hitos de la vida - aragosaurus

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Hitos de la vida II En la tierra o en el espacio: protobiontes y desde las primeras células a los organismos pluricelulares

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Page 1: Hitos de la vida - Aragosaurus

Hitos de la vida II En la tierra o en el espacio: protobiontes y

desde las primeras células a los

organismos pluricelulares

Page 2: Hitos de la vida - Aragosaurus

¿Qué había antes del ancestro común a todos los entes vivos? HII

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra I 2 LUCA

Page 3: Hitos de la vida - Aragosaurus

Un tronco único O Las secuencias de ADN de los organismos modernos permiten reconstruir el

árbol de la vida y averiguar las características probables del ancestro común

más reciente de todos los seres vivos - el "tronco" del árbol de la vida.

O Según algunas hipótesis, este "ancestro común más reciente" puede ser en

realidad un conjunto de organismos que vivieron al mismo tiempo y fueron

capaces de intercambiar genes con facilidad.

O La reconstrucción de las primeras ramas en el árbol de la vida nos dice que

este antepasado, o conjunto de antepasados, probablemente utiliza ácidos

nucleicos, especialmente ARN como material genético y realiza reacciones

químicas complejas (HII).

O Pero, ¿qué había antes de él? Sabemos que este último ancestro común

debe haber tenido antepasados - una larga línea de antepasados que forman

la raíz del árbol de la vida –

O Para saber, tenemos que recurrir a otras líneas de evidencia. Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra I 3

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Page 7: Hitos de la vida - Aragosaurus
Page 8: Hitos de la vida - Aragosaurus

Autocatálisis en micelas

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 8

NATURE COMMUNICATIONS

Physical autocatalysis driven

by a bond-forming thiol–ene

reaction

Andrew J. Bissette,

Barbara Odell

& Stephen P. Fletcher

Affiliations

Contributions

Corresponding author

Nature

Communications 5, Article

number: 4607 doi:10.1038/n

comms5607Received 22

March 2014 Accepted 07 July

2014 Published 02 September

2014

Page 9: Hitos de la vida - Aragosaurus

Procesos necesarios para la abiogénesis en la Tierra

Finalmente, se produce el

empaquetamiento de las moléculas

en membranas, con una química

interna diferente de la de los

alrededores.

La formación de membranas cerradas

es un paso importante. Como hemos visto las vesículas o micelas

de membranas cerrada se forman

expontáneamente por lo lípidos.

Esto permite la diferenciación entre un

medio interno y otro interno.

htt

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xplo

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Page 10: Hitos de la vida - Aragosaurus

La formación de protocélulas

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 10

Ricard V Solé et al. Phil. Trans. R. Soc. B 2007;362:1727-1739.

©2007 by The Royal Society

No-replicante Replicante sin evol. Cel. evoluciona

Acell: célula artificial

Page 11: Hitos de la vida - Aragosaurus

La formación de protocélulas

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 11

Ricard V Solé et al. Phil. Trans. R. Soc. B 2007;362:1727-1739.

©2007 by The Royal Society

Von Neumann (1966) y la

máquina autoreplicante.

La lógica de la máquina de

Neumann: parecida a la de las

células vivas.

Page 12: Hitos de la vida - Aragosaurus

¿Estamos ya en presencia de los Protobiontes?

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 12 protobiontes

Page 13: Hitos de la vida - Aragosaurus

Moléculas autoreplicantes

O En la célula actual el DNA se puede replicar, pero necesita la ayuda de las enzimas (proteinas) para lograrlo.

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 13

Page 14: Hitos de la vida - Aragosaurus

Moléculas autoreplicantes O En la célula actual el DNA se puede replicar, pero necesita la ayuda de las enzimas (proteinas) para lograrlo.

O Las proteinas se ensamblan sobre la base de

información del ADN, que transcribe el ARN.

O pero..... ¿qué fué primero?

O el DNA para hacer proteinas?

O o las proteins para hacer DNA?!?!?!?!?

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 14

Page 15: Hitos de la vida - Aragosaurus

Moléculas autoreplicantes

O La síntesis de DNA y RNA requiere proteinas.

O Por tanto

O Las proteinas no pueden sintetizarse sin

acidos nucleicos y …

O Los acidos nucleicos no sin proteinas

O !Falso!

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 15

Page 16: Hitos de la vida - Aragosaurus

Moléculas autoreplicantes

O Hemos visto la síntesis de nucleótidos y sus bases se polimerizan para formar ácido ribonucleico (RNA).

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 16

Page 17: Hitos de la vida - Aragosaurus

Moléculas autoreplicantes O Hemos visto la síntesis de nucleótidos y sus bases se

polimerizan para formar ácido ribonucleico (RNA).

O Así puede formarse una

hebra de RNA

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 17

Nucleótidos del ARN: Adenina, Guanina, Citosina y Uracilo

Page 18: Hitos de la vida - Aragosaurus

Moléculas autoreplicantes

O La hebra de RNA

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 18

Page 19: Hitos de la vida - Aragosaurus
Page 20: Hitos de la vida - Aragosaurus

Procesos necesarios para la abiogénesis en la Tierra

El origen de las moléculas autoreplicantes

permite la herencia.

• El ADN (DNA) no puede autoreplicarse,

necesita enzimas proteicas.

• Sin embargo, algunos ARN puede auto-

replicarse, pueden catalizar la

formación de copias de sí mismo.

• Se llaman ribozimas y son la base de la

RNA World Hypothesis

Origen y evidencia experimental

Page 21: Hitos de la vida - Aragosaurus
Page 22: Hitos de la vida - Aragosaurus
Page 23: Hitos de la vida - Aragosaurus

Origen de la vida

compleja: los

eucariotas

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 23

Transferencia genética horizontal

(Horizontal gene transfer).

Común entre las bacterias

En los últimos 10 años se ha visto que

también ha ocurrido en los eucariotas

Page 24: Hitos de la vida - Aragosaurus

moléculas fósiles en el tiempo geológico I

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II

24

Page 25: Hitos de la vida - Aragosaurus

moléculas fósiles en el tiempo geológico

II

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II

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Page 26: Hitos de la vida - Aragosaurus

Fungi

EUKARYA

Trypanosomes

Green algae Land plants

Red algae

Forams Ciliates

Dinoflagellates

Diatoms

Animals

Amoebas Cellular slime molds

Leishmania

Euglena

Green nonsulfur bacteria

Thermophiles

Halophiles

Methanobacterium

Sulfolobus

ARCHAEA

COMMON ANCESTOR

OF ALL LIFE

BACTERIA

(Plastids, including chloroplasts)

Green sulfur bacteria

(Mitochondrion)

Cyanobacteria

Chlamydia

Spirochetes

Tree of life

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 26

Page 27: Hitos de la vida - Aragosaurus

Fig. 26-23

Archaea Bacteria

Eukarya

The End

Ring of life

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 27

Page 28: Hitos de la vida - Aragosaurus

Origen de las células

La idea esencial es que hay una

cadena contínua desde las primeras

células a los organismos actuales.

Células fósiles del Precámbrico.

Presentan los mismos principios básicos

http://rstb.royalsocietypublishing.org/content/361/1470/1023/F3.large.jpg

Chris Paine

https://bioknowledgy.weebly.com/

Page 31: Hitos de la vida - Aragosaurus
Page 32: Hitos de la vida - Aragosaurus
Page 34: Hitos de la vida - Aragosaurus

The origin of eukaryotic cells can be explained by the endosymbiotic theory.

Development of the Nucleus

• A prokaryote grows in size and develops folds in it’s membrane to

maintain an efficient SA:Vol

• The infoldings are pinched off forming an internal membrane

• The nucleoid region is enclosed in the internal membrane and hence

becomes the nucelus

http://ib.bioninja.com.au/options/option-d-evolution-2/d1-origins-of-life-on-earth.html

Page 35: Hitos de la vida - Aragosaurus

The origin of eukaryotic cells can be explained by the endosymbiotic theory.

http://ib.bioninja.com.au/options/option-d-evolution-2/d1-origins-of-life-on-earth.html

* An endosymbiont

is a cell which

lives inside

another cell with

mutual benefit

Development of Mitochondria

• An aerobic proteobacterium enters a larger anaerobic prokaryote (possibly as prey or a

parasite)

• It survives digestion to become a valuable endosymbiont*

• The aerobic proteobacterium provides a rich source of ATP to it’s host enabling it to

out-compete other anaerobic prokaryotes

• As the host cell grows and divides so does the aerobic proteobacterium therefore

subsequent generations automatically contain aerobic proteobacterium.

• The aerobic proteobacterium evolves and is assimilated and to become a

mitochondrion.

The development of chloroplasts would be a

very similar process except the benefit to the

cell would be glucose/starch instead of ATP

Page 36: Hitos de la vida - Aragosaurus

1.5.U3 The origin of eukaryotic cells can be explained by the endosymbiotic theory.

The evidence supporting the endosymbiotic

theory for mitochondria and chloroplasts:

• They have their own DNA (which is naked and

circular)

• They have ribosomes that are similar to

prokaryotes (70S)

• They have a double membrane and the inner

membrane has proteins similar to prokaryotes

• They are roughly the same size as bacteria

and are susceptible to the antibiotic

chloramphenicol

• They transcribe their DNA and use the mRNA

to synthesize some of their own proteins.

• They can only be produced by division of pre-

existing mitochondria and chloroplasts.

http://sites.roosevelt.edu/mbryson/files/2011/11/endosymbiosis.jpg

Page 37: Hitos de la vida - Aragosaurus

Metabolismo de la vida primitiva

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II

37 En web de David Castro: Goldman, Aaron David, Baross, John, &

Samudrala, Ram (2012). The Enzymatic and Metabolic Capabilities

of Early Life PLOS ONE DOI: 10.1371/journal.pone.0039912

Page 38: Hitos de la vida - Aragosaurus

Catálisis

O Acelerar las reacciones químicas utilizando

catalizadores

O Homogénea, heterogénea

O Catalizadores biológicos llamados:

O Enzimas

O Las enzimas, al contrario que los

catalizadores químicos, son muy

específicas.

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 38

Page 39: Hitos de la vida - Aragosaurus

Principales eventos en la historia de la vida en la tierra O Life arose from nonlife about 4 billion years ago by means of

chemical evolution. Review Figure 1.3

O Biological evolution began about 3.8 billion years ago when interacting systems of molecules became enclosed in membranes to form cells.

O Photosynthetic prokaryotes released large amounts of oxygen into Earth's atmosphere, making aerobic metabolism possible.

O Complex eukaryotic cells evolved by incorporation of smaller cells that survived being ingested.

O Multicellular organisms appeared when cells evolved the ability to transform themselves and to stick together and communicate after they divided. The individual cells of multicellular organisms became modified to carry out varied functions within the organism.

O The evolution of sex sped up rates of biological evolution.

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 39

Page 40: Hitos de la vida - Aragosaurus

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 40

Page 41: Hitos de la vida - Aragosaurus

BIG BANG

Cosmic dust and gases+ H2O

Oceans

Haldane soup

Reducing atmosphere(gases like

CH4,NH3,N2,CO2,H2O responsible for

abiotic synthesis of organic compounds) Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 41

Page 42: Hitos de la vida - Aragosaurus

OPARIN-HALDANE THEORY Haldane Soup

Simple Molecules

Complex Molecules (building blocks)

Aggregates (coacervates and microspheres)

Protocells( proprimitive stage before formation of true cell

Proto cells + nucleic acid = self replicating system

“CELL”

Microsphere

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 42

Page 43: Hitos de la vida - Aragosaurus

ENERGY YIELDING SYSTEM

O “Cell” Energy Yielding System

• Chlorophyll development Photosynthesis

O2 evolved

Ozone Formation (shielding effect)

• Atmosphere changed to oxidizing from reducing.

• Evolution of photosynthesis which is followed by

respiration. Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 43

Page 44: Hitos de la vida - Aragosaurus

CELL

Replication Metabolism Homeostasis

Anaerobes Aerobes

Chemotrophs Heterotrophs

Chemoheterotrophs Chemoautotrophs

Prokaryotic Cells Eukaryotic cell Endosymbiotic Theory Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 44

Page 45: Hitos de la vida - Aragosaurus

How Eukaryotic Cell Changed to

Multicellular Organism….

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 45

Page 47: Hitos de la vida - Aragosaurus

La complejidad de los organismos

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 47

Medida en función de la longitud del ADN (DNA) funcional, no redundante, por genoma, contado como pares

de bases de los nucleotidos (bp). Aumenta linearmente con el tiempo (Sharov, 2012, Sharov & Gordon, 2013).

Origen de la Tierra Presente

Page 48: Hitos de la vida - Aragosaurus

Photograph from National Geographic magazine

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 48

Page 49: Hitos de la vida - Aragosaurus

Deep-sea Vents

O Their discovery in late 1970’s stretched our

concept of the origin of life on earth.

O Can life exist and that too thousands of

meters beneath the surface of sea in absence

of sunlight?

O It raised the possibility that earlier vents

supplied the energy and chemical

precursors for origin of protobionts.

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 49

Page 50: Hitos de la vida - Aragosaurus

Exploring the deep ocean floor

View of the first high-

temperature vent

(380°C) ever seen by

scientists during a dive

of the deep-sea

submersible Alvin in

1979.

Such geothermal vents

are called smokers. This photograph shows a black smoker, but

smokers can also be white, grey, or clear

depending on the material being ejected.

Photograph by Dudley Foster from RISE

expedition

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 50

Page 51: Hitos de la vida - Aragosaurus

Vent Community

A vent community in its prime: Pale pink eelpout fish and white

brachyuran crabs swim and scuttle among blood-red tube worms

large and small. Scientists are still trying to figure out how the

offspring of such organisms disperse over long stretches of

inhospitable seafloor to colonize widely separated vent systems.

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 51

Page 52: Hitos de la vida - Aragosaurus

Giant Clams

The size of deep-sea giant clams is evident from the

hands of a scientist holding them.

(Photograph by William R. Normark, USGS.)

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 52

Page 53: Hitos de la vida - Aragosaurus

Giant Tube Worms: RIFTIA

O On the bottom of the

ocean around deep-

sea hydrothermal

vents, there is a

profusion of life that

thrives on the

hydrogen sulfide

(H2S) gas released

from the vents.and

live inside hard,

shell-like protective

tubes that attach to

the rocks.

Giant tubeworms that live around hydrothermal vents

on the sea floor. These creatures are about the size of

your hand in shallower waters, but in the ocean's deep

they have been found as big as eight feet long!

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 53

Page 54: Hitos de la vida - Aragosaurus

Biomoléculas

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 54

Page 56: Hitos de la vida - Aragosaurus

Hitos de la vida III

Master Geologia P&DB 60433 Hitos vida tierra II 56

https://twitter.com/museucoa