enzimas reguladoras
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Traducción del capitulo de enzimas reguladoras y espacios alostericos del libro Lenniger de Bioquimica.TRANSCRIPT
Luz María Viñas Cerón BIOQUÍMICA I 15 de marzo de 2015
Capítulo 8: Enzimas Enzimas Reguladoras
Ahora giramos hacía una clase especial de enzimas que representan excepciones a
algunas de las reglas mencionadas a lo largo de este capítulo. En el metabolismo celular,
grupos de enzimas trabajan juntas dentro de caminos secuencia para realizar un proceso
metabólico dado, tal como la multireacción de la conversión de glucosa a lactasa en músculos
esqueléticos o la multireacción en la síntesis de un aminoácido a partir de precursores simples
en una célula bacteriana. En algunos sistemas de enzimas, la reacción producida por la
primer encima convierte el sustrato del siguiente, así sucesivamente.
La mayoría de las enzimas en cada sistema sigue patrones cinéticos ya descritos. Sin
embargo, dentro de cada sistema enzimático, hay por lo menos una enzima que determina la
tasa de reacción de todas las secuencias porque limita la tasa de reacción o es la enzima a la
que pertenece la velocidad limitante. Estas enzimas regulatorias muestran incrementos o
decrementos de su actividad catalítica en respuesta a determinadas señales. Con las acciones
de estas enzimas regulatorias, los procesos metabólicos son constantemente ajustados para
satisfacer los cambios en las demandas de energía y biomoléculas requeridas en el crecimiento
y reparación celular. En la mayoría de los sistemas multienzimáticos, la primera enzima en
canalizar es una enzima regulatoria. En el proceso de catálisis, incluso las primeras reacciones
de una vía que conduce a un productor innecesario, desvían energía y metabolitos de otros
procesos más importantes. Por tanto, un excelente sitio para regular una vía metabólica es el
punto critico de la vía metabólica. Las otras enzimas en la secuencia de reacción usualmente
se presentan en concentraciones que proveen un gran excesos de actividad catalítica, estas
pueden estimular sus reacciones tan rápido como sus sustratos están saliendo de las reacciones
precursoras.
La actividad de las enzimas regulatoria es modelada mediante varios tipos de moléculas
indicadoras, las cuales son generalmente pequeños metabolitos o cofactores. Hay dos clases
TRADUCCIÓN UNIDAD I !1
generales de encimas regulatoria dentro de las vías metabólicas. Las enzimas alostéricas que
actúan reversiblemente, mediante una unión no covalente con el metabolito regulatorio
llamado modulador. El termino alostérico proviene del griego allos que significa “otros” y
setteros que significa “sólido” o “figura”. Las enzimas alostéricas son aquellas que tienen
“otras formas” u arreglos espaciales inducidos por la unión con los moduladores. La segunda
clase incluye a las enzimas reguladas por modificaciones reversibles de los enlaces covalentes.
Ambas clases de enzimas regulatorias tienen a tener múltiples subunidades, y en algunos
casos, el sitio o sitios regulatorios y los sitios activos son unidades separadas.
Existen por lo menos otros dos mecanismos por los cuales cada actividad enzimática es
regulada. Algunas enzimas son estimuladas o inhibidas por otras proteínas de control que se
unen a ellas y afectan su actividad. Otras son activadas por el desdoblamiento proteico, el
cual, a comparación de otros mecanismos, es irreversible. Ejemplos importantes de estos dos
mecanismos se pueden observar en procesos fisiológicos como la digestión, la coagulación de
sangre, las acciones de las hormonas y la visión.
No hay una sola regla que defina la frecuencia de los diferentes tipos de regulación
dentro de los diferentes sistemas. En cierto grado, La regulación alostérica (no covalente)
puede permitir un ajuste de las vías metabólicas que son requeridas continuamente pero en
diferentes niveles de actividad, acordes a las cambiantes necesidades celulares. La regulación
dada por modificaciones en enlaces covalentes tiende a inhibir o permitir totalmente la
actividad enzimática, sin embargo, ambos tipos de regulación son estudiados en cierto
número de enzimas regulatorias.
Enzimas Alostéricas son reguladas por los enlaces no covalentes de Moduladores
En algunos sistemas multienzimaticos la enzima regulatoria es inhibida específicamente
por el producto final de la reacciones siempre que el producto final exceda las necesidades
celularesm cuando se reduzca la reacción de la enzima regulatoria, las enzimas subsecuentes
operaran a tasas de reacción menores debido a que sus sustratos se agotan. Así la tasa de
producción del producto final de las vías enzimáticas se encontrara en balance con las
necesidades celulares. Este tipo de regulación es llamado retroacción inhibido. La
acumulación del producto final desacalorará toda la vía enzimática.
TRADUCCIÓN UNIDAD I !2
Uno de los primeros ejemplos descubiertos de la inhibición por retroacción alostérica
fue en un sistema enzimasico bacteriano que cataliza la conversión de L-Treonina a L-
Isoleucina. En este sistema, la primera enzima, treonina deshidratasa* es inhibida por la
isoleucina, el producto de la ultima reacción del conjunto de reacciones enzimaticas. La
isoleucina es bastante específica como inhibidor, ningún otro intermediario en esta secuencia
de reacciones inhibe la Treonina deshidratasa, así como ninguna otra enzima en la secuencia
de reacciones lo hace. La isoleucina no se une al sitio activo, sino a otro sitio especifico en la
molécula enzimática: el sitio regulatorio. Este enlace es no covalente y, por tanto, fácilmente
reversible; si la concentración de isoleucina decrece, la tasa de acción de la reinan
deshidratasa aumenta, así la actividad de la treonina deshidratasa responde rápida y
reversiblemente a las fluctuaciones de las concentraciones de isoleucina en la célula.
Enzimas Alostéricas son la excepción a muchas reglas generales.
Los moduladores para las enzimas alostéricas pueden ser inhibidores o estimuladores.
Un activador es con frecuencia un sustrato por sí mismo, y las enzimas reguladoras, para las
cuales el sustrato y el modulador son idénticos, son llamadas homotrópicas. Cuando el
modulador es otra molécula diferente al sustrato, la enzima es heterotrópica. Algunas
enzimas tienen dos o más moduladores.
Como ya habrán notado, las propiedades de las enzimas alostéricas son
significativamente diferentes a las simples de las enzimas no regulatoria, discutidas en el
capítulo anterior. Algunas de estas diferencias son estructurales. En adición a sitios activos o
catalíticos, las enzimas alostéricas tienen generalmente un o más sitios regulatorios o
alostéricos para el enlace del modulador. Así como el sitio activo de las enzimas es específico
para su sustrato, el sitio o alostérico es específico para su modulador. Enzimas con varios
moduladores tienen generalmente sitios específicos de enlace para cada uno. En las enzimas
homotrópicas el sitio activo y el sitio regulador son el mismo.
LAs enzimas alostéricas son generalmente más largas y complejas que las enzimas
simples. La mayoría de ellas tiene dos o más cadenas o subunidades polipeptídicas. El
aspartarto transcarbomolasa, quién cataliza la primer reacción de la biosíntesis de los
nucleótidos pirimidicos, tienen doce cadenas polipeptídicas organizadas dentro de
subunidades catalíticas y regulatorias.
TRADUCCIÓN UNIDAD I !3
Otras diferencias entre enzimas no reguladas y enzimas alostéricas involucra sus
propiedades cinéticas. Las enzimas alostéricas muestran relación entre V0 y [S], que difieren
de la normalidad del comportamiento de Michaelis-Menten. Estas exhiben saturación con el
sustrato cuando [S] es suficientemente alto, pero para algunas enzimas alostéricas, cuando V0
esta en un punto intermedio, no podemos referimos con la designación Km porque la enzimas
no sigue la relación hiperbólica de Michaelis-Menten. En su lugar, el síbolo [S]0.5 o [K]0.5 es
frecuentemente usado para representar la concentración de sustrato dada a la mitad de la
velocidad máxima de la reacción canalizada por una enzimas alostérica.
El comportamiento cinético sigmoideo refleja generalmente interacciones cooperativas entre
las múltiples subunidades proteicas. En otras palabras, los cambios de una sub-unidad son
trasladados en cambios estructurales de subunidades adyacentes, un efecto que es mediado
por interacciones no covalentes en la interfase entre las subunidades. Los principios son
similares a los discutidos en la cooperación del oxígeno al momento de unirse a la
hemoglobina.
Las enzimas alostéricas homotrópicas generalmente tienen múltiples subunidades. En
muchos casos el mismo sitio de unión en cada subsidiad funciona como sitio activo y
regulador. El sustrato puede funcionar como un activador porque las unidades actúan
simultáneamente. La unión de una molécula del sustrato a un sitio de unión altera la
conformación de la enzimas y mejora considerablemente la unión de subsecuentes moléculas
de sustrato; esto explica porque se forma la gráfica sigmoidea, en lugar del incremento
hiperbólico en V0 con el incremento de [S].
Con respecto a las enzimas heterotrópicas, en las cuales el modulador es un
metabolismo distinto al propio sustrato, es difícil generalizar la condición de la curva de
saturación del sustrato. Un activador puede hacer que la curva de saturación de sustrato se
haga casi hiperbólica, con un decremento en K0.5 pero manteniendo constante Vmax , lo que
da lugar a un incremento de la velocidad de reacción a una concentración constante de
sustrato. [V0] es mas alto que cualquier valor de [S]. Otras enzimas alostéricas responden a
un activador mediante un incremento de Vmax , con un pequeño cambio en K0.5. Por lo tanto,
las enzimas alostéricas muestran diferentes tipos de respuesta en sus curvas de actividad con el
sustrato, debido a que algunas tienen moduladores inhibitorios, otras activadores, y algunas
otras ambos.
TRADUCCIÓN UNIDAD I !4
Dos Modelos que explican el Comportamiento Cinético de las Enzimas Alostéricas
La dependencia sigmoidal de V0 sobre [S] refleja subunidades cooperativas, y ha
inspirado a dos modelos a explicar estas interacciones cooperativas. En el primer modelo ( el
modelo simétrico), propuesto por Jacques Monod y colegas en 1965, una enzima alostérica
puede existir solamente en dos conformaciones, la activa y la inactiva. Todas las subunidades
están en la forma activa o bien todas están en la forma inactiva. Toda molécula de sustrato
que se une incrementa la posibilidad del estado inactivo al activo.
En el segundo modelo, propuesto por Koshland en 1996, hay dos conformaciones, pero
las subunidades pueden experimentar cambios conformacionales individualmente. La unión
de sustrato incrementoa la probabilidad de un cambio conformacional. Un cambio
conformacional en una subsidiad provoca un cambio similares la subunidad adyacente, así
como la unión de una segunda molécula de sustrato, y así sucesivamente. Hay más estados
intermediarios posibles en este modelo que en el modelo simétrico, ambos modelos no son
mutuamente excluyentes. El modelo simétrico puede verse como un sistema “activo o no
activo”, limitando el modelo secuencial.
El mecanismo preciso de las interacciones alostéricas no ha sido establecido. Diferentes
enzimas alostéricas pueden tener diferentes mecanismos en sus interacciones cooperativas.
Otros mecanismos de la Enzima Reguladora
En otra clase importante de enzimas reguladoras, la actividad es regulada por
modificaciones covalentes en la enzima. La modificación de grupos incluye el fosfato, la
adenosina monofosfato, urdirían monofosfato, ribosa adenosin bifosfato, y grupos metilo.
Estos son generalmente unidos y separados covalentemente de la enzima reguladora por
enzimas separdas.
Un ejemplo importante de regulación mediante la modificación de enlaces colvalentes
es la glicógeno fosforilasa (Mr 94,500) de músculo e hígado, el cuál cataliza la reacción:
TRADUCCIÓN UNIDAD I !5
Otrosmecanismosdelasenzimasreguladoras
Enotraclase importantedeenzimasreguladoras , laactividades reguladapor
modificaciones covalentes en la enzima. Lamodificación de grupos incluido el
fosfato, la adenosina monofosfato, uridina monofosfato, ribosa de adenosin
bifosfato, y grupos metilo. Estos son generalmente unidos y separados
covalentementedelaenzimareguladoraporenzimasseparadas.
Un ejemplo importante de regulación mediante la modificación de enlaces
covalenteseslaglicógenofosforilasa(Mr94,500)demúsculoehígado,elcual
catalizalareacción:
La glucosa‐1‐fosfato formadapuededegradarsehasta lactatoenmúsculoo ser
convertidaenglucosayliberadaenelhígado.Laglucógenofosforilasaactúade
dos formas: La forma activa∝‐fosforilasa y la relativamente forma inactiva b‐
fosforilasa.La∝‐fosforilasatienedossubunidades,cadacualesconunespecifico
tratamientodesuresiduoqueesfosforiladoenelgrupohidroxilo.Estosresiduos
de serina fosfato son indispensables para unamáxima actividad de la enzima.
Losgruposfosfatopuedenserremovidosmediantehidrólisisdela∝‐fosforilasa
porunaenzimaseparadallamadafosforilasafosfatasa:
Enestareacciónla∝‐fosforilasaesconvertidaenb‐fosforilasaporladivisiónde
dosenlacescovalentesdeserina‐fosfato.
La b‐fosforilasa puede reactivarse a ∝‐fosforilasa mediante otra enzima, la
fosforilasaquinasa,lacualcatalizalatransferenciadegruposfosfatodelATPa
loshidroxilosdelosresiduosespecíficosenlab‐fosforilasa.
(Glucosa)n+Pi
Glicógeno
(Glucosa)n‐1+Glucosa‐1‐Fosfato.
∝‐fosforilasa+2H2O
(Masactiva)
b‐fosforilasa+2Pi
(Menosactiva)
La glucosa-1-fosfato formada puede degradarse hasta lactato en músculo o ser
convertida en glucosa y liberada en el hígado. El glucógeno fosforilasa actúa de dos formas:
La forma activa α-fosforilasa y la relativamente forma inactiva β-fosforilasa. La α-fosforilasa
tiene dos subunidades, cada cuales con un específico tratamiento de su residuo que es
fosforilado en el grupo hidróxilo. Estos residuos de serina fosfato son indispensables para una
máxima actividad de la enzima. Los grupos fosfato pueden ser removidos mediante hidrólisis
de la α-fosforilasa por una enzima separada llamada fosforilasa fosfatasa:
En esta reacción la β-fosforilasa puede activarse a α-fosforilasa por la división de dos
enlaces covalentes de serina-fosfato.
La β-fosforilasa puede reactivarse a α-fosforilasa mediante otra enzima, la fosforilasa
quintasa, la cual cataliza la transferencia de grupos fosfato del ATP a los hidroxilos de los
residuos específicos en la β-fosforilasa.
La ruptura de glucógeno en el músculo esquelético y el hígado esta regulada por
variaciones de las proporciones de las dos formas de la enzima. Las formas “α” y “β” de la
fosforilasa difieren en su estructura, y como consecuencia, cambios en la actividad catalítica
cada vez que hay interconversiones de formas.
Algunas de las enzimas regulatorias más complejas se encuentran en los puntos de
particular importancia en el metabolismo, para que respondan a los múltiples metabólicos
regulatorio a través de modificaciones alostéricas y covalentes, glicógeno fosforilasa es un
ejemplo, aunque su regulación primaria es a través de modificación covalente, cabe decir que
también es modulada no covalentemente, de manera alostérica por AMP, el cual es un
activador de la β-fosforilasa; y muchas otras moléculas que son inhibidoras.
TRADUCCIÓN UNIDAD I !6
Otrosmecanismosdelasenzimasreguladoras
Enotraclase importantedeenzimasreguladoras , laactividades reguladapor
modificaciones covalentes en la enzima. Lamodificación de grupos incluido el
fosfato, la adenosina monofosfato, uridina monofosfato, ribosa de adenosin
bifosfato, y grupos metilo. Estos son generalmente unidos y separados
covalentementedelaenzimareguladoraporenzimasseparadas.
Un ejemplo importante de regulación mediante la modificación de enlaces
covalenteseslaglicógenofosforilasa(Mr94,500)demúsculoehígado,elcual
catalizalareacción:
La glucosa‐1‐fosfato formadapuededegradarsehasta lactatoenmúsculoo ser
convertidaenglucosayliberadaenelhígado.Laglucógenofosforilasaactúade
dos formas: La forma activa∝‐fosforilasa y la relativamente forma inactiva b‐
fosforilasa.La∝‐fosforilasatienedossubunidades,cadacualesconunespecifico
tratamientodesuresiduoqueesfosforiladoenelgrupohidroxilo.Estosresiduos
de serina fosfato son indispensables para unamáxima actividad de la enzima.
Losgruposfosfatopuedenserremovidosmediantehidrólisisdela∝‐fosforilasa
porunaenzimaseparadallamadafosforilasafosfatasa:
Enestareacciónla∝‐fosforilasaesconvertidaenb‐fosforilasaporladivisiónde
dosenlacescovalentesdeserina‐fosfato.
La b‐fosforilasa puede reactivarse a ∝‐fosforilasa mediante otra enzima, la
fosforilasaquinasa,lacualcatalizalatransferenciadegruposfosfatodelATPa
loshidroxilosdelosresiduosespecíficosenlab‐fosforilasa.
(Glucosa)n+Pi
Glicógeno
(Glucosa)n‐1+Glucosa‐1‐Fosfato.
∝‐fosforilasa+2H2O
(Masactiva)
b‐fosforilasa+2Pi
(Menosactiva)
Larupturadeglucógenoenelmúsculoesqueléticoyelhígadoestareguladapor
variacionesdelasproporcionesdelasdosformasdelaenzima.Lasformas“∝”&
“b” de la fosforilasa difieren en su estructura cuaternaria, el sitio activo sufre
cambiosensuestructura,ycomoconsecuencia,cambiosenlaactividadcatalítica
cadavezquehayínterconversionesdeformas.
Algunas de las enzimas regulatorias
mascomplejas seencuentranen los
puntosdeparticular importanciaen
elmetabolismo,paraquerespondan
a los múltiples metabolitos
regulatorios a través de
modificaciones alostéricas y
covalentes. Glicógeno fosforilasa es
un ejemplo. Aunque su regulación
primariaesatravésdemodificación
covalente,cabedecirquetambiénes
modulada no covalentemente, de
manera alostérica por AMP, el cual
es un activador de la b‐
fosforilasa, y muchas otras
moléculasquesoninhibidoras.
LaglutaminasintetasadeE.Coli,una
de las enzimas regulatorias mas
complejas conocidas, proporciona
ejemplos de regulación por
alosterismo, modificaciones
covalentesreversiblesydeproteínas
regulatorias. Tiene por lo menos
ochomoduladoresalostéricos.
La activación de una enzima por división proteica es un mecanismo de
regulación un tanto diferente. Un precursor inactivo de la enzima, llamado
zimógenooproenzima,secortaparaformarlaenzimaactiva.Muchasproteasas
del estomago y páncreas son reguladas de esta forma. La quimotripsina y la
tripsina son inicialmente sintetizadas como quimotripsinógeno y tripsinógeno
respectivamente. Rupturas especificas provocan los cambios conformacionales
queexponeelsitioactivode laenzima.Debidoaqueestetipodeactivaciónes
irreversible,otrosmecanismossonnecesariosparainactivarestasenzimas.Las
enzimas proteolíticas son inactivadas por proteínas inhibidoras que se unen
fuertementeal sitioactivode laenzima.El inhibidorde la tripsinapancreática
b‐fosforilasa+2ATP
(Menosactiva)
∝‐fosforilasa+2ADP
(Masactiva)
La glutamina sintetasa E. Coli, una de las enzimas regulatorias más complejas
conocidas, proporciona ejemplos de regulación por aloterismo, modificaciones covalentes
reversibles y de proteínas regulatorias. Tiene por lo menos ocho moduladores alostéricos. La activación de una enzima por división proteica es un mecanismo de regulación un tanto
diferente. Un precursor inactivo de la enzimas, llamado zimógeno o proenzima, se corta para
formar la enzima activa. Muchas promesas del estómago y páncreas son reguladas de esta
forma. La quimotripsina y la triplica son inicialmente sintetizadas como quimotripsinógeno y
tripsinógeno respectivamente. Rupturas específicas provocan los cambios conformaciones que
expone el sitio activo de la enzima, debido a que este tipo de activación es irreversible, otros
mecanismos son necesarios para inactiva estas enzimas. Las enzimas proteolíticas son
inactividas por proteínas inhibidoras que se unen fuertemente al sitio de la enzima. El
inhibidor de la tripsina pancreática (Mr 6,000) se le une a esta y la inhibe; la α1- antiproteasa
(Mr 53,000) primeramente inhibe la elastasa. Se cree que una insuficiencia de α1-
antiproteasa puede ser causada por la exposición al humo de cigarrillo, el cual conduce a un
daño pulmonar y a la condición conocida como enfisema.
Otros ejemplos de activación de zimógenos suceden en las hormonas, tejido conjuntivo,
y el sistema de coagulación sanguíneo. La hormona insulina es producida a partir de la
ruptura de la proinsulina, el colágeno es inicialmente sintetizada como un precursor soluble
llamado procolágeno, y la coagulación sanguínea es regulada por una compleja cascada de
activaciones de zimógenos.
TRADUCCIÓN UNIDAD I !7