PERFILES DE EXPRESIÓN GÉNICA Y DIAGNÓSTICO / PRONÓSTICO

EN CÁNCER

17 DE JUNIO MONTSERRAT SERÉS ROIG 2013 GENÓMICA Y PROTEÓMICA CURSO 2012-2013

DEFINICIONES

• EXPRESIÓN GÉNICA : proceso por el cual todos los organismos procariotas y eucariotas transforman la información por los ácidos nucleicos ( DNA ) en las proteinas necesarias para su desarollo y funcionamiento .

• PERFIL DE EXPRESIÓN GÉNICA : medida de expresión de varios genes en una célula en un momento dado.

METODOS DE DETECCIÓN

GEN PORTERO : •Secuencia conocida .•Caraterísticas visulamente identificables .•Luminiscentes / fluorecentes .

NOTHERN BLOT : •Sonda radioactiva-mRNA•Electroforesis en gel •Separación de fragmentos según su tamaño .

WESTERN BLOT : •Detectar proteinas específicas . •Electroforesis en gel . •Unión mediante Ag-Ac .

HIBRIDACIÓN IN SITU : •Capacidad de AANN de hibridación .•Complementariedad •Sonda marcada con isotopo radioactivo con secuencia de ADN o ARN .

PCR : •gran número de copias . •Fragmento ADN en particular .

MICROARRAYS ( chip de ADN ) •Superficie sólida a la cual se une una colección de ADN •Medir el nivel de hibridación entre sonda y molécula diana (target ) mediante fluorescencia .

APLICACIONES

• Estudio de expresión de genes . • Clasificar enfermedades • Identificar genes específicos de ciertas

patologias . • Predicción de respuesta a un tratamiento . • Detección de polimorfismo de un gen ( SNP’s).

DIAGNÓSTICO/ PRONÓSTICO EN CÁNCER

• Pulmon / hígado / mama / próstata / digestivos / hematológicos / pancreas etc .

• Clasificación de subtipos .• Diagnóstico . • Pronóstico : - respuesta a un tratamiento - supervivencia del paciente .• Buscar nuevas moléculas diana ( TARGETS ) .

CÁNCER / GENÉTICA • Visualizar el cáncer como una enfermedad genética .

(mutaciones heredables ) • Ciertos genes se convierten en oncogenes causantes de

cáncer .• Otros genes , supresores , previenen el crecimiento

incontrolado de células ; si son anulados provocan aparición de cáncer .

• Las mutaciones aisladas , generalmente no son suficientes para causar cáncer , sino que producen cambios que predisponen a las células al crecimiento maligno .

EL CANCER ES UN PROCESO DE MUCHAS ETAPAS

CLASIFICIÓN MOLECULAR EN EL CÁNCER DE MAMA

• Clasificado en 4 subtipos : luminal A / luminal B / Her2neu / Basal Like .

• Estudio descriptivo transversal en 399 pacientes . • Seguimiento en 5 años .• Se mide : - EFECTIVIDAD DEL TRATAMIENTO - PRONÓSTICO

- CLASIFICACIÓN GENÉTICA - RIESGO • DIAGNÓSTICO INICIAL : mediante biopsias guiadas por

ultrasonidos .

CÁNCER DE MAMA DESDE EL PUNTO DE VISTA INMUNOHISTOQUÍMICO

Luimnal A Luminal B Herb2Neu Basal Like

estrogeno positivo positivo negativo negativo

progestageno Positivo/negativo positivo negativo negativo

Gen C-erB2 negativo positivo positivo negativo

Pre / postmenopausa

post post pre pre

diagnóstico precoz precoz tardío tardío

pronóstico favorable favorable desfavorable desfavorable

Diferenciado/ indiferenciado

diferenciado diferenciado indiferenciado indiferenciado

edad precoz precoz tardía tardía

Tratamiento inicial IQ IQ QT QT

Diseminación precoz

negativa negativa positiva positiva

DIAGNÓSTICO GENÉTICO

MICROARRAYS : •Identificar la expresión génica .•Precisión en el diagnóstico .•Un pronóstico más preciso .•Selectividad en el tratamiento con QT :-menos morbi/mortalidad inducida por el tratamiento QT.-menos coste -más índice de curación

GENÉTICA EN CÁNCER DE MAMA

• De los 4 subtipos luminal A / B son menos agresivos respecto a los otros 2 .

• Diagnóstico subclinico mayor en luminal A / B.• Menor / mayor agresividad . • Selectividad del tratamiento .• Posibilidad de realización de un ONCOTYPE

TCGA( The Cancer Genome Atlas )

• Artículo publicado : « Endometrial cancer findings emerge from genome sequencing study « .

• Publicación del análisis genético de 7 cánceres , entre ellos el endometrial .

• Publicado en el New England Journal of Medecine .

• Intenta caracterizar el análisis genómico de hasta 20 cánceres diferentes .

• Gracias a la contribución de muchos pacientes en proporcionar sus datos clínicos

Cáncer de Endometrio• 4 subtipos . • Analizar similitudes con otros cánceres comunes

(ovario , mama , colorectal ) .• Determinar que pacientes se benefician de un

tratamiento más agresivo . • Es el 4° cancer más común en U.S en mujeres . • Clasificamos 2 tipos :- Endometrial : asociado a un exceso de estrógenos y

obesidad . - Seroso : más común en mujeres en edad post

menopáusica .

OBJETIVOS DEL ESTUDIO

• Clasificar la mortalidad asociada segun el tipo de cáncer .

• Adecuar un tratamiento agresivo a cada subtipo . • identificación de mutaciones : - Gen supresor TP53- Extensión de «copy numbers « Que proporcinan mayor agresividad al tipo serosos.

• Compartir características genéticas con otros tipos de cánceres :

- Ovario seroso / basal-like mama / endometrio comparten similar « copy numbers « y mutación en el gen TP53 .

- Menos frecuente la mutación en el gen PTEN - Endometrio- colorectal comparten la

mutación en el gen POLE involucrado en la reparación del ADN .

CONCLUSIONES

• TCGA permite conocer el perfil genético de ciertos cánceres .

• Mayor efectividad en los tratamientos de ciertos cánceres con diferente perfil genético .

• Asociación de anomalías genéticas entre cánceres .

• Contribución pública del conocimiento de la genética de un cáncer para un mejor futuro en su manejo y tratamiento

BIBLIOGRAFIA

• « Endometrial cancer findings emerge from genome sequencing study «. Broad Institute of MIT and Harvard .8 de mayo 2013

• Clasificación molecular del cáncer de mama y su correlación – J.Uribe , C. Herenandez, F.Menolascino . Rev Venez Oncol 2010;22(2):109-116.

• Pubmed : perfiles de expresión génica en cáncer .

MUCHAS GRACIAS