Biología SintéticaDr. Alejandro D. NadraDpto. De Química BiológicaFac. De Cs. Exactas y Naturales – UBAanadra@qi.fcen.uba.ar

GarageLab

11 de Junio de 2012

 

Intro

Objetivos:

●   Crear vida artificial●  Construcción  de  sistemas  biológicos  nuevos  y  el establecimiento de principios para su diseño racional

Premisa:●  Los  sistemas  biológicos  pueden  ser  modificados  y construidos a partir de ”partes” re­utilizables.

 

Ingeniería de la vida

Conceptos:

Abstracción

Modularización/desacople

Estandarización

Componentes biológicos:

Modulares

Estandar

Reutilizables

Niveles de organización:

Partes­> dispositivos­> sistemas

 

Herramientas

”Módulos” estandarizados (banco de partes)

Principios de diseño/ingeniería (racional)

Síntesis de genes (!)

Modelado y simulación

 

 

Proceso de trabajo

Diseño desecuencias

Síntesis del DNA 

Evaluación y caracterización

!Diseño delsistema

Modelado ysimulación

Banco de partes

 

Algunos logros y perspectivas

Logros:

­Osciladores/generadores de ruido/switchs génicos (circuitos)­Computación in vivo (puertas logicas)­Detectores varios ­Producción de artemisinina recombinante (ing. metabólica)­Síntesis y transferencia de un genoma completo (técnico)

­Acercar la academia a la industria­Motivar y entusiasmar jóvenes promesas: iGEM

Perspectivas:

Fuentes renovables de energíaBioremediaciónTratamiento/cura de enfermedades esquivas

(Resolver los problemas de siempre con nuevas herramientas)

 

Ejemplos

BioBricks (Tom Knight, Drew Endy y Christopher Voigt)1) Partes: son los bloques iniciales y codifican funciones biológicas básicas (ej. ungen, una proteína, un promotor, etc)2) Dispositivos: son colecciones de partes que implementan una funcióndefinida. (ej. un grupo de genes que responde a luz y produce un determinadometabolito en respuesta)3) Sistemas: Combinaciones de dispositivos interconectados para ejecutar tareasde alto nivel.

 

The Registry of Standard Biological Parts

 

Detector de fase exponencial

Banana Control

http://openwetware.org/wiki/IGEM:MIT/2006

 

Detector de límite

 

Bacto­Blood

Berkeley iGEM team2007

 

Bacto­Blood

Controller

Plasmid 1: Controls Copy # and T7Pol BAC 2: Regulated Expression

 

Bacto­Blood

recombinant Haemoglobin Haemoglobin Chaperone Hem Biosynthesis

Auto­Oxidation control

 

 

Artemisinin biosynthesis

Jay KeaslingJBEI, Amrys

 

Artemisinin biosynthesis

 

Biología Sintética en Argentina

Comenzando...

Curso 2011Curso 2012Equipo iGEM http:igem.qb.fcen.uba.ar

Proyecto en UADEProyecto en FCEyNProyecto en GarageLabKeclon?

 

Agradecimientos

Ignacio E. Sanchez, QB FCEyN - UBARaik Grünberg, IRIC, CanadaEquipo iGEM Buenos_Aires

Y a ustedes, por su atención!

 

Algunas críticasBioseguridad:

BioterrorismoEcológicos

Eticos:Creación de nueva vida”Resucitación de patógenos extintos”Manipulación de organismos

Propiedad intelectual:La tendencia open-source boicotea la inversión

Bioquímicos y biólogos moleculares clásicos:Nada nuevo bajo el sol