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Taller: CONTROL DE CALIDAD DE MUESTRAS BIOLÓGICAS EN UN BIOBANCO
Dr. Andrés C. García Montero.Banco Nacional de ADN Carlos III- Universidad de Salamanca
18 de Noviembre de 2015
“Situación del control de calidad en la Plataforma Nacional de Biobancos”
Propiedad o conjunto de propiedades
inherentes a algo que permiten juzgar
su valor.
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CALIDAD
MUESTRAS BIOLÓGICAS e INVESTIGACIÓN
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-HindIII 1 2 3 4 5
Establecer los mecanismos necesarios para
demostrar el cumplimiento de los objetivos
de calidad previamente definidos.
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CONTROL DE CALIDAD
1.- Alcanzar un mínimo de calidad en las muestras quepermita obtener resultados fiables.
2.- Conseguir una homogeneidad de calidad dentro de lasmuestras de la colección para evitar sesgos en losresultados.
OBJETIVO
.- DEFINIR CRITERIOS DE EXCLUSIÓN:.- Objetivos de calidad.- Tolerancias
.- DISPONER DE PNTs VALIDADOS
.- CONTROL DE CALIDAD INTERNO
¿CÓMO CONSEGUIRLO?:
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HETEROGENEIDAD DE LA CALIDAD DE LAS MUESTRAS:
.- ESTUDIOS MULTICÉNTRICOS
.- BIOBANCOS EN RED
.- REDES DE BIOBANCOS
RIESGOS
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HETEROGENEIDAD DE LA CALIDAD DE LAS MUESTRAS:
.- ESTUDIOS MULTICÉNTRICOS
.- BIOBANCOS EN RED
.- REDES DE BIOBANCOS
PROGRAMA DE CONTROL DE CALIDAD:
EXTERNO vs INTERNO
RIESGOS
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Estudio multicéntrico BBMRI: 37 centros Fluorescencia (Picogreen)
8 muestras (x3): concentraciones conocidas#1 270 ng/ul#2 220 ng/ul#3 140 ng/ul#4 180 ng/ul#5 60 ng/ul#6 40 ng/ul#7 10 ng/ul#8 100 ng/ul 0
50
100
150
200
250
300
350
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450
500
1
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EVALUACIÓN CUANTIFICACIÓN ADN
Fluorescence Concentrations
0.00
50.00
100.00
150.00
200.00
250.00
300.00
350.00
400.00
450.00
500.00
Q2C_0
01b
Q2C_0
04Q2C
_010
Q2C_0
11b
Q2C_0
14Q2C
_016
Q2C_0
17Q2C
_023
aQ2C
_027
a Q2C
_027
bQ2C
_028
Q2C_0
29a
Q2C_0
29b
Q2C_0
29c
Q2C_0
29d )
Q2C_0
30Q2C
_031
Q2C_0
39Q2C
_042
aQ2C
_042
bQ2C
_047
Q2C_0
49Q2C
_059
Q2C_0
60Q2C
_062
Q2C_0
67Q2C
_070
Q2C_0
71B
Q2C_0
74b
Q2C_0
75b
Q2C_0
79b
Q2C_0
81Q2C
_085
bQ2C
_087
cQ2C
_090
a Q2C
_090
b Q2C
_091
b
Study Centre
Con
cent
ratio
ns n
g/ul
ABCDEFGH
PUNTOS CRÍTICOS en la CALIDAD de las MUESTRAS en un BIOBANCO
1. Implementar mecanismos que garanticen la trazabilidadde las muestras y sus datos asociados;
2. Definir los estándares de calidad de los productos segúnlos requisitos de los usuarios;
3. Definir un protocolo de control de calidad;
4. Controlar los equipos implicados en los procesos deproducción, gestión y almacenamiento que afectendirectamente a la calidad de los productos;
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Laboratory Integrated Management System
Trazabilidad
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.- Etiquetas / lectores códigos de barras
.- Registro
.- Procesamiento (Automatización)
.- Almacenamiento(Microtubos 2D-coded)
TRAZABILIDAD(IDENTIFICACIÓN y SEGUIMIENTO)
Trazabilidad
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Definición de los ESTÁNDARES DE CALIDAD de los productos según los
requisitos de los usuarios
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Cada biobanco (o Red de Biobancos) deberá establecer,
basándose en recomendaciones reconocidas, evidencias
científicas,… cuáles son sus objetivos de calidad.
Éstos tienen que cumplir los requerimientos de los
investigadores (tipo, número y calidad de las muestras)
para que puedan realizar los proyectos investigaciones con
garantías y deben ser exigentes, no de mínimos, para
garantizar la calidad a medio y largo plazo (10-30 años).
RECOMENDACIONES INTERNACIONALES:
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Estándares de calidad
• International Society for Biological and Environmental Repositories(ISBER).
• National Cancer Institute US (NCI).• Organization for Economic Cooperation and Development (OECD). • World Health Organization—International Agency for Research on
Cancer (WHO-IARC).• Organización Internacional de Metrología Legal (OIML)• ISO 15189:2007 Quality management of medical laboratories.
Particular requirements for quality and competence.• ISO 17025:2005 For competence of testing and calibration
laboratories
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Estándares de calidad
ARTÍCULOS CIENTÍFICOS:
• Yuille M, Illig T, Hveem K, Schmitz G, et al. Laboratory managementof samples in biobanks–recommendations of a European ConsensusExpert Group. Biopreserv Biobank 2010; 8:65–69.
• Brown J, Donev AN, Aslanidis C, et al. Observational study on theestimation of DNA concentration in 13 biobanking Infrastructures andlaboratories. BMC Res Notes 2009; 2:208.
• Beck J.C., C.M. Beiswanger, E.M. Jhon, E. Satariano and D. West.
Successful transformation of cryopreserved lymphocytes: a resourcefor epidemiological studies. Cancer epidemiology 2001; 10:551-554.
• Karen Steinberg, et al. DNA Banking for Epidemiologic Studies: A Reviewof Current Practices. Epidemiology. 2002; 13 (3): 246-254
• Lee et al., Optimizing storage and handling of DNA extracts. Forensic.
Sci. Rev. 2010; 22:131
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Estándares de calidad
REQUISITOS DE LOS USUARIOS:
EVIDENCIAS PROPIAS (Validación):
Células purificadas
Ácidos nucleicos en H2O mQ
PLATAFORMA RED NACIONAL DE BIOBANCOS
SITUACIÓN ACTUAL DEL CONTROL DE CALIDAD
PLATAFORMA RED NACIONAL DE BIOBANCOS
TIPOS DE MUESTRA y ALMACENAMIENTO
SITUACIÓN ACTUAL DEL CONTROL DE CALIDAD
TEJIDOS
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Congelado
48 BIOBANCOS (92% de la Plataforma)
100% Temperatura ambiente
100% congeladores -65ºC/-80ºC
Fijado (parafina)
SEROTECAS
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Plasma / suero48 BIOBANCOS (92% de la Plataforma)
0
20
40
60
80
100
Tª ambiente -20ºC/-40ºC -65ºC/-85ºC -150ºC N2 líquido
PLASMA SUERO
ÁCIDOS NUCLEICOS
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ADN
ARN
44 BIOBANCOS (85% de la Plataforma)
34 BIOBANCOS (65% de la Plataforma)
0
20
40
60
80
100
Tª ambiente -20ºC/-40ºC -65ºC/-85ºC -150ºC N2 líquidoADN ARN
CÉLULAS VIABLES
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Células 39 BIOBANCOS (75% de la Plataforma)
0
20
40
60
80
100
Tª ambiente -20ºC/-40ºC -65ºC/-85ºC -150ºC N2 líquido
SANGRE
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Completa
FTA
35 BIOBANCOS (67% de la Plataforma)
14 BIOBANCOS (27% de la Plataforma)
100% Temperatura ambiente
100% congeladores -65ºC/-80ºC
Otras muestras
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Orina 38 BIOBANCOS (73% de la Plataforma)
0
20
40
60
80
100
Tª ambiente -20ºC/-40ºC -65ºC/-85ºC -150ºC N2 líquido
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LCR 23 BIOBANCOS (44% de la Plataforma)
0
20
40
60
80
100
Tª ambiente -20ºC/-40ºC -65ºC/-85ºC -150ºC N2 líquido
Otras muestras
PLATAFORMA RED NACIONAL DE BIOBANCOS
SEGURIDAD EN ALMACENAMIENTO
SITUACIÓN ACTUAL DEL CONTROL DE CALIDAD
Congeladores mecánicos
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100% de los biobancos
0
20
40
60
80
100
Alarmaremota
Backup CO2 Soporteeléctrico
Registrode Tª
RegistroManto.
Tanques de N2
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75% de los biobancos
0
20
40
60
80
100
Alarmaremota
Backup CO2 Soporteeléctrico
Registrode Tª
RegistroManto.
Temperatura ambiente
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Control de temperatura 75%
Control de humedad relativa 2%
PLATAFORMA RED NACIONAL DE BIOBANCOS
CONTROL DE CALIDAD
SITUACIÓN ACTUAL DEL CONTROL DE CALIDAD
¡9% (4 biobancos) carecen de QC!
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PLATAFORMA DE BIOBANCOS
Obligación por parte de la dirección del biobanco de “garantizar lacalidad, la seguridad y la trazabilidad de los datos y muestrasbiológicas almacenadas y de los procedimientos asociados alfuncionamiento del biobanco” (LIB, art. 66.c. y RD, art. 13.c).
el Real Decreto, cuando describe la documentación que debe presentar elbiobanco para solicitar la autorización para su constitución yfuncionamiento, habla de un “plan de calidad” (RD, art 6.h).
OBLIGACIÓN LEGAL
De los biobancos que tienen implantado
algún tipo de Control de Calidad (QC):
76% QC interno
22% QC común a nodos del biobanco
11% QC externo (p.ej. ISBER,…)
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PLATAFORMA DE BIOBANCOS
ADN
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80% de la Plataforma (37 nodos)
0
20
40
60
80
100
A260/280 Agarosa Picogreen PCR Bioanaliz. STRs
ARN
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52% de la Plataforma (24 nodos)
0
20
40
60
80
100
A260/280 Agarosa PCR Bioanaliz.
TEJIDOS
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54% de la Plataforma (25 nodos)
44% Inmunohistoquímica32% Hematosilina-Eosina60% Extracción de ácidos nucleicos
020406080
100
A260/280 Agarosa PCR Bioanaliz.
Plasma / Suero
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24% de la Plataforma (11 nodos)
64% lipemia, hemolisis, ictericia
27% bioquímica
9% A260/280 y/o bioanalizador
Proteínas
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13% de la Plataforma (6 nodos)
0
20
40
60
80
100
A280 Bioanaliz. Western Bioquímica
SITUACIÓN ACTUAL DEL CONTROL DE CALIDAD
PLATAFORMA RED NACIONAL DE BIOBANCOS
SISTEMA DE GESTIÓN DE CALIDAD
¡60% de los biobancos tienen implantado un
Sistema de Gestión de Calidad!
29% lo tienen CERTIFICADO bajo la
ISO/9001:2008 (14) o están en proceso de
certificación (1 biobanco).
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PLATAFORMA DE BIOBANCOS
HERRAMIENTA que nos va a permitir, mediante una
correcta organización y optimización de nuestras
actividades, garantizar la calidad de los servicios que
proporcionemos a los usuarios según los requisitos que
éstos nos hayan demandado.
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SISTEMA DE GESTIÓN DE CALIDAD