h olistic specimens

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Colección Holística de Especímenes de Mamíferos (parásitos, tejidos, informática) para Integrar Estudios de Biodiversidad con Salud Pública: Curso teórico, práctico en campo y laboratorio Instructores: Joseph Cook, Jonathan Dunnum, Mariel Campbell – University of New Mexico Ma. Alejandra Camacho – AEM / PUCE, Quito Martes 24 y miércoles 25 de Septiembre, 8:00– 17:00 h – Museo de Zoología, PUCE Jueves 26 a sábado 28 de Septiembre, Reserva y Estación Científica Mashpi Estudiantes - $75.00 Profesionales Miembros AEM - $100.00 Profesionales no miembros - $120.00 El curso corto está diseñado para abarcar cinco días completos (8-12 horas diarias) para abordar el tema del muestreo holístico de mamíferos salvajes con técnicas modernas y detalle suficiente para dar a los participantes una base sólida en estos métodos. Los instructores del taller tienen una amplia experiencia en museos, mastozoología de campo, laboratorio y parasitología. Holistic Specimens Field notes, ecological data Ecto & endo parasites Ultrafrozen tissues Georeferences & GIS Virus isolates Genetic data Karyotypes Stable Isotopes MicroCT-scans Incluye materiales, hospedaje, alimentación en la EC Mashpi y transporte (cupos limitados)

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Page 1: H olistic Specimens

Colección Holística de Especímenes de Mamíferos (parásitos,

tejidos, informática) para Integrar Estudios de Biodiversidad con

Salud Pública: Curso teórico, práctico en campo y laboratorio

Instructores:

Joseph Cook, Jonathan Dunnum, Mariel Campbell – University of New Mexico

Ma. Alejandra Camacho – AEM / PUCE, Quito

Martes 24 y miércoles 25 de Septiembre, 8:00– 17:00 h – Museo de Zoología, PUCE

Jueves 26 a sábado 28 de Septiembre, Reserva y Estación Científica Mashpi

Estudiantes - $75.00

Profesionales Miembros AEM - $100.00

Profesionales no miembros - $120.00

El curso corto está diseñado para abarcar cinco días completos (8-12 horas diarias) para abordar

el tema del muestreo holístico de mamíferos salvajes con técnicas modernas y detalle suficiente

para dar a los participantes una base sólida en estos métodos.

Los instructores del taller tienen una amplia experiencia en museos, mastozoología de campo,

laboratorio y parasitología.

Holistic Specimens

Field notes, ecological data

Ecto & endo

parasites

Ultrafrozen tissues

Georeferences

& GIS

Virus isolates

Genetic data

Karyotypes

Stable Isotopes

MicroCT-scans

Incluye materiales, hospedaje, alimentación en

la EC Mashpi y transporte (cupos limitados)

Page 2: H olistic Specimens

Contenidos del curso

Las colecciones de historia natural y los bio-repositorios congelados asociados son activos

sumamente importantes para la investigación en biología de patógenos. Desarrollado

originalmente para estudios centrados en la historia natural y el descubrimiento de la

biodiversidad, los avances en las técnicas de preservación de campo (tejidos ultracongelados),

georreferenciación y tecnologías de laboratorio (p. ej. genómica, virómica, ecología química de

isótopos estables) ahora aprovechan la cobertura taxonómica, temporal y espacial representado

por la infraestructura de colecciones de museos.

Los nuevos enfoques permiten la evaluación crítica de importantes problemáticas sociales,

especialmente las relacionadas con la salud pública (por ejemplo, los patógenos emergentes) y

la pérdida de biodiversidad debido a las condiciones ambientales cambiantes. Al mismo tiempo,

la digitalización de muestras ha movilizado rápidamente este recurso de biodiversidad para

estudios bioinformáticos que van desde datos a nivel del genoma hasta evaluaciones espaciales

a gran escala basadas en SIG destinadas a comprender cómo las condiciones ambientales

cambiantes han remodelado las comunidades, las distribuciones de especies y la aparición de

patógenos. Existen oportunidades significativas, pero los desafíos también permanecen para

integrar y explotar completamente este recurso por parte de las agencias de salud pública.

Los mamíferos salvajes albergan una gran diversidad de parásitos y patógenos asociados. A través

de la investigación interdisciplinaria integrada, ahora se revela la complejidad inherente de la

dinámica ecológica y evolutiva dentro de las comunidades interrelacionadas. La recolección

moderna de mamíferos en el campo incluye una variedad de técnicas para capturar datos y

extraer diversas muestras que pueden proporcionar perspectivas más holísticas o integradas de

la biodiversidad y los patógenos zoonóticos asociados. Este taller resumirá un área importante

de investigación de parásitos de mamíferos, proporcionará experiencia práctica con protocolos

de muestreo de campo y capacitará a los participantes en la preservación adecuada a largo plazo

de parásitos y en métodos de identificación para los principales grupos de parásitos.

A los participantes se les enseñarán métodos que han sido refinados por mastozoólogos y

parasitólogos para maximizar la eficiencia en el campo y asegurar la curación de muestras de alta

calidad y datos asociados. Este taller sobre muestreo integrado de biodiversidad debería ser de

interés para muchos biólogos, virólogos e investigadores de salud pública a través de

capacitación en informática basada en muestras, muestreo de campo y técnicas de necropsia que

pueden incorporarse de inmediato en programas de investigación activos.

Page 3: H olistic Specimens

Diagrama de flujo para la necropsia de pequeños mamíferos.

a. se asigna un identificador único al mamífero inmediatamente después de la captura;

b. el mamífero es barrido en búsqueda de ectoparásitos;

c. se toman mediciones estándar;

d. se registran datos reproductivos;

e. se transfiere el tracto gastrointestinal;

f. la cavidad corporal y los órganos (p. ej., hígado) se inspeccionan en busca de parásitos

(como meta-cestodos, nematodos, sarcosistas enquistados);

g. los tejidos del huésped se recogen y conservan;

h. se obtiene un frotis sanguíneo;

i. las secciones principales del tracto gastrointestinal se separan (estómago, intestino

delgado, intestino grueso) y se abren longitudinalmente;

j. el revestimiento se raspa para revelar helmintos;

k. después de transferir los helmintos a una nueva caja petri, los trematodos y los cestodos

se lavan con solución salina o agua;

l. los acantocéfalos se sumergen hasta que la trompa se extiende y el gusano muera;

m. los nematodos se lavan con solución salina;

n. los trematodos y cestodos se procesan;

o. los nematodos se matan usando solución salina caliente;

p. los helmintos se conservan en etanol;

q. los sedimentos fecales se recogen del colon y se almacenan en una solución de dicromato

de potasio para tomar muestras de coccidios (q).

Page 4: H olistic Specimens

MASHPI LODGE

DEPARTAMENTO DE INVESTIGACIÓN Y BIOLOGÍA

Infraestructura para Investigación y Capacitación

Casa de Biólogos Laboratorio (compartido con staff Mashpi Lodge)

[3 cuartos compartidos, 2 baños completos c/agua caliente, [área de trabajo, microscopios, terrarios, cuarto

balcón con mesas de trabajo, generador eléctrico (4 hs/día)] seco, bodega, refrigerador, wifi 24-horas, A/C]

Casa de Biólogos – cuartos compartidos

Cama ancha (1.10 mts) x 4 Cama pequeña (0.90 mts) x 8

La “Casa de Biólogos” se encuentra dentro de la Reserva Mashpi a 1 km del lodge (es posible llegar en vehículo,

pero en horarios asignados). La capacidad es para 12 personas. Cuenta con servicio de limpieza diario. El uso del

generador de luz es limitado, por lo que se debe descartar el trabajar con equipos electrónicos en esa área.

Los asistentes recibirán las tres comidas del día, además de coffee break y agua potable ilimitada. El menú de

alimentación es sencillo, se servirá en el comedor de personal en horario exclusivo para los asistentes al curso.

De acuerdo a la programación del curso, y de la ocupación de los senderos por los huéspedes del lodge, se

determinarán los sitios y horarios de caminatas en la Reserva.

Los asistentes no podrán ingresar al lodge ni hacer uso de sus servicios.