matlab abrir ficheros

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Teoria de matlab para leer ficheros de bases de datos

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  • 7Operaciones de lectura yescritura con ficheros enMATLAB

    Hasta ahora se ha visto:

    Cmo leer valores que el usuario escribe en el teclado (orden input).

    Cmo imprimir informacin en la ventana de comandos de MATLAB (rdenes disp yfprintf).

    En esta prctica veremos operaciones avanzadas de lectura y escritura, esto es, que operansobre el contenido de un fichero.

    7.1 Introduccin a la lectura y escritura en ficheros: r-denes save y load

    7.1.1 Grabar en fichero el espacio de trabajo: orden save

    La utilizacin ms sencilla de la orden save es para guardar en un fichero todo el contenido delworkspace (espacio de trabajo), es decir, el conjunto de las variables almacenadas en memoria:

    save nombredeficherosave('nombredefichero') % tambin se puede escribir as

    Esta orden guarda todo el contenido del workspace (nombres de variables y sus valores) enun fichero de nombre nombredefichero.mat. Esto puede ser til si se necesita abandonar unasesin de trabajo con MATLAB sin haber terminado la tarea: se puede salvar fcilmente a unfichero el workspace en su estado actual, cerrar MATLAB y luego recuperar todas las variablesen una nueva sesin. Esto ltimo se hace con la orden

    load nombredeficheroload('nombredefichero') % equivalente a la anterior

    Prctica 1 Uso de save para salvar el workspace

    1

  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 2

    1. Crea unas cuantas variables en tu espacio de trabajo. Por ejemplo:

    A = rand(5,5);B = sin(4*A);x = 1:15;frase = 'Solo se que no se nada';

    2. Comprueba con la orden who qu variables tienes en el workspace:

    who

    3. Salva el contenido del workspace a un fichero de nombre memoria.mat:

    save memoria

    Comprueba que en tu carpeta de trabajo aparece un fichero con este nombre.

    4. Borra todas las variables de la memoria:

    clear

    y comprueba con who que el workspace est vaco.

    5. Recupera tus variables desde el fichero memoria.mat:

    load memoria

    6. Comprueba de nuevo, con who, que vuelves a tener todas tus variables.

    Tambin es posible salvar slo parte de las variables:

    save nombredefichero var1 var2 var3 (sin comas de separacin)

    Prctica 2 Uso de save para salvar algunas variables

    1. Comprueba con who que tienes tus variables en el workspace. Si no es as, recupralasusando la orden

    load memoria

    2. Salva, a otro fichero de nombre memo.mat el contenido de dos de las variables quetengas, por ejemplo:

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 3

    save memo A frase

    Comprueba que en tu carpeta de trabajo aparece un fichero de nombre memo.mat.

    3. Borra las variables salvadas:

    clear A frase

    y comprueba con who que ya no existen en el workspace.

    4. Recupera tus variables:

    load memo

    y comprueba con who que ahora estn de nuevo en el workspace.

    7.1.2 Distintos tipos de ficheros: de texto y binarios

    Existen muchos tipos distintos de ficheros, que normalmente se identifican por distintas exten-siones;

    .txt .dat .m .mat

    .jpg .xls .pdf etc.

    Una de las cosas que diferencia unos ficheros de otros es el hecho de que su contenido sea o nolegible con un editor de texto plano, tambin llamado editor ascii1. El editor de MATLAB esun editor ascii y tambin lo es el Bloc de Notas de Windows y cualquier editor orientado a laprogramacin. Word no es un editor ascii.Desde el punto de vista anterior, existen dos tipos de ficheros:

    Ficheros formateados o de texto: son aqullos cuyo contenido est formado por textoplano. Se pueden ver con cualquier editor de texto ascii.

    Ficheros no formateados binarios: contienen informacin de cualquier tipo codificadaen binario, es decir, tal y como se almacena en la memoria del ordenador, utilizando cerosy unos. Ejemplos de ficheros binarios son ficheros de imgenes, ficheros que contienenprogramas ejecutables (es decir, escritos en cdigo-mquina), etc. Slo se pueden utilizarcon programas adecuados para cada fichero.

    Prctica 3 Los ficheros .mat no son editables

    1ASCII = American Standard Code for Information Interchange (Cdigo Estndar Estadounidense para elIntercambio de Informacin).

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 4

    Los ficheros .mat creados por la orden save son ficheros binarios, es decir, no son editables.Vemos qu ocurre si lo abrimos con un editor ascii:

    1. En la ventana Current Folder (Carpeta de trabajo), pon el cursor encima del icono delfichero memoria.mat y con el botn derecho del ratn elige Open as Text (Abrir comoTexto).

    2. Observars un montn de signos extraos: has abierto como texto ascii un fichero queno lo es.

    3. Cierra el editor

    La orden save tambin puede ser usada para guardar datos en un fichero de texto:

    save nombrefichero var1 var2 -ascii

    En este caso, el fichero no tiene la extensin .mat, ya que la misma est reservada para losficheros binarios de MATLAB. Se debe especificar la extensin junto con el nombre del fichero.Adems, no se guardan en el fichero los nombres de las variables, solamente sus valores.

    Prctica 4 Uso de save para salvar datos en un fichero de texto

    1. Comprueba con who que tienes tus variables en el workspace. Si no es as, recupralasusando la orden

    load memoria

    2. Salva, a un fichero de texto de nombre memo.dat el contenido de algunas de lasvariables que tengas, por ejemplo:

    save memo.dat A frase -ascii

    El cualificador -ascii indica que se salvaguarden los datos en un fichero formateado.Comprueba que en tu carpeta de trabajo aparece un fichero de nombre memo.dat.

    3. Puedes usar el editor de MATLAB para ver y modificar el contenido de este fichero.Abre el fichero desde el men Open file ... o bien con la orden

    edit memo.dat

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 5

    Es importante hacer notar que los datos guardados de esta manera en un fichero de texto nopueden ser recuperados en la memoria con la orden load, a menos que se trate de una solamatriz de datos numricos, es decir que cada lnea del fichero contenga la misma cantidadde datos. En ese caso hay que usar la versin A=load(nombredefichero.extension) de laorden para guardar los valores de la matriz en la variable A.

    Prctica 5 Cargar datos desde un fichero y hacer una grfica con ellos.

    1. En primer lugar vas a crear el fichero que luego se leer. Crea dos variables x e y conlas abscisas y las ordenadas de los puntos de una curva. Crea tambin una variablecon un ttulo para la grfica. Por ejemplo:

    t = linspace(0,2*pi,200);r = 2*sin(3*t);x = r.*cos(t);y = r.*sin(t);titulo = 'Grafica de la funcion';

    2. Salva, a un fichero datos1.mat el contenido de las variables x, y y titulo:

    save datos1 x y titulo

    Comprueba que en tu carpeta de trabajo se ha creado un fichero datos1.mat. Re-cuerda que se trata de un fichero binario que no se puede editar.

    3. Escribe ahora un script de nombre Plot_datos.m que cargue las variables del ficheroy genere la grfica correspondiente. Para ello abre un fichero nuevo en el editor deMATLAB y slvalo con el nombre Plot_datos.m. Dentro de la ventana del editorescribe:

    file = input('Nombre del fichero a cargar : ','s');load(file)plot(x,y)title(titulo)

    Salva el script y ejectalo.

    Prctica 6 Se dispone de un fichero temperaturas.dat en el que se almacenan datosmeteorolgicos de cierta ciudad. Las temperaturas estn expresadas en grados Celsius, conun decimal. Concretamente, el fichero contiene la temperatura a lo largo del da, medida

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 6

    cada hora, desde las 0 hasta las 23 horas (en total 24 datos por da). Cada linea contienelas temperaturas de un da. El fichero contiene cuatro lneas.Hay que realizar una grfica que represente, mediante 4 curvas, la evolucin de las tempe-raturas a lo largo de cada da.

    1. Puesto que el fichero temperaturas.dat es de texto, se puede editar. brelo para versu estructura. Cierra el fichero.

    2. Comienza por cargar en memoria los datos del fichero temperaturas.dat, que esun fichero de texto. Puesto que todas las filas del fichero contienen el mismo nmerode datos, esto se puede hacer con la orden load:

    Temp = load('temperaturas.dat');

    que guarda en la variable Temp una matriz con 4 filas y 24 columnas conteniendo losdatos del fichero. Comprubalo. Cada fila de Temp contiene las temperaturas de unda.

    3. Crea un vector con 24 componentes representando las horas del da, para usarlo comoabscisas:

    hh = 0:23;

    4. Se quiere construir una curva con cada fila de la matriz Temp. Esto se puede hacercon la orden

    plot(hh,Temp(1,:),hh,Temp(2,:),hh,Temp(3,:),hh,Temp(4,:),)

    Pero tambin se puede hacer mediante la orden

    plot(hh,Temp)

    Consulta en el Help de MATLAB este uso de la funcin plot en el que el segundoargumento es una matriz.

    7.2 Lectura y escritura en ficheros avanzada

    Las rdenes save y load son fciles de usar, aunque apenas permiten disear su resultado yslo sirven en algunos casos.Por ejemplo, con la orden save no se pueden escribir datos en un fichero con un formatopersonalizado, como una tabla, mezclando texto y datos numricos, etc.Con la orden load no podemos cargar en memoria datos de un fichero de texto, a menos quese trate de una sola matriz de datos numricos.

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 7

    Con frecuencia es necesario utilizar ficheros procedentes de otros usuarios o creados por otrosprogramas y cuya estructura y formato no se puede elegir o, por el contrario, es preciso generarun fichero con una estructura determinada.Para todo ello es necesario recurrir a rdenes de lectura/escritura de bajo nivel. Estas rdenesson ms complicadas de usar, ya que requieren ms conocimiento del usuario pero, a cambio,permiten elegir todas las caractersitcas de la operacin que se realiza.Los pasos en el trabajo de bajo nivel con ficheros son:

    Abrir el fichero e indicar qu tipo de operaciones se van a efectuar sobre l. Esto significa queel fichero queda listo para poder ser utilizado por nuestro programa.

    Leer datos que ya estn en el fichero, o bien Escribir datos en el fichero o Aadir datos alos que ya hay.

    Cerrar el fichero.

    Slo hablamos aqu de operaciones con ficheros formateados. No obstante, en algunas ocasiones,como por ejemplo cuando hay que almacenar grandes cantidades de datos, puede ser convenienteutilizar ficheros binarios, ya que ocupan menos espacio y las operaciones de lectura y escriturasobre ellos son ms rpidas.

    7.2.1 Apertura y cierre de ficheros

    Para abrir un fichero slo para lectura con MATLAB se utiliza la orden

    fid=fopen('NombreFichero');

    NombreFichero es el nombre del fichero que se desea utilizar.

    fid es un nmero de identificacin que el sistema asigna al fichero, si la operacin de aperturaha sido exitosa. Si no, fopen devolver el valor fid=-1. En adelante se usar ese nmeropara cualquier operacin sobre el fichero que se quiera realizar.

    De forma ms general, la orden para abrir un fichero es:

    fid=fopen('NombreFichero','permiso');

    permiso es un cdigo que se utiliza para indicar si se va a utilizar el fichero para leer o paraescribir. Posibles valores para el argumento permiso son:

    r indica que el fichero se va a utilizar slo para lectura. Es el valor por defecto.(En Windows conviene poner rt).

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 8

    w indica que el fichero se va a utilizar para escribir en l. En este caso, si existe unfichero con el nombre indicado, se abre y se sobre-escribe (el contenido previo, si lohaba, se pierde). Si no existe un fichero con el nombre indicado, se crea.(En Windows conviene poner wt)

    a indica que el fichero se va a utilizar para aadir datos a los que ya haya en l.(En Windows conviene poner at)Para otros posibles valores del argumento permiso, ver en el Help de MATLAB ladescripcin de la funcin fopen.

    Una vez que se ha terminado de utilizar el fichero, hay que cerrarlo, mediante la orden

    fclose(fid)

    donde fid es el nmero de identificacin que fopen le di al fichero. Si se tienen varios ficherosabiertos a la vez se pueden cerrar todos con la orden

    fclose('all')

    7.2.2 Leer datos de un fichero con fscanf

    La orden

    A = fscanf(fid,'formato');

    lee los datos de un fichero hasta el final o hasta que se encuentre algn dato que no correspondecon el formato proporcionado.

    fid es el nmero de identificacin del fichero, devuelto por la orden fopen.

    formato es una descripcin del formato que hay que usar para leer los datos. Se utilizan losmismos cdigos que con la orden fprint.

    A es un vector columna en el que se almacenan los datos ledos, en el orden en que estnescritos.

    Prctica 7 Leer los datos del fichero datos3.dat con fscanf y almacenarlos en una matrizcon 2 columnas.

    1. Edita el fichero datos3.dat para ver su estructura y luego cirralo:

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 9

    1.000 3.0002.000 1.5003.000 1.0004.000 0.7505.000 0.600etc.

    2. Abre el fichero datos3.dat para lectura:

    fid = fopen('datos3.dat','r');

    3. Lee los datos del fichero con la orden:

    mat = fscanf(fid,' %f'); 1.00003.00002.00001.50003.0000etc.

    4. Para que los datos formen una matriz con 2 columnas como en el fichero hay que usarla orden

    mat2 = reshape(mat,2,[])';

    que en primer lugar organiza los datos como una matriz con 2 filas y luego la transpone.Comprueba que la matriz mat2 contiene los datos organizados como en el fichero.

    5. Cierra el fichero

    fclose(fid);

    Observacin: la Prctica 7 se podra haber ledo hecho usando la orden load, ya que todaslas filas estn formadas por el msmo nmero de datos. Sin embargo la orden fscanf sirve paraotros casos que no se podran leer con load, como en la Prctica siguiente.

    Prctica 8 Se dispone de un fichero contaminacion.dat que contiene datos sobre conta-minacin de las provincias andaluzas.Cada linea del fichero contiene el nombre de la provincia y tres datos numricos.Se quieren recuperar los datos numricos del fichero en una matriz con tres columnas, esdecir, ignorando el texto de cada lnea.

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 10

    1. Abre con el editor el fichero contaminacion.dat para ver su estructura:

    Almeria 3.7 1.4 2.0Cadiz 9.5 8.5 3.3Almeria 0.9 4.2 9.9etc.

    Cierra el fichero.

    2. Intenta abrir el fichero con la orden load. Recibirs un mensaje de error, ya que, comohemos dicho, load no puede leer ficheros de texto con datos de distintos tipos:

    mat = load('contaminacion.dat'); % producira errores

    3. Sin embargo, el fichero se puede leer con la orden fscanf. Abre el fichero para lectura:

    fid = fopen('contaminacion.dat','r');

    4. Escribe la orden siguiente:

    mat = fscanf(fid,' %f');

    que indica que se va a leer el contenido del fichero hasta que se termine o bien hastaque los datos a leer no coincidan con el formato especificado. El formato especifica leer1 dato real. Si despus de ste siguen quedando datos en el fichero, se re-visita elel formato, es decir, es como si pusiramos %f %f %f %f %f %f ... hasta que se acabeel fichero.

    Vers que el resultado es una matriz vaca. Cual es el error?

    5. Escribe ahora la orden:

    frewind(fid);

    Esta orden rebobina el fichero, es decir, coloca el apuntador de lectura al principiodel mismo.

    6. Escribe ahora la orden

    mat = fscanf(fid,' %s %f %f %f');

    Esta orden indica que se han de leer del fichero 1 dato tipo string (cadena de carac-teres), luego 3 reales y repetir. Ahora obtendrs una matriz con una sola columna.Observa sus valores. Es lo que esperabas? Intenta comprender lo que has obtenido.

    7. Rebobina de nuevo el fichero y escribe la orden:

    mat = fscanf(fid,' %*s %f %f %f')

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 11

    Esta orden indica que se ignore ( %*s) un dato de tipo string, que luego se lean 3reales y luego repetir. Observa el resultado.

    8. Para dar a la matriz mat la estructura deseada hay que usar la orden

    mat = reshape(mat,3,[])';

    que indica que se reinterprete mat como una matriz con 3 filas y el nmero decolumnas que salgan y luego se transpone.

    7.2.3 Escribir datos en un fichero con fprintf

    La orden

    fprintf(fid,'formato',lista_de_variables);

    escribe los valores de la variables de la lista_de_variables en el fichero con numero deidentificacin fid de acuerdo con el formato especificado.

    fid es el nmero de identificacin del fichero, devuelto por la orden fopen.

    formato es una descripcin del formato que hay que usar para escribir los datos.

    lista_de_variables son las variables o expresiones cuyos valores hay que escribir en elfichero.

    Prctica 9 El siglo pasado era costumbre escribir los nmeros de los aos con slo dosdgitos: 76, 77, 78, etc.Se dispone de un fichero temp_anuales.dat en donde se almacena la temperatura mximamedia de cada mes del ao, para varios aos del siglo XX. Los aos vienen expresados condos dgitos y las temperaturas vienen expresadas con una cifra decimal.Se necesita generar a partir de este fichero otro que contenga los mismos datos, pero con losaos expresados con 4 dgitos, para poder aadir los de este siglo. Las temperaturas debenser escritas, tambin, con un decimal.Genera tambin una grfica que muestre la evolucin de las temperaturas a lo largo del ao(una curva para cada ao). Dibuja cada curva de un color y aade a cada curva una leyendacon el nmero del ao al que corresponde, como en la grfica siguiente:

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 12

    1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 120

    5

    10

    15

    20

    25

    30

    35

    40

    19951996199719981999

    1. Puesto que el contenido del fichero temp_anuales.dat es una matriz de nmeros, sepuede leer con la orden load:

    datos = load('temp_anuales.dat');

    2. Los nmeros de los aos forman la primera columna de la matriz datos, as que unvector conteniendo los aos con la numeracin de 4 cifras se obtiene con:

    anyos = datos(:,1)+1900;

    Observacin: para escribir los datos en un nuevo fichero no podemos usar la ordensave, ya que los escribira con formato exponencial (p.e. 9.5000000e+01) y queremosescribir los aos sin decimales y los datos con solo un decimal.

    Hay que usar rdenes de bajo nivel, concretamente la orden fprintf.

    3. Abrimos un nuevo fichero para escritura, en el que grabaremos los nuevos datos.

    fid = fopen('temp_anuales_new.dat','w');

    4. Recuperamos las dimensiones de la matriz datos, para saber cuntas filas tiene:

    [nfils,ncols] = size(datos); % nfils = numero de filas

    5. Vamos a realizar un bucle con un ndice k variando desde 1 hasta nfils. En cadaiteracin del bucle escribiremos una fila del nuevo fichero, mediante las rdenes:

    fprintf(fid,' %4i',anyos(k)); % el ao con formato %4ifprintf(fid,' %6.1f',datos(k,2:13)); % los datos con formato %6.1ffprintf(fid,'\n'); % al final un salto de linea

    Prueba a escribir el nuevo fichero mediante una estrategia distinta de esta.

    6. Cerramos el fichero

    fclose(fid);

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 13

    7. La grfica pedida se puede hacer con las rdenes

    plot(1:12,datos(:,2:13),'LineWidth',1.1);legend(num2str(anyos));axis([1,12,0,40])shgsaveas(gca,'temp_anuales.pdf','pdf')

    Analiza estas rdenes pues usan algunas funcionalidades nuevas. La ordenshg posiciona la ventana grfica delante de todas las dems. La ordensaveas(gca,temp_anuales.pdf,pdf) salva la grfica a un fichero pdf.

    Prctica 10 Modifica alguno de los scripts de clculo de series (por ejemplo SumaExp.m)para que la tabla de las iteraciones se escriba en un fichero en lugar de en la pantalla.

    Prctica 11 Una triangulacin es una particin de una regin en tringulos que cumplen lacondicin de que cubren toda la regin y de que dos tringulos cualesquiera slo puedentener en comn un vrtice o un lado completo. Queda definida mediante dos matrices:

    1. Una matriz coor con 2 filas y Np columnas que contiene las coordenadas de los vrticesde los tringulos. Por ejemplo si

    coor = 0.000 -0.300 -0.900 -0.500 ...1.000 0.400 0.300 0.300 ...

    indica que el vrtice nmero 1 es el punto (0, 1); el vrtice nmero 2 es el punto(0.3, 0.4), etc. En total hay Np vrtices.

    2. Una matriz trian con 3 columnas y Nt filas que indica cules son los vrtices de cadatringulo. Por ejemplo

    trian = 7 26 2526 52 2526 27 52..... etc.

    indica que el tringulo nmero 1 tiene los vrtices 7, 26 y 25; que el tringulo nmero2 tiene los vrtices 26, 52 y 25, etc. En total hay Nt tringulos.

    Se dispone de dos ficheros: puntos.dat que contiene la matriz coor y triangulos.dat quecontiene la matriz trian.Esta prctica consiste en leer los datos de los ficheros y dibujar la triangulacin.

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 14

    1. Vamos a escribir un script llamado mallado.m para hacer la prctica. Abre un ficheronuevo, slvalo con ese nombre escribe en l lo que sigue.

    2. Comenzaremos por dibujar los vrtices con marcadores. Aunque no es necesario esun buen ejercicio. Puesto que el contenido del fichero puntos.dat es una matriz denmeros, se puede leer con la orden load:

    coor = load('puntos.dat');

    3. Recuperamos las dimensiones de la matriz coor:

    [Np,nc]=size(coor); % Np es el nmero de vrtices

    4. Abrimos una nueva ventana grfica, fijamos los ejes y utilizamos hold ya que tendre-mos que dibujar muchos objetos distintos:

    figureaxis([min(coor(:,1)),max(coor(:,1)),min(coor(:,2)),max(coor(:,2))])hold on

    5. Para dibujar todos los vrtices con marcadores realizamos un bucle y en cada iteracinmarcamos un punto:

    for k=1:Npplot(coor(k,1),coor(k,2),'rx','LineWidth',1);

    end

    Con esto deben quedar marcados los vrtices de la triangulacin. Comprubalo sal-vando y ejecutando el script.

    6. A continuacin leemos el fichero de triangulos.dat, tambin con load, y recupera-mos las dimensiones de la matriz tri, para saber el nmero de tringulos que hay:

    tri = load('triangulos.dat');[Nt,nc]=size(tri); % Nt es el nmero de tringulos

    7. Mediante un bucle desde k=1 hasta n=Nt, recorremos los tringulos y para cada unode ellos recuperamos los nmeros de sus tres vrtices, las coordenadas de sus tresvrtices y construimos una poligonal que los una

    for k=1:Nt

    p1=tri(k,1); %p2=tri(k,2); % los nmeros de los vrtices del tringulop3=tri(k,3); %

    x1 = coor(p1,1); % las coordenadas del vrtice nmero p1y1 = coor(p1,2); %

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  • 7. Operaciones de lectura y escritura con ficheros en MATLAB 15

    x2 = coor(p2,1); % las coordenadas del vrtice nmero p2y2 = coor(p2,2); %

    x3 = coor(p3,1); % las coordenadas del vrtice nmero p3y3 = coor(p3,2); %

    x=[x1,x2,x3,x1]; % abscisas de la linea a dibujar

    y=[y1,y2,y3,y1]; % ordenadas de la linea a dibujar

    plot(x,y,'b')

    end

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