2009 年度・東京大学第４学期・理学部専門科目（木曜第 5限）三中信宏〈生物統計学〉：2010年 10月～ 2011 年 1月東京大学本郷キャンパス旧理学部 1号館 350番教室

生 物 統 計 学̶ データに基づく「よりよい推論」のために ̶

三中 信宏MINAKA Nobuhiro

独立行政法人 農業環境技術研究所 生態系計測研究領域 上席研究員

東京大学大学院 農学生命科学研究科 生物・環境工学専攻 教授［生態系計測学］

東京農業大学大学院 農学研究科 客員教授［応用昆虫学］

minaka@affrc.go.jp（メール）

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2009 年度・東京大学第４学期・理学部専門科目（木曜第 5限）三中信宏〈生物統計学〉：2010年 10月～ 2011 年 1月東京大学本郷キャンパス旧理学部 1号館 350番教室

講義予定と内容（2010 年 10月～ 2011 年 1月）10月 7日（木） ガイダンス／統計学的思考

10月 14日（木） 統計学概論／統計言語〈R〉紹介

10月 21日（木） データの視覚化とそのツール（散布図，箱ひげ図 etc. ）

10 月 28日（木） パラメトリック統計学と正規分布／分散概念の段階的導出

11月 4日（木） 実験計画法（1）：完全無作為化法と分散分析

11月 11日（木） 実験計画法（2）：一要因・二要因の乱塊法／多重比較

11月 18日（木） モデル選択論／最尤法

11月 25日（木） 線形モデル／正規性と等分散性／一般化線形モデル

12月 2日（木） 計算統計学（1）：リサンプリング統計手法

12月 9日（木） 計算統計学（2）：ベイズ統計学

12月 16日（木） 計算統計学（3）：ベイジアンMCMC

1月 6日（木） 多変量解析：共変動と高次元空間における散布パターン

1月 13日（木） 形態測定学：生物形態の幾何学的情報と形態変形解析

1月 20日（木） 生物系統学：系統樹を推定するための統計理論

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租界Ｒの門前にて（統計学サイト）

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leeswijzer van der dagboek（書評ブログ）

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成績評価の方法

　1) 毎回の講義の出席点

　2) 課題レポートの提出（二回）

　　　※ 試験は実施しません．

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統計学へのお誘い本リスト

三中信宏

大学での講義や統計研修の受講生から，「統計学の参考図書を紹介してほしい」との依頼があったので，下記のよ

うな「お誘い本リスト」をつくってみた．日本語の本のみのリストである．“門前”から“門”までの「参道」が

やや長い気がするが，そこは気の迷いや逡巡が憑いてまわる相手のために，ということでご容赦いただきたい．

また，いったん“入門”してしまった後は，統計手法ごとにそれぞれ特化したより適切な本（中級書以上）がき

っとあると思うが，下のリストはまったく網羅的ではない．個人的に，生物系・農学系の学生や研究員を相手に

講義をする機会が多いので，リストの最初の方はできるだけ“数式汚染”されていない統計本を中心に挙げてあ

る．なお，統計ソフトウェア〈Ｒ〉に関する参考書のより広範なリストは，日本語Ｒ掲示板である〈RjpWiki〉の

中にある「Ｒ本リスト」を参照すれば最新情報が得られるだろう．また，下記のリスト内のリンクは，私のサイ

ト（http://cse.niaes.affrc.go.jp/minaka/R/InvitationStatistics.html）を参照されたい（「※」印の本は，新刊での入手

は現在不可能と思われる）．

1. 門前で迷っている人のためのコミック系入門書

• アイリーン・マグネロ＆ボリン・ヴァン・ルーン［神永正博監訳／井口耕二訳］『マンガ 統計学入門：学

びたい人のための最短コース』（2010 年 4月 20日刊行，講談社［ブルーバックス B1681］，本体価格 800 円，

ISBN:978-4-06-257681-9 →版元ページ）　

• 高橋信『マンガでわかる統計学』（2004 年 7月刊行，オーム社，ISBN:4274065707 →版元ページ）

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2. 統計学の科学史と科学哲学

• デイヴィッド・サルツブルグ［竹内惠行・熊谷悦生訳］『統計学を拓いた異才たち：経験則から科学へ進

展した一世紀』（2010 年 4月 1日刊行，日本経済新聞出版社［日経ビジネス人文庫 1143］，東京，504 pp.，

税込価格 1,200 円，ISBN:978-4-532-19539-7 → 版元ページ｜書評）　

• C・R・ラオ［藤越康祝・柳井晴夫・田栗正章訳］『統計学とは何か：偶然を生かす』（2010 年 2月 10日刊行，

筑摩書房［ちくま学芸文庫］，東京，321 pp.，本体価格 1,300 円，ISBN:978-4-480-09271-7 → 版元ページ）

• サミール・オカーシャ著［廣瀬覚訳］『1冊でわかる 科学哲学』（2008 年 3月 25日刊行，岩波書店［〈1

冊でわかる〉シリーズ］，vi+194+v pp.，本体価格 1,500 円，ISBN:978-4-00-026896-7 → 版元ページ）　

3. 入門の覚悟を決めた人のための本

• 粕谷英一『生物学を学ぶ人のための統計のはなし：きみにも出せる有意差』（1998 年 3月刊行，文一総合

出版，ISBN:4829921234 →書評と目次）

• 佐藤俊哉『宇宙怪人しまりす医療統計を学ぶ』（2005 年 12 月刊行，岩波書店［岩波科学ライブラリー

114］，本体価格 1,200 円．ISBN:4000074547 →版元ページ）

• 竹村彰通『統計［第 2版］』（2007 年 9月刊行， 共立出版［共立講座・21世紀の数学：第 14巻］，

ISBN:978-4-320-01851-8 → 目次｜コンパニオン・サイト）

4. ひたすらヴィジュアル系な入門書

• 市原清志『バイオサイエンスの統計学：正しく活用するための実践理論』（1990 年 2月刊行，南江堂，

ISBN:4524220364）

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• 市原清志・岩本美江子『カラーイメージで学ぶ統計学の基礎』（2006 年 10 月刊行，日本教育研究センター，

ISBN:4890261230）

5. Ｒを片手に統計修行

• 青木繁伸『Rによる統計解析』（2009 年 4月 15日刊行，オーム社，x + 322 pp., 本体価格 3,800 円，

ISBN:978-4-274-06757-0 → 版元ページ）　

• 舟尾暢男『R Commander ハンドブック』（2008 年 12 月 15日刊行，オーム社， x + 265 pp.，本体価格

3,200 円，ISBN:978-4-274-06745-7［CD-ROM付き］→ 版元ページ）　

• 山田剛史・杉澤武俊・村井潤一郎『Rによるやさしい統計学』（2008 年 1月刊行，オーム社，xvi+404

pp.，本体価格 2,835 円，ISBN:978-4-274-06710-5 → 目次｜版元ページ）

• Peter Dalgaard［岡田昌史監訳］『Rによる医療統計学』（2007 年 1月 31日刊行， 丸善出版事業部，

ISBN:4-621-07811-2 → 版元ページ｜サポートページ）　

6. すでに入門してしまった人のための次なる本（線形モデルまわり）

• Michael J. Crawley 著［野間口謙太郎・菊池泰樹訳］『統計学：Rを用いた入門書』（2008 年 5月刊行，共

立出版，xiv+344 pp.，本体価格 4,300 円，ISBN:978-4-320-01857-0 → 目次｜版元ページ）

• lan Grafen，Rosie Hails 著［野間口謙太郎・野間口眞太郎訳］『一般線形モデルによる生物科学の

ための現代統計学－あなたの実験をどのように解析するか－』（2007 年 1月 30日刊行，共立出版，

ISBN-13:978-4-320-05639-8 →情報｜版元ページ）

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7. ややイノチ懸け系な数理統計学書

• 竹村彰通『現代数理統計学』（1991 年 12 月刊行，創文社，ISBN:4423895080 →目次）

• 竹村彰通『多変量推測統計の基礎』（1991 年 9月刊行，共立出版，ISBN:4320014480 →目次）

• C・R・ラオ『統計的推測とその応用』（1977 年 11 月刊行，東京図書，ISBN:4489001746）※

8. たまにはベイズもいかが？

• 伊庭幸人『ベイズ統計と統計物理』（2003 年 8月 27日刊行，岩波書店［岩波講座〈物理の世界〉：物理

と情報３］，ISBN:4000111582 → 版元ページ）　

9. 実例ごりごり系な大御所エンサイクロペディア

• R・R・ソーカル＆ F・J・ロルフ『生物統計学』（1983 年 10 月刊行，共立出版，ISBN:4320052684）

• G・W・スネデッカー＆W・G・コクラン『統計的方法（原書第 6版）』（1972 年刊行，岩波書店）※

• 竹内啓他（編）『統計学辞典』（1989 年 12 月刊行，東洋経済新報社，ISBN:4492010386）※

10. なお余力がある人は統計科学の最前線へどうぞ！

• 甘利俊一・竹内 啓・竹村彰通・伊庭幸人（編）〈シリーズ・統計科学のフロンティア［全 12巻］〉（2002

年～ 2005 年［完結］，岩波書店 → 版元ページ）　

• 甘利俊一，麻生英樹，伊庭幸人（編）〈シリーズ・確率と情報の科学［第Ｉ期・全 15巻］〉（2008 年～［刊

行中］，岩波書店 → 版元ページ）