Transcript
![Page 1: Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 - unizar.eswebdiis.unizar.es/asignaturas/Bio/wp-content/uploads/2015/05/2002… · Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 Bioinformática, 18-2-20 Elvira](https://reader036.vdocumento.com/reader036/viewer/2022062311/5fe0ed0b6bf3ff451c46c514/html5/thumbnails/1.jpg)
Alineamiento: el caso SARS-CoV-2
Bioinformática, 18-2-20Elvira Mayordomo
![Page 2: Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 - unizar.eswebdiis.unizar.es/asignaturas/Bio/wp-content/uploads/2015/05/2002… · Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 Bioinformática, 18-2-20 Elvira](https://reader036.vdocumento.com/reader036/viewer/2022062311/5fe0ed0b6bf3ff451c46c514/html5/thumbnails/2.jpg)
El “coronavirus” de Wuhan Googleando averiguamos que se llama:
SARS-CoV-2
Vamos a buscar otros virus del mismo “subgenus”: hay 1491 en GenBank
Order Suborder Family Subfamily Genus Subgenus Species
Nidovirales Cornidovirineae CoronaviridaeOrthocoronavirinae Betacoronavirus Sarbecovirus
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
![Page 3: Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 - unizar.eswebdiis.unizar.es/asignaturas/Bio/wp-content/uploads/2015/05/2002… · Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 Bioinformática, 18-2-20 Elvira](https://reader036.vdocumento.com/reader036/viewer/2022062311/5fe0ed0b6bf3ff451c46c514/html5/thumbnails/3.jpg)
![Page 4: Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 - unizar.eswebdiis.unizar.es/asignaturas/Bio/wp-content/uploads/2015/05/2002… · Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 Bioinformática, 18-2-20 Elvira](https://reader036.vdocumento.com/reader036/viewer/2022062311/5fe0ed0b6bf3ff451c46c514/html5/thumbnails/4.jpg)
De cuándo son
Los 47 primeros (80 primeros de cualquier longitud) son de febrero de 2020
A partir del 48 (81) de noviembre del 2018 (están ordenados por cuándo fueron secuenciados)
![Page 5: Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 - unizar.eswebdiis.unizar.es/asignaturas/Bio/wp-content/uploads/2015/05/2002… · Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 Bioinformática, 18-2-20 Elvira](https://reader036.vdocumento.com/reader036/viewer/2022062311/5fe0ed0b6bf3ff451c46c514/html5/thumbnails/5.jpg)
Cojo las 10 primeras
A 80 letras por línea, unas 50 líneas por pantalla, son un poco más de 7 pantallas por secuencia
![Page 6: Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 - unizar.eswebdiis.unizar.es/asignaturas/Bio/wp-content/uploads/2015/05/2002… · Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 Bioinformática, 18-2-20 Elvira](https://reader036.vdocumento.com/reader036/viewer/2022062311/5fe0ed0b6bf3ff451c46c514/html5/thumbnails/6.jpg)
![Page 7: Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 - unizar.eswebdiis.unizar.es/asignaturas/Bio/wp-content/uploads/2015/05/2002… · Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 Bioinformática, 18-2-20 Elvira](https://reader036.vdocumento.com/reader036/viewer/2022062311/5fe0ed0b6bf3ff451c46c514/html5/thumbnails/7.jpg)
¿Cómo compararlas?
![Page 8: Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 - unizar.eswebdiis.unizar.es/asignaturas/Bio/wp-content/uploads/2015/05/2002… · Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 Bioinformática, 18-2-20 Elvira](https://reader036.vdocumento.com/reader036/viewer/2022062311/5fe0ed0b6bf3ff451c46c514/html5/thumbnails/8.jpg)
![Page 9: Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 - unizar.eswebdiis.unizar.es/asignaturas/Bio/wp-content/uploads/2015/05/2002… · Alineamiento: el caso SARS-CoV-2 Bioinformática, 18-2-20 Elvira](https://reader036.vdocumento.com/reader036/viewer/2022062311/5fe0ed0b6bf3ff451c46c514/html5/thumbnails/9.jpg)