métodos para el estudio de la ecología microbiana
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MÉTODOS PARA EL
ESTUDIO DE LA ECOLOGÍA MICROBIANA
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RECUENTO EN PLACA ESTÁNDAR PARA LA DETERMINACIÓN DE MICROORGANISMOS DEL SUELO
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Se basa en contar las colonias de microorganismos que se desarrollan después de inocular en un medio de cultivo adecuado e incubar a una temperatura y tiempo determinados un volumen determinado de muestra. Se utiliza para determinar el número de células aisladas o microorganismos unicelulares viables como bacterias, levaduras, también se utiliza para el conteo de esporas fúngicas presentes en la muestra.
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Disponible en :http://aulavirtual.usal.es/aulavirtual/demos/microbiologia/unidades/documen/uni_02/58/texthtml/cap804.htm
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Disponible en: http://www.oocities.org/roberto_raul/crecimiento.html
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NUMERO MAS PROBABLE PARA LA DETERMINACIÓN DE COLIFORMES TOTALES Y FECALES EN AGUA
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La denominación genérica coliformes designa a un grupo
de especies bacterianas que tienen ciertas características
bioquímicas en común e importancia relevante como
indicadores de contaminación del agua y los alimentos
La determinación de microorganismos coliformes
totales por el método del Número más Probable (NMP), se
fundamenta en la capacidad de este grupo microbiano de
fermentar la lactosa
El medio de cultivo que se utiliza es el caldo LMX Fluorocult el cual permite la recuperación de los microorganismos dañados
que se encuentren presentes en la muestra y que sean capaces
de utilizar a la lactosa como fuente de carbono.
La determinación del número más probable de
microorganismos coliformes fecales se realiza a partir de los
tubos positivos de la prueba coliformes totales
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TECNICA PARA DETERMINAR LA RESPIRACION DE
SUELOS
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RESPIRACIÓN DEL SUELO
Es la producción
de CO2 debido a 2 procesos :
La oxidación de materia
orgánica rica en carbono por medio M.O del
suelo
La respiración de las células de las raíces
de las plantas
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Se colocan recipientes de plástico boca abajo sobre varios lugares de muestreo para actuar como cámaras de aire para recoger el CO2 del Suelo. Se colocan un recipiente mas pequeño NaOH dentro de cada de aire para atrapar el CO2 : Este sistema usa las propiedades de acido débil del CO2 en una reacción de neutralización acido base que produce carbonato.
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Disponible en: http://www.dspace.espol.edu.ec/bitstream/123456789/8666/1/lkrebs.pdf
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RECUENTO DE MICROORGANISMOS
DEL AIRE USANDO EL RECIPIENTE ANDERSEN
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Método utilizado para el muestreo de bacterias del aire, donde se fuerza a pasar un volumen determinado de aire a través de un dispositivo como un filtro de membrana.
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En el recipiente de Andersen el aire se arrastra atraves de una serie de rejillas graduadas de
tamaño
Se dispone una placa de agar
bajo cada rejilla para recoger los M.O y partículas contenidas en el
aire
La velocidad del aire aumenta a
medida que disminuye las
aberturas de la rejilla de manera
que en las sucesivas placas con agar se van
depositando partículas mas
pequeñas
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Disponible en : http://www2.uah.es/antonia_andrade/aeropalinol.htm
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Disponible en : http://www.jmcprl.net/ntps/@datos/ntp_203.htm
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TÉCNICA CHOLODNY ROSSI
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La técnica de la laminilla en contacto de Cholodny y Rossi es una manera sencilla en la recogida y recuento directo de M.O del suelo y sedimentos.Aunque esta técnica no es confiable para enumerar organismos del suelo, es útil parailustrar la orientación de unos microorganismos con otros en las partículas de suelo.
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En un recipiente estéril deposite un gran cantidad de suelo a examinar
Posteriormente entierre en este
suelo varias laminas
portaobjetos y déjelas allí por días
Retire las laminas con cuidado de la muestra de suelo
Limpie u n lado de la lamina para
evitar contaminación,
fijar la muestra al mechero
Aplicar cristal violeta y cubrir con
una laminilla
Identificar en el microscopio las
estructuras de M.O en la muestra
observada
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Disponible en :http://www.eapcri.eu/
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RECUENTO DE ESPORAS DE MICORRIZAS Y % DE MICORRIZACION EN RAÍCES DE PLANTAS
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Disponible en:http://www.agro.uba.ar/agro/ced/microbiologia/clases/micorrizas/clases/tp_clase3.htm
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Disponible en:http://www.agro.uba.ar/agro/ced/microbiologia/clases/micorrizas/clases/tp_clase3.htm
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Disponible en:http://www.agro.uba.ar/agro/ced/microbiologia/clases/micorrizas/clases/tp_clase3.htm
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Disponible en:http://www.agro.uba.ar/agro/ced/microbiologia/clases/micorrizas/clases/tp_clase3.htm
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Disponible en:http://www.agro.uba.ar/agro/ced/microbiologia/clases/micorrizas/clases/tp_clase3.htm
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Disponible en: http://www.agro.uba.ar/agro/ced/microbiologia/clases/micorrizas/clases/tp_clase3.htm
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MICROSCOPIA DIRECTA DE
EPIFLUORESCENCIA
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Es una técnica que emplea sondas de oligonucleótidos marcadas con fluorocromos las cuales van dirigidas hacia secuencias específicas del ADN y ARNr, lo que permite la identificación rápida y específica de células microbianas ya sea que estén como células individuales o se encuentren agrupadas en su ambiente natural.
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Disponible en: quimicoclinico.wordpress.com
Coloración con naranja de acridina
Coloración con DAPI
Disponible en: http://morfoudec.blogspot.com/2008/07/microscopa-de-fluorescencia.html
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DETERMINACIÓN DE MICROORGANISMOS
SOLUBILIZADORES DE FOSFATO
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EL fósforo es uno de los elementos esenciales para el funcionamiento de los organismos y los ecosistemas y usualmente se encuentra entre los factores limitantes en el crecimiento de cultivos, lo que ha motivado el desarrollo de productos biotecnológicos, con base en microorganismos solubilizadores de fosfatos inorgánicos.
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PROCEDIMIENTO
10 g de la muestra
90 ml – 10 -1
1 ml
9 ml – 10 -2 9 ml – 10 -3 9 ml – 10 -4
Sembrar en agar NBRIPIncubar 5-7 días (37°C)Contar UFC, reportar
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BIBLIOGRAFIA REGINATTO LUCIANO, «Respiración del suelo como herramienta para evaluar
calidad de fondos en acuicultura. I. Desarrollo de un protocolo estándar para medir dióxido de carbono» Facultad de Ingeniería Marítima y Ciencias del Mar, ESCUELA SUPERIOR POLITÉCNICA DEL LITORAL Guayaquil – Ecuador 2003