Ligamiento Mapeo Cromosomico

Segregacion independiente

Los genes que estn localizados en cromosomas diferentes se distribuyen en los gametos de manera independiente uno del otro, segn la Ley de la Segregacin Independiente de Mendel.

Por ejemplo, si un individuo posee un genotipo AaBb y los genes para las caractersticas A y B estn localizados en diferentes cromosomas, entonces se obtendrn las siguientes 4 clases de gametos y todos en igual proporcin: AB, Ab, aB y ab.

Ligamiento

Cuando dos o ms genes estn en el mismo cromosoma, se dice que estn ligados. Los genes ligados permanecen juntos durante la formacin de gametos. No se distribuyen de manera independiente, sino que tienden a permanecer juntos en las mismas combinaciones en las que se encontraban en los progenitores.

Los gametos recombinantes tendran los genotipos Ab y aB, y la proporcin de estos gametos siempre ser menor a la de los gametos no recombinantes AB y ab, que tambin llamados parentales.

La proporcin de los gametos recombinantes que se obtengan depende directamente de la distancia en la cual los genes estn separados en el cromosoma (a mayor distancia mayor ser el porcentaje de gametos recombinantes que se obtengan). Ligamiento Incompleto

Entrecruzamiento

Entrecruzamiento entre la regin A-B de los cromosomas homlogos.

Entrecruzamientos mltiples: con slo dos marcadores genticos. AB/ab ABABab ab

Los alelos de heterocigotos dobles en loci ligados se pueden encontrar en una de dos posiciones:

Si los alelos del tipo silvestre estn en un cromosoma y los mutantes en el otro:AB/ab, la relacin de ligamiento se conoce como fase de acoplamiento.

Cuando el alelo de tipo silvestre de un locus y el mutante de otro locus ocupan el mismo cromosoma:Ab/aB, la relacin de conoce como fase de repulsin.

Frecuencia de quiasmas

Un par de cromosomas en sinapsis consiste de cuatro cromtidas y se le llama ttrada. Esta estructura experimenta en sus cromatidas no hermanas al menos un quiasma en algn punto de su longitud.

A mayor longitud de un cromosoma, mayor es el nmero de quiasmas que se pueden producir. Mientras ms alejados se encuentren dos genes en un cromosoma, mayor es la posibilidad de que se produzca un quiasma.

Entre ms cercanos, menor es la posibilidad. El porcentaje de gametos recombinantes formados es un reflejo directo de la frecuencia con la cual se forman quiasmas entre los genes.

Frecuencia de quiasmas

Cuando se forma un quiasma entre dos loci gnicos, solo la mitad de los productos meiticos ser del tipo recombinante.

La otra mitad ser del tipo parental ya que la otra cromtida no sufri cambios.

Luego, una ttrada da origen a 4 gametos, 2 recombinantes y 2 parentales. De aqu que la frecuencia de los productos recombinados (o gametos recombinantes) corresponder a la mitad de la frecuencia de ttradas que tienen quiasmas.

Frecuencia de quiasmas

Por ejemplo, si se forma un quiasma entre los loci de los genes A y B en un 30% de las ttradas de un individuo con genotipo AB/ab, entonces, el 15% de los gametos ser del tipo recombinante (Ab o aB) y el 85%, ser del tipo parental (AB o ab).

%Quiasmas = 2 (%de Entrecruzamiento)

Cuando se presentan entrecruzamientos dobles entre marcadores genticos, los productos, a nivel de los fenotipos, son slo del tipo parental.

Para detectar estos tipos de entrecruzamientos se debe tener un tercer marcador C , para de esta forma, poder identificar a travs del fenotipo los posibles entrecruzamientos dobles o simples.Entrecruzamientos mltiples: con un tercer marcador mostrando los recombinantes.

Entrecruzamientos mltiples: con un tercer marcador mostrando los recombinantes.ACB/acbACBAcBaCbacb

Mapa gentico

Para realizar un mapa gentico y determinar el orden de los genes y las distancias de mapa se trabaja actualmente con marcadores genticos que presentan un fenotipo fcil de identificar, con los que adems sea factible encontrar su posicin dentro de un cromosoma, a travs de una progenie obtenida a partir de un cruce de prueba.

Esta es la forma ms fcil de ubicar gametos recombinantes en un dihbrido.

Distancia de mapa

Los lugares en donde se encuentran los genes en los cromosomas estn ubicados en orden lineal.

Hay dos aspectos principales que considerar para el mapeo gentico:

1. La determinacin del orden lineal en el cual estn ordenadas las unidades genticas unas respecto a otras. 2. La determinacin de las distancias entre las unidades genticas.

La unidad de distancia que tiene la mayor utilidad en la prediccin del resultado de ciertos tipos de cruzas es una expresin de la probabilidad de que se presente entrecruzamiento entre los dos genes bajo consideracin.

Distancia de mapa

La unidad de distancia de mapa equivale por lo tanto al 1% de la probabilidad de entrecruzamiento y se conoce como centimorgan.

Por lo general, no se presenta un entrecruzamiento doble entre genes separados a menos de 5 unidades de mapa. Para genes ms lejanos es conveniente usar un tercer marcador entre los otros dos para detectar cualquier entrecruzamiento doble.

Suponga que se cruzan individuos trihbridos de genotipo ABC/abc x abc/abc, y se produce lo siguiente en la progenie:

29% ABC/abc12% Abc/abc8% ABc/abc1% AbC/abc29% abc/abc12% aBC/abc8% abC/abc1% aBc/abc58% Tipo Parental24% Recombinantes Sencillos16% Recombinantes Sencillos2% Recombinantes DoblesRegin A y B (regin I)Regin B y C (regin II)

Los genotipos de individuos (2n) de la F1 se transforman en genotipos de gametos (n). Para lo cual a cada genotipo se le elimina la contribucion del padre recesivo (abc)

29% ABC12% Abc8% ABc1% AbC29% abc12% aBC8% abC1% aBc58% Tipo Parental24% Recombinantes Sencillos16% Recombinantes Sencillos2% Recombinantes DoblesRegin A y B (regin I)Regin B y C (regin II)

Para encontrar la distancia A-B se suman todos los % de las recombinantes para estos 2 genes = 24 + 2 = 26 unidades de mapa.

Explicacin: en la forma parental ambos estan dominantes (en la forma AB) o ambos estn recesivos (en la forma ab). Por lo tanto las recombinantes para estos genes, sern aquellos gametos que lleven un gen dominante y el otro recesivo.

Es decir tenemos que buscar gametos que presenten las combinaciones Ab y aB (independiente de como se encuentre C) en esta regin.

Para encontrar distancia entre B-C se razona de manera similar. Las recombinates para estos genes seran los gametos portadores de las combinaciones Bc y bC. Luego la distancia de mapa = 16 + 2 = 18 unidades de mapa.

Como puede verse, el % de los gametos parentales No contribuye en ninguna de las distancias de mapa. El % del doble recombinante contribuye en ambas distancias de mapa. Cada % de recombinantes simples slo contribuye en una de las distancias de mapa.

Coeficiente de Coincidencia

El % de dobles recombinantes observados, que en el ejemplo es de un 2%, no necesariamente debe resultar igual al % de los dobles recombinantes esperados,

Puesto que el hecho que ocurra una recombinacin simple en un determinado lugar (entre A y B), impide que ocurra simultneamente otra recombinacin (entre B y C) en un sitio cercano.

El % de dobles recombinantes esperados se calcula multiplicando las probabilidades de las distancias de mapa calculadas. As, tendramos 0.26 x 0.18 = 4.68 %.

Coeficiente de Coincidencia

El coeficiente de coincidencia, que como mximo es 1.0, es un cociente entre el % de dobles recombinantes observados y el % de los dobles recombinantes esperados. En el ejemplo es 2/4.67 = 0.42

Al resultar inferior que 1.0, indica que ocurri interferencia, la que es (1 coincidencia).