anexo vii facultad de biologÍa propuesta …reseña de los objetivos y contenido del proyecto:...

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ANEXO VII

FACULTAD DE BIOLOGÍA

PROPUESTA DE TRABAJO FIN DE GRADO

I. Datos de la Entidad Ofertante

Nombre completo del Departamento: BIOQUÍMICA VEGETAL Y BIOLOGÍA MOLECULAR

Nombre de la entidad o empresa ofertante:

Dirección Postal Reina Mercedes 6

Código Postal 41012

Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax 954620154

e-mail [email protected]

II.- Título del Trabajo

Función de la proteína Hfq en la regulación por pequeños RNAs

Titulación Grado en Biología Tipo TFG: Opción A

Reseña de los objetivos y contenido del proyecto:

Los RNAs pequeños no codificantes constituyen un grupo heterogéneo de moléculas cuya implicación en todo tipo de

procesos regulatorios se ha puesto de manifiesto en los últimos años. Actualmente, con numerosos genomas

bacterianos completamente secuenciados, el diseño de herramientas computacionales ha permitido predecir la

existencia de una gran cantidad de RNAs no codificantes en bacterias. En las bacterias Gram negativas la proteína Hfq

juega un papel fundamental en la regulación por sRNAs mediante diversos mecanismos que han sido objeto de intensa

investigación en los últimos años. En este trabajo se describirán las características de Hfq, los mecanismos que utiliza

para modular la interacción entre sRNA y mRNA y su relevancia en organismos patógenos.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Recopilar la bibliografía relevante actual sobre el tema

Leer y comprender los trabajos seleccionados

Redactar una memoria en la que se resuman y discutan estos trabajos de acuerdo a la normativa del TFG

Capacidades y conocimientos que debe tener el alumno/a para la realización de este proyecto:

Imprescindibles: Inglés

Recomendables: Haber cursado Genética Molecular. Cursar Estructura y Biosíntesis de Macromoléculas

Fecha prevista de comienzo: 22/09/2014

Duración prevista del proyecto (meses): 8

Dedicación semanal prevista por parte del alumno/a (horas): 4

Dedicación semanal prevista por parte del tutor/a (horas): 0,5

Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: No hay un lugar específico

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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Vioque Peña, Agustín

Cargo: Catedrático de Universidad

Departamento/Institución/Empresa (Indicar dirección si es diferente de la indicada en el punto I):

Titulación académica del Director: Doctor

Teléfono directo: 954489519/954557082

Fax: 954460165

E-mail: [email protected]

Rellenar en caso de empresas e instituciones ajenas a las áreas propias de la Facultad de Biología

Apellidos y Nombre del Tutor Académico:

Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:

IV.- Convenio. Cumplimentar solo en caso de empresas o instituciones ajenas a la Universidad de Sevilla . ¿Posee su entidad/empresa convenio firmado con la US para la realización del TFG?: Sí

En caso de sí existir convenio, fecha del convenio:

En caso de no existir convenio entre US y entidad/empresa, cumplimente los siguientes datos:

Apellidos y Nombre de la persona que firmará el convenio con la Universidad:

Cargo:

Domicilio social de la entidad/empresa:

Nif de la entidad/empresa:

V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:11/06/2014

Firma del Director

Empresa/Institución/Departamento Firma del Tutor Académico Firma del Director del proyecto

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ANEXO VII


GRADO EN BIOLOGíA: PROPUESTA DE TRABAJO FIN DE GRADO



Nombre de la entidad o empresa ofertante: INSTITUTO DE BIOQUÍMICA VEGETAL Y FOTOSÍNTESIS

Dirección Postal C\ AMÉRICO VESPUCIO, 49


Localidad SEVILLA

Teléfono 954489507

Fax 954460165



Modificaciones post-traduccionales de la almidón sintasa 4 y su efecto en la síntesis del almidón en Arabidopsis thaliana

Titulación: Grado en Biología Tipo TFG: Opción D

Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Hemos determinado que la almidón sintasa 4 (SS4) de Arabidopsis experimenta modificaciones post -traduccionales pero no hemos

determinado qué tipo de modificaciones son ni cómo estas afectan al la función de esta enzima en la iniciación del gránulo de almi

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Se emplearán técnicas de biología molecular y bioquímica. Empleando plantas transgénicas obtenidas por el Grupo, se analizará el

tipo de modificación de la proteína SS4. Para ello se emplearán téncias de purificación de proteínas, análisis mediante espec


Imprescindibles: Conocimientos de los fundamentos de la biología molecular y la bioquímica

Recomendables: Inglés




Dedicación semanal prevista por parte del tutor/a (horas): 5

Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis. CSIC-US

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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: MÉRIDA BERLANGA, ÁNGEL

Cargo: CIENTÍFICO TITULAR DEL CSIC


Titulación académica del Director: DOCTOR

Teléfono directo: 954489507

Fax: 954460165



Apellidos y Nombre del Tutor Académico: FLORENCIO BELLIDO, FRANCISCO JAVIER

Cargo: CATEDRÁTICO DE LA US

Departamento:

BIOQUÍMICA VEGETAL Y BIOLOGÍA MOLECULAR


Fax: 954460165






Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


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ANEXO VII




Nombre completo del Departamento: -


Dirección Postal

Código Postal

Localidad

Teléfono

Fax

e-mail


Análisis de los modos normales de vibración de metalo-porfirinas biológicas y su correlación en los espectros de Resonancia Raman

de hemoproteínas.

Titulación: Grado en Biología Tipo TFG: Opción A

Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Introducción a la Resonancia Raman (RR)

Aplicaciones de RR a porfirinas Particularidades en hemoproteínas

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Hacer una revisión crítica de la aplicación de la Resonancia Raman a hemoproteínas, principalmente a citocromos


Imprescindibles: Altos conocimientos en Química Orgánica y Estructura de Macromoléculas

Recomendables: Buen Expediente Académico





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fostosíntesis - cicCartuja

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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: UNIDAD DOCENTE: GRUPO BIOINTERACTÓMICA:

De la Rosa Acosta Miguel A. / Díaz-Moreno Irene / Díaz-Quintana Antonio

Cargo: Catedrático / Profesores Titulares


Titulación académica del Director: Dres.

Teléfono directo:

Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud: 16 de junio de 2014

Firma del Director


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ANEXO VII




Nombre completo del Departamento: -


Dirección Postal

Código Postal

Localidad

Teléfono

Fax

e-mail


Desarrollo de nuevas bases funcionales para la interpretación de espectros de dicroismo circular de proteínas y ácidos nucleicos

mediante cálculos ab initio.


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Introducción al Dicroismo Circular (CD)

Aplicaciones de CD a proteínas y ácidos nucleicos Cálculos ab initio

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Hacer una revisión crítica de la predicción, mediante cálculos ab initio, de Dicroismo Circular a proteínas y ácidos nucleicos


Imprescindibles: Altos conocimientos en Química Orgánica y Estructura de Macromoléculas

Recomendables: Buen Expediente Académico





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fostosíntesis - cicCartuja

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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: UNIDAD DOCENTE: GRUPO BIOINTERACTÓMICA:

De la Rosa Acosta Miguel A. / Díaz-Moreno Irene / Díaz-Quintana Antonio

Cargo: Catedrático / Profesores Titulares


Titulación académica del Director: Dres.

Teléfono directo:

Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud: 16 de junio de 2014

Firma del Director


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ANEXO VII






Dirección Postal Av Reina Mercedes, 6


Localidad Sevilla

Teléfono

Fax

e-mail


Regulación de la translocación de transportadores de glucosa y su alteración en la diabetes


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Investigación bibliográfica sobre el mecanismo por el cual la insulina estimula el consumo de glucosa en los tejidos incrementando

la translocación de los transportadores de glucosa GLUT4 desde membranas intracelulares a la membrana plasmática celular.

La translocación de GLUT4 es el principal factor regulador de la glucolisis en el músculo, ya que sin un transporte adecuado de glucosa al interior de las células éstas no pueden degradarla y se produce hiperglucemia. En ausencia de insulina, o en situaciones de

resistencia a esta hormona, GLUT4 se almacena en vesículas intracelulares en el músculo esquelético y el tejido adiposo. La insulina

moviliza estas vesículas directamente a la membrana plasmática y estimula su fusión con ella, aumentando la densidad de

transportadores por unidad de superficie. La cascada de señalización intracelular inducida por insulina actúa sobre la ruta de tráfico

de vesículas en un proceso que implica a las proteínas AS160/Tbc1D4 y Tbc1D1 que modulan Rab GTPasas. Este proceso está siendo ampliamente estudiado, dada la importancia que puede tener para entender y controlar la diabetes tipo 2 o de resistencia a

insulina.

Los objetivos concretos incluyen desarrollar en los estudiantes la capacidad de análisis crítico de la información científica, síntesis

de la información seleccionada, identificación de líneas futuras de investigación, planteamiento y redacción de un proyecto sobre el

tema, incluyendo metodología y memoria económica, y preparar para la defensa oral del mismo.

Bogan JS (2012) Regulation of glucose transporter translocation in health and diabetes. Ann Rev Biochem 81: 27.1-27.26.

http://www.annualreviews.org/doi/pdf/10.1146/annurev-biochem-060109-094246

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: - Búsqueda bibliográfica y selección de fuentes.

- Análisis crítico de la información científica.

- Síntesis de la información seleccionada,

- Planteamiento y redacción de un proyecto de investigación sobre el tema incluyendo metodología y memoria económica

- Defensa oral del mismo.


Imprescindibles: Buenos conocimientos en bioquímica; curiosidad científica; habilidades informáticas, buen conocimiento del inglés;

capacidad de trabajo.

Recomendables: Conocimientos de la metodología de trabajo en bioquímica

Fecha prevista de comienzo: Noviembre 2014



Dedicación semanal prevista por parte del tutor/a (horas): ,5

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Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Dpto de Bioquímica vegetal y Biología Molecular, 1ª planta Fac. de Biología

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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Lara Coronado, Catalina

Cargo: Catedrática de Bioquímica y Biología Molecular


Titulación académica del Director: Dr. en Farmacia


Fax: 954620154




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:

IV.- Convenio. Cumplimentar solo en caso de empresas o instituciones ajenas a la Universidad d e Sevilla. ¿Posee su entidad/empresa convenio firmado con la US para la realización del TFG?: Sí




Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:18 de junio 2014

Firma del Director


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ANEXO VII






Dirección Postal Av Reina Mercedes, 6


Localidad Sevilla

Teléfono

Fax

e-mail


Estructura, función y mecanismo de acción del Centro de Reacción del Fotosistema II


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Investigación bibliográfica sobre la estructura, función y mecanismo de acción del Centro de Reacción del Fotosistema II, una

máquina molecular que usa la energía de la luz para romper el agua en electrones, protones y oxígeno molecular, e implulsar así la

vida en la Tierra. Recientemente se ha obtenido mediante difracción de Rayos X la estructura atómoica (a 1,9 A de resolución) del centro tertranuclear

de Mn del sistema fotooxidante del agua que permiten formular propuestas del mecanismo de reacción de la oxidación del agua.

Los objetivos concretos incluyen desarrollar en los estudiantes la capacidad de análisis crítico de la información científica, síntesis

de la información seleccionada, identificación de líneas futuras de investigación, planteamiento y redacción de un proyecto sobre el tema, incluyendo metodología y memoria económica, y preparar para la defensa oral del mismo.

Vinyard DJ, Ananyev GM and Dismukes GC (2013) Photosystem II: The Reaction Center of Oxygenic Photosynthesis. Ann Rev

Biochem 82: 577-606. http://www.annualreviews.org/doi/full/10.1146/annurev-biochem-070511-100425

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: - Búsqueda bibliográfica y selección de fuentes.

- Análisis crítico de la información científica.

- Síntesis de la información seleccionada,

- Planteamiento y redacción de un proyecto de investigación sobre el tema incluyendo metodología y memoria económica - Defensa oral del mismo.


Imprescindibles: Buenos conocimientos en bioquímica; curiosidad científica; habilidades informáticas, buen conocimiento del inglés;

capacidad de trabajo.

Recomendables: Conocimientos de la metodología de trabajo en bioquímica

Fecha prevista de comienzo: Noviembre 2014



Dedicación semanal prevista por parte del tutor/a (horas): ,5

Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Dpto de Bioquímica vegetal y Biología Molecular, 1ª planta Fac. de Biología

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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Lara Coronado, Catalina

Cargo: Catedrática de Bioquímica y Biología Molecular


Titulación académica del Director: Dr. en Farmacia


Fax: 954620154




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:18 de junio 2014

Firma del Director


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ANEXO VII





Nombre de la entidad o empresa ofertante: Universidad de Sevilla

Dirección Postal Facultad de Biología, Reina Mercedes


Localidad SEVILLA

Teléfono 954557909

Fax



CONSIDERACIONES TERMODINÁMICAS Y CINÉTICAS DE LA FORMACIÓN Y EVOLUCIÓN DE LA VIDA


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Revisión bibliográfica sobre el tema y elaboración del informe correspondiente

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Los principios que gobiernan el nacimiento de la vida siguen en una profunda discusión. Se mantiene por muchos que lo que ha

determinado y aún mantiene la vida es el principio segundo de termodinámica. Este principio dice que un sistema aislado tiende

inexorablemente hasta un estado de equilibrio con un mínimo de entropía. El universo en su conjunto tiende a un máximo de

desorden. Sin embargo, los sistema abiertos –y un ser vivo lo es- pueden disminuir en entropía (aumentar en orden) cuando reciben

energía externa.

La termodinámica determina el resultado final de un proceso, si es o no posible, pero no determina la vía o el camino. La evolución

a través de la vida ha dado lugar a una variabilidad de vías metabólicas que son promovidas por proteínas catalíticas con

mecanismos de actuación muy diversos. Estas vías son favorecidas cinéticamente –transcurren a velocidades altas- y dan lugar a

todo el entramado que constituye el metabolismo celular. La evolución no es sino la puesta en escena de los más eficientes de los posibles mecanismos cinéticos, que hacen que se cumpla de la forma más rigurosa los principios termodinámicos.

BIBLIOGRAFÍA BÁSICA:

1.- J. Theor. Biol. 220, 393-406 (2004)

2.- J. Theor. Biol. 117, 363-383 (1985) 3.- Proc. Nat. Acad. Sci. USA 97, 4463- 4468 (2000)


Imprescindibles: ninguno

Recomendables: Asignaturas relacionadas con el Departamento

Fecha prevista de comienzo: 1-octubre-2014




Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Facultad de Biología, Univ de Sevilla

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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: De la Rosa Acosta, Fco. Fernando





Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:18-6-2014

Firma del Director


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ANEXO VII






Dirección Postal Facultad de Biología, Reina Mercedes


Localidad SEVILLA

Teléfono 954557909

Fax



MEJORA EN LA PRODUCCIÓN DE TRIACILGLICERIDOS POR PLANTAS Y MICROALGAS PARA LA OBTENCIÓN DE

BIODIESEL


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Revisión bibliográfica sobre el tema y elaboración del informe correspondiente

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: El biodiesel es una fuente de energía renovable alternativa formado por ésteres de alcohol que se derivan principalmente de

triacilglicéridos que se someten a una reacción de esterificación. Dichos triacilglicéridos son constituyentes principales de aceites de

plantas y constituyen la reserva energética principal en algas. Debido al elevado coste de esta materia prima es necesario el

desarrollo de métodos para aumentar y mejorar su producción. En plantas, el conocimiento de las rutas de biosíntesis de lípidos y la manipulación genética de enzimas clave puede acercarnos a estos objetivos, permitiendo reducir el uso del terreno cultivable y

evitando la subida del precio de los alimentos. Las algas, y en particular las microalgas, son el futuro proyecto de fábricas de

producción de triacilglicéridos, por sus características de producción y contenido lipídico superiores a los de plantas, pero se

necesitan grandes mejoras para su producción comercial.


Imprescindibles: ninguno

Recomendables: Asignaturas relacionadas con el Departamento

Fecha prevista de comienzo: 1-octubre-2014




Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Facultad de Biología, Univ de Sevilla

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: De la Rosa Acosta, Fco. Fernando





Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Avda Reina Mercedes, 6


Localidad Sevilla

Teléfono 954489511

Fax 954460165



Regulación redox de procesos fotosintéticos


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Realizar una revisión bibliográfica de las sistemas redox del cloroplasto.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Búsqueda de la bibliografía necesaria. Lectura y comprensión crítica de estas referencias y redacción del trabajo en el que discuta las

características de los sistemas redox y los mecanismos de regulación de procesos fotosintéticos.


Imprescindibles: Conocimientos de Bioquímica. Biología Molecular y Genética, así como conocimientos de Biología Vegetal. Imprescindible

buen nivel de inglés.

Recomendables:

Fecha prevista de comienzo: 01-10-2014




Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Departamento de Bioquímica Vegetal y Biología Molecular

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Cejudo Fernández, Fco. Javier

Cargo: Catedrático de Bioquímica y Biología Molecular

Departamento/Institución/Empresa (Indicar dirección si es diferente de la indicada en el punto I): Bioquímica Vegetal y Biología Molecular



Fax: 954460165




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:

IV.- Convenio. Cumplimentar solo en caso de empresas o instituciones ajenas a la Universidad d e Sevilla. ¿Posee su entidad/empresa convenio firmado con la US para la realización del TFG?: Sí




Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:

Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII








Localidad Sevilla

Teléfono 954489511

Fax 954460165



Sistemas antioxidantes en plantasA


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Realizar una revisión bibliográfica de las condiciones que causan extrés oxidativo en plantas, sus efectos en elrendimiento

agronómico de los cultivos más importantes. Describir los sitemas antioxidantes de las plantas y su posible uso biotecnológico.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Búsqueda de la bibliografía necesaria. Lectura y comprensión crítica de estas referencias y redacción del trabajo en el que discuta las

características de los sistemas antioxidantes con las posibles aplicaciones biotecnólogicas de los mismos.


Imprescindibles: Conocimientos de Bioquímica. Biología Molecular y Genética, así como conocimientos de Biología Vegetal. Imprescindible

buen nivel de inglés.

Recomendables:






Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Cejudo Fernández, Fco. Javier





Fax: 954460165




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:

IV.- Convenio. Cumplimentar solo en caso de empresas o instituciones ajenas a la Universidad de Sevilla. ¿Posee su entidad/empresa convenio firmado con la US para la realización del TFG?: Sí




Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal

Código Postal

Localidad

Teléfono

Fax

e-mail


RECIENTES AVANCES EN LA FUNCIÓN Y MECANISMOS DE TRANSDUCCIÓN DE LOS FITOCROMOS


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Analizar los avances recientes en el mecanismo de funcionamiento de los fitocromos

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: TRabajo de revisión y puesta al dia de las funciones de los fitocromos y del mecanismo de transducción de la señal lumínica y sus

interacciones con otras proteínas en plantas


Imprescindibles: Conocimientos de Inglés

Recomendables:

Fecha prevista de comienzo: ENERO 2015


Dedicación semanal prevista por parte del alumno/a (horas):


Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: INSTITUTO DE BIOQUÍMICA VEGETAL Y FOTOSÍNTESIS

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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: FLORENCIO BELLIDO FCO JAVIER

Cargo: CATEDRÁTICO DE UNIVERSIDAD

Departamento/Institución/Empresa (Indicar dirección si es diferente de la indicada en el punto I): BIOQUÍMICA VEGETAL Y BIOLOGÍA MOLECULAR



Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII


GRADO EN BIOLOGÍA. PROPUESTA DE TRABAJO FIN DE GRADO



Nombre de la entidad o empresa ofertante: Dpto. Bioquímica y Biología Molecular. Facultad de Biología

Dirección Postal Reina Mercedes s/n


Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax 954620154



Destoxificación de superóxido por reducción


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: El daño que causan las especies reactivas del oxígeno (ROS) es contrarrestado en gran medida por los mecanismos antioxidantes celulares y por los mecanismos de recambio y reparación. Los mecanismos antioxidantes son muy diversos y en cada organismo, célula o tejido predominan algunos sobre otros. Hay compuestos antioxidantes con varias funciones, enzimas antioxidantes que mantienen en forma reducida dichos compuestos antioxidantes y enzimas que eliminan el O2

•− y el H2O2 evitando así la formación de 1O2 y de HO•. Aparte de los mecanismos antioxidantes específicos, muchos otros compuestos y enzimas contribuyen de diversas maneras a mantener el estado rédox celular. Entre éstos destaca el control de la homeostasis de hierro y cobre, metales esenciales que a la vez pueden reaccionar con oxígeno o peróxido de hidrógeno generando HO•, y de compuestos antioxidantes como el glutatión, ascorbato, tocoferol, carotenos, fenoles, melaninas... Además de las sustancias mencionadas, la mayoría de células tienen una batería de enzimas que eliminan el O2

•−, el H2O2 y el NO. Cualquier deficiencia o exceso de estos sistemas antioxidantes puede desencadenar múltiples daños celulares, como peroxidación de lípidos, oxidación de proteínas, inactivación de enzimas y formación de aductos en el DNA, que finalmente pueden producir la muerte celular. De todas las ROS, este trabajo se centrará en uno de los sistemas de destoxificación de O2

•−, la superóxido reductasa (SOR). Hasta hace poco tiempo sólo se conocía una única actividad enzimática capaz de destoxificar radical superóxido, la actividad superóxido dismutasa (SOD), que cataliza la dismutación del O2

•− en H2O2 y O2 y lo hace de manera muy eficiente (Kcat = 109 M-1 s-1).

2H+ + 2O2•− → O2 + H2O2 (SOD)

Las SOD están presentes en casi todas las células que viven en presencia de O2 y son esenciales para la vida en aerobiosis. La combinación de SOD y peroxidasas/catalasas conduce finalmente a la producción de agua. Aparte de la actividad SOD, que está presente en todos los organismos aerobios conocidos, durante la última década se ha descubierto otro tipo de enzimas, las superóxido reductasas (SOR), que destoxifican O2

•− mediante su reducción con un electrón y que serán el objeto de estudio de este proyecto.

SORred + O2•− + 2H+ → SORox + H2O2 (SOR)

La reacción catalizada por la SOR puede considerarse como más simple que la catalizada por la SOD, ya que, en este caso, el O2

•− actúa solamente como un oxidante del sitio activo de la SOR.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: El alumno deberá llevar a cabo una revisión bibliográfica actualizada.

Capacidades y conocimientos que debe tener el alumno/a para la realización de este proyecto: Imprescindibles:

Conocimientos sólidos de Bioquímica y Biología Molecular. Recomendables:

Manejo de bibliografía especializada. Buen nivel de inglés, sobre todo escrito.

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Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis. cicCartuja. Avda. Américo Vespucio 49, 41092 Sevilla

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto

Apellidos y Nombre: MOLINA HEREDIA, FERNANDO PUBLIO

Cargo: PROFESOR TITULAR DE BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR Departamento/Institución/Empresa (Indicar dirección si es diferente de la indicada en el punto I): BIOQUÍMICA VEGETAL Y BIOLOGÍA MOLECULAR

Titulación académica del Director: Doctor Teléfono directo: 954489514

Fax: 954460165




Cargo:

Departamento: - Teléfono directo:

Fax:

E-mail:

IV.- Convenio. Cumplimentar solo en caso de empresas o instituciones ajenas a la Universidad de Sevilla. ¿Posee su entidad/empresa convenio firmado con la US para la realización del TFG?: Sí En caso de sí existir convenio, fecha del convenio:



Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:16 de junio de 2014 Firma del Director Empresa/Institución/Departamento Firma del Tutor Académico Firma del Director del proyecto

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ANEXO VII





Nombre de la entidad o empresa ofertante: UNIVERSIDAD DE SEVILLA

Dirección Postal AVDA REINA MERCEDES, 6. FACULTAD DE BIOLOGÍA


Localidad SEVILLA

Teléfono 954557075

Fax 954620154



PRODUCCIÓN DE ÁCIDOS GRASOS POLIINSATURADOS (OMEGA-3) POR MICROALGAS: EPA y DHA


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Los Ácidos Grasos Omega-3 son esenciales para la vida y salud de los animales, incluyendo los seres humanos. Los animales somos

incapaces de sintetizarlos, por lo que debemos ingerirlos con la dieta. Normalmente los consumimos al comer pescado, pero no son

realmente la fuente primaria de de dichos ácidos grasos. Los ácidos grasos Eicosapentaenoico (EPA), C20:5, y el Docosahexaenoico (DHA), C22:6 , son especialmente importantes para la salud. Los productores primarios de EPA y DHA son las microalgas, de las

que se alimentan los peces, moluscos y crustáceos. La industria de la Acuicultura es cada vez más potente y menor el número de

peces capturados directamente del mar. Por ello debe suministrarse microalgas ricas en Ácidos Grasos Omega-3 a los peces y otros

animales marinos criados en piscifactorías para su correcto desarrollo y nuesta alimentación saludable. Entre los efectos

beneficiosos de dichos ácidos grasos se encuentran el tratamiento de enfermedades cardiovasculares, alta presión sanguínea, protección del sistema nervioso, depresión, artritis reumatoide, asma, tratamiento del exceso de colesterol…Además en mujeres

embarazadas el adecuado consumo de DHA y EPA son esenciales para el correcto desarrollo del feto. Existe una gran demanda

actual de DHA y Ácido Araquidónico, un ácido graso omega-6, para añadirlos a la leche artificial para bebés. Son fundamentales

para un buen desarrollo del cerebro. Sólo esta última aplicación mueve un mercado mundial de más de 10.000 millones de dólares al

año. Estos Ácidos Grasos también son de gran utilidad en la industria cosmética. La principal empresa productora de DHA es MARTEK (USA), que vende sus productos en más de 60 países del Mundo. Muchas microalgas poseen contenidos en lípidos de

hasta el 70% del peso seco. Entre la mejores microalgas productoras de estos interesantes ácidos grasos se encuentran

Nannochloropsis, Isocrysis, Tetraselmis, Phaeodactylum y muy especialmente Cryptecodinium and Schizochytrium. Phaeodactylum

y Nannocloropsis poseen contenidos en EPA de cerca del 40% del total de ácidos grasos y Schizochytrium un contenido en DHA

del 30-40% del total de ácidos grasos. Los contenidos y productividades en estos ácidos grasos se pueden incrementar mediante cambios ambientales y nutricionales en sus condiciones de cultivo, así como mediante Genética Clásica, ampliamente admitida y

aprobada por las normativas vigentes para las Industrias alimentarias. Es necesario elegir microalgas con un crecimiento rápido y

alto contenido en lípidos, para que finalmente las productividades de EPA Y DHA sean altas. Quizás en un futuro próximo sean

admitidos los GMOs, por lo que también es interesante realizar estudios de Ingeniería Genética en este campo.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Búsqueda bibliográfica especializada, revisión del estado actual del tema y preparación de la memoria final y de la exposición.


Imprescindibles: Conocimiento medio de inglés a nivel de lectura . Haber cursado con éxito las asignaturas de Bioquímica, Fisiología Vegetal

y Genética.

Recomendables: Hábito de trabajo continuado.

Fecha prevista de comienzo: Octubre 2014


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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: RODRÍGUEZ MARTÍNEZ, HERMINIA

Cargo: PROFESORA TITULAR DE UNIVERSIDAD

Departamento/Institución/Empresa (Indicar dirección s i es diferente de la indicada en el punto I): BIOQUÍMICA VEGETAL Y BIOLOGÍA MOLECULAR

Titulación académica del Director: DOCTORA EN BIOLOGÍA


Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:Octubre de 2014

Firma del Director


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ANEXO VII





Nombre de la entidad o empresa ofertante: Facultad de Biología



Localidad Sevilla

Teléfono 954 55 70 75

Fax 954 62 01 54



Reparación de roturas en el ADN e implicaciones en el desarrollo de procesos neurodegenerativos.


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: La acumulación de roturas en el ADN tiene una demostrada influencia en la etiología de diversos síndromes neurológicos. Sin

embargo se desconocen los aspectos mecanísticos que rigen dicha asociación. El objetivo de este Trabajo Fin de Grado es elaborar

un proyecto científico que nos permita avanzar en el conocimiento sobre la relación entre roturas en el ADN y patologías neurológicas

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Para llevar a cabo los objetivos propuestos, el alumno deberá:

1. Estar familiarizado con el campo de investigación. 2. Ser capaz de identificar posibles problemas biológicos no resueltos en dicho campo

3. Diseñar aproximaciones experimentales y metodológicas que permitan abordar dichos problemas

4. Elaborar un Proyecto Científico basado en los anteriores conocimientos


Imprescindibles: a) Disposición para leer extensivamente

b) Sólidos conocimientos e interés del alumno con el campo de investigación c) Nivel medio-alto de comprensión escrita del inglés

Recomendables: a) Interés y entusiasmo por la ciencia en general





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Centro Andaluz de Biología Molecular y Medicina Regenerativa (CABIMER), Américo Vespucio 49, 41092 Sevilla

Facultad de Biología, Reina Mercedes 6, 41012 Sevilla

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Ruiz Pérez, Jose F.

Cargo: Investigador Ramón y Cajal/ Profesor Ayudante Doctor




Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Avda. Reina Mercedes s/n


Localidad Sevilla

Teléfono

Fax



Detección y análisis de genes implicados en cáncer mediante algoritmos de aprendizaje automático


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Detectar genes implicados en cáncer

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: El alumno analizará bases de datos públicas de cáncer, para tratar de encontrar genes cuyos cambios de expresión estén asociados al

desarrollo de cáncer.


Imprescindibles: Capacidad analítica, búsquedas bibliográficas

Recomendables: Conocimientos de Bioinformática, buen nivel de inglés

Fecha prevista de comienzo: Enero 2015




Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Facultad de Biología/Escuela Técnica Superior de Ingeniería Informática/Instituto de Biomedicina de Sevilla

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: García Heredia, José Manuel

Cargo: Profesor Ayudante Doctor

Departamento/Institución/Empresa (Indicar dirección si es diferente de la indicada en el punto I): Departamento de Bioquímica Vegetal y Biología Molecular


Teléfono directo:

Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones En este caso, se trata de un Trabajo Fin de Grado adscrito a la opción Sinergia


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Avda. Reina Mercedes s/n


Localidad Sevilla

Teléfono

Fax



Detección de genes relacionados con la resistencia a platino de células cancerígenas


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Detectar genes implicados en mecanismos de resistencia de células cancerígenas

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: El alumno, utilizando bases de datos públicas, tratará de encontrar genes que determinen resistencia a platino en algunos tipos de

cáncer


Imprescindibles: Capacidad analítica, búsqueda bibliográfica

Recomendables: Conocimientos de Bioinformática, buen nivel de inglés

Fecha prevista de comienzo: Octubre-Noviembre 2014




Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Facultad de Biología/Instituto de Biomedicina de Sevilla

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: García Heredia, José Manuel

Cargo: Profesor Ayudante Doctor

Departamento/Institución/Empresa (Indicar dirección si es diferente de la indicada en el punto I): Departamento de Bioquímica Vegetal y Biología Molecular


Teléfono directo:

Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones E


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Avda. Reina Mercedes 6


Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax 954620154



Citocromo b559. Estructura y función


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Describir la estructura tridimensiomal del citocromo b559 y las funciones propuestas para esta proteína en las ultimas publicaciones

científicas relacionadas

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Revisión bibliográfica

Elaboración de una memoria

Preparación de una exposición y defensa pública


Imprescindibles: a) Disposición para leer extensivamente temas relativos a fotosíntesis. b) Buen conocimiento de inglés

c) Capacidad de redactar un trabajo bibliográfico

d) Capacidad para presentar adecuadamente el trabajo ante la comisión

Recomendables: a) Haber cursado Genética Molecular. Cursar Estructura y Biosíntesis de Macromoléculas





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis (Centro mixto US-CSIC), CicCartuja, Américo Vespucio 49, 41092 Sevilla

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Ortega Rodríguez, José María



Titulación académica del Director: Doctor en Biología


Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Avda. Reina Mercedes 6


Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax 954620154



Organización estructural del Fotosistma II


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Describir la estructura tridimensional del Fotosistema II según las últimas publicaciones científicas relacionadas


Elaboración de una memoria

Preparación de una exposición y defensa pública


Imprescindibles: a) Disposición para leer extensivamente temas relativos a fotosíntesis.

b) Buen conocimiento de inglés c) Capacidad de redactar un trabajo bibliográfico

d) Capacidad para presentar adecuadamente el trabajo ante la comisión

Recomendables: a) Haber cursado Genética Molecular. Cursar Estructura y Biosíntesis de Macromoléculas





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis (Centro mixto US-CSIC), CicCartuja, Américo Vespucio 49, 41092 Sevilla

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Ortega Rodríguez, José María



Titulación académica del Director: Doctor en Biología


Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII








Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax 954 62 01 54



Biosíntesis y degradación del almidón


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Realizar una revisión bibliográfica sobre el proceso de síntesis de almidón y su degradación en organismos fotosintéticos



Imprescindibles: Conocimiento de inglés escrito

Recomendables:






Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Romero Rodríguez, José María





Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Avda Reina Mercedes 6


Localidad Sevilla

Teléfono 954489500 ext 9112

Fax 954460165



Caracterizacion de lineas de Arabidopis deficientes en sistemas redox cloroplastidicos


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Identificacion y caracterizacion de basica de dobles y triples mutantes de Arabidopsis afectados en sistemas redox del cloroplasto

(NTRC, 2-Cys Prx, Trxs) .

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Genotipado de plantas mediante PCR, analisis del crecimiento de las lineas mutantes, respuesta al fotoperiodo, contenido en

pigmentos fotosintéticos, determinacion de parametros fotosinteticos (fijacion de CO2, Fv/Fm, etc).


Imprescindibles: Conocimeintos suficientes en las áreas moleculares (Bioquímica, Genética, Microbiología)

Recomendables: Conocimientos de Fisiología Vegetal





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis, Avda Américo Vespucio 49, 41092-Sevilla

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Pérez Ruiz, Juan Manuel

Cargo: Contratado Juan de la Cierva


Titulación académica del Director: Doctor en Bioquimica

Teléfono directo: 954489500 ext 9112

Fax: 954460165




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Avda Reina Mercedes 6


Localidad SEVILLA

Teléfono 954489500 ext 9112

Fax 954460165



Señalizacion cloroplasto-núcleo en plantas


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Discusion critica de los aspectos mas relevantes en la comunicación intracelular que tiene lugar entre cloroplastos y nucleo y de la

importancia de estos sistemas de señalizacion en el desarrollo de las plantas y en su capacidad de respuesta a estrés.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Revision bibliografica sobre el tema que se propone, utilizando para ello articulos de investigacion y revisiones sobre el tema.


Imprescindibles:

Recomendables:





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis, Avda Américo Vespucio 49, 41092-Sevilla

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Pérez Ruiz, Juan Manuel

Cargo: Contratado Juan de la Cierva


Titulación académica del Director: Doctor en Bioquímica


Fax: 954460165




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/3

ANEXO VII






Dirección Postal Profesor García Gónzalez s/n


Localidad Sevilla

Teléfono

Fax

e-mail


Mecanismos de resistencia a arsénico en organismos fotosintéticos


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: El arsénico es un metaloide muy tóxico ampliamente distribuido en la naturaleza. Su fuente principal es de origen geológico pero el

amplio uso en la fabricación de herbicidas, pesticidas y fungicidas han incrementado sus niveles en la naturaleza contaminando

principalmente las aguas superficiales y aumentando la toxicidad del mismo, provocando importantes problemas para la salud pública en zonas como Bangladesh, Taiwán o la India. Este elemento presenta dos estados de oxidación biológicamente activos, uno

pentavalente, AsO43- (arseniato) y otra trivalente, AsO2ˉ (arsenito). La toxicidad del arseniato viene dada por ser un análogo

estructural del fosfato interfiriendo en las reacciones bioquímicas de éste. El arsenito es tóxico debido a que principalment e

interacciona con los grupos funcionales de las proteínas, como los grupos sulfidrilos de las cisteínas o los grupos imidazol de las

histidinas, generando estrés oxidativo. En algunas estirpes quimiolitotrofas, sin embargo, el arsénico desempeña un papel como donador o aceptor de electrones, mediante la oxidación del arsenito o la respiración del arseniato, respectivamente, siendo éstas las

únicas funciones biológicas conocidas para este metaloide

Esta ha hecho que la mayoría de los organismos presenten mecanismos de resistencia a arsénico. Estos mecanismos han sido

estudiados con detalle en bacterias y levaduras pero solo recientemente se han empezado a dilucidar en organismos fotosintéticos

como las plantas, las algas o las cianobacterias. Este trabajo se centrara en estos organismos tratando de sintetizar el importante número de trabajos que se han llevado a cabo en los últimos años.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Revisión de la bibliografía reciente sobre los mecanismos de resistencia a arsénico..

Generar esquemas que faciliten la compresión a lectores no expertos. Desarrollo del tema en formato de un artículo de revisión en el que se desarrollen cada uno de los puntos y se lleve a cabo una

discusión crítica, así como el enunciado de hipótesis y posibles líneas de investigación.


Imprescindibles: Conocimientos de Biología molecular y técnicas intrumentales en bioquímica.

Conocimento de Inglés para el manejo de bibliografía.

Recomendables: Conocimientos en biología molecular de organismos fotosínteticos





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto:

Pág 2/3

IBVF. Americo Vespucio, 49

Pág 3/3

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: López Maury, Luis

Cargo: Contrato de Acceso al sistema español de Ciencia y tecnología




Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII








Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax 954620154



Respuestas de las microalgas ante el estrés por metales


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Los microorganismos fotosintéticos, debido a las cambiantes condiciones de su hábitat acuático (bien sea este fluvial, lacustre o marino) deben hacer frente a grandes variaciones en la disponibilidad de metales imprescindibles para su metabolismo, como el hierro y el cobre, además de luchar, en determinadas circunstancias, contra la acumulación de estos mismos metales a concentraciones que les resultan tóxicas. Para todo ello, las microalgas eucariotas, en particular, han desarrollado una serie de sofisticadas estrategias, entre ellas la de reemplazar una metaloproteína por otra de idéntica función en ausencia del metal que contiene la primera, y que utiliza como cofactor un metal diferente o un compuesto orgánico no metálico, como una flavina. Las respuestas de resistencia a metales son también muy variadas. El trabajo que se propone consiste en hacer una revisión actualizada de los diferentes mecanismos que usan estos microorganismos fotosintéticos unicelulares para luchar contra el estrés por metales. Bibliografía J.A. Raven (2013) Iron acquisition and allocation in stramenopile algae. J. Exp. Bot. 64, 2119–2127. J. Guo, S. Lapi, T.J. Ruth, M.T. Maldonado (2012) The effects of iron and copper availability on the copper stoichiometry of marine phytoplankton. J. Phycol. 48, 312-325. A. Marchettia, D.M. Schrutha, C.A. Durkina, M.S. Parkera, R.B. Kodnera, C.T. Berthiaumea, R. Moralesa, A.E. Allenb, E.V. Armbrusta (2012) Comparative metatranscriptomics identifies molecular bases for the physiological responses of phytoplankton to varying iron availability. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 109, 317-325. C.E. Blaby-Haas, S.S. Merchant (2012) The ins and outs of algal metal transport. Biochim. Biophys. Acta 1823, 1531-1552. B.L. Nunn, J.F. Faux, A.A. Hippmann, M.T. Maldonado, H.R. Harvey, D.R. Goodlett, P.W. Boyd, R.F. Strzepek (2013) Diatom proteomics reveals unique acclimation strategies to mitigate Fe limitation. PLOS ONE 8, 1-16.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: El alumno deberá llevar a cabo una revisión bibliográfica actualizada de estos diferentes mecanismos que usan las microalgas fotosintéticas para luchar contra el estrés por metales.



Manejo de bibliografía especializada. Buen nivel de inglés, sobre todo escrito.



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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto

Apellidos y Nombre: Hervás Morón, Manuel

Cargo: Catedrático de Universidad Departamento/Institución/Empresa (Indicar dirección si es diferente de la indicada en el punto I): Bioquímica Vegetal y Biología Molecular


Fax: 954460165




Cargo:


Fax:

E-mail:




Cargo:



V.- Observaciones


Pág 1/3

ANEXO VII








Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax 954620154



Reconocimiento molecular y evolución en la transferencia de electrones al fotosistema I

Titulación Grado en Biología Tipo TFG: Opción D

Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Se han propuesto tres modelos cinéticos diferentes para la reducción del fotosistema I (PSI) por sus donadores, plastocianina (Pc) o citocromo c6 (Cit c6): en el modelo tipo I la transferencia de electrones ocurre durante una colisión bimolecular, orientada por fuerzas de largo alcance, entre el PSI y su donador. En el modelo tipo II la reacción ocurre en dos etapas, formándose un complejo transitorio antes de que la transferencia de electrones tenga lugar. Los sistemas que siguen el modelo III alcanzan la máxima eficiencia, y en él se observa un paso extra de reorganización del complejo transitorio hasta alcanzar la conformación óptima antes de la transferencia de electrones en sí. La asociación de las proteínas en el espacio intracelular requiere la participación de fuerzas a larga distancia, mientras que el reajuste entre ellas para optimizar el proceso de transferencia electrónica depende de las fuerzas que actúan a corta distancia. Las interacciones a largo alcance son de naturaleza electrostática, permitiendo el reconocimiento molecular y la preorientación inicial de las moléculas integrantes del complejo; este tipo de interacciones se ven influidas por la fuerza iónica del medio, pudiendo ésta alterar las características del complejo. Cuando las moléculas se encuentran próximas comienzan a actuar las fuerzas hidrofóbicas, los puentes de hidrógeno y los enlaces de van der Waals, desencadenando el proceso de reorganización que optimiza la orientación de los centros redox y consolida el complejo funcional activo. Por esta razón, la carga superficial global de la proteína desempeña un papel importante en el proceso de asociación, mientras que las cargas locales están fundamentalmente implicadas en la reorganización y la estabilización del sistema. Todos estos factores están implicados en la interacción donador/PSI, pero su contribución es variable. Resulta de enorme interés estudiar el reconocimiento molecular y la evolución del mecanismo de interacción entre donador y PSI, y para ello se ha analizado este proceso en multitud de organismos, ya sean procariotas o eucariotas. Para este estudio dan mucha información los cruces entre donadores y PSI de diferentes organismos. En este sentido, ya se ha estudiado previamente, entre otros, el cruce entre la Pc del alga verde Chlamydomonas reinhardtii y el PSI de la diatomea Phaeodactylum tricornutum, que presenta como único donador nativo el Cit c6. Los parámetros cinéticos obtenidos para este cruce indican claramente que la Pc eucariota es peor donador que el propio Cit c6 nativo. Es necesario indicar que la Pc eucariota está bastante más cargada que el donador nativo, presentando el sistema del alga verde una interacción electrostática más fuerte que el de la diatomea. Por ello se han diseñado mutantes de carga de la Pc para reducir la fuerza de la interacción electrostática y tratar de mejorar así la interacción con el PSI. El proyecto se centrará en la expresión y purificación de las Pcs mutantes y el posterior estudio de su interacción con el PSI de la diatomea, centrándose en la relación estructura-función y los factores que regulan el reconocimiento molecular proteína-proteína, para lo que se determinarán las constantes de asociación y de transferencia electrónica del sistema. Para este trabajo se usarán diferentes técnicas disponibles en el laboratorio del grupo (espectroscopia láser, potenciometría redox, etc). En definitiva, el proyecto que se plantea contribuirá muy significativamente a introducir al alumno/a en la dinámica de la investigación, dándole la oportunidad de conocer el fundamento y aprender una gran variedad de técnicas bioquímicas y biofísicas que supondrán una importante base para desarrollar su futura carrera profesional. Bibliografía Hervás, M., Navarro, J.A., Díaz, A., Bottin, H. y De la Rosa, M.A. (1995) Laser-flash kinetic analysis of the fast electron transfer from plastocyanin and cytochrome c6 to photosystem I. Experimental evidence on the evolution of the reaction mechanism. Biochemistry 34, 11321-11326.

Pág 2/3

Hervás, M., Navarro, J.A. y De la Rosa, M.A. (2003) Electron transfer between soluble proteins and membrane complexes in photosynthesis. Accounts Chem. Res. 36, 798-805. Bernal-Bayard, P., Molina-Heredia, F.P., Hervás, M. y Navarro, J.A. (2013) Photosystem I reduction in diatoms: as complex as the green lineage systems but less efficient. Biochemistry 52, 8687-8695.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Expresión y purificación de dos mutantes de la plastocianina del alga verde Chlamydomonas reinhardtii. Se dispone ya de los vectores de expresión de dichos mutantes en E. coli. A partir de estas construcciones se producirán las proteínas recombinantes en el espacio periplásmico de E. coli y se procederá a su purificación mediante precipitación diferencial con sulfato amónico y técnicas cromatográficas (DEAE-celulosa y filtración en gel). Caracterización físico-química de las plastocianinas mutantes. Se determinarán algunas de las propiedades físico-químicas (espectro de absorción UV-Vis, potencial de óxido-reducción, etc) de las proteínas mutantes para comprobar si las mutaciones han afectado ha dichas propiedades. Análisis funcional de la interacción de estos mutantes con el fotosistema I de la diatomea Phaeodactylum tricornutum. Se dispone ya de una preparación purificada de PSI de la diatomea. Se analizará mediante espectroscopia de excitación por láser pulsado la transferencia de electrones desde las plastocianinas mutantes al PSI. Para ello se dispone de un sistema de espectroscopia con un láser pulsado de Nd:YAG. Las cinéticas de los cambios de absorbancia inducidos por el pulso láser y asociados a la fotooxidación del PSI se seguirán a 830 nm, en una banda de absorción específica de dicho fotosistema y sin interferencias de otros componentes de la preparación. De los trazos cinéticos es posible calcular la constante observada de la interacción (kobs). El análisis de la variación de dicha kobs con la concentración de proteína donadora permitirá establecer el mecanismo cinético por el que ocurre la transferencia de electrones entre el donador y el PSI y determinar las constantes cinéticas del proceso, bien la constante bimolecular (k2), o las constantes de asociación de los reaccionantes (KA), de reajuste (KR) (si la hubiera) y de transferencia de electrones (ket). Para determinar el tipo de interacción no covalente que predomina en el proceso, se analizará la variación de la kobs con la fuerza iónica, incrementada gradualmente en el medio de reacción mediante la adición de NaCl. Estos resultados se compararán con los obtenidos para la plastocianina silvestre del alga verde, analizando si se ha modificado el mecanismo de interacción y si las mutaciones han mejorado o empeorado la interacción con el PSI.



Manejo de técnicas básicas de laboratorio de Bioquímica y Biología Molecular. Buen nivel de inglés.






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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Hervás Morón, Manuel

Cargo: Catedrático de Universidad Departamento/Institución/Empresa (Indicar dirección si es diferente de la indicada en el punto I): Bioquímica Vegetal y Biología Molecular


Fax: 954460165




Cargo:


Fax:

E-mail:




Cargo:



V.- Observaciones


Pág 1/2

ANEXO VII








Localidad SEVILLA

Teléfono 954557075

Fax 954620154



BIOSÍNTESIS DE CAROTENOIDES EN ARABIDOPSIS


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Los carotenoides de plantas son una familia de pigmentos isoprenoides que participan en la absorción de luz y son esenciales para la

fotoprotección contra el exceso de luz, que conlleva daños fotooxidativos. Además, los carotenoides actúan como precursores de

hormonas apocarotenoides tales como el ácido abscísico y estrigolactonas, que regulan el desarrollo vegetal y la interacción de las plantas con su entorno. En este trabajo, se describirán los conocimientos actuales sobre los genes y las enzimas de la ruta de

biosíntesis de carotenoides y la regulación de la biosíntesis de carotenoides, tanto a nivel transcripcional como post-transcripcional,

en Arabidopsis.




y Genética.







Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: VARGAS MUÑOZ, MARÍA ÁNGELES





Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII








Localidad SEVILLA

Teléfono 954557075

Fax 954620154



ASTAXANTINA EN MICROALGAS: RUTAS, FUNCIONES E IMPLICACIONES BIOTECNOLÓGICAS


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: La astaxantina (3,3′-dihidroxi-β,β-caroteno-4,4′-diona) es un cetocarotenoide sintetizado por un número muy limitado de

microalgas, plantas, bacterias y hongos. En microalgas, la astaxantina es un carotenoide secundario que se acumula en cuerpos

lipídicos citosólicos bajo estrés ambiental o condiciones de cultivo adversas, y se ha propuesto que su biosíntesis constituye un mecanismo de defensa para proteger a las células del estrés oxidativo. La astaxantina se utiliza como colorante en acuicultura y,

debido a sus propiedades antioxidantes, como nutracéutico para la prevención de ciertas enfermedades asociadas a la formación de

radicales libres. Puesto que la astaxantina producida por microalgas es generalmente preferida a la obtenida mediante síntesis

química, la producción de astaxantina por Haematococcus pluvialis y Chlorella zofingiensis ha sido objeto de intensa investigación

en los últimos años, tanto en sistemas de cultivo fotoautotróficos como heterotróficos y mixotróficos. En este trabajo se describirán las rutas biosintéticas de astaxantina y su regulación, y el papel fisiológico de la biosíntesis de esta xantofila en microalgas, tomando

como organismos modelo H. pluvialis y C. zofingiensis. Asimismo, se analizarán las principales ventajas e inconvenientes del

cultivo en masa de estas microalgas para la producción de astaxantina.




y Genética.







Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: VARGAS MUÑOZ, MARÍA ÁNGELES





Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Av. Reina Mercedes, 6


Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax 954620154



Regulación redox del metabolismo del almidón


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Dada la importancia del almidón como producto de la fijación fotosintética en plantas , así como por sus importantes aplicaciones a

nivel industrial, se propone revisar la literatura referente a la regulación redox de su metabolismo

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Búsqueda bibliográfica, análisis crítico de la información y síntesis de la información disponible.


Imprescindibles: Conocimiento de Ingles. Conocimientos de Bioquímica y Fisiología Vegetal

Recomendables: Hábito de trabajo continuo






Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: González García, María de la Cruz

Cargo: Profesora Titular de Universidad


Titulación académica del Director: Doctora


Fax: 954460165




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:18/Mayo/2014

Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Profesor García Gónzalez s/n


Localidad Sevilla

Teléfono 954489517

Fax



Optimización del uso de cianobacterias para la producción de biodiesel.


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: La disminución de las reservas de petróleo y la combustión causada por la quema de combustibles fósiles generado la necesidad de

buscar otras fuentes para la obtención de biocombustibles. Las cianobacterias presentan la capacidad de secuestrar y fijar CO2 hasta

materia orgánica utilizando energía solar , esto ha generado que estos organismos fotosintéticos puedan utilizarse como biofactorias para la producción de compuestos como los biocombustibles. Existen limitaciones al uso de cianobacterias, por lo que se está

investigando de manera exhaustiva. El objetivo es fundamentalmente aumentar la productividad a través de la mejora de la fijación

de CO2, la mejora de las rutas de producción y la mejora de la tolerancia a los biocambustibles. El objetivo del trabajo es indigar en

la bibliografía y obtener una visión global del tema en los aspectos reseñados.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: Búsqueda bibliográfica del uso de cianobacterias para la obtención de biodiesel.

Desarrollo del tema en formato de un artículo de revisión en el que se desarrollen cada uno de los puntos y se lleve a cabo una

discusión crítica, así como el enunciado de hipótesis y posibles líneas de investigación.


Imprescindibles: Conocimento de Inglés para el manejo de bibliografía.

Recomendables:





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: IBVF. Americo Vespucio, 49

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: HUERTAS ROMERA MARIA JOSE

Cargo: PROFESORA CONTRATADA DOCTOR




Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:18 de Junio de 2013

Firma del Director


Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Avda Reina Mercedes


Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax



Aproximaciones moleculares a la generación de biodiesel por microalgas


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Conocer el estado de la investigación en la obtención de biodiesel mediante la modificación genética de microalgas y cianobacterias


Elaboración de la memoria


Imprescindibles: Todas las disciplinas de la Biología a nivel de 3º curso de grado

Inglés

Recomendables:





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: García González, Mercedes

Cargo: Profesora Titular


Titulación académica del Director: Doctora en Biología


Fax: 954460165




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud: Junio 2013

Firma del Director


mggonza

Sello

Pág 1/2

ANEXO VII






Dirección Postal Avda Reina Mercedes


Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax



Inmovilización de microalgas. Aplicaciones


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Recabar información sobre las técnicas utilizadas para inmovilizar microalgas y las posibles aplicaciones de estos sistemas

inmovilizados


Elaboración de la memoria


Imprescindibles: Todas las disciplinas de la Biología a nivel de 3º curso de grado

Inglés

Recomendables:





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis

Pág 2/2

III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: García González, Mercedes



Titulación académica del Director: Doctora en Biología


Fax: 954460165




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud: Junio 2013

Firma del Director


mggonza

Sello

Pág 1/3

ANEXO VII








Localidad Sevilla

Teléfono 954 55 70 75

Fax 954 62 01 54



Citocromo c550 fotosintético: estructura y función


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: El citocromo (cit) c550 (PsbV) fue descubierto inicialmente como proteína soluble por Holton y Meyers (1963) en cianobacterias.

Es un citocromo que posee un sólo grupo hemo de tipo c coordinado mediante dos histidinas y cuyo peso molecular es de 15 kDa.

Su localización como proteína extrínseca asociada al PSII en la zona del lumen muy cerca del OEC y junto a la p roteína CP43 y a la subunidad alfa del cit b559, ha podido establecerse a partir de la resolución de la estructura tridimensional del PSII de la

cianobacteria T. elongatus (Zouni et al. 2001; Kamiya y Shen, 2003; Ferreira et al. 2004; Loll et al. 2005 Guskov et al. 2009)

La estructura tridimensional resuelta del cit c550 en estado aislado (Frazao et al. 2001; Sawaya et al. 2001; Kerfeld et al. 2003) ha

puesto de manifiesto que posee una estructura similar a la de un citocromo tipo-c típico con un núcleo interior hidrófobo formado por tres regiones en hélice α que forman el nicho para el grupo prostético, más un cuarto segmento N-terminal que protege al hemo

del solvente. La estructura del cit c550 soluble difiere poco de la del estado asociado al PSII. En la actualidad no está claro el modo

en el que el cit c550 se une al PSII, ni si se producen cambios estructurales significativos durante su asociación. Recientemente se ha

propuesto que la región próxima a la His67 sería una región importante en el reconocimiento y unión entre las superficies del cit

c550 y el PSII, y que la región N-terminal del citocromo podría ser el dominio de anclaje al complejo transmembranal (Guskov et al. 2009).

La función del cit c550 se desconoce. Los complejos fotosintéticos de la mayor parte de las bacterias fotosintéticas anoxigénicas que

no oxidan el agua poseen citocromos de tipo c que participan con un papel importante en la transferencia electrónica fotos intética. El

cit c550 podría ser un análogo de estos citocromos con una posible función redox en la transferencia electrónica. Sin embargo, está perfectamente establecido que no participa en ninguna de las reacciones primarias de la cadena de transporte fotosintético en

condiciones estándar. Además las mediciones del potencial redox de esta proteína en su estado soluble han puesto de manifiest o

valores extremadamente negativos (entre −325 y −250 mV) impropios de un citocromo de este tipo e incompatibles con una posible

función redox en la transferencia electrónica en el PSII. La determinación de un Em de +200 mV para el cit c550 asociado al PSII,

significativamente más elevado que en su estado soluble (Roncel et al. 2003; Kirilovsky et al. 2004; Guerrero et al. 2011; Roncel et al. 2012) ha permitido replantear la posibilidad, previamente descartada por la comunidad científica, de una función redox de esta

proteína en la transferencia electrónica fotosintética.

Objetivos

Con este trabajo se pretende que el/la estudiante adquiera un conocimiento detallado de la fotosíntesis y del citocromo c550. El/la estudiante deberá dedicar especial atención a descripción de las estructuras determinadas para este citocromo en diferentes

organismos fotosintéticos y a los posibles papeles fisiológicos propuestos para él en la literatura.

Referencias

Ferrerira KN, Iverson TN, Maghlaoui K, Barber J, Iwata S (2004) Science 303:1831-1836. Frazão C, Enguita FJ, Coelho R, Sheldrick GM, Navarro JA, Hervás M, De la Rosa MA, Carrondo MA (2001) J Biol Inorg Chem.

6:324-32.

Guerrero F, Sedoud A, Kirilovsky D, Rutherford AW, Ortega JM, Roncel M. (2011) J. Biol Chem 286:5985-5994.

Pág 2/3

Guskov A, Kern J, Gabdulkhakov A, Broser M, Zouni A, Saenger W. (2009) Nat Struct Mol Biol. 16:334-342.

Holton RW, Myers J (1963) Science 142:234-235.

Kamiya N, Shen JR (2003) Proc. Nat. Acad. Sci. USA 100:98-103.

Kerfeld CA, Sawaya MR, Bottin H, Tran KT, Sugiura M, Cascio D, Desbois A, Yeates TO, Kirilovsky D, Boussac A. Plant. (2003)

Cell. Physiol. 44:697-706. Kirilovsky D, Boussac A, Roncel M, Wilson A, Zurita J, Ducruet JM, Bottin H, Sugiura M, Ortega JM and Rutherford AW (2004)

J. Biol. Chem. 279:52869-52880.

Loll B, Kern J, Saenger W, Zouni A, Biesiadka (2005) Nature 438:1040-1044.

Roncel M, Boussac A, Zurita JL, Botin H, Sugiura M, Kirilovsky D, Ortega JM (2003) J. Biol. Inorg. Chem. 8:206-216.

Roncel M, Kirilovsky D, Guerrero F, Serrano A, Ortega JM (2012) Biochim. Biophys. Acta1817:1152-63. Sawaya MR, Krogmann DW, Serag A, Ho KK, Yeates TO, Kerfeld CA (2001) Biochemistry 40:9215-9225.

Zouni A, Witt H-T, Kern J, Fromme P, Krauss N, Saenger W, Orth P (2001) Nature 409:739-743.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: El alumno/a deberá realizar un trabajo bibliográfico que consista en una revisión actualizada sobre la función y estructura del citocromo c550 fotosintético. Para ello tendrá que hacer una búsqueda de trabajos realizados en este citocromo y en los que se

describa de forma detallada:

-Aspectos sobre su estructura tanto de la forma soluble como asociada al PSII.

-Diferente metodología utilizada para su estudio tanto estructural como funcional.

-Aspectos sobre la posible función fisiológica de las dos formas: soluble y asociada al PSII. -Implicaciones en un posible papel protector.


Imprescindibles: a) Capacidad para preparar su trabajo en el formato establecido.

b) Disposición para leer extensivamente, tanto temas relativos a citocromos como a fotosíntesis.

c) Ser capaz de pensar y actuar independientemente, tomando una posición activa en el proceso de elaboración del trabajo. d) Capacidad para estructurar adecuadamente el trabajo teniendo en cuenta la propuesta y los objetivos establecidos.

e) Capacidad para presentar adecuadamente el trabajo ante la Comisión Evaluadora, haciendo uso de las herramientas que

considere más adecuadas para ello.

Recomendables: a) Buen conocimiento de inglés





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto: Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis (Centro mixto US- CSIC), CicCartuja, Américo Vespucio 49, 41092 Sevilla

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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Roncel Gil, Mercedes



Titulación académica del Director: Doctora en Química


Fax: 954460065




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


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ANEXO VII








Localidad Sevilla

Teléfono 954 55 70 75

Fax 954 62 01 54



Aplicación de técnicas biofísicas al estudio del fotosistema II

Titulación Grado en Biología Tipo TFG: Opción D

Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: El progreso en la investigación en fotosíntesis depende en gran parte de la instrumentación. Por tanto, no es sorprendente que los

impresionantes avances que se han llevado a cabo en las últimas décadas sean paralelos al desarrollo y mejoras conseguidas en la

sensibilidad y sofisticación tanto de métodos experimentales como de equipamientos físicos. Los métodos biofísicos empleados para el estudio del aparato fotosintético pueden clasificarse en tres grandes grupos: (i) métodos ópticos; (ii) métodos de resonancia

magnética y (iii) métodos enfocados principalmente a la obtención de información estructural. Los métodos ópticos incluyen

dicroísmo linear y circular, fluorescencia resuelta en el tiempo, medidas de absorbancia incluyendo espectroscopía vibracional (IR y

Raman), algunas otras como la espectroscopía fotoacústica, termoluminiscencia (TL), fluorescencia modulada (PAM) y

potenciometría redox utilizando espectroscopía UV-Vis como método de seguimiento del progreso de la reacción redox. En este trabajo, se emplearán diferentes técnicas biofísicas, ampliamente utilizadas en nuestro laboratorio, para el estudio tanto de la

transferencia electrónica como de los componentes del aparato fotosintético. En este trabajo se pretende que el estudiante ut ilize

diferentes técnicas biofísicas como la TL, la fluorescencia modulada (PAM) y la potenciometría redox aplicadas al estudio del

fotosistema II.

La termoluminiscencia es el nombre que recibe la emisión de energía en forma de luz y a temperaturas determinadas, que se produce

tras calentar de forma gradual materiales orgánicos o inorgánicos previamente iluminados a bajas temperaturas. La TL estándar

(STL) aplicada a los organismos fotosintéticos, permite obtener curvas con máximos a varias temperaturas y que se describen como

una serie de bandas o componentes de TL (Roncel and Ortega 2005). La mayoría de estos componentes surgen por reversión de la

separación de cargas inducida por luz en el PSII mediante una recombinación activada térmicamente entre las cargas positivas acumuladas en los intermediarios del sistema de oxidación del agua en el sitio donador y las cargas negativas estabilizadas en las

quinonas QA o QB (aceptores primarios y secundarios del PSII). De este modo, se habla de pares de cargas específicos responsables

de los componentes de TL. A pesar de ser destructiva, esta técnica tiene la ventaja de no ser invasiva y en comparación con otras,

resulta de bajo coste, fácil manejo y alto rendimiento. Por tanto, la TL fotosintética ha llegado a ser ampliamente usada como una

simple pero eficiente técnica en el estudio del funcionamiento del PSII no solo para propósitos biofísicos sino también como complemento para estudios genéticos y medioambientales.

La termoluminiscencia a altas temperaturas (HTL) permite detectar peroxidación lipídica que suele presentarse como una de las

principales consecuencias del estrés oxidativo en las membranas ricas en ácidos grasos poli-insaturados del cloroplasto. La

peroxidación lipídica, una vez iniciada, da lugar a una reacción en cadena de radicales libres en la que algunos compuestos formados, especialmente 1O2 y carbonilos excitados, son especies por sí mismas quimioluminiscentes, es decir, emiten luz al volver

a su estado basal de energía (Havaux 2003). En los cloroplastos, el triplete de los carbonilos puede transferir su energía a moléculas

de clorofilas cercanas, cuya desactivación resulta en una emisión de fotones entorno a los 730 nm. Esta señal de luminiscencia de

origen no fotosintético se ve fuertemente inducida por el incremento en la temperatura lo que permite detectarla mediante TL. En la

actualidad, se sabe que si calentamos por encima de los 60ºC y hasta los 160ºC material fotosintético que haya sufrido estrés oxidativo (estrés medioambiental, senescencia, etc.) es posible detectar la presencia de dos bandas denominadas HTL1 y HTL2, con

un máximo de temperatura entre 65-85ºC y 120-140ºC, respectivamente (ver revisión de Ducruet 2003 y referencias incluidas).

Ambas bandas son atribuidas al 1O2 y a los tripletes de carbonilos que se forman a partir de la peroxidación lipídica y/o durante la

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termolísis de hidroperóxidos lipídicos (Ducruet and Vavilin 1999). Los estudios realizados con esta técnica han puesto de manifiesto

que la banda HTL2 puede emplearse como indicador general de estrés oxidativo (Havaux y Niyogi, 1999; Ducruet 2003; Baroli et

al. 2004).

También se pretende poner a punto la técnica de fluorescencia modulada en cultivos de algas y cianobacterias. Esta técnica permite estudiar, mediante un fluorímetro de pulso modulado (PAM) adaptado a un electrodo de oxígeno, la evolución de la fluorescencia

variable de un material fotosintético a lo largo del tiempo variando las condiciones de la muestra. La determinación de una serie de

parámetros como son la fluorescencia inicial (Fo) y la fluorescencia máxima (Fm) permite obtener información sobre el estado

redox del organismo estudiado.

Además se utilizará la técnica biofísica de la potenciometría para aplicarla al estudio de las propiedades redox de diferentes

proteínas implicadas en el transporte fotosintético. Esta técnica consiste en el registro simultáneo de los cambios en el espectro de

absorción producidos en una proteína al ir reduciéndose u oxidándose, mediante un espectrofotómetro UV-Vis y de los diferentes

valores de potencial de cubeta mediante un potenciómetro (Roncel et al. 2003; Kirilovsky et al. 2004; Guerrero et al. 2011; Guerrero

et al. 2014). Este método permite determinar el valor del potencial medio de oxidación-reducción de diferentes componentes del fotosistema II (citocromos c550, c6 y b559).

Objetivos

Con este trabajo se pretende que el/la estudiante adquiera destreza en el uso de diferentes técnicas biofísicas y en su aplicación al

estudio del fotosistema II. También se pretende que adquiera experiencia en el cultivo de organismos fotosintéticos y en el trabajo de laboratorio.

Referencias

Baroli I, Gutman BL, Ledford HK, Shin JW, Chin BL, Havaux M, Niyogi KK (2004) Photo-oxidative stress in a xanthophyll-

deficient mutant of Chlamydomonas. The Journal of biological chemistry 279 (8):6337-6344. Ducruet JM (2003) Chlorophyll thermoluminescence of leaf discs: simple instruments and progress in signal interpretation open the

way to new ecophysiological indicators. Journal of experimental botany 54 (392):2419-2430.

Ducruet JM, Vavilin D (1999) Chlorophyll high-temperature thermoluminescence emission as an indicator of oxidative stress:

perturbating effects of oxygen and leaf water content. Free Radic Res 31 Suppl:S187-192 Guerrero F, Sedoud A, Kirilovsky D, Rutherford AW, Ortega JM, Roncel M (2011) A high redox potential form of cytochrome

c550 in photosystem II from Thermosynechococcus elongatus. The Journal of biological chemistry 286 (8):5985-5994.

Guerrero F, Zurita JL, Roncel M, Kirilovsky D, Ortega JM (2014) The role of the high potential form of t he cytochrome b559:

Study of Thermosynechococcus elongatus mutants. Biochim Biophys Acta 1837 (6):908-919.

Havaux M (2003) Spontaneous and thermoinduced photon emission: new methods to detect and quantify oxidative stress in plants. Trends in plant science 8 (9):409-413.

Havaux M, Niyogi KK (1999) The violaxanthin cycle protects plants from photooxidative damage by more than one mechanism.

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 96 (15):8762-8767

Kirilovsky D, Roncel M, Boussac A, Wilson A, Zurita JL, Ducruet JM, Bottin H, Sugiura M, Ortega JM, Rutherford AW (2004)

Cytochrome c550 in the cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus: study of redox mutants. The Journal of biological chemistry 279 (51):52869-52880.

Roncel M, Boussac A, Zurita JL, Bottin H, Sugiura M, Kirilovsky D, Ortega JM (2003) Redox properties of the photosystem II

cytochromes b559 and c550 in the cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus. J Biol Inorg Chem 8 (1-2):206-216.

Roncel M, Ortega JM (2005) Afterglow thermoluminescence band as a possible early indicator of changes in the photosynthetic

electron transport in leaves. Photosynth Res 84 (1-3):167-172.

Sinopsis de los trabajos a realizar por el alumno/a: El alumno/a deberá realizar un trabajo de laboratorio que consista en la aplicación de diferentes técnicas biofísicas al estudio del

aparato fotosintético y fundamentalmente del fotosistema II. Para ello utilizará una o varias de las tres técnicas mencionadas

anteriormente: termoluminscencia, fluorescencia modulada y potenciometría redox.


Imprescindibles: a) Capacidad para preparar su trabajo en el formato establecido.

b) Disposición para trabajar en el laboratorio.

c) Ser capaz de pensar y actuar independientemente, tomando una posición activa en el proceso de realización del trabajo.

d) Capacidad para estructurar adecuadamente el trabajo teniendo en cuenta la propuesta y los objetivos establecidos.

e) Capacidad para presentar adecuadamente el trabajo ante la Comisión Evaluadora, haciendo uso de las herramientas que considere más adecuadas para ello.

Recomendables: a) Buen conocimiento de inglés





Dirección del lugar donde se realizará el proyecto:

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Instituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis (Centro mixto US- CSIC), CicCartuja, Américo Vespucio 49, 41092 Sevilla

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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Roncel Gil, Mercedes



Titulación académica del Director: Doctora en Química


Fax: 954460065




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones


Firma del Director


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ANEXO VII








Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax 954620154



Interacción de ADN y Proteínas con el complejo metálico Cisplatino.


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Investigación bibliográfica del papel de Cisplatino en el desarrollo de nuevas drogas anticancerigenas.



Redactar una memoria en la que se resuma y discutan estos trabajos de acuerdo a la normativa TFG

Defensa oral del mismo


Imprescindibles: Inglés, buenos conocimientos de bioquímica, curiosidad científica, habilidades informáticas, capacidad de trabajo







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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Murdoch, Piedad el Socorro

Cargo: Profesor Titular de la Universidad de Sevilla




Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:18 Junio 2014

Firma del Director


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ANEXO VII








Localidad Sevilla

Teléfono 954557075

Fax 954620154



Sinorhizobium fredii, a broad-host range bacterium that nodulates soybean and many other legumes.


Reseña de los objetivos y contenido del proyecto: Investigación bibliográfica del papel en simbiosis de los diversos polisacáridos superficiales (PSS) en Sinorhizobium fredii.

Los objetivos concretos incluyen desarrollar en los estudiantes la capacidad de análisis crítico de la información científica, s



Redactar una memoria en la que se resuma y discutan estos trabajos de acuerdo a la normativa TFG Defensa oral del mismo


Imprescindibles: Inglés, buenos conocimientos de bioquímica, curiosidad científica, habilidades informáticas, capacidad de trabajo







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III.- Datos del Director/Tutor del Proyecto Apellidos y Nombre: Murdoch, Piedad el Socorro

Cargo: Profesor Titular de la Universidad de Sevilla




Fax:




Cargo:

Departamento:

-

Teléfono directo:

Fax:

E-mail:





Cargo:



V.- Observaciones

Fecha de la solicitud:18 Junio 2014

Firma del Director


anexo vii facultad de biologÍa propuesta …reseña de los objetivos y contenido del proyecto:...

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