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INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL Centro de Desarrollo de Productos Bióticos Departamento de Biotecnología Cultivo de Bacillus subtilis cepa 105 en biorreactor y su actividad antagonista contra Sclerotinia sclerotiorum T E S I S Que para obtener el grado de: Maestría en Ciencias en Desarrollo de Productos Bióticos PRESENTA: Florencio Ramos Gómez Directores de Tesis: Dra. Melina López Meyer Dr. Mario Rodríguez Monroy Yautepec, Morelos. Enero, 2014.

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INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL

Centro de Desarrollo de Productos Bióticos

Departamento de Biotecnología

Cultivo de Bacillus subtilis cepa 105 en biorreactor y su actividad antagonista contra

Sclerotinia sclerotiorum

T E S I S

Que para obtener el grado de:

Maestría en Ciencias en Desarrollo de Productos Bióticos

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Florencio Ramos Gómez

Directores de Tesis:

Dra. Melina López Meyer

Dr. Mario Rodríguez Monroy

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El presente trabajo se llevó a cabo en el Departamento de Biotecnología del

Centro de Desarrollo de Productos Bióticos del Instituto Politécnico Nacional bajo

la dirección de la Dra. Melina López Meyer y el Dr. Mario Rodríguez Monroy. Para

la realización de los estudios se contó con el apoyo económico de la beca

CONACyT (415303), beca del Programa Institucional de Formación de

Investigadores (20110311, 20120914 y 20131007). La realización del proyecto

conto con el financiamiento económico del proyecto de la Secretaria de

Investigación y Posgrado del IPN, SIP 20120914 y SIP20131007 del Proyecto en

Red de Biotecnología del IPN "Obtención de bacterias benéficas para el cultivo del

frijol".�

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AGRADECIMIENTOS

A mis directoras la Dra. Melina López Meyer y al Dr. Mario Rodríguez Monroy

por los consejos, orientación, sugerencias y asesoría en el trabajo. A los demás

integrantes de la comisión revisora, la Dra. Gabriela Sepúlveda Jiménez, la

Dra. Kalina Bermúdez Torres, el Dr. Luis Arturo Bello Pérez y la Dra. Perla

Osorio Díaz por los comentarios, observaciones, consejos y correcciones con

la finalidad de mejorar y reforzar este trabajo de tesis.

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ÍNDICE

Página

Índice I

Índice de cuadros II

Índice de figuras III

Abreviaturas V

Resumen VI

Abstract VII

1. INTRODUCCIÓN 1

2. REVISION DE LITERATURA 3

2.1 Sclerotinia sclerotiorum 3

2.2 Ciclo de la enfermedad del moho blanco 5

2.3 Tratamientos de control del moho blanco 6

2.3.1 Bacillus subtilis como alternativa de control biológico 6

2.4 Formación de esporas de B. subtilis 8

2.5 El efecto del oxígeno en el desarrollo de B. subtilis 9

2.6 Cultivo de B. subtilis en biorreactor 10

2.7 Usos de medios de cultivo de origen industrial para el cultivo de microorganismos

12

2.8 Bacillus subtilis cepa 105 13

3. JUSTIFICACIÓN 15

4. OBJETIVOS 16

4.1 Objetivo general 16

4.2 Objetivos específicos 16

5. METODOLOGÍA 17

5.1 Microorganismos 17

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5.2 Medios de cultivo 17

5.3 Mantenimiento de las cepas 18

5.4 Determinación del crecimiento y esporulación de l a bacteria 18

5.5 Crecimiento en matraz de B. subtilis 105 en el medio soya y LB

19

5.6 Crecimiento en biorreactor de B. subtilis 105 20

5.7 Ensayos de antagonismo 21

5.8 Análisis estadístico 22

6. RESULTADO Y DISCUSIÓN 23

6.1 Crecimiento y esporulación de B. subtilis cepa 105 a nivel de matraz

23

6.2 Crecimiento de B. subtilis cepa 105 bajo una TOD mayor y menor al 20%

26

6.3 Evaluación del efecto antagonista de B. subtilis cepa 105 in

vitro. 31

7. CONCLUSIÓN 34

8. LITERATURA CITADA 35

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����

ÍNDICE DE FIGURAS Número Página

1 Lesión causada por S. sclerotiorum. 4

2 Ciclo biológico de la enfermedad del moho blanco

causado por el hongo S. sclerotiorum.

5

3 B. subtilis, microorganismo usado para control biológico. 7

4 Ciclo de esporulación de B. subtilis 9

5 Compuestos producidos por B. subtilis: surfactina (a),

iturina (b) y fungicina (c).

10

6 B. subtilis 105 (a), y S. sclerotiorum (b). 17

7 Ensayo de antagonismo in vitro. 21

8 Crecimiento (A) y esporulación (B) de B. subtilis cepa 105

a nivel de matraz, evaluando los medios LB y soya.

24

9 Perfiles de tensión de oxígeno (TOD), durante el cultivo

de B. subtilis 105, en el medio LB (A) y el medio soya (B),

bajo una TOD<20% y una TOD>20%. Línea límite de

20% de TOD.

26

10 Crecimiento (A) y esporulación (B), de B. subtilis 105 a

nivel de biorreactor en medio LB, evaluando la TOD < 20

% y TOD > 20%.

27

11 Crecimiento (A) y esporulación (B), de B. subtilis 105 a

nivel de biorreactor en medio soya, evaluando la TOD <

20 % y TOD > 20%.

28

12 Porcentaje de inhibición micelial de S. sclerotiorum,

evaluando el sistema matraz, biorreactor bajo una TOD

por arriba y por abajo del 20%.

32

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ÍNDICE DE CUADROS

Cuadro Página

1

2

Clasificación taxonómica de S. sclerotiorum sp.

Crecimiento y esporulación de B. subtilis 105 en biorreactor,

para los medios LB y soya, evaluando TOD < 20 % y TOD >

20 %.

3

29

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ABREVIATURAS �

Símbolo Significado

vv Volumen sobre volumen

vvm Volumen de aire por volumen de líquido por minuto

rpm Revoluciones por minuto

Cel Célula

LB Luria agar Broth

UFC Unidades formadoras de colonias

TOD Tensión de oxígeno disuelto

DMCT Diámetro micelial con tratamiento

DMST Diámetro micelial sin tratamiento

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RESUMEN �

Bacillus subtilis es una bacteria con actividad antagonista contra el hongo

Sclerotinia sclerotiorum, el cual es un patógeno que afecta cultivos agrícolas de

importancia comercial, tales como el frijol, la papa y el jitomate, entre otros. B.

subtilis 105 cultivada en medio microbiológico LB bajo condiciones de matraz

Erlenmeyer es una cepa sobresaliente por su capacidad de crecimiento y

actividad antagonista contra el hongo. Por lo tanto, es deseable lograr su

producción masiva en medios de cultivo con componentes industriales a nivel de

biorreactor. Considerando que el oxígeno disuelto es un factor determinante para

el crecimiento, esporulación y actividad antagónica de la bacteria durante su

cultivo en biorreactor el objetivo de este trabajo fue evaluar el efecto de la

limitación de oxígeno a nivel de biorreactor y de la substitución del medio de

cultivo, en el crecimiento de B. subtilis cepa 105 y en su actividad antagónica

contra S. sclerotiorum.

Utilizando matraces Erlenmeyer y biorreactor, el medio denominado de soya

compuesto por componentes de bajo costo: proteína de soya (10 g L-1), extracto

de levadura (5 g L-1) y cloruro de sodio (5 g L-1), mostró resultados favorables

para el crecimiento y esporulación de B. subtilis cepa 105. Por lo que se considera

adecuado para substituir al medio microbiológico LB. Adicionalmente, usando el

medio de soya en biorreactor y bajo una condición sin limitación de oxígeno

(tensión de oxígeno disuelto (TOD) > 20%), el crecimiento de la bacteria alcanzó

218 x 106 UFC mL-1, con una esporulación del 21.4 ± 3.63 %. Mientras que bajo

una limitación de oxígeno (TOD < 20 %), se redujo el crecimiento en 43 % y la

esporulación a solo el 15 ± 2.14 %. Sin embargo, los caldos de B.subtilis cepa 105

obtenida bajo la TOD < 20%, tuvieron una actividad antagonista contra S.

sclerotioum del 41.4 ± 2.8 % de inhibición, que resultó superior a la obtenido bajo

el TOD > 20 % (29.5 ± 7.3 % de inhibición). Lo cual sugiere que la limitación de

oxígeno en el cultivo de B. subtilis cepa 105 en el biorreactor, favorece la

producción de compuestos activos que incrementan su actividad antagónica

contra el hongo.

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ABSTRACT

Bacillus subtilis105 is a bacterial strain with antagonistic activity against the fungus

Sclerotinia sclerotiorum, which is a pathogen that affects agricultural crops of

commercial importance, such as common beans, potatoes and tomatoes, among

others. B. subtilis 105 grown in microbiological LB medium in Erlenmeyer flask has

shown to be an outstanding strain due to its growth and antagonistic abilities.

Then, in order to obtain mass production, it is desirable the use of a culture media

formulated with industrial components in bioreactor. Since dissolved oxygen

tension (DOT) is a determining factor for growth, sporulation, and antagonistic

activity of bacteria during its cultivation in a bioreactor, the main objective of this

work was to evaluate the effect of oxygen limitation in bioreactor and the

substitution of culture medium on the growth of B. subtilis strain 105 and its

antagonistic activity against S. sclerotiorum.

Erlenmeyer flasks and bioreactor assays using the soy medium which is

composed of low-cost components [protein from soy (10 g L- 1), extract of yeast (5

g L-1) and sodium chloride (5 g L-1)], showed favorable results for growth and

sporulation of B. subtilis strain 105. So, this growth medium is considered suitable

to replace the microbiological LB medium. Additionally, using the soy medium in

bioreactor and under a condition without oxygen limitation (DOT > 20%), bacterial

growth reached 218 x 106 cfu mL-1 and 21.4 ±3.63 % sporulation; whereas in

condition of oxygen limitation (DOT < 20%), growth was reduced to 43% and

sporulation to 15 ± 2.14 %. On the other hand, the culture broth obtained under

DOT < 20% showed and stronger effect on S. sclerotium (41.4 ± 2.8 % inhibition),

compared to the effect of the broth obtained under DOT > 20% (29.5 ± 7.3 %

inhibition). This suggests that oxygen limitation during the cultivation of B. subtilis

strain 105 in bioreactor promotes the production of active compounds that

enhance the antagonistic activity against the fungus.

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I. INTRODUCCIÓN �

Actualmente existe demanda por cultivos comestibles de calidad, así como libres de

pesticidas de origen químico, ya que estos últimos puedan llegar a ser peligrosos

para la salud humana. En México, el frijol es un cultivo agrícola de importancia

económica y social, por lo que existe el interés de adoptar estrategias para reducir o

reemplazar parcial o completamente los agroquímicos utilizados para la prevención y

control de algunas de las enfermedades que lo atacan (Erental et al., 2008; SIEA-

SAGARPA, 2011).

El frijol, es el cultivo agrícola que ocupa el segundo lugar a nivel nacional en

superficie sembrada. En el 2012, se sembraron 1,700,513.50 ha en todo el país con

un valor de producción de 13,784 MDP (SIAP-SAGARPA www.siap.gob.mx/ ). La

importancia social de este cultivo radica en que existen alrededor de 650 mil

productores de frijol en todo el país. El rendimiento de frijol en 2012 fue de 0.69

Ton/Ha, este valor se encuentra por debajo del rendimiento potencial obtenido en

otras partes del mundo, como Estados Unidos, donde se reportan un rendimiento

promedio de 1.92 Ton/Ha (SIEA-SAGARPA, 2011).

Una de las enfermedades principales que causa disminuciones en los rendimientos

del cultivo de frijol es el moho blanco�del frijol causada por el hongo S. sclerotiorum.

Este patógeno tiene un rango de hospederos muy amplio, ya que además del frijol

afecta a más de 400 especies de plantas (Zeng et al., 2012). En los últimos años, la

presencia de esta enfermedad ha sido reportada en los estados de Jalisco, Nayarit y

Sinaloa, causando reducciones significativas en el rendimiento (López-Rodríguez,

2010).

La presente tesis se inició en 2011 dentro del proyecto “Fortalecimiento de la

Rentabilidad del Sistema Producto Frijol mediante el uso de Herramientas

Biotecnológicas” perteneciente de la Red Biotecnología de IPN; particularmente

dentro de la meta de “Desarrollar productos biotecnológicos con actividades

biofertilizantes, bioestimulantes y antagonistas a fitopatógenos”. Posteriormente, en

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el 2012 el proyecto continuó con el nombre de “Obtención de bacterias, benéficas

para el cultivo del frijol”.

La selección y utilización de agentes de control biológico, particularmente de

antagonistas a plagas y enfermedades, ha tenido un desarrollo importante en las

últimas décadas, ya que esto microorganismos representan potenciales sustituyentes

o alternativas a los pesticidas de origen químico. Los agentes de control

microbiológicos usualmente tienen efectos letales o inhibidores de la fisiología o la

bioquímica de la agente infeccioso, interrumpiendo el crecimiento y desarrollo del

mismo, ya sea por parasitismo, antagonismo o alelopatía (Thakore, 2006; Bailey et

al., 2010).

La cepa de B. subtilis 105 fue aislada de suelos agrícolas de Sinaloa y seleccionada

por su efecto antagonista contra S. sclerotiorum. B. subtilis tiene la habilidad de

producir compuestos bioactivos, los cuales han mostrado capacidades antifúngicas y

baja toxicidad para el ser humano, así como una alta biodegrabilidad en el medio

ambiente. La bacteria tiene la capacidad de formar endosporas, las cuales son

estructuras muy resistentes a condiciones ambientales adversas. Las pruebas de

antagonismo con la cepa de B. subtilis cepa 105 fueron llevadas a cabo con cultivos

a nivel de matraz. Ya que uno de los fines de la selección de este tipo de

microorganismos es su aplicación en campos de cultivos, es indispensable llevar su

producción a nivel de biorreactor para su producción masiva, por lo que es

importante optimizar las condiciones de crecimiento y producción de esporas, sin

afectar su capacidad bioactiva (Carvalho y Lacerda, 2010; Kwon et al., 2011).

Se ha reportado que en cultivos de B. subtilis en biorreactor, una condición de

limitación de oxígeno, estimula la síntesis de sustancias bioactivas, pero disminuye

el crecimiento de la bacteria (Schisler et al., 2004; Berry et al., 2010; Zeng et al.,

2012). En el presente trabajo se tuvo como objetivo evaluar el efecto de la limitación

de oxígeno en biorreactor y de la sustitución del medio microbiológico en el

crecimiento de B. subtilis cepa 105 y en su capacidad antagonista contra S.

sclerotiorum.

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II. REVISIÓN DE LITERATURA

2.1 Sclerotinia sclerotiorum

S. sclerotiorum (Lib.) de Bary es un hongo Ascomycete (Cuadro 1) que causa daños

severos en cultivos de importancia agrícola. Este patógeno exhibe poca especificidad

y un rango amplio de hospedaros incluyendo a 408 especies, 278 géneros y 75

familias de especies de plantas, principalmente dicotiledóneas (Boland y Hall 1994;

Duncan et al., 2005).

Cuadro 1. Clasificación taxonómica de S. sclerotiorum sp.

Las condiciones frescas y de alta humedad favorecen el desarrollo de S. sclerotiorum

no solamente en cultivos agrícolas, sino también en malezas susceptibles, lo cual

aumenta la producción de esclerocios en el suelo y por lo tanto del inóculo

potencialmente infectivo en un siguiente ciclo de cultivo (Erental et al., 2008; Zeng et

al., 2012).

En condiciones de campo húmedo, S. sclerotiorum es capaz de invadir por completo

una planta huésped, colonizando casi todos los tejidos de la planta con el micelio. La

temperatura óptima para su crecimiento es de 15 a 21 oC. Bajo condiciones de lluvia

S. sclerotiorum produce gran cantidad de micelios y esclerocios (Rodriguez et al.,

2006).

Reino Fungi Filum Ascomycotina Clase Ascomycetes Orden Helioteliales Familia Sclerotiniaceae Género Sclerotinia Especie S. sclerotiorum

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S. sclerotiorum afecta de manera importante al cultivo de frijol en México. En los

últimos años, el moho blanco del frijol ha tenido incidencia en los estados de Jalisco,

Nayarit y Sinaloa, causando reducciones significativas en el rendimiento. Los

síntomas que causa este patógeno son la formación de lesiones oscuras y acuosas

en las hojas y tallos de la planta infectada, en las cuales se desarrolla tejido necrótico

con la aparición de micelio blanco (Figura 1) y la subsecuente formación de

esclerocios, el cual es el síntoma más evidente de que la planta está infectada por S.

sclerotiorum (Abawi y Grogan, 1975).

Figura 1. Lesión causada por S. sclerotiorum.

Tomada de Campa et al. (2009).

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2.2. Ciclo de la enfermedad del moho blanco

El ciclo de la enfermedad del moho blanco causado por S. sclerotiorum sobre la

planta de frijol inicia en el suelo, con la germinación de las estructuras de resistencia

o esclerocios (Figura 2). Los esclerocios pueden germinar de dos maneras: a)

carpogénicamente, produciendo apotecios, los cuales son estructuras que forman

ascosporas, mismas que son dispersadas por el viento y son fuente de infección al

germinar sobre tejidos senescentes tales como tejidos florales y b)

miceliogénicamente, en la cual el esclerocio produce micelio algodonoso que infecta

directamente tejidos vegetativos como tallos y hojas (Erental et al., 2008).

Figura 2. Ciclo biológico de la enfermedad del moho blanco causado por el hongo S.

sclerotiorum. (Campa et al., 2009) �

Esclerocios

Liberación de las ascosporas

Germinación de ascosporas en

las flores

Hongo colonizando

flores

Formación de los apotecios en la

superficie del suelo

Formación de esclerocios en vainas y tallos

Germinación en el suelo

Planta de frijol marchita

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2.3 Tratamientos de control del moho blanco �

Existen diferentes tratamientos químicos utilizados para el control de S.sclerotiorum,

pero existen normas cada vez más rigurosas para su aplicación, debido a los efectos

tóxicos sobre la salud humana, el medio ambiente y otros microorganismos

benéficos. Ante esta problemática, se han investigado algunas estrategias

alternativas como la utilización de diferentes extractos de plantas, que han mostrado

resultados positivos para el control de esta enfermedad (Homans y Fuchs, 1970;

Cutler, 1999; Rodríguez et al., 2006), aunque en estos casos no se determinó su

factibilidad ni su toxicidad. Otra alternativa para el control de esta enfermedad, es la

utilización de microorganismos antagonistas que puedan ser utilizados como agentes

de control biológico (Thakore, 2006; CESAVEG, 2011).

2.3.1 B. subtilis como alternativa de control biológico �

El control biológico contra S. sclerotiorum comprende el uso de hongos

micoparásitos y bacterias antagonistas (Schisler et al., 2004; Berry et al., 2010).

Coniothyrium minitans es un ejemplo de un hongo micoparásito de esclerocios de S.

sclerotiorum (Gerlagh et al., 1999). C. minitans es la base del producto comercial

CONSTANS® WG mismo que ha sido utilizado principalmente en Europa y el norte

de Estados Unidos (McQuilken y Chalton, 2009).

De igual manera, en el mercado existen productos comerciales a base de B. subtilis

que presentan un efecto antagonista contra el moho blanco del frijol. Probac BS® es

un producto comercial formulado con B. subtilis en México. El producto tiene un

efecto antagonista y compite por espacio y nutrientes con patógenos en los nichos

donde es aplicado (Schisler et al., 2004; Horbach et al., 2011).

B. subtilis es una bacteria gram positivo, aerobio o anaerobio facultativo, con

capacidad de formar endosporas (Figura 3). Las esporas son estructuras

termotolerantes, resistente a la sequía, radiación ultravioleta y solventes orgánicos

(Fritze, 2004; Schisler et al., 2004; Ongena et al., 2005). Además, B. subtilis es

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conocido por sintetizar varios compuestos con actividad antibacterial y antifúngica,

tales como: la subtilina y la iturina que inhiben el crecimiento de patógenos (Pérez-

García et al., 2011).

Figura 3. B. subtilis, microorganismo usado para control biológico Modificado de Chamberlain, 2010.

El suelo es el hábitat natural de B. subtilis. En el suelo, existen microambientes

anaerobios, así como abundantes fuentes de nitratos, los cuales inducen a los genes

involucrados en la formación de estos compuestos antibióticos (Nakano et al., 1997).

Por el contrario, bajo condiciones aerobias no se producen estos compuestos

activos (Yeh et al., 2006). Esto se debe a que los microorganismos crecen rápido

cuando existe una fuente de nutrientes abundante y la producción de antibióticos

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toma lugar cuando el crecimiento termina (Marazioti et al., 2003; Carvalho y Lacerda,

2010). Además de producir compuestos antibióticos, estos microorganismos

producen enzimas degradadoras de la pared celular como quitinasas, glucanasas,

proteasas y otras moléculas orgánicas volátiles que contribuyen a su efecto

antagonista sobre microorganismos patógenos (Carvalho y Lacerda, 2010). Todas

estas características hacen de B. subtilis un microorganismo factible de ser utilizado

como alternativa de control para algunas enfermedades de plantas.

2.4 Formación de esporas de B. subtilis

Al terminar el crecimiento exponencial de un cultivo de B. subtilis se llevan a cabo

una serie de cambios en las células tanto estructurales como metabólicos, los cuales

culminan con la formación de esporas. Los principales estímulos para el inicio de la

esporulación, es una densidad celular alta y la limitación por algún nutriente. El

proceso de esporulación comprende varios estadios (Figura 4). El estadio cero se

inicia con una respuesta al agotamiento de nutrientes y a la producción de péptidos

que detecta y responden a una alta concentración celular (Schneider et al., 2002). El

inicio de la esporulación es regulado por la proteína de unión a DNA Spo0A, la cual

actúa como regulador maestro del proceso y tiene influencia directa o indirectamente,

sobre la expresión de más de 500 genes durante los estados tempranos de

desarrollo de B. subtilis (Molle et al., 2003). En el estadio II se producen enzimas

hidrolíticas, como las proteasas y amilasas, y el estadio termina con la formación de

un septo en un polo de la célula. En el estadio siguiente (III) ocurre el engullimiento

de la preespora. Del estadio IV al VII, hay la formación de la corteza y de la cubierta,

la maduración de la espora y la lisis celular. La duración de cada etapa es de

aproximadamente una hora (Errington, 1993).

Durante esta serie de eventos de la esporulación se forman dentro de un mismo

cuerpo dos células; la célula madre y la preespora, las cuales mantienen una

comunicación para poder, en conjunto y de una forma metabólica ordenada, formar

la espora. La transición de un estado al otro es gobernada por seis proteínas

Page 23: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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reguladoras llamadas factores sigma, que se unen a la ARN polimerasa y determina

qué promotores serán reconocidos para su posterior transcripción (Errington, 1993).

Figura 4. Ciclo de esporulación de B. subtilis (Errintong, 2003).

2.5 El efecto del oxígeno en el desarrollo de B. subtilis

B. subtilis fue considerado un aerobio estricto, pero se demostró que puede crecer

bajo condiciones anaeróbicas. B. subtilis puede crecer anaeróbicamente mediante la

reducción de nitratos o nitritos en amonio, mediante la utilización de la enzima nitrato

reductasa, codificada por el gen narGHJI. El mecanismo de regulación de esta

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enzima se encuentra mediado por la condición de oxígeno generada dentro de un

medio de cultivo en fermentación. En ausencia de oxígeno, el nitrato o nitrito

funcionan como un aceptores de electrones en el proceso respiratorio de B. subtilis

(Nakano et al., 1997; Carvalho y Lacerda, 2010).

Una condición de limitación de oxígeno, puede inducir la expresión de algunos

genes, como los relacionados con la reducción de los nitratos (narGHJI), así como

los genes involucrados en la producción de compuestos bioactivos, tales como:

surfactina, iturina y fungicina (Figura 5). La producción de este tipo de sustancias

permite a B. subtilis colonizar diferentes nichos ecológicos, dándole ventajas

competitivas. Por ejemplo, la surfactina se conoce que tiene un efecto destabilizador

de la membrana lipídica de otro tipo de microorganismo (Ongena et al., 2005; Pérez-

García et al., 2011).

Figura 5. Compuestos producidos por B. subtilis: surfactina (a), iturina (b) y fungicina

(c).

2.6 Cultivo de B. subtilis en biorreactor

La función principal de un biorreactor es la de proveer un ambiente controlado para

que los microrganismos alcancen el máximo crecimiento y la óptima formación de

un producto deseado (Frioni, 1999). La aireación y agitación son las operaciones

más importantes en el biorreactor y con ellas se busca mantener la homogeneidad

a b c

Page 25: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

en los parámetros fisicoquímicos, además de proporcionar el oxígeno a los

microorganismos aerobios (Galindo et al., 2011).

Los biorreactores están equipados con varios sensores para la medición y el control

de la temperatura, de la velocidad de agitación, la concentración de oxígeno disuelto

(DO2), el pH, el potencial redox y la concentración de dióxido de carbono (CO2). El

principal inconveniente para el desarrollo de este tipo de tecnología, radica en que no

existe un diseño de biorreactor que se adapte a todas las aplicaciones (Preil, 1991).

La concentración de oxígeno disuelto (DO2) en el medio de cultivo, es descrita como

uno de los parámetros más importantes y de mayor influencia. Debido a que la

solubilidad del oxígeno en el agua es baja, solamente 7 mgL-1. Por otro lado, cuando

el aire es suministrado al medio, el oxígeno debe vencer varias resistencias físicas,

antes de alcanzar a la célula.

En cultivos de B. subtilis se conoce que la concentración de oxígeno es importante

debido a que influye en su metabolismo. En condiciones de limitación de oxígeno las

células vegetativas entran en un proceso de esporulación y se favorece la formación

de compuestos activos (Carvalho y Lacerda, 2010; Kwon et al., 2011). Por otro lado,

si el oxígeno no es limitante, se favorece la proliferación de células, obteniendo

cultivos más concentrados. La transición de una condición aerobia a una anaerobia,

se presenta cuando la concentración de oxígeno en el cultivo, alcanza niveles

menores al 10% de la TOD. En ésta condición se induce la expresión de algunos

genes, como el de la nitrato reductasa (Tseng et al., 1996).

Diversos autores han evaluado en cultivo a nivel de biorreactor el efecto de la

condición del oxígeno sobre el crecimiento, esporulación y formación de productos.

Por ejemplo: Kwon et al. (2011), con la cepa B. subtilis DMJ maximizaron la

producción de biomasa (77g L-1) controlando la TOD � 20%. Carvalho y Lacerda

(2010), con la cepa B. subtilis R-14. Obtuvieron una concentración celular de 1 x 108

UFC mL-1 bajo una condición de exceso de oxígeno y observaron la formación de

sustancias bioactivas en condiciones de limitación de oxígeno. Nakano et al (1997)

reportaron la formación de sustancias bioactivas utilizando la cepa de B. subtilis

Page 26: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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JH642 bajo crecimiento anaerobio. Mientras que Yáñez-Mendizábal et al (2012),

utilizando la cepa de B. subtilis CPA-8, obtuvieron altas concentraciones de células

(3 x 109 UFC mL-1), bajo una condición de no limitación de oxígeno y el uso de medio

a base de soya.

2.7 Usos de medios de cultivo de origen industrial para el cultivo de microorganismos

En la producción de Bacillus para el control biológico, un factor clave a considerar es

el desarrollo de un medio de cultivo económico y la definición de las condiciones

adecuadas de aireación, de tal manera de mantener los costos de producción bajos

conservando la máxima eficacia del sistema para ser utilizado en control biológico

(Matsumoto et al., 2010; Yánez-Mendizábal et al., 2012).

Los constituyentes de bajo costo en el medio deben de satisfacer los requerimientos

nutrimentales de las células y proveer la energía necesaria para la biosíntesis y el

mantenimiento celular (Galindo et al., 2011).

El uso de subproductos de la industria alimentaria puede servir como sustratos

comerciales de costo más económico al de los productos de grado microbiológico. La

harina de soya, melaza, extracto de levadura, peptona y harina de maíz son materias

primas probadas para proveer de fuente de nitrógeno y carbono a los

microorganismos durante su crecimiento en biorreactor. El uso de subproductos para

formular medios de cultivo puede reducir los costos de producción de sistemas que

reproducen B. subtilis para usarse como agente de control biológico (Chen et al.,

2009; Matsumoto et al., 2010; Yánez-Mendizábal et al., 2012)

Hay antecedentes para la producción de Bacillus en medios formulados con sales

industriales o con subproductos de la industria. Yánez-Mendizábal et al (2012)

probaron medios de cultivo a base de extracto de levadura, peptona y harina de

soya, encontrando que el medio con la harina de soya ( 20 g L-1) generó una

biomasa de 3 x 109 UFC mL-1 y un producto fermentado con un efecto antagonista

Page 27: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

contra Monilinia fructicola. Matsumoto et al (2010) comparó el uso de la harina de

soya y un medio definido formulado con sales químicas y observó que la producción

de biomasa en B.subtilis fue favorecida en el medio formulado con soya. Chen et al

(2009) observó que B. subtilis cepa WHK-Z12 cultivada en harina de soya favoreció

el crecimiento de la bacteria, alcanzando una producción de 1.52 x 1010 UFC de

esporas mL-1. De esta maneta la harina de soya coincide en varios trabajos como

una fuente de nitrógeno, favorable para el crecimiento de bacilos.

Por otro lado, la sustitución de peptona del medio LB (Sigma) por harina de soya de

origen industrial en el cultivo de la cepa 105 de B. subtilis no causó diferencias

significativas en el crecimiento (Sarmiento, 2012).

2.8 B. subtilis cepa 105 �

En el CIIDIR-IPN Unidad Sinaloa, se llevó a cabo un estudio a partir de una colección

de 114 microorganismos aislados de suelos agrícolas del norte de Sinaloa con el fin

de identificar cepas capaces de inhibir el crecimiento in vitro de S. sclerotiorum. A

partir de este estudio se seleccionaron diez aislados que presentaron inhibición de

germinación miceliogénica de esclerocios, de entre las cuales B. subtilis 105 mostró

un porcentaje de inhibición de la germinación micelial del 100% y presentó también

inhibición de la infección en hojas desprendidas de frijol (Sotomayor-García, 2008).

Las pruebas in vitro y en hoja desprendida de frijol con el aislado de B. subtilis 105 se

realizaron con cultivos celulares crecidos en matraces Erlenmeyer de 250 mL con

medio LB grado microbiológico (Sigma) y que contenían. Después de 16 h de cultivo

2.89 X 108 UFC mL-1 (Sotomayor-García, 2011). Sin embargo, en este trabajo no se

determinó la viabilidad ni la producción de esporas.

En el CeProBi-IPN, se evaluó el crecimiento de B. subtilis 105 a nivel de biorreactor

en donde se substituyó la peptona del medio LB (Sigma) por un medio con harina de

soya de origen industrial. El monitoreo de TOD a lo largo del ciclo de cultivo mostró

Page 28: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

que este parámetro cayó a 0% durante la hora dos de cultivo recobrando un nivel

apenas mayor al 20% a la hora cuatro del cultivo, lo cual indica que el cultivo estuvo

limitado por oxígeno. Bajo estas condiciones de crecimiento no se observaron

diferencia significativa en el rendimiento de biomasa (8.3 x 108 células mL-1), ni en su

efecto antagonista (50% de inhibición micelial) entre las dos condiciones de

crecimiento (Sarmiento, 2012). Con el objeto de reducir la limitación de oxígeno, se

probó una condición de agitación de 700 rpm, pero aun así, el cultivo mostró una

baja de TOD por un periodo de 2 horas al inicio del cultivo (Sarmiento, 2012).

Tomando en cuenta estos antecedentes, éste trabajo se realizó con la intención de

definir el efecto de la TOD sobre cultivos de B. subtilis 105 crecidos en biorreactor.

Se considero, una TOD por encima y por debajo del 20 % y se determinó su efecto

sobre el crecimiento y esporulación de la bacteria, además de determinar su

capacidad antagonista contra el hongo S. sclerotiorum en ensayos in vitro.

Page 29: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

III. JUSTIFICACIÓN

B. subtilis 105 es una bacteria autóctona aislada de suelos agrícolas de Sinaloa. Esta

bacteria sobresale por su actividad antagonista sobre S. sclerotiorum, que es un

hongo que ataca a cultivos de importancia agrícola, particularmente al frijol. Como

parte del proyecto “Obtenidas de bacterias benéficas para el cultivo del frijol” que se

desarrolla dentro de la Red de Biotecnología de IPN. Se tiene antecedentes del

crecimiento de la cepa 105 de B. subtilis a nivel de matraz, así como biorreactor. Los

caldos de cultivo obtenidos muestran actividad antagónica contra el hongo S.

sclerotiorum. Dado que el crecimiento de la bacteria y la producción de sus

compuestos antifúngicos se pueden ver afectados por el suministro de oxígeno, es

deseable entender el efecto que puede generar una condición de limitación de

oxígeno y una no limitada, en el crecimiento celular y la actividad antagonista del

caldo contra el hongo.

Page 30: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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IV. OBJETIVOS

4.1 Objetivo general

Evaluar el efecto de la limitación de oxígeno a nivel de biorreactor y de la sustitución

del medio de cultivo en el crecimiento de B. subtilis cepa 105 y en su capacidad

antagonista contra S. sclerotiorum.

4.2 Objetivos específicos

• Evaluar el crecimiento y esporulación de B. subtilis cepa 105 a nivel de matraz

en los medios de soya y LB.

• Evaluar en biorreactor el efecto de una TOD mayor y menor al 20 %, en el

crecimiento y esporulación de B. subtilis cepa 105, utilizando los medios de

cultivo de soya y LB.

• Determinar el efecto antagonista de los caldo de B. subtilis cepa 105,

obtenidos en matraz y biorreactor contra el hongo S. sclerotiorum en pruebas

in vitro.

Page 31: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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V. METODOLOGÍA

5.1 Microorganismos

Las cepas utilizadas en el presente trabajo fueron B. subtilis cepa 105 y S.

sclerotiorum (Figura 6). Las cepas pertenecen a la colección del CIIDIR Sinaloa y

fueron aisladas en campos agrícolas de jitomate en Guasave, Sinaloa, México.

Figura 6. B. subtilis 105 (a), y S. sclerotiorum (b).

5.2 Medios de cultivos

Se utilizó el medio de soya propuesto por Sarmiento (2012). La composición del

medio soya fue la siguiente: 10 g L-1de proteína de soya, 5 g L-1 de extracto de

levadura y 5 g L -1 de cloruro de sodio. Las muestras de los componentes del medio

fueron proporcionadas por el Biol. Carlos Roberto Gutiérrez y corresponden a

sustratos utilizados para la formulación de medios de cultivo microbiológico e

industrial por la compañía de fermentaciones Fermic, S. A. El medio microbiológico

Luria Broth LB (Sigma-Aldrich) fue utilizado como el cultivo de referencia. S.

sclerotiorum fue crecido en medio PDA (papa-dextrosa-agar) 40 g L-1 y para la

realización de la cuenta de unidades formadoras de colonias se utilizó el medio luria

agar 40 g L-1.

a) b)

Page 32: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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5.3 Mantenimiento de las cepas

La cepa 105 de B. subtilis se conservó mediante resiembras en el medio Luria Agar

(Sigma-Aldrich). El medio se preparó disolviendo 16 g en 400 mL de agua

desionizada en un matraz Erlenmeyer de 500 mL. Los medios se esterilizaron en un

autoclave (AESA modelo CV. 250) a una temperatura de 121 ºC durante 15 minutos

a una presión de 1 Kg/cm². Cuando la temperatura del medio alcanzó 30 a 35 ºC, se

realizó el vaciado en cajas Petri (SYM Laboratorios) de 100 X 15 mm a un volumen

25 a 30 mL.

Durante la resiembra se tomó una asada de B. subtilis cepa 105, las cajas se

incubaron a 37 °C en una estufa durante 24 horas. Las cepas crecidas en las placas

de agar se almacenaron a 4 °C.

El mantenimiento del hongo S. sclerotiorum se realizó mediante resiembras en

placas con medio PDA (Sigma). La preparación del medio se realizó disolviendo 16 g

en 400 mL de agua desionizada en un matraz Erlenmeyer de 500 mL. Los medio se

esterilizaron en un autoclave (AESA modelo CV. 250) a una temperatura de 121°C

durante 15 minutos a una presión de 1 Kg/cm2. Cuando la temperatura del medio

alcanzó 30 a 35°C, se realizó el vaciado en cajas Petri (SYM laboratorios) de 100 X

15 mm a un volumen de 25 a 30 mL.

Durante la resiembra se cortó un trozo de agar de una placa con el hongo

previamente crecido con un sacabocados. El fragmento de agar fue colocado sobre

una caja fresca con medio PDA, las cajas se incubaron a 27°C durante 72 horas.

5.4 Determinación del crecimiento y esporulación de la bacteria

La cuantificación del crecimiento celular y de las esporas se realizó por medio del

conteo de las unidades formadoras de colonias (UFC), que se describe a

continuación.

Page 33: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

Para la cuantificación por UFC de células vegetativas se tomaron 10 mL de muestra

del caldo de fermentación cada 30 minutos. Se hicieron diluciones en tubos

eppendorf de 1 mL y alícuotas de 0.1 mL, y de los caldos diluidos fueron usadas

para la siembra en cajas Petri con medio Luria Agar (Sigma-Aldrich). Los cultivos se

incubaron durante 24 h a 37°C y se contó el número de colonias. Para determinar

la concentración celular se utilizó la ecuación siguiente:

Ec. 1

La cuantificación de esporas se realizó después de la aplicación de un choque

térmico al cultivo, siguiendo la técnica reportada por Cristiano (2012). Las muestras

diluidas de los caldos de fermentación se sometieron a un calentamiento a una

temperatura de 85°C durante 15 min en un Thermomixer eppendorf. De esta manera

se eliminan las células vegetativas del cultivo. Las muestras fueron sembradas en

cajas de Petri con el medio Luria Agar. Los cultivos se incubaron durante 24 h a

37°C. El número de colonias fue contado y utilizado para determinar la

concentración de esporas utilizando la ecuación 1.

5.5 Crecimiento en matraz de B. subtilis 105 en el medio soya y LB

El crecimiento de B. subtilis se llevó a cabo en medio de soya y LB en matraces

Erlenmeyer de 500 mL. Los matraces se inocularon con una asada de B. subtilis 105

y se incubaron a 37 °C, con agitación orbital de 150 RPM Rotabit (HHI-08) durante

12 horas. Se tomaron muestras de 1 mL, cada 60 minutos. Se determinó el

crecimiento celular y la esporulación por medio del conteo de UFC.

Page 34: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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5.6 Crecimiento en biorreactor de B. subtilis 105

Se utilizó un biorreactor tipo tanque agitado de 2 L con un impulsor Rushton

(Applikon, Schiedam, Holanda). El volumen de trabajo del biorreactor fue de 1 L con

el medio comercial soya y LB (Sigma-Aldrich). El biorreactor se inoculó con 100 mL

de un cultivo crecido durante 3 horas en matraces Erlenmeyer de 500 mL y se

agregó al biorreactor en una relación 10% (v/v). Las condiciones establecidas fueron

una aireación del sistema de 0.1 vvm, una temperatura de 30°C, y una velocidad de

agitación de 700 rpm, la medición de pH y oxígeno disuelto se realiza en línea con un

controlador Applikon, ADI 1030 (Applikon, Schiedam, Holanda).

El crecimiento de B. subtilis en biorreactor se realizó inicialmente en una condición

sin control de TOD, es decir, manteniendo constante el suministro de aire a lo largo

del cultivo.

El crecimiento en biorreactor bajo las dos condiciones de oxígeno se llevaron a cabo

en el biorreactor tipo tanque agitado de 2 L, bajo las condiciones descritas

anteriormente y utilizando el dispositivo de control Proporcional Integral Derivativo del

controlador Applikon, ADI 1030 (Applikon, Schiedam, Holanda). El dispositivo cuenta

con válvulas solenoides independientes que permiten la entrada de oxígeno o

nitrógeno, de acuerdo a la necesidad que presenta el cultivo, con relación a la

desviación que se presenta en el valor de “set-point” dado para la TOD. Para la

condición de limitación de oxígeno, el “set-point” de la TOD fue establecido por

debajo de una TOD de 20%; mientras que la condición de no limitación de oxígeno el

“set-point”, se mantuvo por encima del 20 %. Los resultados de crecimiento de los

cultivos se obtuvieron de dos corridas independientes.

Page 35: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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5.7 Ensayos de antagonismo

Las pruebas del efecto antagonista de los caldos de B. subtilis 150 sobre S.

sclerotiorum se realizaron en ensayos in vitro y utilizando los caldos de los cultivos

obtenidos a las 10 h, en la fase estacionaria del cultivo. En cajas de Petri con medio

PDA (Sigma-Aldrich), se colocó una porción de 0.5 mm de diámetro de micelio del

hongo crecido previamente a 27°C por 7 días en PDA. En uno de los extremos de la

caja se agregó 0.1 mL de caldo de cultivo. La muestra se incubó durante tres días a

37°C y se midieron los diámetros de crecimiento del micelio. El efecto antagonista se

reporta como el porcentaje de inhibición de B. subtilis sobre S. sclerotiorum,

calculado mediante la ecuación 2.

Ec. 2

Figura 7. Ensayo de antagonismo in vitro.

Donde DMST es el diámetro micelial sin tratamiento y DMCT es el diámetro miceliar

con tratamiento. Los ensayos se realizaron por triplicado.

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Page 36: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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5.8 Análisis estadístico

Los resultados se expresaron como promedios ± desviación estándar (D.E). Las

diferencias entre los grupos se analizaron mediante un análisis de varianza (ANOVA)

de una vía utilizando el Software Sigmaplot 11. Posterior se realizó una comparación

múltiple por medio de una prueba de Tukey, considerando una diferencia

estadísticamente significativa de P � 0.001.

Page 37: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

VI. RESULTADOS Y DISCUSIÓN

6.1 Crecimiento y esporulación de B. subtilis 105 a nivel de matraz.

La caracterización del cultivo de B. subtilis 105, comparando los medios LB (Sigma) y

soya, se realizó primeramente a nivel de matraz. La figura 8 muestra la cinética de

crecimiento; para el medio LB el crecimiento máximo fue de 75.3 x 106 ± 3.47 x 106

UFC mL-1 y se alcanzó a las 7 h, mientras que para el medio soya se obtuvo 113 x

106 ± 10.8 x 106 UFC mL-1 a las 8 horas. Lo anterior implica que, el medio de soya

generó 0.5 veces más bacterias que el medio LB y la diferencia de crecimiento fue

significativa. De forma consistente, la producción de esporas obtenidas en el medio

de soya (58.3 x 106 ± 5.78 x 106 UFC mL-1) fue 0.8 veces superior a la obtenida en el

medio LB (31.6 x 106 ± 7.62 x 106 UFC mL-1), lo cual indica que el medio de soya

también favorece la formación de las esporas.

El conocimiento de la cinética de crecimiento de B. subtilis 105, permite identificar las

fases características del crecimiento de la bacteria. La comparación de las cinéticas

en los medios LB y soya, indican que el comportamiento del crecimiento de la cepa

es paralelo en ambos medios, pero el crecimiento y esporulación en un mismo

tiempo siempre es superior para el medio de soya. Se descarta que dicha diferencia

pudiera ser debida a un efecto de tamaño de inóculo, pues se utilizó la misma

concentración de células para ambos cultivos (8.5 x 103 UFC mL-1). No obstante, se

presentó una diferencia en el tiempo en que se alcanza la fase estacionaria, para el

medio de soya la fase estacionaria se alcanza una hora después al medio LB.

Sarmiento (2012), previamente realizó un estudio con la cepa de B. subtilis 105,

comparando el crecimiento de la cepa en ambos medios, pero utilizando un conteo

directo de las bacterias en cámara de Neubawer. Sin embargo, esa técnica no

permite discriminar entre las células vivas y las células muertas. Por lo tanto, en este

estudio se decidió caracterizar el crecimiento de la cepa mediante la técnica de UFC,

la cual descarta las células incapaces de formar una colonia.

Page 38: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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Figura 8. Crecimiento (A) y esporulación (B) de B. subtilis cepa 105 a nivel de matraz, en el medio LB (—) y soya (- - -).

A

B

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���

Comparando los resultados obtenidos por Sarmiento (2012), que obtuvo un

crecimiento en el medio de soya de 480 x 106 células mL-1 y para el medio LB de 480

x 106 células mL-1, contra los obtenidos mediante la técnica de UFC, se puede inferir

que el conteo directo sobreestima el crecimiento del cultivo, ya que no considera la

viabilidad de las células vegetativas. Sin embargo, se confirma que el medio de soya

favorece el crecimiento y esporulación de B. subtilis 105.

La utilización de un medio a base de harina de soya, como fuente de nitrógeno está

reportado por Yáñez-Mendizabal et al, (2012), quien observó para la cepa B. subtilis

CPA-8 un crecimiento máximo de 300 x106 UFC mL-1. Por otra parte Chen et al

(2009) reportaron que los medios formulados con harina de soya para el crecimiento

de la cepa de B. subtilis WHK-Z21 pueden generar una producción máxima de

esporas de 15 200 x 106 UFC mL-1. Esto sugiere que la utilización de soya como

fuente de nitrógeno asimilable en el medio de cultivo, favorece el crecimiento y

esporulación de cultivos de B. subtilis.

El momento en que los cultivos de bacterias alcanzan la máxima producción de

esporas, es considerado como el momento de la cosecha para formular productos

para control biológico (Galindo et al., 2011; Yáñez-Mendizábal et al., 2012).

Cristiano-Fajardo (2012) reporta para un medio definido, con glucosa como fuente de

carbono, que el inicio de la fase estacionario coincide con el agotamiento de la fuente

de carbono. En este sentido, estudios futuros podrían dirigirse a identificar el

nutriente que limita el crecimiento en el caso del medio de soya. Sin embargo, se

sugiere que entre las 7 y 8 horas de cultivo de B. subtilis 105, se podrían considerar

como el tiempo de cosecha para obtener los caldos con rendimiento de esporas

máximo.

Los resultados obtenidos a nivel de matraz mostraron que el crecimiento y la

esporulación, al utilizar el medio de soya aumentaron en comparación al medio de LB

(Sigma). Por lo tanto, se logró la sustitución de componentes de origen industrial

para continuar con el estudio de B. subtilis 105 en el biorreactor.

Page 40: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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6.2 Crecimiento de B. subtilis cepa 105 bajo una TOD mayor y menor al 20%. �

La figura 9a, muestra para la condición de TOD � 20% en el medio LB (sigma), cómo

la TOD del cultivo descendió desde 100 % a 0% en las primeras dos hora del cultivo.

A partir de las cuatro horas, la TOD se mantuvo por debajo del 20% mediante la

inyección de nitrógeno al sistema. Por otra parte, para el medio de soya, en la figura

9b, se observa que para el control de la TOD � 20%, sólo se requirió de la inyección

de nitrógeno a la hora seis.

Figura 9. Perfiles de tensión de oxígeno (TOD), durante el cultivo de B. subtilis 105, en el medio LB (A) y el medio soya (B), bajo una TOD�20% (—) y una TOD�20% (—). Línea límite

de 20% de TOD (---).

Por el contrario, para mantener la condición de TOD � 20%, fue necesario enriquecer

la corriente de entrada de gas con oxígeno. Los perfiles con el cultivo del medio LB y

el medio de soya muestran que desde la hora dos, el sistema de cultivo empezó a

ejercer la acción de control.

A B

Page 41: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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El establecimiento de la condición TOD � 20% se consideró como una condición de

oxígeno limitante tomando en cuenta el reporte previo de Tseng et al. (1996). En

dicho reporte, cultivos de B. subtilis en una TOD � 10% (22 µM oxígeno) se indujo la

expresión de los genes de la nitrato reductasa respiratoria (narGHJI), indicando que

el metabolismo de la bacteria cambió de aerobiosis a anaerobiosis (Tseng et al.,

1996).

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A

B

Page 42: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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En la figura 10, se presenta el perfil de crecimiento y esporulación de B. subtilis

obtenidas en el medio LB. Para la condición de TOD � 20%, el crecimiento máximo

fue de 151.0 x 106 ± 60.3 x 106 UFC mL-1, mientras que para la condición de TOD �

20% las células alcanzaron 82.3 x 106 ± 5.61 x 106 UFC mL-1, a pesar de tener una

diferencia 0.83 veces mayor para la TOD � 20%, no se encontró diferencia

significativa (P<0.001). Por otro lado, en el medio de soya, para la condición de TOD

� 20% la concentración de células de B. subtilis máxima fue de 218.0 x 106 ± 10.6 x

106 UFC mL-1 y para la condición de TOD � 20% fue de 95.7 x 106 ± 4.12 x 106 UFC

mL-1, bajo esta condición la TOD � 20% favoreció un aumento (significativo, P<0.001)

de 2.27 veces con relación a la condición de TOD � 20%.

Figura 11. Crecimiento (A) y esporulación (B), de B. subtilis 105 a nivel de biorreactor en medio soya, evaluando la TOD < 20 % (—) y TOD > 20% (- - -).

B

A

Page 43: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

Por otro lado, si se comparan los valores de crecimiento y esporulación obtenidos

bajo la misma condición de TOD, pero con diferente medio. Se observa que a una

TOD � 20% la producción de células de B. subtilis en el medio LB (151 X 106 ± 60.3 x

106 UFC mL-1) fue 30% menor a la que se obtiene con el medio de soya (218 x 106 ±

10.6 x106), esta diferencia resultó significativamente menor (P < 0.001). No obstante

la producción de esporas correspondientes a ambas condiciones (48.7 x 106 ± 4.25 x

106 UFC mL-1 y 46.7 x 106 ± 4.18 x 106 UFC mL-1, para el medio de LB y soya

respectivamente) no presentó diferencia significativa (P < 0.001).

Los resultados correspondientes a la evaluación de la TOD, señalan que los medios

de cultivo no tuvieron efecto ni en el crecimiento ni en la producción de esporas.

Cuadro 2. Crecimiento y esporulación de B. subtilis 105 en biorreactor, para los medios LB y soya, evaluando TOD < 20 % y TOD > 20 %.

Los datos representan el promedio ± DS (n=2) letras diferentes por columna en el crecimiento indican diferencias estadísticas según la prueba de una vía y una comparación múltiple por medio de la prueba Tukey (P�0.001). TOD > 20% (tensión de oxígeno disuelto menor a 20%), TOD < 20% (tensión de oxígeno disuelto mayor a 20%).

Medios TOD (%) Crecimiento

(UFC mL-1 x106) Esporas

(UFC mL-1 x106)Esporulación

(%)

LB TOD>20% 151 + 60.3 b 48.7 + 4.25 a 32.2 ± 6.63ª

TOD<20% 82.3 + 7.61 b 11.3 + 2.84 b 13.7 ± 1.32c

Soya TOD>20% 218 + 10.6 a 46.7 + 4.18 a 21.4 ± 3.63b

TOD<20% 95.7 + 4.12 b 14.4 + 9.67 b 15 ± 2.14c

Page 44: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

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El cuadro 2, muestra la concentración de esporas de B. subtilis correspondientes a la

figura 10 y 11. Para el medio LB, la condición de TOD � 20% permitió una

producción de esporas 4.3 veces superior a la generada con la TOD � 20%. De igual

manera, se observó que la condición de TOD � 20%, favoreció la producción de

esporas en 3.2 veces con relación a la condición de TOD � 20%.

Como se puede observar en el cuadro 2, la TOD � 20% durante el cultivo de B.

subtilis en el biorreactor, favorece el proceso de esporulación de las células,

obteniendo porcentajes de esporulación de 32% para el medio LB y de 21% para el

medio de soya. Estos valores fueron superiores a los obtenidos con la TOD � 20%

(13 y 15 % para los medios LB y soya, respectivamente).

Es posible que la limitación de oxígeno impuesta a TOD � 20% favorezca el cambio

de metabolismo de la bacteria, pasando de una condición de aerobiosis a

anaerobiosis (Nakano et al, 2007; Ongena y Jacques, 2007). Bajo esta condición la

bacteria pudiera estar sintetizando algunas sustancias bioactivas, de manera análoga

a cuando los cultivos alcanzan su fase estacionaria por limitación de nutrientes.

Page 45: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

6.3 Evaluación del efecto antagonista de B. subtilis cepa 105 in vitro.

La capacidad antagonista de B. subtilis cepa 105 es una característica muy

importante para que este pueda ser usado como un agente de control biológico; esta

capacidad se puede ver afectada por las condiciones de crecimiento, de esta manera

en la figura 13 se muestran los resultados de la capacidad antagonista de los caldos

de cultivo de B. subtilis cepa 105 contra el hongo S. sclerotiorum.

Los resultados mostraron que la mayor inhibición de crecimiento del hongo se obtuvo

con los caldos de B. subtilis 105 obtenidos en la condición de TOD � 20%,

independientemente del medio utilizado. El porcentaje de inhibición para el cultivo

crecido en el medio LB fue de 39.3 ± 2.5 % y para el cultivo creado en el medio de

soya 41.4 ± 2.8 %. Mientras que los caldos de B. subtilis cepa 105 generados bajo la

condición de TOD � 20%, produjeron inhibición micelial del 30.4 ± 5.8 % el medio

LB y 29.5 ± 7.3% con el medio de soya.

Finalmente, la menor actividad inhibitoria fue la obtenida con los caldos en los

matraces, donde la actividad fue menor al 25% menor. El análisis de varianza mostró

que los porcentajes de inhibición de los caldos obtenidos en condiciones de TOD �

20% fueron significativamente mayores (P<0.001) a las obtenidas bajo condiciones

de TOD � 20% (Figura 12).

Yeh et al. (2006) reportaron que en B. subtilis la anaerobiosis favorece la formación

de compuestos con propiedades antifúngicos. Muchos de estos compuestos son

regulados por genes que se activan en condiciones anaerobias parciales (Errington

et al., 1993). Este dato es consistente con lo reportado por Tseng et al. (1996), quien

encuentra la máxima expresión de la enzima nitrato reductasa respiratoria (narGHJI)

en B. subtilis cuando el oxígeno disuelto en el medio alcanza 22 µM L-1,

correspondiente a 10% de TOD, es decir en una condición de anaerobiosis parcial.

Page 46: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

Figura 12. Porcentaje de inhibición micelial de S. sclerotiorum, evaluando el sistema matraz, biorreactor bajo una TOD � 20%

y TOD � 20%. Los gráficos presentados muestran promedio ± DS (n=6), letras diferentes indican diferencias estadísticas

según la prueba de una vía y una comparación múltiple por medio de la prueba Tukey (P�0.001).

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El mantener el cultivo bajo limitación de oxígeno (por debajo del 20% TOD), después

de la fase exponencial de crecimiento pudo haber inducido la formación de

compuesto bioactivos tales como micosubtilina, surfactina y plispaspatina, entre otros

(Nakano et al., 1997; Ongena et al., 2005; Pérez-García et al., 2011).

Las diferencias significativa en los porcentajes de inhibición entre la condición de

limitación de oxígeno, respecto a la condición de no limitación de oxígeno, así como

a los demás sistemas evaluados, sugiere que la inhibición del crecimiento del hongo

patógeno pudo deberse a la formación de sustancias bioactivas en los caldos de

cultivo (caldo fermentado, células vegetativas y esporas), (Ongena y Jacques, 2007;

Pérez-García et al., 2011).

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VII. CONCLUSIÓN

• Tanto en matraces Erlenmeyer, como en biorreactor, el medio denominado de

soya compuesto por componentes de bajo costo: proteína de soya, extracto

de levadura y cloruro de sodio, mostró resultados favorables para el

crecimiento y esporulación de B. subtilis cepa 105, por lo que se considera

adecuado para substituir al medio microbiológico LB.

• El nivel de oxígeno durante el cultivo de B. subtilis cepa 105 en el biorreactor,

fue determinante para el crecimiento y esporulación de la bacteria. El cultivo

crecido en el medio de soya, sin limitación de oxigeno (TOD > 20%), alcanzó

valores de 218 x 106 UFC mL-1, con una esporulación del 21 %. Pero en la

condición de limitación de oxígeno (TOD < 20 %) mostró un 43% menos de

crecimiento y con un 15 % de esporulación.

• El nivel de oxígeno del biorreactor, también afectó la actividad antagonista de

los caldos de B.subtilis, bajo la TOD < 20% se obtuvieron valores de 41% de

inhibición una contra el hongo S. sclerotium, resultado 0.46 veces superior al

obtenido bajo la TOD > 20 %.

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���

VIII. LITERATURA CITADA

Abawi G., Grogan R., 1975, Source of primary inoculum and effects of temperature

and moisure on infection of beans by Whetzelinia sclerotiorum, Phytopatology,

65:300-309.

Bailey K. L., Boyetchko S. M., Längle T., 2010, Social and economic drivers shaping

the future of biological control: A Canadian perspective on the factors affecting

the development and use of microbial biopesticides, Biological Control,

52:221–229.

Berry C., Dilantha W. G., Loewen P. C., Kievit T. R., 2010, Lipopeptides are essential

for Pseudomonas sp. DF41 biocontrol of Sclerotinia sclerotiorum, Biological

Control, 55:3:211-218.

Boland G. J., Hall R., 1994, Index of plant hosts of Sclerotinia sclerotiorum, Canadain

Journal Plant Pathology, 16:93-108.

Campa A., Pascual A., Ferreira., 2009, El moho blanco: una enfermedad común en el

cultivo de Faba Granja Asturiana, SERIDA – Área de cultivos Hortofrutícolas y

Forestales, Programa de Genética Vegetal, Disponible en:

http://www.serida.org/publicacionesdetalle.php?id=3814, Consultado: Febrero

2013.

Carvalho A., Lacerda U., 2010, Growth sporulation and production of bioactive

compounds by Bacillus subtilis R14, Brazilian Archives Biology and

Technology, 53:3:643-652.

CESAVEG, 2011, Manual de plagas y enfermedades del frijol, SENASICA,

SAGARPA, Disponible en: www.cesaveg.org.mx, Consultado: Septiembre

2012.

Chamberlain N., 2010, Micrograph of Bacillus subtilis spore stain, ASM

MicrobeLibrary, Disponible en:

Page 50: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

��

http://www.iccb.org/pt3/mod/science/mod_bio111/mod10/p4.html, Consultado:

Marzo 2013.

Chen Z. M., Li Q., Liu H. M., Yu N., Xie T. J., Yang M. Y., Shen P., Chen X. D., 2009,

Greater enhancement of Bacillus subtilis spore yields in submerged cultures by

optimization of medium composition through statistical experimental designs,

Applied Microbiology and Biotechnology, 85:1353-1360.

Cutler H. G., Cutler S. J. 1999, Biologically Active Natural Products: Agrochemicals,

CRC Press, Boca Raton, USA.

Duncan W. R., Fernando D. W. G., Rashid Y. K., 2005, Time and burial depth

influencing the viability and bacterial colonization of sclerotia of Sclerotinia

sclerotiorum, Soil Biology and Biochemestry, 20:1-10.

Erental A., Dickman M. B., Yarden O, 2008, Sclerotial development in Sclerotinia

sclerotiorum: awakening molecular analysis of a “Dormant” structure, Fungal

Biology Reviews, 22:1:6-16.

Errington J., 1993, Bacillus subtilis sporulation: regulation of gene expression and

control of morphogenesis, Microbiology Revision, 57:1-33.

Errington J., 2003, Regulation of Endospore formation in Bacillus subtilis, Nature

Reviews Microbiology, 1:117-126.

Frioni L., 1999, Procesos microbianos, Editorial de la fundación Universidad

Nacional de Rio Cuarto, Argentina, ISBN: 950-665-110.

Fritze D., 2004, Taxonomy of the Genus Bacillus and Related Genera: The Aerobic

Endospore-Forming Bacteria, Phytopathology, 94:11:1245-1248.

Galindo E., Peña C., Serrano-Carreón L., 2011, Domesticar microorganismos en un

biorreactor: los retos del bioingeniero, Grupo de Investigación:

http://pbr322.ceingebi.unam.mx/�Geg/

Page 51: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

��

Gerlagh M., Goossen-van de Geijn H. M., Fokkema N. J., Vereijken P. F., 1999,

Long-Term Biosanitation by Application of Coniothyrium minitans on Sclerotinia

sclerotiorum-Infected Crops, Phytopathology, 89:2:141-7

Homans A. L., Fuchs A., 1970, Direct bioautography on thin-layer chromatography

as a method for detecting fungitoxic substances. Journal of Chromatography

51:325-328.

Horbach R., Navarro-Quesada A. R., Knogge W., Deising W. B., 2011, When and

how to kill a plant cell: Infection strategies of plant pathogenic fungi, Journal of

Plant Physiology, 168:1:51-62.

Kwon E. Y., Kim K. M., Kim M. K., Lee I. Y., Kim B. S., 2011, Production of

nattokinase by high cell density fed-batch culture of Bacillus subtilis,

Bioprocess and Biosystems Engineering, 34:789-793.

López-Rodríguez O. D., 2010, Microorganismos que utilizan oxalato de calcio como

antagonistas potenciales a Sclerotinia sclerotiorum en frijol, Tesis de Maestría,

Departamento de Biotecnología agrícola, CIIDIR-SINALOA.

Marazioti C., Kornaros M., Lyberatos G., 2003, Kinetic modeling of a mixed culture of

Pseudomonas Denitrificans and Bacillus subtilis under aerobic and anoxic

operating conditions, Water Research, 37:6:1239-1251.

Matsumoto T., Sugiura Y., Kondo A., Fukuda H., 2010, Efficient production of

protopectinases by Bacillus subtilis using medium based on soybean flour,

Biochemical Engineering Journal, 6:2:81-86.

McQuilken M. P. y Chalton D., 2009, Potencial for biocontrol of Sclerotinia rot of

carrot with foliar sprays of CONTANS® WG (Coniothyrium minitans),

Biocontrol Science and Technology, 19:2: 229-235.

Molle V., Fujita M., Jensen S.T., Eichenberger S., González-Pastor J., E., Liu J. S.,

Losick, R., 2003, The Spo0A regulon of Bacillus subtilis, Molecular

Microbiology, 50:5:1683–1701.

Page 52: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

Nakano M., Dailly Y. P., Zuber P., Clark D. P., 1997, Adaptation of Bacillus subtilis to

oxygen limitations, FEMS Microbiology Letters, 157:1-7.

Ongena M., Jacques P., Toure Y., Destain J., Jabrane A., Thonart P., 2005,

Involvement of fengycin-type lipopeptides in the multifaceted biocontrol

potential of Bacilli, Phytopathology, 94:11:1272-1275.

Pérez-García A., Romero D., De Vicente A., 2011, Plant protection and growth

stimulation by microorganisms: biotechnological applications of Bacilli in

agriculture, Current Opinion in Biotechnology, 22:2: 187-193.

Preil W., 1991, Application of bioreactors in plant propagation, Debergh y RH

Zimmerman (Eds.) Micropropagation, 425-445

Rodriguez M. A., Cabrera G. M., Godeas A., 2006, Cyclosporine A from a

nonpathogenic Fusarium oxysporum suppressing Sclerotinia sclerotiorum,

Journal of Applied Microbiology, 100:575-586.

Sarmiento L., 2010, Producción de Bacillus subtillis cepa 105 en reactor y evaluación

de su actividad antagonista a Sclerotinia sclerotiorum, Tesis licenciatura,

Instituto Tecnologico superior de Alamo Temapache.

Schisler A., Slininger P. J., Behle R. W., Jackson M. A., 2004, Formulation of Bacillus

sp. for Biological Control of Plant Diseases, Phytopathology, 94:11: 1267-1271.

Schneider K.B., Palmer T.M., Grossman A. D., 2002, Characterization of comQ and

comX, two genes required for production of ComX pheromone in Bacillus

subtilis, Journal of Bacteriology, 184: 410-419.

SIEA-SAGARPA., 2011, Investigación sobre el frijol, Disponible en:

http://www.siea.sagarpa.gob.mx/Publicaciones/Archivos/Frijol9000.pdf.,

Consultado: Septiembre 2012.

Sotomayor-García L. G, 2011, Efecto de antagonistas microbianos a Sclerotinia

sclerotiorum en el desarrollo de apotecia y en la incidencia de moho blanco en

frijol, Tesis de maestría. CIIDIR-IPN Unidad Sinaloa.

Page 53: cultivo de bacillus en bioreactor.pdf

���

Sotomayor-García L. G., 2008, Selección e identificación de antagonistas

microbianos contra esclerocios de Sclerotinia sclerotiorum, Tesis de

licenciatura, Universidad de Occidente campus Guasave.

Thakore Y., 2006, The Biopesticide Market, BCC Research © January, Report Code:

CHM029B.

Tseng C. P., Albrecht J., Gunsalus R. P., 1996. Effect of microaerophilic cell growth

conditions on expression of the aerobic (cyoABCDE and dmsABC) respiratory

pathway genes in Escherichia coli, Journal of Bacteriology, 178: 1094-1098.

Yánez-Mendizábal V., Viñas I., Usall J., Torres R., Solsona C., Teixidó N., 2012,

Production of the postharvest biocontrol agent Bacillus subtilis CPA-8 using

low cost commercial products and by-products, Biological Control, 60:3: 280-

289.

Yeh M. S., Wei Y. H., Chang J. S., 2006, Bioreactor design for enhanced carrier-

assisted surfactin production with Bacillus subtilis, Process Biochemistry, 41:8,

1799-1805.

Zeng W., Kirk W., Hao J., 2012, Field management of Sclerotinia stem root of

soybean using biological control agents, Biological Control, 60:2: 141-147.