efsa source attribution

Jornada de Seguridad Alimentaria

Las enfermedades trasmisibles atribuibles a los alimentos:

Mas allá de los brotes

Documento EFSA sobre atribución de enfermedades

a los alimentos

Antonio Martínez

Los peligros microbiológicos son un desafio importante para las politicas de inocuidad alimentaria.

ORIGEN DE APLICACION DE METODOS DE ATRIBUCION

50%50%Brucella spp.

25%0%Aeromonas spp.

Included[TR1]

ExcludedIncludedIncludedExcludedIncludedTravel-related cases

EEEE/CCOE/O/RData sources*

20062000ninetiesnineties1992-

2000

ninetiesPeriod

NLAustraliaFranceNLUKUSACountry

HavelaarCresseyHallAnonDuynAdakMead Reference&

[TR1]Excluded ?


80%80%$80%**Salmonella Typhi

55%61%87%95%>90%92%95%Salmonella spp.

28%Mycobacterium bovis

42%NANANANANAMycobacterium avium

69%85%NA99%99%99%Listeria monocytogenes

50%8%30%Other diarrheogenic

70%Enterotoxigenic

42%65%NANANA85%STEC non-O157

40%40%65%50%50-90%63%85%STEC O157

Escherichia coli

42%58%75%80%30-80%80%80%Campylobacter spp.

Para disminuir la incidencia de las enfermedades transmitidas por alimentos, expertos y sectores sociales han expresado la necesidad de desarrollar sistemas de inocuidad alimentaria basados en la ciencia y en la evaluación de riesgos microbiologicos.

Con ello las entidades con capacidad de toma de decisión pueden priorizar los peligros y desarrollar intervenciones (Actuaciones) usando los mejores datos disponibles en la distribuión y reducción del riesgo.



� La identificación y priorización de intervenciones en inocuidad alimentaria requiere que se entienda la relacion entre alimento y patógeno desde la granja hasta el consumo.

� Para ello se debe llevar a cabo la atribucion al alimento, es decir, identificarque alimentos son vehículos para casos específicos de enfermedsdes.


� Estos datos son de vital importancia para las agencias gubernamentales que regulan los alimentos en general, vegetales, animales y el agua para beber.


� Hay una variedad de aproximaciones para la atribución al alimento y de datos que se usan en todo el mundo, análisis de datos de brotes, etudios de casos y controles, subtipado microbiológico, mètodos de rastreo y elicitación de expertos, por mencionar algunos.

� El Food Safety Research Consortium propició un workshop en Octubre de 2003 para discutir las virtudes y limitaciones de las diferentes aproximaciones.

El documento de EFSA

� La Comisión pidió a EFSA una opinión sobre una evaluación cuantitativa del riesgo micorobiológico de Salmonella en carnes.

� En concreto se le preguntó a EFSA sobre la contribución relativa de las diferentes categorías de carnes.

� La petición ocasionó una discusión entre la Comisión y EFSA sobe la forma mas apropiada de responder a la petición.

� Como consecuencia se vio la necesidad de un documento en el que se revisara la metodología disponible para llevar a cabo la atribución de la fuente de contagio y para identificar las mejores aproximaciones y necesidad de datos.


� De acuerdo al documento de EFSA, para llevar a cabo una política de inocuidad alimentaria, es importante conocer no solo la fracción de la incidencia de enfermedades humanas debido a patógenos específicos que son atribuibles a alimentos específicos, si no también aquellas atribuibles a otras fuentes, como el contacto con el medio ambiente, contacto directo con animales y contacto humano con humano.


� Este es un proceso dificil que puede basarse en diferentes fuentes de informacion que no proporcionan siempre las mismas respuestas


� Con estas consideraciones, EFSA estableció un dialogo e intercambio de opiniones con la Comision Europea en relación a la problematica planteada.

� El resultado fue que EFSA decidio producir un documento recopilatorio de los metodos actualmente existentes para la atribución de las fuentes de enfemedades alimentarias de origen microbiológico.


� Los términos de referencia:� Hacer una revisión de los métodos

disponible para la atribución de la fuente de contagio

� Identificar las fortalezas y debilidades de cada método

� Identificar los datos necesarios para cada uno de los métodos


� ¿Que es el termino “Source attribution” o “ Human illness attribution” ?

� Se refiere a los esfuerzos conjuntos para cuantificar la importancia relativa de las fuentes específicas de alimentos y reservorios animales para los casos humanos de enfermedades transmitidas por los alimentos.


� Para la política de inocuidad alimentariaes importante conocer la fracción de la incidencia total de enfermedades humanas debidas a patógenos entéricos que se puede atribuir a los alimentos y que alimentos contribuyen a dicha fracción

ReservoirTransmission

routeExposure Illness

Biological, technological and social factors Dose-response

Causal pathways of food-borne infectious diseases


� El principal interés para la “source attribution” es evaluar la transmisión total procedente del alimento comparada con otras rutas imporatntes de infección� Exposición al medio ambiente

� Contacto directo con animales

� Transmisión humano a humano

La figura siguiente muestra las principales rutas de transmisión de patógenos entéricos


Water, soil, air,

wasteFood plants Food animals Companion

animals

Processing Processing

Preparation

Consumption

Humans

Foodborne

Environmental Animal contact

Human-human

Wild animals


� Actualmente muchos patógenos procedentes de alimentos tienen muchas fuentes potenciales, la tarea de atribuir enfermedades humanas a las fuentes responsables de las mismas es bastante complicado.


� Se requiere una aproximación estructurada adonde además de identificar las fuentes y rutas de transmisión mas importantes, se cuantifique la importancia relativa de cada una de las fuentes.

� La atribución de enfermedades humanas debe incluir todas las fuentes potenciales y rutas de transmisión y no limitarse a una o unas cuantas combinaciones de fuente y enfermedad.

El documento de EFSAEl documento de EFSA

� Hay diferentes aproximaciones para atribuir enfermedades humanas y diferentes fuentes de datos� Subtipado microbioloógico

� Compilación de datos de brotes

� Estudios epidemiológicos

� Evaluación de la exposición comparativa

� Opinión de expertos


� Para determinar la incidencia total de una enfermedad alimentaria determinada es de poca importancia distinguir entre casos procedentes de brotes y casos esporádicos.

� Para evaluar tendencias e identificar fuentes de infecciones humanas la distinción entre ambos es esencial. El documento de EFSA se centro mas en los casos esporádicos.

� A lo largo del documento de EFSA se analiza cada una de estas metodologías tratando de identificar una serie de cuestiones de interés para cada uno de ellas, siguiendo el esquema siguiente:


� En el documento cada método se estudióbajo el siguiente esquema:� Metodología

� Ejemplos y resultados

� Necesidad de datos

� La base de datos ideal

� Bases de datos existentes

� Recomendaciones para mejorar los datos existentes

� Fortalezas y debilidades

� Conclusiones y perspectivas de futuro


� Seria prolijo entrar en detalle en cada una de las metodologías. Es mas interesante pasara las conclusiones y recomendaciones que mantendré en ingles para trasmitir exactamente el espíritu de las mismas. Solo decir que yo coordine el capítulo: � Epidemiological studies for source

attribution of sporadic cases.


� It is important to know the fraction of incidence of human illness due to specific pathogens that is attributable to foods and which foods are contributing to that fraction in addition to thecontribution of other sources like environmental, direct animal contact and human to human contact.

El documento de EFSAConclusiones

� Attribution to sources of human food-borne illness can be achieved using different methods such as microbial subtyping, outbreak summary data, epidemiological studies, comparative exposure assessment, and structured expert opinion. Each method of source attribution has different strengths and weaknesses and addresses different points in the food chain.

� The choice of method depends on the specific question that needs answering and the data and resources available.


� Source or reservoir attribution using microbial subtypinghas mainly been applied for Salmonella and so far only in a few countries. Serotyping and phage typing are thepreferred typing methods for this purpose, but newgenotypic-based methods may prove to be valuable in thefuture also for other pathogens like Campylobacter andVTEC.

� Reservoir attribution of human salmonellosis has providedguidance to risk managers and policy makers on theimplementation and evaluation of control strategies formajor reservoirs. The philosophy behind the approach isthat control of the reservoir will prevent subsequent human exposure, regardless of the transmission route or vehicle. By collating results from surveillance programs that are in place and comparing these to cases of human illness, themethod provides added value to data that are already beingcollected.


� Outbreak investigations give publichealth officials important information tobe used for immediate control ofindividual events.

� Although source attribution usingoutbreak data is a promising approach, there are gaps in the datasets availableat EU level.


� Case-control studies of sporadic infections are a valuable tool to identify relevant risk factors to human food-borne infections, including sources of exposure andpredisposing, behavioural or seasonal factors.

� A primary limitation of the method is the accuracy of therecall about exposures from interviewed participants, which can lead to either an over- or underestimation ofthe contribution of specific sources. In addition, statistical power to determine the importance of commonexposures will require enrolment of many participants.


� Given the current data limitations, it isconcluded that comparative exposureor risk assessment between majorcategories (food, direct animal contact, environments, person-to-person) needsfurther development and more data tobe ready for decision support purposes.


� Expert Opinions have always been used forsource attribution, and recently more explicit, quantitative methods have been introduced. Experts are able to combine and weigh data from the different approaches as discussedabove for which currently no analyticalmethods exist.

� Protocols to reduce bias in expert estimateshave been developed in other areas of riskassessment but have not yet been fullyapplied for source attribution.


� As described in this report, a variety of approaches havebeen used to better define the source of foods responsiblefor human infections. However, none of these approaches islikely to be sufficient on its own. Comparing and compilingresults from more than one method may improverobustness.

� For source attribution, there is a need for harmonizationand structured categorization of food items, taking intoaccount the legal definition of water as food. Ideally, harmonization and categorisation should be based on boththe food commodity and the processing/preservationmethods in order to gather data by variouscountries/organisations/research teams that are comparable and to enable exchange of data.


� The implicit conclusion, therefore, isthat the scientific and accurateattribution of food-borne illnesses tospecific foods means developing a comprehensive program that combines many of the discussed methods anddata. Such a system can be achievedwith increased resources andcooperation among food safetyinstitutions.


� Data gathering for purposes of attributionshould be question driven and by representative sampling. Baseline tudies, as carried out under the Zoonosesregulations, are an importantmove in theright direction. Similarly, a commonapproach to epidemiological studies isrecommended.

El documento de EFSARecomendaciones

Methodology and data requirements for use of subtyping data for sourceattribution

� It is recommended to perform intensive monitoring of all majorreservoirs (i.e. food animals) and/or food including imported foodand humans providing;

� A collection of representative isolates from the majorreservoirs/sources and humans. It is better to choose representativedata instead of amount of data.

� Avoid clustered data, i.e. precise and meaningful definition ofepidemiological unit e.g.flock and NOT isolate.

� Avoid using animal isolates from diagnostic submissions (notrepresentative).If available include information on the number oftravel-related cases and the number of outbreakrelated cases; particularly important for large outbreaks.



� Application of discriminatory and definitive epidemiological markermethods providing

� knowledge of the distribution of the different subtypes in the majorreservoirs/sources is recommended. For Salmonella this includes:� Serotyping for all Salmonella isolates� Phage typing of S. Enteritidis and S. Typhimurium isolates and/or

application of othermethods that can distinguish between strains withinthese serovars.

� It is recommended to apply and evaluate new subtyping methodsfor Salmonella attribution e.g. multiple locus variable numbertandem repeats analysis (MLVA). MLVA is increasingly used forsurveillance of human S. Typhimurium infections and tracing ofoutbreaks, but its usefulness for source attribution needs to be explored.

� It is recommended to apply and evaluate other typing techniquesfor source attribution of other pathogens e.g. use of. multi-locus sequence typing (MLST) for Campylobacter spp. and VTEC based


Methodology and data requirements for use of

outbreak data for source attribution;

� It is recommended to develop a minimum

dataset including standardized food categories

and reporting of contributing factors linked to

outbreaks, to be collected in each MS.

Disaggregated data should be reported to

EFSA.


Methodology and data requirements for use of

epidemiological studies for source attribution of

sporadic cases;

� It is recommended to conduct multinational (multi-

Member State) studies of sporadic foodborne diseases,

where cases and controls in several MSs are

interviewed during the same time period and applying

the same questionnaire.


Methodology and data requirements for comparative exposure or riskassessments;

� Comparative exposure assessment should be developed as the mostappropriate tool to identify food categories within the same reservoir (i.e. pig, cattle, poultry) that pose a greater risk to individual consumers or thepopulation as a whole.

� Risk assessors and risk managers should agree on specific scenarios withrespect to storage, handling, preparation and consumption that reflect thediversity of consumer habits in the EU.

� Data on the prevalence and number of the investigated organisms in retailproducts together with data on frequency of consumption and portion sizemust be available for those products to be compared. In addition, dependingon products, data on the effect of undercooking and cross contamination, and fraction consumed raw and prepared may also be necessary.


Methodology and data requirements for source

attribution by structured expert opinions

� A structured expert survey could provide the EC

with a set of estimates for attribution of several

pathogens to food. Such a study would need to

take into account different exposures and

consumer habits within different regions of EU.

Aproximaciones que se vienen aplicando para la atribución a alimentos en distintos paises

� Experiencia Danesa.

Dinamarca tiene un sistema integrado en el cual los datos procedentes de vigilancia de salud pública y monitorizado de patógenos en alimentos y animales se recolectan de forma rutinaria, se organizan y analizan por una oficina de coordinación.

Los cultivos procedentes de personas infectadas, animales y alimentos en el punto de venta se subtipan, permitiendo una comparación directa de datos de vigilancia y monitoreo y la identificación de posibles problemas de seguridad alimentaria que tengan a los alimentos como fuente de los mismos


� Experiencia Inglesa

El reino Unido un sistema integrado para la seguridad alimentaria que incluye tanto métodos epidemiológicos como microbiológicos. La responsabilidad recae sobre una sola oficina del gobierno.


� Datos de brotes en USA

Los informes de investigaciones de brotes componen la mas extensa base de datos en USA para determinar la responsabilidad de un alimento en la enfermedad. El sistema de vigilancia de brotes contiene mas de 20000 brotes informados al CDC desde 1973, estos informes conectan alimentos específicos con casos de enfermedades humanas.


� FoodNet Sporadic Case Control Studies

FoodNet es un programa de vigilancia muy activo centrado en el seguimiento que el CDC hace sobre enfermedades de origen alimentario de 9 patógenos en 10 poblaciones diana muy bien definidas. En los estudios de casos y controles de FoodNet los pacientes que informan a través de FoodNet son contactados para una serie de entrevistas y completar cuestionarios para estimar la proporción de enfermedades asociadas con alimentos específicos, preparación de alimentos, prácticas de manipulación y comportamientos como tenencia de mascotas, visita a granjas o viajes internacionales.

Aproximaciones de futuro para apoyar las decisiones en seguridad alimentaria

� Las decisiones en el campo de la seguridad alimentaria no se basan solo en la efectividad de las diferentes intervenciones que se hagan en riesgos de seguridad alimentaria, sino teniendo también en cuenta las consecuencias económicas.

� La integración de la economía en la toma de decisiones, es un reto pero merece la pena. Puede dar una visión sobre el costo-eficacia de las medidas de intervención

Aproximaciones de futuro para apoyar las decisiones en seguridad

alimentaria

� En resumen un análisis integrado combinado epidemiología, Evaluación de Riesgos y evaluación económica puede ser un soporte poderoso para los que deben tomar decisiones (políticos y otros interesados) para tomar una decisión en gestión de riesgos

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