clonación en fagos -...

30
Clonación en Fagos

Upload: others

Post on 23-Jan-2020

3 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Clonación en Fagos

Page 2: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Escrutinio de la biblioteca con sonda

Page 3: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Bibliotecas genómicas

DNA genomico

Digestion con enzima de restriccion

Page 4: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Bibliotecas de cDNA

Cebador de oligo dT Reverso transcripcion

Sintesis de DNA doble cadena

RNA mensajero

Page 5: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Bibliotecas genómicas vs. Bibliotecas de cDNA

Page 6: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Clonación en Cósmidos

Page 7: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Cromosomas artificiales

Se pueden clonar hasta 1,000,000 nucleótidos

Page 8: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes
Page 9: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes y sus productos

Insertar en vector de expresión

Transformar E. coli u otro hospedero

Deducir secuencia de aminoácidos

Preparar péptidos sintéticos

Preparar anticuerpos específicos para una proteína

Secuencia de aminoácidos

Anticuerpo específico

Sintetizar sonda específica

Escrutinio de una biblioteca de DNA por Southern blot

Escrutinio de una biblioteca de expresión por Western blot

Page 10: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Análisis global de los genomas

TRANSCRIPTOMA

PROTEOMA

INTERACTOMA

METABOLOMA

SNPs

RNAs pequeños

Polimorfismos de un solo nucleótido: Este tipo de análisis permite detectar mutaciones, variaciones genéticas entre individuos, y base hereditaria en un organismo

Análisis global de la expresión genética: Permite obtener información rápida, detallada y comparativa del estado en la expresión de genes en diferentes tipos celulares, tejidos u órganos, estados de desarrollo, condiciones o mutantes específicas

Análisis global de la función de proteínas: Información de redes metabólicas y de interacción sistemática entre proteínas en un organismo

Page 11: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Arreglos (Arrays, Chips) de DNA

Macroarreglos: el tamaño del spot es de ~ 300 micras

Colección ordenada de secuencias de ácido nucleico que proporciona un medio para aparearlas con una muestra problema facilitando la determinación de los niveles de dichas secuencias en la muestra y la identificacón de genes desconocidos.

Microarreglos: el tamaño del spot es de ~ 2-5 micras

Page 12: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Análisis de microarreglos con dos marcas

problema control

Page 13: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Transformacion en celulas eucariontes

Transformación directa

Biobalística

Microinyección

Virus

Page 14: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Métodos de transfección Permeabilización química de las membranas Electroporación Liposomas

Vectores

Vectores derivados de virus animales SV40 Retrovirus Vacuna Vectores mixtos

Métodos de selección

Detección de actividades enzimáticas Resistencia a inhibidores Resistencia a antibióticos

Integración dirigida

Clonación en células animales

Page 15: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Vectores de expresión para células animales

Promotor inducible para animales

Page 16: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes
Page 17: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes
Page 18: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes
Page 19: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Creando ratones Knockout

Page 20: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes
Page 21: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

El resto de características de los vectores de expresión son similares

Promotor del gen X Gen reportero

5’UTR X 3’UTR X

Construcción de Reporteros

Page 22: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Proteínas reporteras

Proteína verde fluorescente (GFP)

Beta-glucoronidasa (GUS)

Page 23: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Luciferasa de luciérnaga (LUC)

Page 24: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Las regiones reguladoras del promotor se pueden clonar individualmente ó en combinación

Page 25: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Transformación de células vegetales

Agrobacterium tumefaciens

Page 26: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes
Page 27: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Transformación mediada por Agrobacterium tumefaciens

Page 28: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

Transformación por biobalística

Page 29: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes
Page 30: Clonación en Fagos - depa.fquim.unam.mxdepa.fquim.unam.mx/amyd/archivero/24IngenGenet2_23748.pdf · La tecnología de DNA recombinante genera herramientas para estudiar los genes

¡ Muchas gracias por ser un grupo tan bueno y con ganas de saber !

El Fin ¿ O solo el principio ?