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UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE NUEVO LEÓN FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS

LICENCIADO EN BIOTECNOLOGÍA GENÓMICA

PROGRAMA ANALÍTICO DE LA UNIDAD DE APRENDIZAJE: GENÓMICA FUNCIONAL

1. Datos de identificación: • Nombre de la institución y de la dependencia Universidad Autónoma de Nuevo León

Facultad de Ciencias Biológicas Licenciado en Biotecnología Genómica

• Nombre de la unidad de aprendizaje Genómica Funcional • Horas aula-teoría y/o práctica, totales 96 • Horas extra aula totales 24 • Modalidad Escolarizada • Tipo de periodo académico Semestre 7º • Tipo de Unidad de aprendizaje Obligatoria • Área Curricular ACFP • Créditos UANL 4 • Fecha de elaboración 4 de Noviembre del 2011 • Fecha de última actualización 25/11/15 • Responsable (s) del diseño: Dra. Elva Teresa Aréchiga Carvajal

M.C. Adriana Mayrel Martha Paz

2. Presentación: La genómica funcional es el estudio de la función del DNA, ya sea de genes o elementos no codificantes, ácidos nucleídos (RNA) y proteínas codificadas. Consiste en la recolección sistemática de información sobre la función de los genes, mediante la aplicación de aproximaciones experimentales globales, haciendo uso de la información y elementos de la genómica estructural. Se caracteriza por la combinación de metodologías experimentales a gran escala con estudios

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computacionales de los resultados, involucrando a su vez la alteración de la función del gen para investigar las consecuencias en la función del genoma u otros genes, permitiendo entender la relación entre el genotipo y el fenotipo.

3. Propósito(s) El propósito de esta Unidad de Aprendizaje es estudiar la función del genoma, genes o elementos no codificantes, ácidos nucleídos (RNA) y proteínas codificadas, los sistemas que permiten la activación o represión de los genes, proporcionando el conocimiento de metodologías experimentales a gran escala con estudios computacionales de los resultados, aplicando aproximaciones experimentales globales, haciendo uso de la información y elementos de la genómica estructural. Para cursar esta UA es necesario tener conocimientos previos adquiridos de la UA de Genómica Estructural sobre reglas que gobiernan la estructura de los genomas y la aplicación de metodologías para su análisis. El conocimiento adquirido en esta UA es básico para la UA de Proteómica, proporcionando el conocimiento básico sobre el funcionamiento del genoma y los mecanismo de expresión génica, las técnicas que permiten su análisis y los organismos usados, adquiriendo nuevos conocimientos sobre el funcionamiento del genoma, mediante la construcción de propuestas innovadoras basadas en la comprensión holística de la realidad para contribuir a superar los retos del ambiente global interdependiente. La presente UA permitirá el entendimiento de las consecuencias de la función del genoma, entendiendo la relación entre genotipo y el fenotipo, mediante el uso de protocolos de investigación de análisis de expresión génica y el desarrollo del pensamiento crítico del estudiante. Esta UA le proporciona al egresado las herramientas para desarrollar estrategias, metodologías y técnicas para analizar la expresión del genoma, para ser utilizados en los sectores salud, agrícola, pecuaria y ambiental, proporcionando servicios biotecnológicos y detección de organismos con fenotipos de interés.

4. Enunciar las competencias del perfil de egreso a. Competencias Generales a las que contribuye esta unidad de aprendizaje

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• Emplear pensamiento lógico, crítico, creativo y propositivo para analizar procesos biológicos, ecológicos y sociales que le permitan tomar decisiones pertinentes en su ámbito de influencia con responsabilidad.

• Intervenir frente a los retos de la sociedad contemporánea en lo local y global con actitud crítica y compromiso humano, académico y profesional para contribuir a consolidar el bienestar general y el desarrollo sustentable.

• Construir propuestas innovadoras basadas en la comprensión holística de la realidad para contribuir a superar los retos del ambiente global interdependiente

b. Competencias específicas del perfil de egreso a las que contribuye la unidad de aprendizaje

• Desarrollar diagnósticos moleculares, empleando conocimientos de la genómica y técnicas de manipulación de

genes, para ser utilizados en los sectores salud, agrícola, pecuario y ambiental • Diseñar estrategias de detección, modificación y selección de genomas, empleando conocimientos de la genómica y

técnicas de manipulación de genes, para el desarrollo de productos, procesos y servicios biotecnológicos de los sectores salud, agrícola, pecuario, industrial y ambiental.

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5. Representación gráfica:

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6. Estructuración en capítulos, etapas, o fases, de la unidad de aprendizaje Etapa 1 (1) Elementos de competencias.

Identificar factores relevantes en la expresión génica en la célula para definir su participación en los procesos biológicos.

Evidencias de aprendizaje

(2)

Criterios de desempeño

(3)

Actividades de aprendizaje

(4) Contenidos

(5) Recursos

(6) Exposición oral: sobre como funcionan los genomas y cambios en la actividad del genoma.

La exposición debe contar con: - Introducción

dando información general sobre el tema.

- Desarrollo: Explicará a fondo los sitios donde se lleva a cabo el proceso y los efectos de los mismos en la regulación de la expresión.

- Explicar un artículo Científico referente al tema, que sea de interés actual.

- Deberá presentar referencias en

-Encuadre de la unidad de aprendizaje. -Aplicación de examen diagnóstico. -Exposición por parte del maestro de los temas ¿Que estudia la genómica funcional? Y Dominios funcionales del genoma. -El alumno toma notas sobre explicación. -Elaboración de un mapa conceptual sobre los temas abordados por el maestro. -Se reparten los

1. FUNCIONAMIENTO DE LOS GENOMAS 1.1. ¿Que estudia la genómica funcional? 1.2. Dominios funcionales del genoma 1.3.1. Modificaciones de las histonas (Código de histonas). 1.3.2. Mecanismos de silenciamiento del genoma: Cromosoma X 2. CAMBIOS EN LA ACTIVIDAD DEL GENOMA 2.1. Respuesta celular a señales

Aula Equipo de Computo con acceso a red Artículos científicos Rúbrica

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cada diapositiva y agregar una sección de bibliografía al final de la presentación.

- La exposición deberá desarrollarse de manera clara, usando un lenguaje y terminología adecuados, con una duración máxima de 1 hora, los participantes deberán tener una presentación formal.

subtemas de los temas: modificaciones de las histonas (Código de histonas) y mecanismos de silenciamiento del genoma: Cromosoma X para su exposición por los alumnos en equipo. -Se investiga información actualizada sobre el tema a tratar. -Presentación de las clases por los estudiantes de acuerdo a los criterios de desempeño y rúbrica. -Se realizan preguntas intercaladas por el profesor hacia los estudiantes durante y después de la presentación. -Elaboración de un cuadro comparativo sobre los temas vistos durante las exposiciones.

externas 2.1.1 Transducción de señales

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-Exposición por parte del maestro de los subtemas del tema: Cambios en la actividad del genoma. -Elaboración de crucigrama de manera individual.

Reporte de Práctica de laboratorio sobre la Evaluación in silico de sitios de modificaciones postraduccionales de proteínas.

El reporte de laboratorio deberá contar con lo siguiente: - Metodología:

Describir paso a paso el procedimiento y los programas utilizados para el desarrollo de la práctica, incluyendo referencias y las ligas de los programas.

- Resultados: Deberá cumplir

- Explicación por parte del maestro de la práctica Evaluación in silico de sitios de modificaciones postraduccionales de proteínas. -El alumno toma notas. -Se realizan preguntas sobre dudas por parte del estudiante. - Elaboración de reporte sobre la práctica, de acuerdo a los criterios de desempeño y rúbrica.

Funcionamiento de los genomas y los cambios en la actividad del genoma. Predicción de modificaciones postraduccionales, efectos de las mismas en la expresión génica.

• Practicas Impresas. • Cañón

• Aula • Equipo de

Computo con acceso a la red

• Rúbrica BASES DE DATOS Y PROGRAMAS: • N.C.B.I (The

National Center for Biotechnology Information) http://www.ncbi.nlm.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

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con los requerimientos planteados en el manual utilizando diferentes bases de datos y programas bioinformáticos. Deberá comparar sus resultados.

- Discusión: Deberá comparar sus resultados con aquellos publicados en revistas científicas de años recientes.

- Conclusión: Deberá describir por puntos, de manera resumida y concreta los hallazgos obtenidos tras la realización de la práctica.

- Literatura Consultada: Deberá ser redactada en formaro APA,

-Retroalimentación por parte del maestro acerca de las áreas de oportunidad.

nih.gov/ • Raptor X

http://raptorx.uchicago.edu/ . Este programa ayuda en la predicción de estructura y función de proteínas.

• ExPASy http://www.expasy.org/proteomics/protein_structure .

• Abgent para encontrar posibles sitios de SUMOilación http://www.abgent.com/sumoplot

• http://www.expasy.org/proteomics/post-translational_modification

• http://cplm.biocuckoo.org/

• http://ptmfunc.com/

• http://pir.georgetown.edu/pro/


http://raptorx.uchicago.edu/


http://www.expasy.org/proteomics/protein_structure



http://www.abgent.com/sumoplot


http://www.expasy.org/proteomics/post-translational_modification




http://cplm.biocuckoo.org/


http://ptmfunc.com/

http://pir.georgetown.edu/pro/


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provenir de revistas de años recientes.

PPA1: reporte de selección de un gen de interés para la aplicación de la genómica funcional y análisis de las modificaciones que afectan su expresión.

Se realizará un reporte sobre la selección de un gen de interés para la aplicación de la genómica funcional y análisis de las modificaciones que afectan su expresión que debe contar con lo siguiente: -Introducción: Se presentará la información más reciente referente al gen seleccionado, la problemática a resolver y como afectan las modificaciones postraduccionales en la expresión del gen. - Metodología:

Deberá describir paso a paso el procedimiento y

-Explicación por parte del maestro del PPA1: reporte de selección de un gen de interés para la aplicación de la genómica funcional y análisis de las modificaciones que afectan su expresión. -El estudiante toma notas. -El estudiante pregunta sus dudas. -El alumno elabora un reporte cumpliendo con los criterios de desempeño y la rúbrica. -El maestro da retroalimentación sobre el reporte presentado por los estudiantes

Cómo funcionan los genomas y los cambios en la actividad del genoma.

• Cañón

• Aula • Equipo de

Computo con acceso a la red

• Rúbrica BASES DE DATOS Y PROGRAMAS: • N.C.B.I (The

National Center for Biotechnology Information) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

• Raptor X http://raptorx.uchicago.edu/ . Este programa ayuda en la predicción de estructura y función de proteínas.

• ExPASy http://www.expasy.org/proteomics/protein







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los programas utilizados para el desarrollo del reporte, incluyendo referencias y las ligas de los programas.

- Resultados: Deberá cumplir con los requerimientos planteados en el manual utilizando diferentes bases de datos y programas bioinformáticos. Deberá comparar sus resultados.

- Discusión: Deberá comparar sus resultados con resultados publicados en revistas científicas de años recientes.

- Conclusión: Deberá describir por puntos, de manera resumida

_structure . • Abgent para

encontrar posibles sitios de SUMOilación http://www.abgent.com/sumoplot



• http://ptmfunc.com/

• http://pir.georgetown.edu/pro/










http://ptmfunc.com/



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y concreta los hallazgos obtenidos tras la realización de la práctica.

-Literatura Consultada: Deberá ser redactada en formato APA, provenir de revistas de años recientes.

Primer examen parcial Contestar correctamente las cuestiones y desarrollar los planteamientos, tomando como base lo aprendido en clase.

El estudiante contesta diversos planteamientos hipotéticos y cuestiones emitidas por el Profesor.

Cómo funcionan los genomas y los cambios en la actividad del genoma.

Exámenes impresos Aula

Identificar las técnicas de detección de transcriptomas, organización de datos y detección de productos específicos para evaluar la expresión génica en las células.


(2)


(3)


(4)

Contenidos (5)

Recursos (6)

Exposición oral: Sobre reestructuración del genoma y productos de

La exposición debe contar con: - Introducción

-Encuadre del segundo parcial. -Exposición por parte

3. REESTRUCTURACIÓN DEL GENOMA

Aula

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expresión de los genomas.


Desarrollo: Explicará a fondo lo referente a los productos de la expresión de los genomas: transcriptoma y proteoma y Métodos de detección del transcriptoma.

- Explicar un

artículo Científico referente al tema, que sea de interés actual.

- Deberá presentar referencias en cada diapositiva y agregar una sección de bibliografía al final de la presentación.

- La exposición deberá desarrollarse de manera clara, usando un

del maestro de los subtemas del tema: Reestructuración del genoma. -El alumno toma notas sobre explicación. -El estudiante elabora un mapa conceptual sobre los temas abordados por el maestro. -Se reparten los subtemas de los temas: a) Productos de la expresión de los genomas: transcriptoma y proteoma. b) Métodos de detección del transcriptoma. -Se investiga información actualizada sobre el tema a tratar. -Presentación de las clases por los estudiantes de acuerdo

3.1. Reestructuración física del genoma 3.2.1 Eventos de conversión génica 3.2.2. Rearreglos permanentes del DNA (El caso de las Inmunoglobulinas) 4. PRODUCTOS DE LA EXPRESIÓN DE LOS GENOMAS: TRANSCRIPTOMA Y PROTEOMA 4.1. Como se construye el transcriptoma 4.2. Contenido de RNA de una célula 4.3. Caracterización de transcriptomas. 5. MÉTODOS DE DETECCIÓN DEL TRANSCRIPTOMA 5.1. Técnicas de detección de transcritos 5.2. Técnicas para el

Equipo de Computo con acceso a red Artículos científicos Rúbrica

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lenguaje y terminología adecuados, con una duración máxima de 1 hora, los participantes deberán tener una presentación formal.

a los criterios de desempeño y rúbrica. -Se realizan preguntas intercaladas por el profesor hacia los estudiantes durante y después de la presentación. -Elaboración de un cuadro comparativo sobre los temas vistos durante las exposiciones. -Exposición por parte del maestro de los subtemas del tema: Cambios en la actividad del genoma. -Elaboración de crucigrama de manera individual.

estudio de la expresión del genoma: 5.3. ¿Cómo se obtienen los Biomarcadores?

Portafolio de prácticas de laboratorio.

El portafolio debe contener las practicas sobre: A) Diseño de oligonucleótidos.

Explicación por parte del maestro de las prácticas: a) Diseño de oligonucleótidos y b) Análisis de regiones

Reestructuración del genoma y productos de expresión de los genomas.

• Cañón

• Aula

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B) Análisis de regiones reguladoras de genes. Se realizará un reporte de cada práctica y deben contar con lo siguiente: - Metodología:

Deberá describir paso a paso el procedimiento y los programas utilizados para el desarrollo de la práctica, incluyendo referencias y las ligas de los programas.

- Resultados: Deberá cumplir con los requerimientos planteados en el manual utilizando diferentes bases de datos y

reguladoras de genes. -El alumno toma notas. -Se realizan preguntas sobre dudas por parte del estudiante. - Elaboración de reportes individuales sobre cada práctica, de acuerdo a los criterios de desempeño y rúbrica. -Retroalimentación por parte del maestro acerca de las áreas de oportunidad.

• Equipo de Computo con acceso a la red

• Rúbrica Primer 3 plus: http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/primer3plus/primer3plus.cgi/ Oligoanalyzer: https://www.idtdna.com/calc/analyzer Oligocalc: http://www.basic.northwestern.edu/biotools/oligocalc.html Software opcional región promotora: http://www.gene-regulation.com/pub/programs.html http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/signalscan.html http://molbiol-tools.ca/Promoters.htm http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/

http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/primer3plus/primer3plus.cgi/




https://www.idtdna.com/calc/analyzer

https://www.idtdna.com/calc/analyzer

http://www.basic.northwestern.edu/biotools/oligocalc.html



http://www.gene-regulation.com/pub/programs.html



http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/signalscan.html


http://molbiol-tools.ca/Promoters.htm


http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/


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programas bioinformáticos. Deberá comparar sus resultados.



Literatura Consultada: Deberá ser redactada en formaro APA, provenir de revistas de años recientes.

http://mendel.cs.rhul.ac.uk/mendel.php?topic=fgen http://bioportal.weizmann.ac.il/toolbox/seq_analysis/promoters.html http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=bprom&group=programs&subgroup=gfindb http://www.yeastract.com/ http://www.athamap.de/ http://genome.ucsc.edu/

Región de adición de poliA: http://cub.comsats.edu.pk/polyapredict.htm http://www.imtech.res.in/raghava/polyapred/help.html http://dnafsminer.bic.nus.edu.sg/PolyA.html

PPA2: Análisis de los factores que afectan la expresión de genes.

Se realizará un reporte sobre el análisis de los

Explicación por parte del maestro del PPA2: Análisis de los factores

Reestructuración del genoma y productos de expresión de los

Software opcional región promotora: http://www.gene-

http://mendel.cs.rhul.ac.uk/mendel.php?topic=fgen



http://bioportal.weizmann.ac.il/toolbox/seq_analysis/promoters.html



http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=bprom&group=programs&subgroup=gfindb




http://www.yeastract.com/


http://www.athamap.de/

http://genome.ucsc.edu/

http://cub.comsats.edu.pk/polyapredict.htm


http://www.imtech.res.in/raghava/polyapred/help.html



http://dnafsminer.bic.nus.edu.sg/PolyA.html



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factores que afectan la expresión de genes que debe contar con lo siguiente: -Introducción: Se presentará la información más actualizada referente a factores que afectan la expresión de genes. - Metodología:

Deberá describir paso a paso el procedimiento y los programas utilizados para el desarrollo del reporte, incluyendo referencias y las ligas de los programas.

- Resultados: Deberá cumplir con los requerimientos planteados en el

que afectan la expresión de genes. -El estudiante toma notas. -El estudiante pregunta sus dudas. -El alumno elabora un reporte cumpliendo con los criterios de desempeño y la rúbrica. -El maestro da retroalimentación sobre el reporte presentado por los estudiantes

genomas.

regulation.com/pub/programs.html http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/signalscan.html http://molbiol-tools.ca/Promoters.htm http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ http://mendel.cs.rhul.ac.uk/mendel.php?topic=fgen http://bioportal.weizmann.ac.il/toolbox/seq_analysis/promoters.html http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=bprom&group=programs&subgroup=gfindb http://www.yeastract.com/ http://www.athamap.de/ http://genome.ucsc.edu/

Región de adición de poliA: http://cub.comsats.edu.pk/polyapredict.htm http://www.imtech.res.in/raghava/polyapred/help.html http://dnafsminer.bic.nus.edu.sg/PolyA.html





















http://www.athamap.de/

http://genome.ucsc.edu/








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manual utilizando diferentes bases de datos y programas bioinformáticos. Deberá comparar sus resultados.




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Segundo examen parcial

Contestar correctamente las cuestiones y desarrollar los planteamientos, tomando como base lo aprendido en clase.

El estudiante contesta diversos planteamientos hipotéticos y cuestiones emitidas por el Profesor.

Reestructuración del genoma y productos de expresión de los genomas.

Exámenes impresos Aula

Diseñar experimentos de expresión génica en organismos modelo para su aplicación en áreas de interés de la genómica funcional.


(2)


(3)


(4)

Contenidos (5)

Recursos (6)

Exposición oral: Organismos modelo para la genómica funcional y aplicaciones prácticas para la genómica funcional.

La exposición debe contar con: - Introducción:


Desarrollo: Explicará a fondo lo referente a Organismos modelo para la genómica funcional y Aplicaciones prácticas de la genómica funcional.

Encuadre del tercer parcial. -Exposición por parte del maestro del tema: Organismos modelo para la genómica funcional. -El alumno toma notas sobre explicación. -Se reparten los subtemas de los temas: Organismos modelo para la genómica

6. ORGANISMOS MODELO PARA LA GENÓMICA FUNCIONAL 6.1 Escherichia coli 6.1.1 Bacillus subtilis 6.2 Saccharomyces cerevisiae 6.2.1 Neurospora crassa 6.2.2 Ustilago maydis

Aula Equipo de Computo con acceso a red Artículos científicos Rúbrica

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- Explicar un artículo científico referente al tema, que sea de interés actual.

- Deberá presentar referencias en cada diapositiva y agregar una sección de bibliografía al final de la presentación.

- La exposición

deberá desarrollarse de manera clara, usando un lenguaje y terminología adecuados, con una duración máxima de 1 hora, los participantes deberán tener una presentación formal.

funcional y Aplicaciones prácticas de la genómica funcional. -Se investiga información actualizada sobre el tema a tratar. -Presentación de las clases por los estudiantes de acuerdo a los criterios de desempeño y rúbrica. -Se realizan preguntas intercaladas por el profesor hacia los estudiantes durante y después de la presentación. -Elaboración de un mapa conceptual sobre los temas vistos durante las exposiciones. -Exposición por parte del maestro del tema predicción funcional. -Elaboración de

6.3 Arabidopsis thaliana

6.3.1 Zea mays 6.4 Caenorhabditis elegans 6.5 Drosophila melanogaster

6.6 Danio rerio 6.7 Mus musculus 7. APLICACIONES PRÁCTICAS DE LA GENÓMICA FUNCIONAL 7.1. Biomedicina 7.2. Medio ambiente. 7.3. Predicción funcional.

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crucigrama de manera individual.

PIA

Reporte de la demostración de la expresión genética y función de proteínas en un organismo modelo, aplicable en alguna área de interés.

El alumno integrará los productos parciales del aprendizaje con las correcciones adecuadas y complementará con Diseño de experimentos de expresión génica en organismos modelo para su aplicación en áreas de interés. El reporte deberá incluir: -Introducción: Se presentará la información más actualizada referente al gen seleccionado, área de aplicación, organismo modelo, problemática a resolver, etc. No deberá exceder de 2 cuartillas.

Explicación por parte del maestro del PIA: Reporte de la demostración de la expresión genética y función de proteínas en un organismo modelo, aplicable en alguna área de interés. -El estudiante toma notas. -El estudiante pregunta sus dudas. -El alumno elabora un reporte cumpliendo con los criterios de desempeño y la rúbrica. -El maestro da retroalimentación sobre el reporte presentado por los estudiantes

Organismos modelo para la genómica funcional y aplicaciones prácticas para la genómica funcional.

Aula Equipo de Computo con acceso a red Artículos científicos Rúbrica BASES DE DATOS Y PROGRAMAS: • N.C.B.I (The

National Center for Biotechnology Information) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

• Raptor X http://raptorx.uchicago.edu/ . Este programa ayuda en la predicción de estructura y función de proteínas.

• ExPASy http://www.expasy.or






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- Metodología:

Deberá describir paso a paso el procedimiento y los programas utilizados para el desarrollo del reporte, incluyendo referencias y las ligas de los programas.

- Resultados: Deberá cumplir con los requerimientos planteados en el manual utilizando diferentes bases de datos y programas bioinformáticos. Deberá comparar sus resultados.

- Discusión: Deberá comparar sus resultados con resultados publicados en

g/proteomics/protein_structure .

• Abgent para encontrar posibles sitios de SUMOilación http://www.abgent.com/sumoplot



• http://ptmfunc.com/ http://pir.georgetown.edu

/pro/











http://ptmfunc.com/



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revistas científicas de años recientes.



Tercer examen parcial

Contestar correctamente las

cuestiones y desarrollar los

planteamientos, tomando como base

lo aprendido en clase.

El estudiante contesta diversos planteamientos hipotéticos y cuestiones emitidas por el Profesor

Organismos modelo para la genómica funcional y aplicaciones prácticas para la genómica funcional.

Exámenes impresos

Aula

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7. Evaluación integral de procesos y productos (ponderación / evaluación sumativa).

Valor % Evidencia 1 prese Evidencia 2 prac Evidencia 5 prese Evidencia 6 prac

3% 5% 3% 8%

Evidencia 7 prac 5% Evidencia 10 3% Primer examen parcial Segundo examen parcial Tercer examen parcial

15% 15% 10%

Producto parcial del aprendizaje 1 Producto parcial del aprendizaje 2 Producto Integrador del aprendizaje

10% 10% 13%

Total 100%

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8. Producto integrador del aprendizaje de la unidad de aprendizaje (señalado en el programa sintético). Elaborar un reporte que aborde un tema de interés actual, donde se diseñen estrategias para la caracterización y detección de la expresión de genes mediante el uso de organismos modelo, siendo aplicable en alguna área de interés de la genómica funcional. Proporcionando una recopilación bibliográfica para entender la problemática y la razón de la búsqueda de solución, los puntos clave para lograr una solución del problema y sugerir una metodología que nos permita lograr nuestro objetivo. 9. Fuentes de apoyo y consulta (bibliografía, hemerografía, fuentes electrónicas). http://www.bioinformatics.nl/cgi-bin/primer3plus/primer3plus.cgi/ https://www.idtdna.com/calc/analyzer http://www.basic.northwestern.edu/biotools/oligocalc.html http://www.gene-regulation.com/pub/programs.html http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/signalscan.html http://molbiol-tools.ca/Promoters.htm http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ http://mendel.cs.rhul.ac.uk/mendel.php?topic=fgen http://bioportal.weizmann.ac.il/toolbox/seq_analysis/promoters.html http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=bprom&group=programs&subgroup=gfindb http://www.yeastract.com/ http://www.athamap.de/ http://genome.ucsc.edu/

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http://cub.comsats.edu.pk/polyapredict.htm http://www.imtech.res.in/raghava/polyapred/help.html http://dnafsminer.bic.nus.edu.sg/PolyA.html http://www.gene-regulation.com/pub/programs.html http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/signalscan.html http://molbiol-tools.ca/Promoters.htm http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ http://mendel.cs.rhul.ac.uk/mendel.php?topic=fgen http://bioportal.weizmann.ac.il/toolbox/seq_analysis/promoters.html http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=bprom&group=programs&subgroup=gfindb http://www.yeastract.com/ http://www.athamap.de/ http://genome.ucsc.edu/ http://raptorx.uchicago.edu/ http://www.expasy.org/proteomics/protein_structure . http://www.abgent.com/sumoplot http://www.expasy.org/proteomics/post-translational_modification http://cplm.biocuckoo.org/ http://ptmfunc.com/ http://pir.georgetown.edu/pro/ http://www.mbio.ncsu.edu/BioEdit/bioedit.html http://emu.imb.uq.edu.au/genomes.php http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ http://www.ensembl.org/index.html http://www.genome.jp/kegg/ http://www.gene-regulation.com/pub/databases.html

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Brown, T. A. Genomes.2002. 2nd Edition. Garland Science. Saccone C., Pesole G. Handbook of Comparative genomics: Principles and Methodology. Wiley-Liss, Inc. NY. 2003 Koonin, V. and Michael Y. Galperin. 2003. Sequence-Evolution-Function: Computational approaches in comparative genomics. Kluwer academic publishers. Hwan-Sung, C., Jong-Ho. P. and Young-Joon Kim. 2007. Rev. Epigenomics: A novel Aspect of Genomic Regulation. Journal of Biochemistry and Molecular Biology. 40: 151-155. Foos, L. Eryuksel, E., and M. H. Brutsche. 2003. Minireview. Functional genomics and gene microarrays, the use in research and clinical medicine. Swiss Med WKLY. 133: 31-38. Broeckel, U., Maresso, K., and Kugathasan, S. 2006. Functional Genomics and its Implications for Molecular Medicine. Pediatr. Clin. N. Am. 53. 807-816. Narry Kim, V. 2003. Review. RNA interference in Functional Genomics and Medicine. J. Korean Med. Sci. 18: 309-318. Callinan, P. A. and Andrew P. Feinberg. 2006. The emerging science of epigenomics. Human Molecular Genetics. 15: R95- R101 Lesk A.M. 2006. Introduction to bioinformatics. 2nd edition. Oxford. Pp 329-339 Lesk A.M. 2007. Introduction to genomics. Oxford. Pp 14, 57 Pevsner J. 2009. Bioinformatics and Functional Genomics. Wiley-Blackwell. Pp 461

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