modificaciÓn genÉtica de levaduras vÍnicasmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · levaduras...

40
MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICAS Amparo Querol IATA-CSIC, Valencia (España)

Upload: others

Post on 03-Jul-2020

5 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICAS

Amparo QuerolIATA-CSIC, Valencia (España)

Page 2: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

VENTAJAS DE LAS LEVADURAS SECAS ACTIVAS

1. INICIO RÁPIDO DE LA FERMENTACIÓN

2. REGULARIDAD EN EL CURSO DE LA FERMENTACIÓN

3. SEGURIDAD DE UNA BUENA FERMENTACIÓN

Page 3: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Condiciones climatológicas favorables

Condiciones climatológicas desfavorables

Page 4: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

tiempo de fermentación (días)

0 2 4 6 8 10 12 14 16 18

frecu

enci

a (%

)

0

20

40

60

80

100

B-I (T73) B-II B-VI B-VIII

mm T-73

T-73

B-II

B-II

B-VI

B-VI

B-VIII

B-VIII

¿Se impone la levadura inoculada durante la fermentación?

Page 5: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

POSIBILIDAD DE MEJORA GENÉTICA

1. Del proceso de fermentación alcohólica

2. De la calidad de las propiedades del vino

3. Del proceso de producción de la levaduracomercial

Page 6: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

MODIFICACIÓN GENÉTICA DE “STARTERS”Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante(Querol y Ramón, 1996 y Pretorius 2000).

Gen expresado Efecto en la levadura vínica o en el vino

Toxina “killer” K1 Ventaja ecológica de la cepa al inocular

Pectato liasa Problemas de filatración e incremento del aroma afrutado

Poligalacturonsas ND

β-(1,4)-endoglucanas Incremento del aroma afrutado

β-(1,4)-endoglucanas Incremento del aroma afrutado

Arabinofuranosidasa Incremento del aroma afrutado

β-glucosidasa Incremento del aroma afrutado e incremento de resveratrol

Xilanasa Incremento del aroma afrutado

L(+)-lactato deshidrogenasa Aumenta la acidez del vino

Malato permeasa y enzima málico Disminución de la acidez del vino

Disminución de la acidez del vino Incremento de los aromas secundarios: ésteres

Sobreexpresión de glicerol-3-fosfato dehidrogenasa Incremento en la producción de glicerol

Expresión de bacteriocinas dePediococcus acidilactici y Leuconostoc carnosum

Inhibición del crecimineto de baterias alterantes del vino

Page 7: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

AMPLIACIAMPLIACIÓÓN DEL GENOTIPO KILLERN DEL GENOTIPO KILLER

K2

K1

K1/K2

K2 K1

K2

K1

Page 8: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

FERMENTACIFERMENTACIÓÓN MIXTAN MIXTA

S. cerevisiae

Lactobacillus casei

LDH

LDH

ETANOL + ÁCIDO LÁCTICO

GLUCOSA

Page 9: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

FERMENTACIFERMENTACIÓÓN MALOLN MALOLÁÁCTICACTICA

L-malato L-lactatoNAD+

+ CO2

mlemle

mleA

mleS

mle Lactobacillus delbrueckii

Lactococcus lactis

Leuconostoc oenos

Page 10: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

FERMENTACIFERMENTACIÓÓN MALOLN MALOLÁÁCTICACTICA

mleS

S. cerevisiae

L. lactis

mleS

mleSS. pombe mae1mae1

MÁLICO LÁCTICO

Page 11: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Enzimas comerciales

- Pectinasas• Mejorar rendimiento• Mejorar procesos de filtración y clarificación• Extracción de Fenoles (Antocianos, Taninos,

otros)• Extracción de precursores del aroma• Estabilidad del vino

- Glucanasas- Glucosidasas

• Liberación de aromas primarios

Page 12: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

POSIBILIDADESPOSIBILIDADES

• Adición directa: producción usando hongos filametosos

• Sobreexpresión en levadura vínica

Page 13: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

INCREMENTO DE AROMAINCREMENTO DE AROMA

PRIMARIOS

SECUNDARIOS

TERCIARIOS

Page 14: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Terpeno

Glucosa

Terpenono volátil

+

GLUG

A

BGL

G+TT

Terpenovolátil

ArabinosaApiosaRamnosa

AROMA PRIMARIO

Page 15: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

LEVADURAS VLEVADURAS VÍÍNICAS HIDROLNICAS HIDROLÍÍTICASTICAS

S. cerevisiae

Aspergillus niger ABFBGL

ABF

Candida molischiana BGL

T

G

Terpenono volátil

+

ABFA G

A

BGL

G+TT

Terpenovolátil

Page 16: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

0.00

0.25

0.50

0.75

1.00

T73 AbfB BglN AbfB+BglN

µM

t-piceidc-piceidt-resveratrolc-resveratrol

INCREMENTO DEL RESVERATROL

Page 17: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

AROMAS SECUNDARIOS

ÉSTER - SINTASAÉSTER - HIDROLASA

ALCOHOL ACETIL TRANSFERASA

A-CoA + AlcoholAATF

É S T E R

Éster -sintasaÉster - Hidrolasa

Alcohol + Acido

Page 18: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Mejora del proceso de producciónindustrial de levaduras vínicas

Sobreacumulación de glucógeno y de

trehalosa

Page 19: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Producción de levaduras vínicas a escala de laboratorio

Page 20: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Sobreacumulación de glucógeno

Glucosa GlucógenoGlucógeno sintasa

Glucógeno fosforilasa

Glucógeno sintasa: gen GSY2Glucógeno fosforilasa: gen GPH1

1. Sobreexpresión del gen GSY2

2. Deleción del gen GPH1

Page 21: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Sobreacumulación de trehalosa

Glucosa TrehalosaTrehalosa sintasa

Trehalasa

Trehalosa sintasa: genes TPS1 y TPS2Trehalasa: gen NTH1 y gen ATH1

1. Sobreexpresión de los genes TPS1 y TPS2

2. Deleción del gen NTH1 y/o del gen ATH1

Page 22: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Etanol Acetaldehído

Elaboración de vino de Jerez

Page 23: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Elaboración de vino de Jerez

Page 24: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Estructura y localización de Flo1p

Page 25: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Estructura y localización de Flo11p

Page 26: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Deleción del gen FLO1

Page 27: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Deleción del gen FLO11

Page 28: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Caracterización del gen FLO11

Page 29: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol
Page 30: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

MODIFICACIÓN GENÉTICA DE “STARTERS”

1. Regulación de la expresión génica

2. Mejora de respuesta al estrés de levaduras vínicas industriales

Page 31: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

EXPRESIÓN GÉNICA EN LEVADURAS

Page 32: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

REGULACIÓN GÉNICA(Diferencias entre vinos)

Vino tintoVino blanco

PGK1HSP30SPI1

1/2 1 2 3 4 5 6 1/2 1 2 4 6 8 9

Días Días

Page 33: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

MODIFICACIÓN GENÉTICA DE “STARTERS”

1. Sistemas de integración en el genomade la levadura: levaduras GRAS

2. Regulación de la expresión génica

3. Mejora de respuesta al estrés de levaduras vínicas industriales

Page 34: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

MEJORA DE RESPUESTA AL ESTRÉS DE LEVADURAS VÍNICAS INDUSTRIALES

1. Aspectos fisiológicos y moleculares de la adaptación a las condiciones adversas de los procesos industriales

2. Identificación de nuevos genes implicadosen la resistencia a estrés de cepas vínicas

3. Mejora genética: aumento de la resistenciaa estrés de cepas vínicas.

Page 35: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

RESISTENCIA A ESTRÉS, EXPRESIÓNGÉNICAY COMPORTAMIENTO

FERMENTATIVO

1. Viabilidad frente a varias condiciones de estrés

2. Expresión de genes marcadores de estrés

3. Comportamiento en condiciones de microvinificación

Page 36: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Characterisation regarding stress response of three commercial wine strains, one of them

having problems of fermentative arrest: T73, LYCC047 y LYCC082

• Behaviour under microvinification conditions • Viability under several stress conditions• Expression of stress marker genes such asHSP12, HSP82, HSP26 or HSP104 (chaperones)

Stress adaptation

Page 37: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

0

50

100

150

200

250

0 5 7 12 14

Time (days)

Glu

cose

con

cent

ratio

n(g

/L)

LYCC082

LYCC047

T73

Microvinifications in synthetic must with low nitrogen concentration

Page 38: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

5.3 cm3.3 cm3.2 cm3.9 cmOxidative5

78%75%88%42.5%Glucose starvation4

0.0035%0.0022%0.0041%0.0014%Osmotic3

15%15%19%7%Ethanol2

0.8%3.1%2.7%0.45%Heat shock1

W303 dipl.T73LYCC082LYCC047

1 number of viable cells after 2 hours at 45ºC2 number of viable cells after 5 hours in presence of 8% (v/v) ethanol3 number of viable cells after 16 hours in presence of 3M KCl4 number of viable cells 48 hours after glucose depletion 5 diameter of the region of growth inhibition under H2O2

Resistance to several stress conditions

STRESSSTRAIN

Page 39: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Response to ethanol stress (8% v/v, 1 h)

02468

101214

LYCC047 LYCC082 T73 W303

HSP12 SSA3

Indu

ctio

n Le

vels

Strains

Hsp12p protects membranesagainst desiccation and ethanol-induced stress

Page 40: MODIFICACIÓN GENÉTICA DE LEVADURAS VÍNICASmural.uv.es/igarmut/mejoragenetica3.pdf · Levaduras vínicas modificadas genéticamente mediante técnicas del DNA recombinante (Querol

Stress adaptation

1. The commercial S. cerevisiae strains are more resistant to different stresses.

2. In general, we observed an over-expression of the genes coding heat shock proteins Hsp12 and Hsp104 in commercial S. cerevisiae strains.

3. S. cerevisiae sherry strains (flor yeasts) are less resistant to osmotic stresses and more resistant to alcohol and acetaldehyde than the strains isolated during the alcohol fermentation.