Universidades de Alcalá, Complutense y S. Pablo-CEUDoctorado en Química Médica

DISEÑO DE FÁRMACOS

Beatriz de Pascual-Teresa

Programa de Doctorado: Química MédicaUSP-CEU

Programa de doctorado verificado por la ANECA conforme al RD

1393/2007 y resuelto favorablemente por el consejo de coordinación

universitaria en su sesión de 6 de Julio de 2009.

Denominación de las materias (todas de 6 ECTS):Química Médica Avanzada (UCM)

DiseDiseñño de Fo de Fáármacos (CEU)rmacos (CEU)Metodologías químicas en el descubrimiento de nuevos fármacos (UA)

MetodologMetodologíías para la determinacias para la determinacióón estructural de fn estructural de fáármacos y el estudio rmacos y el estudio de fende fenóómenos de reconocimiento molecular (CEUmenos de reconocimiento molecular (CEU--CIB)CIB)

Estrategias en síntesis de fármacos (UA-IQO)Síntesis de fármacos heterocíclicos (UCM)

Aspectos químicos y tecnológicos del desarrollo de los fármacos (UA-CEU)

Programa adherido al Paul Ehrlich European PhD in Medicinal ChemistryLabel to PhD Graduates in Medicinal Chemistry.

www.MedChem Euro-PhD.net

AL DISEÑO RACIONAL DE FÁRMACOS

DEL DESCUBRIMIENTO CASUAL

Objetivos: Diseño de Fármacos

Suministrar al alumno las bases químicas para el diseño racional de fármacos mediante la utilización de

técnicas computacionales.

USP-CEU

Química Computacional, Diseño de Fármacos:

Molecular Modeling, Modelado molecular, Modelización molecular.

CADD (Computer Aided Drug Design)[Quimioinformatica, Bioinformática]

PrácticasTeoría

USP-CEU

CompetenciasUSP-CEU

• Conocer las bases químicas teóricas para el diseño racional de fármacos

mediante la utilización de técnicas computacionales.

• Ser capaz de poner en práctica algunos de los conocimientos adquiridos

a través de la realización de talleres.

• Ser capaz de seleccionar las diferentes técnicas y metodologías

empleadas más frecuentemente en el diseño de fármacos, dependiendo

del sistema objeto de estudio.

Programa de Clases Teóricas y PrácticasUSP-CEU

Hora Lunes, 9 de Mayo Martes, 10 de Mayo Miércoles, 11 de Mayo Jueves, 12 de Mayo Viernes, 13 de Mayo

9:00B. Pascual-Teresa

(USP-CEU)Introducción

B. Pascual-TeresaDiseño de FármacosB. Pascual-Teresa

Diseño de Fármacos S. Martín-Santamaría

QM/MM

F. J. González (U. Oviedo)Química Cuántica

Aula 014

F. J. González (U. Oviedo)Química Cuántica

Aula 011

10:00 B. Pascual-TeresaDiseño de Fármacos

11:00

S. Martín-Santamaría (USP-CEU)

Modelado de Proteínas (I)

B. Pascual-TeresaPrácticas (PDB,

PoseView DrugBank, Molinspiration)

12:00 Pausa Pausa Pausa Pausa Pausa

12:30S. Martín-Santamaría

Modelado de Proteínas (II)

A. Ramos (USP-CEU)REA Danièle Altschuh

(CNRS)“The binding

modes of sequence-based peptido-mimetics: real or imaginary

mimicry?“

F. J. González (U. Oviedo)Prácticas Gaussian

Aula AF. J. González (U. Oviedo)

Química CuánticaAula 011

13:30S. Martín-Santamaría

Prácticas (formatos xyz, mol, smiles y PDB)

A. Ramos“MMP-2 y el Receptor

de Estrógenos: dos dianas para el diseño de nuevos agentes

antitumorales”

F. J. González (U. Oviedo)Prácticas Gaussian

Aula A

F. J. González (U. Oviedo)Prácticas Gaussian

Aula A

Teoría Aula 103 A Prácticas Aula 101, 014, 011 y Aulas A y B

Programa de Clases Teóricas y PrácticasUSP-CEU

Teoría Aula 103 A Prácticas Aula 004

Hora Lunes, 16 de Mayo Martes,17 de Mayo Miércoles, 18 de Mayo Jueves, 19 de Mayo Viernes, 20 de Mayo

9:009:30-11:00- M.

Martín (IQM-CSIC)“Aminoácidos no proteinogénicos

como inductores de giros inversos”

Case Study Janssen(Toledo)

10:00

Conferencia Glaxo

(Tres Cantos)

10:30-12:30- M. Pastor (UPF)

ADME-Tox11:00-12:00- A.

Morreale (CBM-CSIC)Virtual Screening

Aula 01111:00

A. Ramos“MMP-2 y el Receptor de

Estrógenos: dos dianas para el

diseño de nuevos agentes

antitumorales”

12:00 Pausa Pausa Pausa Pausa Pausa

12:30 a

14:30

Visita Glaxo(Tres Cantos)

A. Gradillas (USP-CEU)“Caso: Gleevec”

Visita Janssen(Toledo)

12:45-14:45-C. Pérez Martínez (Lilly)

Docking

12:30-14:00- A. Morreale (CBM-CSIC)

Virtual Screening (taller)Aula B

ContenidosUSP-CEU

Propiedades de los productos drug-like. Relación estructura-actividad.

Química Computacional. Mecánica molecular. Métodos semiempíricos.

Métodos ab initio. Cálculos DFT.

Análisis conformacional. Dinámica molecular.

Diseño de fármacos basado en la estructura.

Diseño de fármacos basado en el ligando.

QSAR-3D. Identificación de farmacóforos.

Modelado de proteínas. Modelado de ácidos nucleicos.

Predicción de estructura.

Docking. Screening virtual. Diseño de novo.

Programa de clases prácticas

Prácticas 1 y 2. Visualización 3D, manipulación de complejos fármaco-receptor,

construcción y modelado de ligandos y receptores:

PDB, DrugBank, Molinspiration, Rasmol, Chime, Sybyl,

ChemSketch, Corina, Moviemaker, etc.

Práctica 3. Estudio ab initio de un proceso enzimático: Gaussian, Gaussview

Prácticas 4. Diseño de Fármacos Basado en la estructura. Docking

USP-CEU

Profesores participantes de la USP-CEU

Dra. Beatriz de Pascual-Teresa

Catedrática

Departamento de Química.

Diseño de Fármacos, ADME-Tox y practicas

Dra. Sonsoles Martín Santamaría.

Profesora Adjunta.

Departamento de Química.

Modelado de proteínas. QSAR-3D y prácticas

Dra. Ana Ramos González.

Catedrática

Departamento de Química

Relación Estructura Actividad y seminario

Dra. Ana Gradillas Nicolás

Profesora Adjunta

Departamento de Química

Caso

USP-CEU

Dr. Javier González Fernández. Profesor Titular. Departamento de Química. Universidad de Oviedo.

Química Computacional. Prácticas.

Dr. Carlos Pérez Martínez. Computational Drug Discovery (DCRT). Eli Lilly and Company

Docking en el diseño de fármacos (Glide). Prácticas.

Dra. Danièle Altschuh. CNRS(France)

Surface Plasmon Resonance and applications

Dr. Manuel Pastor. Universidad Pompeu Fabra

“ADME-Tox”

Dra. Mercedes Martín. IQM-CSIC

“Aminoácidos no proteinogénicos como inductores de giros inversos”

Dr. A. Morreale. CMB (CSIC)

“Virtual Screening”

Dr. M. Cacho. Glaxo

Visita

Dr. J. Fernández Gadea. Janssen

Visita

USP-CEUProfesores participantes de otras instituciones

Bibliografía general

Andrew R. Leach, Molecular Modelling, Principles and Applications, 2nd Edition, Pearson,

Prentice Hall, 2001.

Grant, G.H.; Richards, W.G.; Computational Chemistry. Oxford University Press, 1996

U. Burkert and N.L. Allinger, Molecular Mechanics, ACS Monograph 177. Washington D.C.,

American Chemical Society, 1982.

P. R. Schleyer and P. R. Schreiner. Eds. Encyclopedia of Computational Chemistry. Wiley,

1998

Kenny B. Lipkowitz and Donald B. Boyd. Eds. Reviews in Computational Chemistry. Wiley.

1996

Hugo Kubinyi, Gerhard Müller. Chemogenomics In Drug Discovery: A Medicinal Chemistry

Perspective, Wiley-VCH, Weinheim, Germany, 2004

Dr. David C. Young Computational Drug Design Wiley interscience 25 Feb 2009. Print ISBN:

9780470126851

USP-CEU

JOIN US!Apply to the SEQT-sponsored grants before April7thhttp://www.seqt.org/englinf/grants.asp

Young Researchers Searched for the Second SEQT –Janssen Summer SchoolEFMC Sponsored

Promoting education and research training of PhD students in Medicinal Chemistry.

In this congress PhD students are encouraged to present their research and interact within the multidisciplinary field of Pharmaceutical Sciences, and foster professional and personal networks throughout Europe.

1st Meeting of the Paul Ehrlich MedChem Euro-PhD Network 7th Meeting of the European Network of Doctoral Studies in Pharmaceutical Sciences

Deadlines:- Communications and registration: 22nd April, 2011.- More information: paul.ehrlich@ceu.ess; bpaster@ceu.es

1st Meeting of the Paul Ehrlich MedChem Euro-PhD Network 7th Meeting of the European Network of Doctoral Studies in Pharmaceutical Sciences

COLEGIO MAYOR SAN PABLO CEU

“De un doctor bien formado, lo menos importante es el resultado

específico de sus trabajos, lo importante es que la gente así formada:

•ha aprendido el proceso de pensamiento crítico

•sabe que las cosas importantes por pequeñas que sean

requieren un esfuerzo grande y a largo plazo

•sabe reconocer que se ha equivocado y sabe rectificar

•sabe comunicarse y comunicar

•sabe formular ideas

•sabe discutir y defender racionalmente sus posiciones

•sabe extraer lo esencial de problemas complejos”

Pedro Miguel Echenique Landiríbar. “Lo Útil de Conocer” Salamanca 2001

USP-CEU