Guanajuato se encuentra dentro de 2 regiones hidrológicas.

La región Número 26 del panuco ocupa parcialmente una pequeña parte del norte del estado de Guanajuato

La región Numero 12 Lerma – Santiago ocupa la mayor parte del estado de Guanajuato, junto con Michoacán, Jalisco, Querétaro, estado de México y zacatecas.

Dentro de las regiones hidrológicas están las cuencas hidrográficas

El estado se encuentra ocupado por 8 cuencas la mayoría de ellas corresponden a la región hidrológica numero 12 Lerma – Santiago.

Cuenca de cuitzeo, Pátzcuaro, laguna de yurira

Cuenca del rio Lerma- Toluca

Cuenca del Lerma- Chapala

Cuenca Lerma- salamanca

Cuenca del rio laja

Cuenca de Moctezuma

Cuenca del rio verde grande

Dentro de la región hidrológica numero 26 ocupada por una pequeña parte del norte del estado

Cuenca del rio tamuin

SUBCUENCAS

Dentro de las cuencas están las subcuencas

Cuenca del rio laja

Subcuenca RIO LAJA – PEÑUELITAS

Subcuenca PRESA ALLENDE

Subcuenca RIO LAJA – CELAYA

Subcuenca RIO APASEO

Cuenca de Moctezuma

Subcuenca RIO EXTORAZ

Cuenca del rio tamuin

Subcuenca RIO SANTA MARÍA

Subcuenca RIO SANTA MARÍA BAJO

Cuenca Lerma - salamanca

Subcuenca RIO TURBIO-PRESA PALOTE

Subcuenca RIO TURBIO – MANUEL DOBLADO

Subcuenca RIO TURBIO- CORRALEJO

Subcuenca RIO GUANAJUATO

Subcuenca RIO TEMASCATIO

Subcuenca RIO SALAMANCA – RIO ANGULO

Subcuenca SOLIS- SALAMANCA

Cuenca del Lerma – Toluca

Subcuenca RIO TIGRE

Subcuenca PRESA SOLIS

Cuenca del Lerma Chapala

Subcuenca RIO ANGULO-RIO BRIZEÑAS

Cuenca de Pátzcuaro – cuitzeo – laguna de Yuriria

Subcuenca LAGO DE YURIRIA

Cuenca del rio verde grande

Subcuenca CERRADA DE OCAMPO

Subcuenca RIO DE LOS LAGOS