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MINISTERIO DE DEFENSA NACIONAL DIRECCIÓN GENERAL MARÍTIMA

CENTRO DE INVESTIGACIONES OCEANOGRÁFICAS E HIDROGRÁFICAS DEL PACÍFICO

SISTEMA DE ADMINISTRACIÓN DE DATOS OCEANOGRÁFICOS Y DE METEOROLOGÍA MARINA –

SEGUNDO PROTOTIPO

- MANUAL DE USUARIO –

Área Técnica – Oficina Tecnologías de la Información y Comunicaciones

San Andrés de Tumaco (Colombia), 2012

Sistema de Administración de Datos Oceanográficos y de Meteorología Marina – Manual de Usuario -

CONTROL DE REVISIONES

Versión Fecha de la

Versión Observaciones

Revisión No.

Fecha de Aprobación

0.0 2008-12-15 Creación del documento.

0.1 2012-08-30 Actualización del contenido. 1

0.1 2012-10-11 Ajustes al procedimiento de normalización de datos.

Elaboró Revisó Aprobó Ing.Helbert Rico e Ing. Ruby Ortiz

Contratistas

PD Nelson Carvajal Jefe TIC CCCP


CONTENIDO

Pág.

1. PREFACIO ............................................................................................................................... 1

1.1 ACERCA DEL PROYECTO................................................................................................ 1 1.2 LICENCIA ............................................................................................................................ 1 1.2.1 Software ......................................................................................................................... 1 1.2.2 Documentación .............................................................................................................. 1

2. GUÍA DE INICIO ................................................................................................................... 2

2.1 FUNCIONALIDAD ............................................................................................................ 2 2.2 NAVEGADORES COMPATIBLES ................................................................................... 2

3. SOMETER DATOS ................................................................................................................ 3

3.1. CONSIDERACIONES INICIALES ............................................................................... 3 3.1.1. Condiciones para someter datos ..................................................................................... 3 3.1.2. Preparación de la matriz de datos .................................................................................. 3

3.1.2.1. Formato del encabezado ................................................................................... 5 3.1.2.2. Formato de los datos temporales y geográficos ............................................ 6 3.1.2.3. Codificación de datos ........................................................................................ 6 3.1.2.4. Tratamiento de datos nulos y datos ausentes ................................................ 8 3.1.2.5. Codificación de parámetros .............................................................................. 9 3.1.2.6. Formato de archivo .......................................................................................... 10

3.2. PROCESO PARA SOMETER DATOS ........................................................................ 11 3.2.1. Autenticación de usuario ............................................................................................. 11 3.2.2. Asistente para someter datos ....................................................................................... 11

3.2.2.1. Paso 1: Asociar metadato ................................................................................ 12 3.2.2.2. Paso 2: Validar formatos ................................................................................. 13 3.2.2.3. Paso 3: Validar contenido ............................................................................... 14 3.2.2.4. Paso 4: Validar escalas y códigos ................................................................... 16 3.2.2.5. Paso 5: Desplegar parámetros ........................................................................ 17 3.2.2.6. Paso 6: Desplegar la distribución geográfica ............................................... 18

4. BUSCAR Y SOLICITAR DATOS ...................................................................................... 20

4.1. BÚSQUEDA DE DATOS .............................................................................................. 20 4.2. SOLICITUD DE DATOS ............................................................................................... 22

5. GLOSARIO ............................................................................................................................ 25

6. BIBLIOGRAFÍA .................................................................................................................... 26


LISTA DE FIGURAS

Pág.

Figura 1. Conversión de datos meteorológicos a las claves de la WMO. ................................. 7 Figura 2. Codificación de buques de tráfico internacional. ........................................................ 8 Figura 3. Especificación para el manejo de campos vacíos. ....................................................... 8 Figura 4. Matriz de datos normalizada. ...................................................................................... 10 Figura 5. Formato en el que se almacena la matriz de datos normalizada. ........................... 10 Figura 6. Interfaz para agregar ingresar al menú de administración. .................................... 11 Figura 7. Interfaz de usuario para someter datos en Cecoldo: Paso 1. ................................... 13 Figura 8. Interfaz de usuario para someter datos en Cecoldo: Paso 2. ................................... 14 Figura 9. Interfaz de usuario para someter datos en Cecoldo: Paso 3. ................................... 16 Figura 10. Interfaz de usuario para someter datos en Cecoldo: Paso 4. ................................. 17 Figura 11. Interfaz de usuario para someter datos en Cecoldo: Paso 5. ................................. 18 Figura 12. Interfaz de usuario para someter datos en Cecoldo: Paso 6. ................................. 19 Figura 13. Interfaz para la búsqueda de datos. .......................................................................... 21 Figura 14. Resultados de una búsqueda de datos. ..................................................................... 22 Figura 15. Botón para solicitar datos a Cecoldo. ........................................................................ 22 Figura 16. Formulario de solicitud de datos a Cecoldo. ........................................................... 24


1

1. PREFACIO

1.1 ACERCA DEL PROYECTO

El Centro Colombiano de Datos e Información Oceanográfica (Cecoldo) está a cargo de la Dirección General Marítima (Dimar) quien realiza las gestiones necesarias para integrar los datos e información suministrados por los proveedores (inicialmente sus Centros de investigaciones) en un sistema documentado y estandarizado que garantice su aprovechamiento, custodia y conservación al largo plazo.

Cualquier institución, empresa, entidad educativa o persona a nivel nacional puede aportar voluntariamente datos, información y productos a Cecoldo. La condición se vuelve obligatoria para aquellos que desarrollan proyectos de investigación, actividades, salidas a campo, cruceros oceanográficos y demás labores técnicas o científicas con la Autoridad Marítima Nacional o sus Centros de investigaciones, cuyos resultados y fuentes deben ser compartidos en Cecoldo.

En este marco, se desarrolló el Sistema de Administración de Datos Oceanográficos Oceanográfico y de Meteorología, cuyo primer prototipo fue implementado en el 2008 para apoyar las necesidades de normalización de datos oceanográficos de la entonces Central de Información Marina Colombiana (CENIMARC), aplicando estándares internacionales.

Desde entonces, se venían reuniendo los requisitos para mejorar esta primera aproximación al sistema, concluyendo en la definición de un segundo prototipo que incluye además la validación de formatos y la aplicación de buenas prácticas internacionales en manejo de bases de datos de este tipo.

1.2 LICENCIA

1.2.1 Software

El software “Sistema de Administración de Datos Oceanográficos y de Meteorología Marina” de Cecoldoes propiedad de la Dirección General Marítima (Dimar).

1.2.2 Documentación

La documentación del “Sistema de Administración de Datos Oceanográficos y de Meteorología Marina” de Cecoldoes propiedad de la Dimar.

Para compartir (copiar, distribuir y comunicar públicamente) y para adaptar esta documentación tendrá que contar con la autorización expresa de la Dimar.


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2. GUÍA DE INICIO

2.1 FUNCIONALIDAD

El Sistema de Administración de Datos Oceanográficos y de Meteorología Marina le permitirá contar con:

� Un conjunto de formularios para someter datos en forma de asistente, compuesto de 6 pasos que guían al usuario en la carga de datos y validan paso a paso los conjuntos de datos según los criterios establecidos para manejar bases de datos oceanográficas de calidad.

� Un formulario de búsqueda de datos, basado en criterios generalmente utilizados por los investigadores como son la extensión temporal, extensión geográfica, extensión vertical, parámetros medidos, instrumentos utilizados, e instituciones que han proporcionado datos.

� Unformulario para solicitar datos a los encargados de Cecoldo.

2.2 NAVEGADORES COMPATIBLES

Para la presente versión del aplicativo se probó la funcionalidad en los siguientes navegadores: Firefox 14, Google Chrome21 e Internet Explorer 9.


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3. SOMETER DATOS

3.1. CONSIDERACIONES INICIALES

3.1.1. Condiciones para someter datos

Para someter datos deberá cumplir con las siguientes condiciones:

1) Disponer de una cuenta de usuario Editor. Ya que los usuarios que se utilizan en el sistema corresponden a los gestionados mediante Geonetwork, deberá ponerse en contacto con el Administrador del Catálogo de Metadatos Marinos “Geonetwork” al correo [email protected] para solicitar la creación de la cuenta.

2) Haber creado el metadato asociado al conjunto de datos que va a someter. Esto se realiza en el catálogo Geonetwork.

3) Haber normalizado el conjunto de datos que va a someter. Este procedimiento se describe en el ítem 3.1.2 del presente manual.

3.1.2. Preparación de la matriz de datos

Antes de iniciar la normalización de su conjunto de datos tenga a la mano información relacionada con estos datos como:

� Información de la planificación de la salida de campo o información del proyecto. � Instrumentación y metodología utilizada. � Procedimientos de control de calidad aplicados. � Informes de salidas de campo, informe de proyecto, productos relacionados, etc.

Adicionalmente, se recomienda crear un documento en el que registre las notas sobre los cambios que vaya realizando sobre los datos brutos. Lo llamaremos “Notas del procedimiento de normalización”. El archivo de datos tiene una estructura matricial con las siguientes secciones:

a) La primera fila corresponde al encabezado o títulos de los parámetros.

b) Las primeras cuatro columnas corresponden a las variables temporales y geográficas. Estas son obligatorias en el siguiente orden: fecha, hora, latitud y longitud.


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c) Las siguientes columnas corresponden a los parámetros de administración (Ej. Profundidad, presión, identificación del buque, velocidad de desplazamiento del buque, etc.).

d) Las siguientes columnas corresponden a los parámetros oceanográficos y/o de

meteorología marina. IMPORTANTE: Si las mediciones incluyen banderas de calidad, estas deben ubicarse justo después de la columna que contiene los valores del parámetro oceanográfico. Otras consideraciones:

� Solo registre la columna de banderas de calidad si desarrolló un procedimiento sustentado de control de calidad que condujo a la asignación de banderas.

� Para los datos temporales y geográficos no se requerirá expresar una bandera de

calidad ya que como política del Centro de datos, sin embargo, cualquier prueba de calidad efectuada sobre estos debe documentarse en los metadatos.

� Procure que la cantidad de decimales utilizados sea la más apropiada teniendo en

cuenta el grado de precisión deseada para el parámetro.

� Se deben agotar todas las fuentes de información para evitar campos vacíos en la matriz de datos, inclusive si se trata de datos históricos.

Documente previamente en las “Notas del procedimiento de normalización” (ANEXO A):

� ¿Qué motivó la obtención de datos… fue un proyecto? un convenio? es función de la institución?

� ¿Quiénes estaban a cargo de la recopilación de datos? Ej. Dimar-CCCP y Univalle.

� ¿Qué área geográfica se cubrió? Ej. Bahía de Tumaco, Colombia.

� ¿En qué año se recopilaron los datos? Ej. 2004

� Lista de plataformas utilizadas para recopilar los datos. Ej. Buque oceanográfico, lancha, etc.

� Lista de instrumentos utilizados con los respectivos parámetros obtenidos de estos. Ej. CTD: Temperatura de la columna de agua, salinidad y presión.

� Breve resumen de la metodología aplicada para obtener los datos.


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� Si no se está trabajando sobre datos brutos, documente a qué pruebas o procedimiento fueron sometidos previamente. Ej. Conversión del formato de origen, aplicación de una rutina en Matlab, etc.

A continuación se describen las recomendaciones y mejores prácticas a tener en cuenta para normalizar la matriz de datos. 3.1.2.1. Formato del encabezado

� Para nombrar los parámetros en la primera fila de la matrizde datos, se deben incluir

títulos comunes, claros y cortos, como por ejemplo, Salinidad, pH, etc. Puede utilizar palabras abreviadas siempre y cuando éstas sean reconocidas en el medio, por ejemplo: TSM para Temperatura Superficial del Mar.

� Al título de todos los parámetros debe seguirle entre corchetes la abreviatura de su unidad de medida. Ej. Salinidad [ppt]. Puede guiarse con la lista de unidades del BODC1.

� Las unidades por defecto para las primeras cuatro columnas de la matriz son: o Fecha [aaaa-mm-dd UT-5] o Hora [hh:mm:ss UT-5] o Latitud [deg] o Longitud [deg]

� Para los parámetros que no tengan unidades de medida debe expresarse entre corchetes así: pH [Dmnless].

� En los títulos de variables de oceanografía biológica se deben expresar losnombres exactos de los organismos o plantas hasta el nivel de identificación alcanzado, seguido de la unidad de medida. Ejemplo: Bacillariophyta [#/ml]

� En los títulos de variables de observaciones de meteorología marina a las cuales se les

deba realizar alguna conversión a una clave de referencia2, se deberá reportar entre corchetes el número de referencia o nombre de la tabla de conversión utilizada. Ejemplo: Intensidad_viento [Beaufort],Genero_nubes [WMO0500].Algunas claves de referencia utilizadas en Cecoldose pueden revisar en el ANEXO B.

1BODC Vocab Library. (P061) BODC data storageunits. [en línea] [09 de octubre de 2012]. http://seadatanet.maris2.nl/v_bodc_vocab/search.asp?name=%28P061%29%20BODC+data+storage+units&l=P061 2WMO. Manual de claves: Claves internacionales. Volumen I.1. Parte A – Claves alfanuméricas. Edición de 2011 [en línea] [09 de octubre de 2012]. ftp://ftp.wmo.int/Documents/MediaPublic/Publications/CodesManual_WMO_no_306/WMO306_Vol_I.1_2011_es.pdf


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� En los títulos del parámetro que corresponda a la identificación de un buque de tráfico

internacional, se deberá reportar entre corchetes el número OMI, así: Id_buque [OMI].

� En los títulos de las columnas que contengan banderas de calidad, se deberá incluir la palabra QF (en inglés, QualityFlag) y entre corchetes el nombre del modelo aplicado. Ejemplo: QF [ODV]. Para conocer el modelo de banderas de calidad del BODC utilizado en Cecoldo revise elANEXO C.

3.1.2.2. Formato de los datos temporales y geográficos

� Ajuste el formato del contenido de las dos primeras columnas de la matriz conforme a las recomendaciones del estándar internacional ISO 8601:

o Para fecha aaaa-mm-dd. Ej. 2008-01-16. o Para hora hh:mm:ss. Ej. 14:08:00.

� Ajusteel formatodel contenido de las variables geográficas, es decir latitud y

longitud,conforme a las recomendaciones del estándar internacional ISO 6709: o Fracciones decimales de grados, representados por un número real con signo y

el número de dígitos significativos hasta la precisión deseada (se recomienda cinco decimales).

o Las medidas de latitud varían desde -90 a 90, en tanto que las medidas de longitud varían entre -180 y 180.

IMPORTANTE: Una vez realizado cambios en los datos temporales y geográficos, cerciórese de la calidad de estos, ya sea mediante la ayuda de gráficas y desplegando la información sobre un mapa. Recuerde registrar los cambios realizados en el documento “Notas de normalización”. 3.1.2.3. Codificación de datos � Realice las conversiones de datos necesarias para observaciones de meteorología

marina, solo debe registrar valores numéricos en la matriz de datos (Figura 1). Guíese por el Manual de claves de la Organización Meteorológica Mundial3 (en inglés, WMO). Las claves más frecuentemente usadas en Cecoldo se aprecian en la Tabla I.

3Ídem.


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Tabla I. Parámetros meteorológicos y su referencia WMO.

Parámetro Variable/Unidades Ref. WMO Pág. Manual

Género de nubes Género de nubes 0500 A–290

Cubierta total de nubes Octas 2700 A–351

Dirección de la ola Grados 0877 A–304

Periodo de la ola Segundos 3155 A–357

Estado del mar Términos descriptivos y altura de la ola [m]

3700 A–366

Visibilidad Distancia [Km] 4300 A–395

Tiempo presente Términos descriptivos 4677 A–402

Figura 1. Conversión de datos meteorológicos a las claves de la WMO. � Para conjuntos de datos donde se requiera registrar la identificación del buque en el

que se realizaron las mediciones, deberá utilizar el Número OMI de siete dígitos sin la palabra “OMI”4 (Figura 2).

IMPORTANTE: Si no encuentra el número OMI deberá llenar el campo correspondiente con el valor -99999, el cual le indicará al sistema que el campo está vacío. Cabe anotar que se deben agotar todas las fuentes de información para evitar campos vacíos, inclusive si se trata de datos históricos. En cualquier caso registrelos cambios realizados en el documento “Notas del procedimiento de normalización”.

4IMO. Ship IMO numbersdatabase [en línea]. [09 de octubre de 2012]. http://www.imonumber.com.


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Figura 2. Codificación de buques de tráfico internacional.

3.1.2.4. Tratamiento de datos nulos y datos ausentes

No deje campos vacíos en la matriz de datos. Ante la ausencia de datos llene los espacios con el valor -99999 (Figura 3).

Figura 3. Especificación para el manejo de campos vacíos. Si su conjunto de datos registra valores iguales a 0.00000 deberá decidir, en tal caso decida si es necesario que el valor “cero” se almacene en la base de datos. Analice si:

� Requiere que se muestren más decimales en los campos porque los valores registrados son muy pequeños.

� Si no se observó determinado organismo en la muestra, en tal caso podría llenar estos campos con el valor -99999.

� Si se cree que el instrumento no estaba correctamente calibrado o que los valores no están acordes con el comportamiento esperado para la variable, entonces se recomienda revisar minuciosamente la calidad de los datos y asignar banderas de calidad.

� Si la configuración del instrumento o la metodología aplicada no permitió detectar un valor > 0.00000 para el parámetro.

IMPORTANTE: recuerde realizar anotaciones sobre el tratamiento de datos ausentes y datos nulos en las “Notas del procedimiento de normalización”.


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3.1.2.5. Codificación de parámetros

Consiste en asignar un código alfanumérico a cada parámetro incluido en el conjunto de datos para proveerle una descripción básica acerca de este. Para el caso de Cecoldo se aplica la codificación propia del Diccionario de Parámetros del BODC5. Antes de iniciar la búsqueda:

� Inserte una fila inmediatamente después del encabezado (o títulos) de su matriz de datos, en donde incluirá el código BODC.

� La búsqueda de parámetros en el Diccionario del BODC debe realizarla utilizando palabras claves en el idioma inglés. Estas palabras pueden ser el nombre del parámetro, el instrumento de medición, la metodología, el nombre abreviado o sigla del parámetro, hasta el código propiamente dicho.

� Realice la búsqueda de los parámetros de fecha y hora únicamente para el huso horario UT. Aunque el huso horario para Colombia es UT-5, el BODC no creará nuevos códigos para los diferentes husos horarios, pero tampoco se le exigirá al Editor realizar las conversiones, por lo cual esta excepción queda consignada en el título del encabezado de la matriz de datos.

� Para datos de oceanografía biológica se recomienda contar con el TSN o Número de Serial Taxonómico6o el identificador WoRMS7 para facilitar la búsqueda de organismos o platas.

� Para observaciones de meteorología marina se recomienda contar con la referencia de la clave OMM aplicada.

Una vez localizados los códigos, estos se deben consignar en la segunda fila de la matriz en la posición correspondiente al parámetro a describir. En laFigura 4se observa un ejemplo.

5SeaDataNet. BODC Vocab Library. [en línea]. [11 de octubre de 2012]. http://seadatanet.maris2.nl/v_bodc_vocab/search.asp?name=%28P011%29%20BODC+Parameter+Usage+Vocabulary&l=P011 6IntegratedTaxonomicInformationSystem. [09 de octubre de 2012]. http://www.itis.gov. 7WorldRegister of Marine Species. [09 de octubre de 2012]. http://www.marinespecies.org


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Figura 4.Matriz de datos normalizada. 3.1.2.6. Formato de archivo

Una vez concluido el procedimiento de normalización, los conjuntos de datos deben ser guardados como un archivo de texto delimitado por comas para proceder a cargarlo en l aplicación. En Excel puede realizar este procedimiento seleccionando la opción “Guardar Como” del menú “Archivo” y seleccionando el tipo de archivo “Texto (delimitado por comas)”. El aplicativo le preguntará si está seguro de almacenar el archivo en ese formato ya que puede que no sea compatible con otros programas, a lo cual el usuario deberá responder que “Si”.

Figura 5.Formato en el que se almacena la matriz de datos normalizada.


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3.2. PROCESO PARA SOMETER DATOS 3.2.1. Autenticación de usuario

Para poder someter datos en Cecoldo deberá autenticarse en el sistema como Editor (un perfil gestionado mediante Geonetwork). Para asignar o cambiar la contraseña, así como los datos personales registrados para este usuario deberá hacerlo directamente en Geonetwork. Los pasos para autenticarse son:

� Vaya al enlace http://www.cccp.org.co:8080/cecoldo/faces/dataLogin.jsp.

� En la parte superior derecha de la página localice los campos de autenticación de

usuario. Ingrese su usuario y contraseña y haga clic en el botón “Ingresar” (Figura 6).

Figura 6. Interfaz para agregar ingresar al menú de administración.

� Concluidas las tareas de administración no olvide cerrar la sesión dando clic en el

botón “Salir” que puede ubicar en la parte superior derecha de la página. 3.2.2. Asistente para someter datos

Para iniciar la carga de datos, el usuario cuenta con un asistente compuesto de seis (6) pasos que lo guiarán por el proceso. En cada paso se realizan una serie de actividades tanto por parte del sistema, como por parte del usuario. Una vez concluida la carga de datos, el sistema generará el reporte de carga, le asignará el identificador único a su conjunto de datos (el mismo que se asignó para su metadato), comprimirá la matriz de datos para dejarla disponible en el repositorio, y agregará la respectiva ruta de descarga al metadato. IMPORTANTE: Los datos quedarán disponibles para ser descargados únicamente por el usuario que los sometió. Para otros usuarios, estos deberán solicitar la autorización de la descarga de datos al Administrador del Catálogo de Metadatos Oceanográficos “Geonetwork” (ver capítulo 4). A continuación se describen cada uno de los pasos por medio de los cuales se verifica la calidad de la estructura y contenido general de la matriz de datos.

Comentario [RVOM1]: Actualizar por la ruta en producción.


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3.2.2.1. Paso1: Asociar metadato Si ha llegado a esta instancia es porque inició sesión con un usuario y contraseña válidos para someter datos a Cecoldo. RECUERDE:Antes de iniciar este procedimiento, usted debe:

� Haber creado el metadato del conjunto de datos que va a someter, mediante el servicio de Catálogo de Metadatos Oceanográficos“Geonetwork”.

� Asegurarse que su metadato esté completo. Los valores que el sistema leerá de su metadato serán: país, extensión geográfica, extensión temporal y extensión vertical (esta última no es un dato obligatorio).

En este paso deberá desarrollar el siguiente procedimiento:

1. Verifique que el nombre del usuario e institución proveedora que aparezcan en pantalla sean correctos, de lo contrario notifíquelo al Administrador para que realice la actualización de datos del usuario.

2. Seleccione el metadato asociado a su conjunto de datos. Si no selecciona ningún metadato no podrá continuar la carga de los datos.

3. Verifique que la información que se despliega en pantalla corresponde a su conjunto de datos, ya que el sistema lo toma del metadato que usted ha seleccionado en el paso anterior.

4. Si la información es correcta oprima el botón "Paso 2", de lo contrario seleccione otro metadato de la lista para actualizar la información en pantalla.

5. En cualquier momento cierre la sesión de su usuario para cancelar el proceso de someter datos.


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Figura 7. Interfaz de usuario para someter datos en Cecoldo: Paso 1.

3.2.2.2. Paso 2: Validar formatos En este paso usted deberá cargar su conjunto de datos para que el sistema valide los formatos internacionales adoptados para la gestión de datos oceanográficos enCecoldo. RECUERDE: Antes de iniciar este procedimiento usted debe:

� Verificar que sus datos tengan "punto" y no la "coma" como separador de miles.

� Verificar los formatos de las variables de las cuatro primeras columnas de su matriz de datos; estas son: fecha (aaaa-mm-dd), hora (hh:mm:ss), latitud (grados decimales) y longitud (grados decimales). Adicionalmente, si el conjunto de datos registra datos relacionados con buques de tráfico internacional, entonces verifique que haya consignado correctamente el número OMI (OrganizaciónMarítima Internacional) el cual se compone de un valor numérico de 7 dígitos.

El procedimiento a desarrollar es el siguiente:

1. Haga clic en el botón "Agregar" para adicionar el conjunto de datos, cuyo archivo debe estar en formato .csv, .txt o .zip.

2. Una vez transferido el archivo, haga clic en el botón “Validar formatos”para ejecutar la verificación de los formatos de las variables temporales, geográficas, y número OMI en busca de inconsistencias frente a los formatos manejados por el Centro de Datos.


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NOTA:La validación de formatos puede tomar unos minutos dependiendo del tamaño de la matriz de datos cargada.

3. A continuación, el sistema le mostrará la lista de errores encontrados indicando la línea en la cual encontró la inconsistencia. Usted podrá corregirlos y cargar nuevamente el archivo haciendo clic en el botón "Borrar" y posteriormente "Agregar" para iniciar nuevamente la verificación de los formatos.

4. En caso de no hallarse errores de formato se le permitirá continuar con la carga de datos. Para ello oprima el botón "Paso 3".



3.2.2.3. Paso 3: Validar contenido En este paso el sistema validará el contenido general de la matriz de datos cargada en el paso anterior la cual ya ha superado la prueba de validación de formatos. RECUERDE: La revisión del contenido incluirá:


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� Detección de caracteres ASCII anómalos como tabuladores, símbolos de interrogación o admiración, saltos de línea, retrocesos, etc., que puedan ocasionar problemas al indexar los datos.

� Títulos de los parámetros incompletos. Estos deben tener el nombre de la variable y la unidad de medición o escala de observación entre corchetes, por ejemplo: Conductividad [us/cm],Mytilusspp. [Ind/m^3],Cubierta_nubes [WMO2700],Presion Atm [mBar].

� Parámetros a los que no se les haya incluido el código BODC en la segunda fila de la matriz.

� Campos vacíos.

� Reporte de valores nulos (campos que registran 0 o 0.00000).

� Reporte de valores ausentes (campos que registran -99999). El procedimiento a desarrollar es el siguiente:

1. Haga clic en el botón "Revisar contenido" para iniciar la verificación de la matriz.

2. A continuación, el sistema le mostrará la lista de errores encontrados indicando la línea en la cual encontró la inconsistencia. Por calidad de los datos oceanográficos de Cecoldo no se le permitirá continuar con la carga si se encuentran errores de contenido; de manera que deberá corregirlos y devolverse al “Paso 2” para cargar la matriz de datos nuevamente.

3. El sistema también le mostrará el reporte de datos ausentes y datos nulospara que el usuario analice si el porcentaje de estos valores es representativo frente a todos los datos de la matriz. De acuerdo a los valores mostrados, se deja a criterio del usuario si continúa o no con la carga. Si el % de datos reportados por el sistema como ausentes o nulos es significativo se recomienda no continuar con la carga y analizar la matriz de datos con más detenimiento.

4. Para continuar con la carga de datos haga clic en el botón "Paso 4".



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3.2.2.4. Paso 4: Validar escalas y códigos En este paso el sistema revisará los datos sobre los parámetros oceanográficos y meteorológicos en cuanto a su extensión temporal y geográfica, así como su codificación y escalas utilizadas. RECUERDE: La revisión de los parámetros incluirá:

� Diferencia entre datos de fecha, latitud y longitud de la matriz versus los

consignados en el metadato asociado.

� Códigos que no se encuentren en el Diccionario de Parámetros del BODC.

� Valores que no se encuentren en las claves de la OMM utilizadas en Cecoldo y la escala deBeaufort (para datos de meteorología marina)

� Valores que no correspondan a las banderas de calidad del ODV (para conjuntos de datos que registren banderas de este tipo).


1. Haga clic en el botón "Validar parámetros" para iniciar la verificación de la matriz.


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2. A continuación, el sistema le mostrará la lista de errores encontrados indicando la línea en la cual encontró la inconsistencia. Por calidad de los datos oceanográficos de Cecoldo no se le permitirá continuar con la carga si se generan errores en este paso; de manera que deberá corregirlos y devolverse al “Paso 2” para cargar la matriz de datos nuevamente.

3. Si no se generaron errores el sistema le permitirá continuar con la carga de datos, para lo cual deberá hacer clic en el botón "Paso 5".



3.2.2.5. Paso 5: Desplegar parámetros

En este paso el sistema le mostrará un resumen de los parámetros oceanográficos y de meteorología marina cargados. Asimismo, para cada parámetro, el usuario deberá seleccionar el instrumento de medición u observación con el que se obtuvieron los datos. RECUERDE:Revise cuidadosamente los valores mostrados, ya que se deja a criterio del usuario si continúa o no con la carga. Se recomienda verificar que los títulos de los parámetros del BODC correspondan a la descripción de los parámetros consignados en su matriz, y si los valores máximos y mínimos son posibles para su área geográfica de estudio.


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1. El sistema le mostrará el reporte de parámetros encontrados con sus respectivos títulos, unidades de medición o escalas de observación, valores máximos y mínimos.

2. Frente a cada parámetro deberá seleccionar el instrumento de medición u observación empleado para obtener los datos, haciendo clic sobre la lista controlada de instrumentos. También cuenta con la opción “No aplica” o “No registra”.

3. Para continuar con la carga de datos haga clic en el botón "Paso 6". Si considera que debe hacer una revisión de la matriz de datos pues observó inconsistencias, corríjala y vuelva a cargar la matriz de datos haciendo clic en el botón "Paso 2".



3.2.2.6. Paso 6: Desplegar la distribución geográfica

En este paso el sistema le permitirá visualizar los datos sometidos sobre un mapa. RECUERDE: Revise cuidadosamente que sus datos se distribuyan en el área geográfica de estudio, ya que se deja a criterio del usuario si finaliza o no la carga.


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1. Haga clic en el botón "Mostrar datos" para desplegar la información sobre el mapa.

2. A continuación, el sistema le mostrará los datos distribuidos geográficamente.

3. Si los datos se despliegan correctamente concluya con la carga haciendo clic en el botón "Finalizar", de lo contrario haga clic en el botón "Paso 2" para cargar nuevamente la matriz de datos corregida.




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4. BUSCAR Y SOLICITAR DATOS

Para realizar una búsqueda o solicitud de datos no se requiere de una cuenta de usuario. Vaya al enlace http://www.cccp.org.co:8080/cecoldo/faces/dataLogin.jsp. A continuación se explican estos procedimientos.

4.1. BÚSQUEDA DE DATOS

Para buscar datos en Cecoldo tenga en cuenta los siguientes criterios de búsqueda cuya información podrá obtener haciendo clic en el icono “?” ubicado al frente de cada campo (Figura 13). Recuerde que debe seleccionar por lo menos un criterio para poder realizar la búsqueda. Fecha de inicio: Mediante el selector de fechas indique la fecha de inicio de la toma de datos. El sistema le devolverá la información acerca de los conjuntos de datos que fueron recopilados después de esta fecha. Fecha de fin: Mediante el selector de fechas indique la fecha de finalización de la toma de datos. El sistema le devolverá la información acerca de los conjuntos de datos que fueron recopilados antes de esta fecha. Cobertura geográfica: Con la ayuda del recuadro de selección ubicado en el costado izquierdo del mapa, seleccione el área geográfica de interés. El sistema le devolverá la información acerca de los conjuntos de datos que se encuentran dentro de dicha área. Profundidad mínima: De la lista de profundidades estándar seleccione la profundidad mínima a la cual se hicieron las mediciones u observaciones oceanográficas. El sistema le devolverá la información acerca de los conjuntos de datos que registren datos a partir de esta profundidad. Profundidad máxima: De la lista de profundidades estándar seleccione la profundidad máxima a la cual se hicieron las mediciones u observaciones oceanográficas. El sistema le devolverá la información acerca de los conjuntos de datos que registren datos hasta esta profundidad. Parámetros: Seleccione el tipo de parámetros que desea incluir en su búsqueda. Primero deberá seleccionar la Disciplina, a continuación el Grupo y para finalizar, el Vocabulario al cual pertenecen los parámetros de su interés. Esta lista se encuentra en el idioma inglés y es mantenida por el BODC (British Oceanographic Data Centre).


21

Instrumento: Permite seleccionar uno o varios instrumentos de la lista controlada. Esta lista se encuentra en el idioma inglés y es mantenida por la NASA/Global Change Master Directory (GCMD). País: Seleccione el país sobre el cual desea obtener información sobre conjuntos de datos oceanográficos. Esta lista es mantenida por ISO. Institución: Permite seleccionar una institución que haya aportado datos oceanográficos al Centro de Datos. Esta lista es mantenida por Cecoldo.

Figura 13. Interfaz para la búsqueda de datos. Para iniciar la búsqueda haga clic en el botón “Buscar” que encontrará al final del formulario. Para limpiar la información seleccionada haga clic en el botón “Borrar”. En la parte inferior de la pantalla obtendrá la cantidad de coincidencias de los criterios de búsqueda y una tabla de resultados con la siguiente información (Figura 14):

� Identificador de los datos � Título del metadato � Proveedor de los datos

Al hacer clic sobre el identificador de los datos podrá obtener la información detallada de estos mediante una consulta de su metadato (Figura 14).


22

Figura 14. Resultados de una búsqueda de datos.

4.2. SOLICITUD DE DATOS

A partir de los resultados de una búsqueda de datos, usted podrá decidir solicitar autorización para descargarlos. Para ello, localice el botón “Solicitar datos” ubicado debajo de los resultados de una consulta de datos (Figura 15).

Figura 15. Botón para solicitar datos a Cecoldo. A continuación tendrá que diligenciar un formulario de solicitud de datos la cual será atendida posteriormente por el Administrador del sistema. Los datos del formulario son los siguientes, siendo “Departamento” y “Observaciones adicionales” los únicos campos opcionales.

Comentario [RVOM2]: Pendiente cambiar esta imagen cuando se realicen las

modificaciones de la tabla de resultados.


23

Apellidos: Apellido(s) de quien solicita los datos. Nombre: Nombre(s) de quien solicita los datos. Institución: Nombre de la institución a la que pertenece el solicitante de los datos. En caso de tratarse de una solicitud personal, entonces expresarlo así en este campo. Dirección: Dirección de las instalaciones físicas de la institución a la que pertenece la persona que solicita los datos. En caso de tratarse de una solicitud personal, entonces deberá incluir la dirección de residencia. Ciudad: Nombre de la ciudad donde se localizan las instalaciones físicas registradas en el campo “Dirección”. Departamento/Estado: Nombre del Departamento o del Estado donde se localizan las instalaciones físicas registradas en el campo “Dirección”. País: Nombre del país donde se localizan las instalaciones físicas registradas en el campo “Dirección”. Correo electrónico:Dirección electrónica que se registrará en Cecoldo para mantener contacto con el solicitante de los datos. Motivo de la solicitud: Describa qué lo motiva a realizar la solicitud, declare los objetivos, el alcance, quienes participan, etc. Productos que se obtendrán del uso de los datos: Describa los productos que se van a obtener a partir del análisis de los datos, por ejemplo, publicaciones, participación en eventos, tesis de grado, etc., y la manera en que el proveedor de datos podría participar en estos. Observaciones adicionales: Indique en este campo observaciones adicionales a las consignadas en los campos anteriores.


24

Figura 16. Formulario de solicitud de datos a Cecoldo.

Comentario [RVOM3]: Pendiente por incluir.


25

5. GLOSARIO

BODC: Centro Británico de Datos Oceanográficos (por su sigla en inglés, British Oceanogaphic Data Centre). Catálogo de metadatos: Sistema ordenado de elementos de metadatos que permite tener una descripción estandarizada de los diferentes conjuntos de datos que están presentes en el sistema. Clave OMM: Conjunto de caracteres alfanuméricos que representan elementos meteorológicos o, según el caso, elementos geofísicos, los cuales son empleados por la Organización Meteorológica Mundial (OMM) para facilitar el intercambio internacional de información meteorológica proporcionada por el Sistema Mundial de Observación de la Vigilancia Meteorológica Mundial (VMM). Diccionario de Parámetros: Recopilación de vocabularios controlados para la administración de parámetros construido de manera sistemática y usando un modelo semántico especial.Ej. Diccionario de Parámetros del BODC. Instrumentación oceanográfica: Equipos utilizados para realizar las mediciones u observaciones oceanográficas. Número OMI:Es un identificador único tanto para los buques como para las empresas de gestión de buquesregistrados.IHS Fairplay(anteriormente Register de Lloyd – Fairplay), es la fuente de origen y es la única autoridad encargada de la validación y asignación de números en nombre de la Organización Marítima Internacional (OMI). ODV: Es un esquema de banderas de calidad del software Ocean Data View ampliamente usado por la comunidad oceanográfica para facilitar el intercambio de datos. OMI: Organización Marítima Internacional (en inglés, International MaritimeOrganization). OMM: Organización Meteorológica Mundial (en inglés, WorldMeteorologicalOrganization). Parámetro oceanográfico: Cada una de las variables que se incluyen en un conjunto de datos oceanográficos. Usuario: Persona que tiene acceso al sistema de Administración de Datos. De acuerdo al perfil asignado puede realizar determinadas acciones dentro de este.


26

6. BIBLIOGRAFÍA

British Oceanographic Data Centre - BODC parameter codes[en línea].[20 de agosto de 2012].https://www.bodc.ac.uk/data/codes_and_formats/parameter_codes/. GCMD's Science Keywords and Associated Directory Keywords – Instruments.[en línea].[20 de agosto de 2012].http://gcmd.nasa.gov/Resources/valids/archives/keyword_list.html. IMO. Ship IMO numbersdatabase [en línea] [09 de octubre de 2012]. http://www.imonumber.com. OMM. Manual de claves: Claves internacionales. Volumen I.1. Parte A – Claves alfanuméricas. Edición de 2011 [en línea]. [20 de agosto de 2012]. ftp://ftp.wmo.int/Documents/MediaPublic/Publications/CodesManual_WMO_no_306/WMO306_Vol_I.1_2011_es.pdf Ortiz-Martínez, R. 2011. Instructivo para la normalización de conjuntos de datos oceanográficos y de meteorología marina. Versión 1.6. Centro Colombiano de Datos e Información Oceanográfica (Cecoldo). Dirección General Marítima – Centro de Investigaciones Oceanográficas e Hidrográficas del Pacífico. Tumaco, Colombia. 40 pp. Ortiz-Martínez, R. 2008. Introducción a la gestión de datos oceanográficos. En: Dimar (Ed.). Gestión datos e información oceanográfica colombiana. (pp. 43-62). Bogotá: Editorial Dimar, 140 pp. SeaDataNet - BODC webservices (Libraries) CL12[en línea].[20 de agosto de 2012].http://seadatanet.maris2.nl/v_bodc_vocab/welcome.aspx.


27

ANEXO A. NOTAS DEL PROCEDIMIENTO DE NORMALIZACIÓN DE CONJUNTOS DE DATOS OCEANOGRÁFICOS Y DE METEOROLOGÍA MARINA

I. INFORMACIÓN DEL EDITOR Fecha: Lugar: Nombre: Institución: Correo electrónico: II. INFORMACIÓN PRELIMINAR Motivación Ej. Convenio interinstitucional No. xxxx entre la Universidad Eafit y Dimar-CCCP. Encargados Ej. Universidad Eafit y Dimar-CCCP Área geográfica cubierta Ej. Bahía de Tumaco, departamento de Nariño, Colombia. Periodo de tiempo cubierto Ej. Entre enero y febrero de 2010 Plataformas utilizadas Ej. Buque oceanográfico Instrumentos y unidades de medida Ej. CTD: Temperatura de la columna de agua (grados centígrados), salinidad (unidades prácticas de salinidad) y presión (decibares). Metodología o técnica de obtención de datos aplicada Ej. Las muestras de zooplancton fueron colectadas mediante arrastres verticales de 200 m a superficie con una red minibongo de 250 micras, con flujómetro adosado a la boca de la red para medir la cantidad de volumen de agua filtrado y así estandarizar el número de individuos/litro… en el laboratorio… Tratamiento previo a los datos brutos Ej. Conversión del formato de origen, aplicación de una rutina en Matlab, etc.


28

III. INFORMACIÓN DE NORMALIZACIÓN Control Ejemplos de registro de cambios y aclaraciones

Preparación de la matriz

� Fueron omitidas los siguientes parámetros para la generación del conjunto de datos normalizado: xxxx

� Se agregaron los siguientes parámetros a partir del informe de proyecto consultado: xxxx.

� El número de decimales utilizado fue de cinco (5) para ofrecer la mayor precisión.

� Los parámetros oceanográficos no fueron sometidos a rigurosas pruebas de calidad, por lo cual no le fueron asignadas banderas de calidad.

� Se agotaron todas las fuentes de información (en soporte electrónico u papel) disponibles en el CCCP y sin embargo el conjunto de datos históricos no pudo completarse.

Formato del encabezado

� Los títulos de los parámetros fueron ajustados teniendo en cuenta la convención internacional para nombrar archivos de Ciencias de la Tierra.

� Para cada parámetro se agregó entre corchetes la abreviatura de la unidad de medida.

Formato de los datos temporales y geográficos

� Se ajustó el formato de los datos geográficos de grados minutos segundos a grados decimales, mediante la utilización de una función en Excel.

� El número de decimales utilizado en las coordenadas geográficas fue de cinco para precisión centimétrica.

� Se ajustó el formato de la fecha a aaaa-mm-dd UT-5 para Colombia.

� Se ajustó el formato de la fecha a hh:mm:ss UT-5 para Colombia. � Se realizaron pruebas de calidad para verificar la consistencia de

las variables temporales y geográficas. Codificación de datos

� Se convirtieron los valores registrados sobre observaciones de meteorología marina teniendo como referencia las claves de la Organización Meteorológica Mundial (OMM).

� Se convirtieron los valores registrados sobre buques de tráfico internacional teniendo como referencia el número OMI (Organización Marítima Internacional).

� Las banderas de calidad se codificaron teniendo como referencia la convención del ODV (Ocean Data View).

Tratamiento de datos nulos y datos ausentes

� Los campos vacíos fueron remplazados por el valor -99999. � Los campos con valores iguales a “cero” corresponden a aquellos

en los que el instrumento no detectó el valor. Codificación de parámetros

� Para la descripción de los parámetros se utilizó como referencia el Diccionario de Parámetros del BODC.

� Los códigos de los parámetros se incluyeron en la segunda fila de la matriz de datos.


29

ANEXO B. CLAVES Y ESCALAS PARA OBSERVACIONES DE METEOROLOGÍA MARINA

Dirección de la ola: Ref. WMO0877

Código Dirección de la ola [°]

00 Calma (sin olas) 01 5 - 14 02 15 - 24 03 25 - 34 04 35 - 44 05 45 - 54 06 55 - 64 07 65 - 74 08 75 - 84 09 85 - 94 10 95 - 104 11 105 - 114 12 115 - 124 13 125 - 134 14 135 - 144 15 145 - 154 16 155 - 164 17 165 - 174 18 175 - 184 19 185 - 194 20 195 - 204 21 205 - 214 22 215 - 224 23 225 - 234 24 235 - 244 25 245 - 254 26 255 - 264 27 265 - 274 28 275 - 284 29 285 - 294 30 295 - 304 31 305 - 314 32 315 - 324 33 325 - 334 34 335 - 344 35 345 - 354 36 355 - 4 99 Variable, o todas las direcciones,o desconocida u olasconfusas, dirección indeterminada.


30

Periodo de la ola: Ref. WMO3155

Código Periodo de la ola [s] 0 10 1 11 2 12 3 13 4 14 o más 5 5 o menos 6 6 7 7 8 8 9 9

Estado del mar: Ref. WMO3700

Código Términos descriptivos Altura del oleaje[m]

0 Calma (como un espejo) 0 1 Calma (con rizos) 0 - 0.1 2 Ondulada (pequeñas olas) 0.1 - 0.5 3 Ligeramente agitado 0.5 - 1.25 4 Moderado 1.25 - 2.5 5 Gruesa 2.5 - 4 6 Muy gruesa 4 - 6 7 Alta 6 - 9 8 Muy alta 9 - 14 9 Enorme Más de 14

Visibilidad: Ref. WMO4300

Código Distancia [Km] Significado

0 Inferior a 50 m Niebla muy densa, sin visibilidad 1 50 - 200 m Niebla espesa, muy poca visibilidad 2 200 - 500 m Niebla, muy poca visibilidad 3 500 - 1000 m Niebla, poca visibilidad 4 1 - 2 km Neblina o calina, visibilidad escasa 5 2 - 4 km Neblina o calina, visibilidad escasa 6 4 - 10 km Atmósfera diáfana, visibilidad moderada 7 10 - 20 km Atmósfera diáfana, buena visibilidad 8 20 - 50 km Atmósfera diáfana, muy buena visibilidad 9 50 km o más Atmósfera diáfana, excelente visibilidad


31

Cubierta total de nubes: Ref. WMO2700

Código Cantidad de Nubes 0 Cielo despejado 1 1/8 2 2/8 3 3/8 4 4/8 5 5/8 6 6/8 7 7/8 8 8/8 9 Cielo oscurecido, o la cantidad de nubes no puede ser estimada

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37

ANEXO C. BANDERAS DE CALIDAD Es importante que el usuario tenga presente que los conjuntos de datos deben cumplir con los niveles de calidad mínimos exigidos por la comunidad científica y por esta razón es responsabilidad del proveedor de datos aplicar pruebas de calidad rigurosas a los datos a someter, siendo ello un compromiso importante para el intercambio. Las pruebas de calidad varían dependiendo del parámetro, el instrumento de medición utilizado, la climatología local, etc. Dentro de las pruebas de calidad que se deben adelantar previamente a la normalización de los conjuntos de datos se encuentra:

� Prueba de datos completos. � Prueba de localización geográfica. � Prueba de rango, en el cual se compara la medición con límites inferiores y

superiores prestablecidos que pueden ser de la misma variable o de climatología propia de la región.

� Prueba de continuidad, en el cual se rastrea el comportamiento de una variable en el tiempo.

� Prueba de consistencia interna que se basa en las relaciones entre las variables. � Pruebas específicas para cada parámetro.

Al concluir las pruebas de la calidad del dato deben ser asignadas banderas para informar al usuario acerca de la calidad del dato. El modelo de banderas de calidad adoptado para el repositorio de Cecoldo corresponde a las utilizadas por el aplicativo Ocean Data View (ODV), donde: 0 = Bueno 1 = Desconocido 4 = Cuestionable 8 = Malo Existen otros modelos de banderas de calidad que también pueden ser utilizados, sin embargo, se recomienda en lo posible contar además con el esquema básico del ODV. Algunos esquemas equivalentes han sido definidos y pueden ser consultados en el siguiente enlace: http://odv.awi.de/fileadmin/user_upload/odv/misc/ODV4_QualityFlagSets.pdf