultados

positivos

• Paciente 28 años. Sexo masculino.

• Sin antecedentes mórbidos.

• MC: • Consulta SU, desde hace 3 días con dolor abdominal intenso 10/10 ,

acompañado de fiebre hasta 39ºC, diarrea acuosa 4 veces/día, acompañado de estrías sanguinolentas.

• Parámetros inflamatorios elevados.

• TAC abdomen y pelvis: engrosamiento difuso colon descendente y sigmoides, colitis colon izquierdo.

• Hospitalización.

Caso clínico 2

• Colonoscopía: • Perdida transparencia vascular, eritema y erosiones colon izquierdo, biopsias.

• Colitis izquierda inespecífica.

• Biopsia: • Elementos de inflamación aguda inespecífica. Sin hallazgos de cronicidad.

• Panel GI FilmArray (a las 48 hrs de hospitalización):

• Salmonella sp.

• Coprocultivo: Salmonella typhi.

Caso clínico 2

[VALOR] (34)

[VALOR] (28)

[VALOR] (26)

[VALOR] (17) [VALOR]

(14) [VALOR] (13) [VALOR]

(9) [VALOR]

(9) [VALOR]

(3) [VALOR]

(3) [VALOR] (1)

0%

[VALOR] (1)

0%

5%

10%

15%

20%

25%

30%

Porcentaje de bacterias identificadas

Porc

enta

je d

e b

acte

rias

id

enti

fica

do

s (%

de

los

po

siti

vos)

Bacterias:

75% de los

resultados

positivos

Análisis resultados Salmonella sp.

Salmonella sp.: 13(+) FilmArray

Coprocultivo (+): 10/13 (76,9%)

Coprocultivo (-): 3 PCR específica: 2/2 (+).

• Paciente 50 años, sexo femenino.

• Sin antecedentes mórbidos, arsenalera en Hospital Público.

• Antecedente ITU tratada con ciprofloxacino.

• MC:

• Diarrea líquida de 1 semana evolución, 14 episodios/día, sin elementos patológicos, sin fiebre, con leve dolor abdominal.

• Deshidratación leve.


Caso clínico 3

• PCR Clostridium difficile: Positivo, Ribotipo 027(+).


• Clostridium difficile



Caso clínico 3

[VALOR] (34)

[VALOR] (28)

[VALOR] (26)



(9) [VALOR]

(9) [VALOR]

(3) [VALOR]

(3) [VALOR] (1)

0%

[VALOR] (1)

0%

5%

10%

15%

20%

25%

30%


Porc

enta

je d

e b

acte

rias

id

enti

fica

do

s (%

de

los

po

siti

vos)

• ¿Como se comporta FilmArray en relación con PCR específica para Clostridium difficile?

Caso clínico 3

• Clostridium difficile: 13 (+) FilmArray. PCR específica 7/8 positivas.

• Clostridium difficile: 22 PCR específica (-) FilmArray 22/22 (-).

• Paciente 58 años, sexo masculino.

• Antecedente de HTA y cirrosis hepática Child C compensado.

• MC: • Consulta Gastroenterologo de la Red, por cuadro de diarrea 10 días evolución,

4 veces/día, sin elementos patológicos, sin fiebre, acompañado de dolor abdominal moderado.

• Sin deshidratación.

• Se decide estudio etiológico.

Caso clínico 4


• Cryptosporidium


• Parasitológico:

• Ooquistes Cryptosporidium

• Tratamiento con azitromicina:

• Buena respuesta clínica.

Caso clínico 4

[VALOR] (12)

[VALOR] (7)

0% 0% 0%

1%

2%

3%

4%

5%

6%

7%

8%

9%

10%

Cryptosporidium Giardia lamblia Entamoeba histolytica

Cyclospora cayetanensis

Porcentajes de parásitos identificados Po

rcen

taje

de

par

ásit

os

ide

nti

fica

do

s (%

de

los

po

siti

vos)

Parásitos:

15% de los

resultados

positivos

• Cryptosporidium: 12 (+) FilmArray Parasitológico 10/12 (+).

• Giardia: 7 (+) FilmArray Parasitológico: 1/6 (+).

Caso clínico 4

• Paciente 20 años, sexo masculino.

• Sin antecedentes mórbidos, estudiante.

• MC: • Consulta en SU por Diarrea 12 días evolución, con sangre en deposiciones,

promedio de 14 deposiciones/día, acompañado de fiebre, dolor abdominal, deshidratación.

• Recibe tratamiento con ciprofloxacino ambulatorio, con respuesta parcial.

• Hospitalización: • Hidratación.

• Alta sospecha de ¿EII?, ¿colitis psudomembranosa?.

Caso clínico 5

• Plan: • Colonoscopía ….

• Panel GI FilmArray: • Campylobacter sp.

• Tratamiento: • Azitromicina • Buena respuesta, cede diarrea y mejoría clínica.

• Coprocultivo: negativo. Tinción Hucker (-).

• Cultivo especial para Campylobacter: Negativo.


Caso clínico 5

[VALOR] (34)

[VALOR] (28)

[VALOR] (26)



(9) [VALOR]

(9) [VALOR]

(3) [VALOR]

(3) [VALOR] (1)

0%

[VALOR] (1)

0%

5%

10%

15%

20%

25%

30%


Porc

enta

je d

e b

acte

rias

id

enti

fica

do

s (%

de

los

po

siti

vos)

Bacterias:

75% de los

resultados

positivos

Campylobacter: 27 (+) FilmArray Cultivo específico (+): 13/20 (65%)

PCR específica (+): 6/6 (100%) Tinción Hucker (+): 0/27

Caso clínico 5

• Paciente 23 años, sexo femenino.

• Antecedente psoriasis.

• MC: • Consulta en SU por diarrea 10 días de evolución, con sangre y mucosidad,

promedio de 7 deposiciones/día, acompañado de dolor abdominal.

• Deshidratación leve.

• Recibió tratamiento antibiótico empírico con ciprofloxacino y metronidazol.


Caso clínico 6

• Panel GI FilmArray: • Negativo.


• Parasitológico: Negativo.

• Colonoscopía:

Caso clínico 6

Caso clínico 6

• Resultado negativo: Pensar en causa no infecciosa de diarrea.

Caso clínico 6

• 66 muestras negativas por FilmArray: todas negativas por coprocultivos.

• De los 66 pacientes con resultado negativo en al menos 29 de ellos se

identificó una causa no infecciosa de diarrea. • Colitis isquémica, EII, Amiloidosis, Por sales biliares, Funcional, Enteropatía

diabética, etc.

Sensibilidad de las distintas técnicas

Adaptado de Platt-Mills et al. Nature 2013; 6(5)

Límite analítico Límite clínico

Detección por cultivo

Seve

rid

ad d

e en

ferm

edad

Examen optimo

Detección por PCR

Cantidad de patógenos en deposiciones

Pacientes calprotectina

Selección pacientes sin comorbilidad y Panel (+)

Calprotectina basal

Repetir Panel GI Film Array y calprotectina (6-8 semanas).

Pacientes Calprotectina

Paciente Resultado PCR FilmArray Calprotectina

1 Campylobacter, Cryptosporidium 366

2 ECEP, Giardia lamblia >600

3 Sapovirus 544

4 Campylobacter, Clostridium difficile >600

5 Norovirus GI/GII, ECEA <19,5

6 Salmonella >600

7 Campylobacter >600

8 ECET, ECST 353

9 Salmonella, Norovirus >600

10 C. Difficile 62,2

11 Cryptosporidium 276

12 Salmonella >600

Promedio 435

Paciente Resultado PCR inicial

Calprotectina

inicial PCR control

Calprotectina

control

1 Campylobacter, Cryptosporidium 366

2 ECEP, G. lamblia >600


8 ECET, ECST 353


Promedio

Controles 100% asintomáticos


Calprotectina

inicial PCR control

Calprotectina

control

1 Campylobacter, Cryptosporidium 366 Negativo 187

2 ECEP, G. lamblia >600


8 ECET, ECST 353


Promedio



Calprotectina

inicial PCR control

Calprotectina

control


2 ECEP, G. lamblia >600 ECEP, G. lamblia, 287


8 ECET, ECST 353


Promedio



Calprotectina

inicial PCR control

Calprotectina

control


2 ECEP, G. lamblia >600 ECEP, G. lamblia, C. difficile 287


8 ECET, ECST 353


Promedio



Calprotectina

inicial PCR control

Calprotectina

control



7 Campylobacter >600 ECEP < 19,5

8 ECET, ECST 353


Promedio



Calprotectina

inicial PCR control

Calprotectina

control




8 ECET, ECST 353 ECEA, ECST < 19,5


Promedio



Calprotectina

inicial PCR control

Calprotectina

control




8 ECET, ECST 353 ECEA, ECST < 19,5

9 Salmonella, Norovirus >600 ECEA, ECEP 324

Promedio 167


Platt-Mills et al. Nature 2013; 6(5)

Conclusiones

• Necesidad de hospitalización.

• Inmunodeprimidos.

• Cuadro severo.

• Disentería.

• Diarrea del viajero.

• Prolongada.

• EII.

• Diarrea crónica.

• Intrahospitalaria.

Conclusiones

¿Cuándo solicitar estudio etiológico por Panel GI FilmArray?

• Rapidez en obtener resultado.

• Amplia cobertura de agentes infecciosos.

• Buena sensibilidad y especificidad.

• Uso criterioso de las nuevas tecnologías, son un gran apoyo, pero se debe considerar el contexto clínico del paciente.

Conclusiones

Principales ventajas

MUCHAS GRACIAS Dr. Carlos Valenzuela

Gatroenterologo (PUC)

Hospital Las Higueras de Talcahuano

Universidad Católica de la Santísima Concepción

Agradecimientos:

Dra. Paulette Legarraga, Dr. Arturo Peña, Dr. Alex Arenas, Enrique Geoffroy, Carolina Miranda, Andrea Vera, Dra. Patricia García, Dr. Manuel Álvarez.

experiencia panel gi filmarray · 2017-06-24 · •colitis izquierda inespecífica. •biopsia:...

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