procesos demográficos, diversidad y estructura …...procesos demográficos, diversidad y...
TRANSCRIPT
![Page 1: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/1.jpg)
Procesos demográficos, diversidad y
estructura genética en Taxus baccata
Santiago C. González Martínez y cols.
(CIFOR: C. Burgarella, M. Zabal, Carmen García; CREAF: E. Berganzo, M.
Riba, M. Mayol; CNR: G.G. Vendramin; INRA: Miguel Navascués; MIMARM:
Salustiano Iglesias)
Web: http://sites.google.com/site/santiagocgonzalezmartinez/
Skype: santiago.c.gonzalez.martinez
![Page 2: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/2.jpg)
Distribución amplia pero rango fragmentado
Tamaño efectivo poblacional pequeño
Especie protegida en muchas regiones y países de
Europa (Directiva de Hábitats 92/43 CEE)
![Page 3: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/3.jpg)
Estructura genética a
escala amplia (nuSSRs)
At least three gene pools!
![Page 4: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/4.jpg)
Estructura genética
relacionada con el tipo de
hábitat y continuidad de la
distribución (González-Martínez et al. 2010 MPE)
Norte de España
Sistema Central
![Page 5: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/5.jpg)
0.00
0.50
1.00
1.50
2.00
2.50
0.0 1.0 2.0 3.0 4.0 5.0 6.0 7.0
Minimum Temperature during Spring (ºC)
Sh
oo
t vo
lum
gro
wth
2008_09
(Ln
tra
nfo
rmed
)
Banco clonal de Valsaín:
análisis comparativo de
crecimientos (‘common
garden’)
Los machos crecen más →
especialización sexual?
Clinas ambientales con
temperaturas mínimas →
adaptación local?
![Page 6: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/6.jpg)
Fuerte estructura genética a escala
fina (e.g. Montseny)…
Dubreuil et al. (2009)
Am. J. Bot.
Autocorrelogramas
![Page 7: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/7.jpg)
Fuerte estructura genética a escala
fina (e.g. Montseny)…
Dubreuil et al. (2009)
Am. J. Bot.
…y clara señal de declive
demográfico.
Burgarella et al.
(enviado a MBE)
“Skyline plots”
Autocorrelogramas
![Page 8: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/8.jpg)
TXS, taxadiene synthase (3780 pb)
DBAT, 10-deacetyl baccatin III-10-o-acetyl transferase (1392 pb)
TAT, taxadienol acetyl transferase (1480 pb)
*
*
*
*
*
T5aH, taxadiene 5-alpha hydroxylase (1600 pb)
TBT, 2-alpha-hydroxytaxane 2-O-benzoyltransferase (1900 pb)
Genes de la ruta metabólica
de producción de taxol
![Page 9: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/9.jpg)
Cabañeros (Centre)
Sierra Nevada (South)
Picos de Europa (North)Ordesa (N-East)
Agres
(N-E Mediterranean)
seeds from 18
seeds from 10
seeds from 10seeds from 18
seeds from 8
Variación natural (proyecto Parques Nacionales)
![Page 10: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/10.jpg)
Conclusiones & Perspectivas
o Los modelos demográficos (cuellos de botella intensos y muy
recientes) explican la mayor parte de la variación encontrada.
o Sin embargo, hay evidencias de selección negativa en las partes
funcionales de TXS.
o Además, otros dos genes () parecen estar bajo selección natural
en las poblaciones de Pineta (P. N. Ordesa y Monte Perdido) y
Agres (Valencia).
![Page 11: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/11.jpg)
Conclusiones & Perspectivas
o Los modelos demográficos (cuellos de botella intensos y muy
recientes) explican la mayor parte de la variación encontrada.
o Sin embargo, hay evidencias de selección negativa en las partes
funcionales de TXS.
o Además, otros dos genes () parecen estar bajo selección natural
en las poblaciones de Pineta (P. N. Ordesa y Monte Perdido) y
Agres (Valencia).
1. Uso de ultrasecuenciación (Illumina HiSeq2000) para la generación de
un transcriptoma de referencia en la especie → ~36.000 unigenes
2. Secuenciación de aproximadamente 1000 genes en poblaciones
contrastadas → ADAPCON (CIFOR-CREAF, IP: Delphine Grivet)
![Page 12: Procesos demográficos, diversidad y estructura …...Procesos demográficos, diversidad y estructura genética en Taxus baccataSantiago C. González Martínez y cols. (CIFOR: C. Burgarella,](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022062606/5fde35a4fedc5a4f4263d8cf/html5/thumbnails/12.jpg)
Gracias a tod@s
… Y especialmente a los organizadores del Maratón
P. N. Sierra Nevada