generalidades y ecología bacteriana

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  • 7/23/2019 Generalidades y Ecologa Bacteriana

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    Generalidades y ecologa bacteriana

    Para tener una idea de la

    importancia de las bacterias les

    muestro esta diapositiva de unsimposio de la sociedad

    americana de microbiologa en

    donde hay un contraste entre

    microorganismos y seres

    humanos. En cantidad sobre la

    Tierra nos superan en 10^22

    veces, en masa tambin nos

    superan en 10^8 veces, el

    tiempo de generacin de una

    bacteria es de 30 minutos

    mientras que el de los seres

    humanos es como de 30 aos,mientras ellos se dividen 500 mil veces nosotros lo hacemos solo una vez. Y sobretodo

    el tiempo en la Tierra, nosotros solo hace 4 millones de aos que estamos, los

    microorganismos hace 3.500 millones de aos.

    Esta diapositiva me gusto porque

    hace realce en la importancia de los

    microorganismos. Ellos fueron los

    pioneros, los que crearon la

    atmsfera respirable, los ocanos, los

    ciclos de vida de los ocanos, la

    mayor biodiversidad existe a nivel de

    los microorganismos. En nuestro

    cuerpo humano tenemos ms

    microorganismos que clulas

    humanas y no solo son dainos, sino que tambin nos ayudan a metabolizar los

    alimentos, sintetizar vitaminas, y sobretodo permiten entender la esencia de la evolucin

    de la vida, un aspecto ms filosfico.

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    Los seres vivos al principio se

    dividieron en 5 reinos en una

    clasificacin muy antigua: animal,

    planta, hongo, protista (donde estn

    los protozoos) y monera (donde

    estaban las bacterias; pero despus

    esa definicin qued obsoleta y sedividieron en 6 reinos, el reino

    monera se dividi en 2: eubacterias

    y archaebacterias (dos tipos de

    bacterias). Y la ltima clasificacin

    fue hecha en 1990 en base al RNA

    ribosomal, y bajo esa clasificacin

    se definieron 3 dominios: eucarya,

    que son todos los animales superiores y las plantas; el reino bacteria y el reino archaea.

    Las bacterias son las bacterias que conocemos normalmente, las que son de importancia

    clnica; y las archaea son las que habitan en ambientes extremos, las que viven en los

    giseres, a alta profundidad en el mar, etc.

    Esto hace que nosotros

    definamos dos tipos de

    clulas, el dominio eucarya

    est formado por clulas

    eucariotas, son las que tienen

    organelos separados por

    membranas, siendo esto lo

    que las define. Y el dominio

    bacteria est formado por

    procariotas, que son clulas

    sencillas que no tienen

    organelos separados pormembranas (orgnulos o

    estructuras supramoleculares).

    Ac estn las caractersticas de los tres dominios: el dominio eucarya que agrupa los 4

    reinos de animales superiores, plantas, hongos y protozoos. Las bacterias que son

    procariotas y que adems de no tener organelos, otras caractersticas morfolgicas que

    las definen, como que tienen membranas compuestas de cidos grasos no ramificados;

    incluye a las bacterias que ya les contaba, micoplasmas, cianobacterias, gram positivas,

    gram negativas. Y las archaeas que tienen membranas compuestas por compuestos que

    no son cidos grasos, sino que son derivados del isopreno, la pared celular no tiene

    proteoglicanos como tienen la de las bacterias, y tienen esta estructura justamente

    debido a que tienen que vivir en ambientes extremos.

    Ahora vamos a ver que tipos de clulas existen y que tipos de estructuras celulares se

    conocen.

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    La clula procariota tiene su

    DNA circular mientras que

    la clula eucariota tiene un

    DNA lineal. Los organelos

    eucariotas la teora

    endosimbitica dice que

    fueron bacterias fagocitadaspor otras clulas y pasaron a

    formar parte de una

    simbiosis donde viven

    dentro de los organismos

    eucariotas, y es por eso que

    si ustedes ven las

    caractersticas de los

    organelos son similares a las

    de los organismos eucariotas apoyando esta hiptesis de la teora endosimbitica. Las

    clulas eucariotas tienen histonas, mientras que las clulas procariotas y los organelos

    no. Los organelos tienen sus propios ribosomas que tienen el mismo coeficiente de

    sedimentacin que las clulas procariotas. Y tambin tienen el mismo tipo dereproduccin que es por fisin binaria, mientras que la clula eucariota hace mitosis.

    Al ver, en comparacin una clula eucariota

    contra una procariota, no solo el tamao sino

    que en complejidad, la clula procariota tiene

    numerosos organelos, mitocondrias, cloroplastos

    (en caso de clulas vegetales y algas), tienen

    ncleo definido rodeado por una membrana

    donde est el DNA, la clula procariota tiene su

    ncleo suelto en una zona llamada nucleoide y

    los ribosomas tambin estn sueltos, mientras

    que en la eucariota estn pegados al retculo endoplsmico. La clula procariota tambintiene cosas que la clula eucariota no tiene, por ejemplo una pared celular, aunque

    despus vamos a ver que clulas vegetales si tienen pared celular.

    Esto es en ms detalle

    como se compone una

    clula procariota

    (bacteria). Pueden tener

    un glicocalix (no todas lo

    tienen), que es una

    cubierta de polisacridos

    que es para encubrir sus

    determinantes antignicos.

    El cromosoma bacteriano

    o nucleoide. Pueden tener

    pili, que es para

    transferencia de material

    gentico. El mesosoma,

    que son extensiones de la

    membrana celular para

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    aumentar la superficie. Pueden tener flagelo que es una estructura especializada que les

    da movilidad. Pueden tener fimbrias. Grnulos de inclusin que son sustancias de

    reserva. Pared celular, que tambin es excepcional, pero la mayora de las bacterias la

    tiene. Membrana celular. Y los ribosomas, que al no haber retculo endoplsmico como

    en la clula eucariota, se encuentran dispersos en el citoplasma o pegados a la

    membrana celular.

    Esto es como se ve una clula eucariota, vean la

    complejidad de organelos que tiene. Tambin tienen

    vacuolas de reserva. Membrana celular,

    mitocondrias, tienen aparato de Golgi, retculo

    endoplasmtico. Ribosomas, mitocondrias,

    cloroplastos y muchos organelos.

    Eso es bsicamente los tipos de

    clulas que existen, las bacterias,

    pero en cuanto a que hemos

    hecho nosotros para poder

    estudiarlos: Todo empez en la

    antigedad hasta los primeros

    microscopistas, fue un periodo

    especulativo. El segundo periodo

    va desde 1675, donde este seos

    fue el primero el observar a los

    microorganismos porque se

    dise sus propias lentes que

    podan aumentar hasta 300X y

    observ los microorganismos porprimera vez llamndolos minsculos animlucos y desde ah cambi todo. Despus

    apareci el cultivo de microorganismos con la era de Pasteur y Koch. Y la era en que

    estamos ahora donde los microorganismos se estudian en toda su complejidad y donde

    han surgido disciplinas especializadas dentro de la microbiologa.

    La microbiologa se divide en dos

    grandes ramas, que es la

    investigacin bsica y la

    microbiologa aplicada. Dentro de

    la investigacin bsica podemos

    clasificar por tipos de

    microorganismos, donde tenemosla bacteriologa, algologa,

    micologa, protozologa,

    parasitologa, virologa; la

    taxonoma microbiana que es en

    esencia la clasificacin de los

    microorganismos; en relacin a la

    enfermedad tenemos la

    inmunologa, epidemiologa,

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    etiologa; y por procesos estn quienes estudian metabolismo microbiano, gentica

    microbiana, ecologa microbiana. Y dentro de la microbiologa aplicada, que es una

    rama totalmente diferente, est la microbiologa enviromental; en relacin a al

    enfermedad est el control de infecciones y la quimioterapia; y los procesos industriales

    que es bsicamente aplicar lo que se sabe de microbiologa para tener un producto o

    provecho para el uso de todos, la tecnologa de los alimentos y bebidas, la

    microbiologa farmacutica, la ingeniera gentica para hacer organismos modificados.

    Uno de los conceptos que quisiera transmitir

    es la diversidad morfolgica que existe dentro

    de las bacterias. Existen diversas formas:

    cocaceas, bacilos, espirilos; tienen bacterias

    con yemas, con apndices, bacterias

    filamentosas.

    La diversidad de tamao que existe no solo de las bacterias sino que de las clulas en

    general. Tenemos las que van desde virus en 100 nm, un glbulo rojo que tiene 10 um,

    un alga que mide 100um, una ameba que es mucho ms grande; aqu en el orden de 1

    um es donde estn las bacterias, las ms conocidas (estafilococo, escherichia coli).

    La diversidad metablica que

    tienen los microorganismos, ellos

    pueden vivir casi a partir de

    cualquier cosa (orgnica, inorgnica). Pueden producir su fuente de energa a partir de

    compuestos qumicos, a partir de la luz. Tambin estn los quimiolitotrofos que son los

    que ocupan compuestos inorgnicos para generar energa y son los que viven del azufre

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    (un granulo de azufre para ellos es suficiente fuente de energa). Los

    quimioorganotrofos que son los que utilizan compuestos orgnicos.

    La diversidad ecolgica, pueden vivir en ambientes sumamente diversos (giseres,

    desiertos, salares), pueden vivir casi al borde del congelamiento, pero tambin estn los

    microorganismos que pueden vivir en el cuerpo humano, en animales de sangre caliente,

    en las plantas. Pueden vivir en cualquier lado. Ac estn los factores ambientales quepueden tolerar, la profundidad (pueden vivir hasta a 1000 m de profundidad).

    La diversidad gentica tambin es muy

    grande, ellos pueden, gracias a su

    promiscuidad, transferir material gentico

    entre ellos y difundir as caractersticas

    genticas que los hacen ms adaptables.

    Habamos visto la clasificacin de todos

    los seres vivos, ac tenemos una

    clasificacin funcional de los

    microorganismos. Ac tenemos laseubacterias, archaebacterias y los

    microorganismos eucariotas (algas, hongos

    y protozoos); y los agentes infecciosos que es donde se encuentran los virus, los

    viroides y los priones.

    Vamos a empezar por las bacterias, las eubacterias que son las bacterias ms

    evolucionadas. Tienen una pared celular de peptidoglicano, se reproducen por fisin

    binaria y obtienen energa por una diversidad de procesos metablicos. Son siempre

    unicelulares y pueden ser mviles cuando tienen el flagelo.

    Las archaebacterias, son el otro tipo de bacterias que no tienen peptidoglicano, sereproducen por fisin binaria, tambin son unicelulares, pero habitan en ambientes

    extremos. Es donde se encuentran los metangenos, los halfilos (viven en altas

    concentraciones de sal - salares), los termfilos. Eso es una pequea clasificacin de lo

    que son las archaebacterias.

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    Ahora pasamos a los

    microorganismos

    eucariticos, entre los cuales

    estn los hongos. Estos

    tienen ms de 100.000

    especies y se dividen en dos

    grupos: hongosmacroscpicos y hongos

    microscpicos. Los

    macroscpicos suelen estar

    asociados a lo que son los

    hongos filamentosos y los

    hongos que conocemos. Y

    los hongos microscpicos

    que son las levaduras. Ellos

    tienen una estructura celular

    tambin bien especial, una pared celular con quitina (lo que no existe en el mundo

    microbiano) y descomponen plantes y animales porque viven sobre plantas y animales

    muertos. Son una fuente de antibiticos, son muy utilizados en la tecnologa dealimentos y estudios genticos. Y son productores de toxinas, micosis y tambin son los

    responsables de los deterioros de los alimentos.

    Los hongos

    filamentosos

    se dividen en

    los que tienen

    hifas septadas

    y las no

    septadas, lo

    que tiene gran

    importanciapara la clnica

    ya que se

    puede ver

    perfectamente

    al microscopio. Las levaduras son los que habamos dicho eran los hongos

    microscpicos

    Los hongos viven de plantas y

    animales muertos, son saprobios; son

    heterotrficos, no pueden sintetizar sus

    propios puentes de carbono, tienen que

    tomarlo del medio como nosotros;

    algunos son parsitos; tienen una

    temperatura de crecimiento de entre 20

    a 40C, por lo que viven a temperatura

    ambiente; y tambin tienen una

    distribucin sper amplia, viven en

    muchos hbitats.

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    As es como se reproducen los

    hongos filamentosos. Si uno mira el

    hongo que crece en las naranjas al

    microscopio va a haber una espora

    como esta que se llama

    conidioforo, en este caso conidias y

    esta es su forma de reproduccin,estas conidias vuelan y van a

    infectar ms naranjas. Y esto es

    otra forma que se llama

    esporangiforo y son esporas, este

    es el que est por ejemplo en el

    rhizopus del tomate en

    descomposicin, donde se ven esas

    pelotitas negras. Los hongos tambin pueden reproducirse de forma sexual, la anterior

    era reproduccin asexual, esporas que se formaron por simple mitosis sin variacin de

    material gentico; pero las levaduras y hongos pueden reproducirse sexualmente cuando

    hay un apareamiento de una clula masculina y una femenina, ah hay unin de gametos

    y variacin de material gentico.

    Las algas es otro microorganismo

    eucariota. Son fotosintticos.

    Dentro de este grupo estn las

    diatomeas, los dinoflagelados, las

    algas verdes, algas pardas y algas

    rojas. Como son fotosintticos

    tienen cloroplastos, clorofila y otros

    pigmentos. Tambin son

    unicelulares pero existen

    multicelulares. La mayora son de

    vida libre en agua y losdinoflagelados son los que causan

    las mareas rojas.

    El tercer tipo de microorganismo eucariota que

    vimos son los protozoos. Hay 65.000 especies, y

    la mayora son unicelulares. Tienen estructuras

    de locomocin distintas: tienen flagelos, cilios,

    seudpodos. Tienen formas muy variadas y no

    tienen ni pared celular ni cloroplastos. Adems

    son hetertrofos, igual que los hongos.

    Ahora empezamos con los agentes

    infecciosos (virus, viroides y priones).

    Los virus son estructuras acelulares

    formadas solo por un DNA o un RNA

    rodeado por una cubierta proteica; hay

    muchos virus que tambin pueden estar

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    envueltos en lpidos que son los virus envueltos, estos virus tienen que, cuando van a

    salir de la clula hospedera se llevan parte de la membrana. Los virus si son parsitos

    intracelulares obligados, no se pueden reproducir ni vivir si no estn adentro de otra

    clula, solo se pueden replicar dentro de un hospedero.

    Los viroides son agentes infecciosos compuestos solo de una molcula de RNA, simple

    hebra circular que presenta regiones doble hebra, es decir que por apareamiento seforman estructuras de orquilla. No tienen cpsula proteica rodeando los cidos

    nucleicos, y se localizan en el ncleo del hospedero. Son estructuras tpicas de los virus

    que infectan las plantas.

    Los priones, es una partcula proteica infecciosa. Prin es una palabra proveniente de

    protena e infeccin. Solamente es una protena que tiene una estructura terciaria

    alterada y que al entrar en una clula sana, encuentra a su homologa que est sana y la

    vuelve defectuosa y forma agregados de esas protenas que finalmente producen las

    enfermedades. Los priones son los responsables de los trastornos degenerativos del

    sistema nervioso, en los animales la conocida enfermedad de las vacas locas, y en

    trastornos neurodegenerativos de los seres humanos.

    Ahora vamos a ver algunos conceptos de lo que es la ecologa

    microbiana, que es los microorganismos en su ambiente natural

    interactuando con el entorno y los dems microorganismos.

    Para estudiar la ecologa microbiana

    lo mejor es estudiar la comunidad

    microbiana, donde vamos a ver qu

    es la comunidad, qu es la diversidad

    y porqu es importante conocer la

    diversidad microbiana.

    Supongo alguna vez habrn visto los

    distintos niveles de complejidad de

    interacciones entre microorganismos,

    desde los individuos, una poblacin

    que es un grupo de individuos, un

    gremio que son poblaciones que

    utilizan los mismos recursos (tienen

    el mismo nicho ecolgico), hasta la

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    unidad ms compleja que es la comunidad, que es un grupo de poblaciones y de

    individuos, es la unidad biolgica superior. El ecosistema no es una unidad biolgica,

    porque lo que comprende son las interacciones con el medio ambiente y sus distintos

    factores. Entonces no se considera unidad biolgica, por lo que la unidad biolgica

    superior es la comunidad.

    La comunidad microbiana es un conjunto integrado de poblaciones microbianas que

    interactan entre ellas y coexisten en un determinado espacio llamado hbitat.

    El hbitat es el espacio donde se desarrollan

    las comunidades, y el nicho es el papel de las poblaciones dentro de la comunidad,

    distintas poblaciones tienen distintos nichos. Por ejemplo un nicho puede ser humedad

    de tanto a tanto, temperatura de tanto a tanto; entonces en ese nicho hay una

    determinada poblacin.

    Las comunidades tienen distintos atributos. Uno de ellos es la composicin, quines

    componen a esa comunidad, de qu microorganismos en este caso. La riqueza de una

    comunidad, cuntos tipos de microorganismos. La abundancia, cmo estn

    representados, cuntos hay de cada tipo. Todos esos son atributos de una comunidad al

    momento de estudiar la ecologa microbiana.

    Ac habla de biotipo que puede ser no solo especie, sino que variantes genticas, cepas

    por unidad de espacio.

    Esto es lo que les deca, poblacin A y

    poblacin B, distintas poblaciones pero

    que comparten el nicho, utilizan un nicho

    muy parecido lo que significa que

    mientras ms similar sea el nicho mayor

    ser la competencia entre las poblaciones

    A y B, y eso va a terminar en que la

    poblacin mejor adaptada va a desplazara la otra. Ese reemplazo de una poblacin

    por la otra se llama sucesin. Una

    sucesin primaria es la colonizacin de

    un hbitat sin historia de invasiones

    previas, por ejemplo la colonizacin del

    intestino en los animales recin nacidos. Una sucesin secundaria es la que ocurre en un

    hbitat que ya tiene una historia sucesional previa, ya ha sido poblada por

    microorganismos, y generalmente es consecuencia de un evento catastrfico, por

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    ejemplo lo que pasa con la poblacin de microorganismos cuando nos lavamos el

    cabello.

    Las sucesiones es la forma de

    evolucin de las comunidades y tienen

    distintas etapas. Los organismos

    pioneros colonizan un hbitat, alcolonizar el hbitat si o si van a

    modificarlo, eso le hace ampliar su

    dominio y hacerlos ms dominantes en

    caso que vengan otros

    microorganismos a invadir, pero al

    haberlo modificado otras poblaciones

    lo pueden encontrar atractivo y pueden

    haber poblaciones mejor adaptadas a

    ese nuevo hbitat que van a

    desplazarlos; esto es una tendencia

    constante al clmax, y una comunidad clmax difcilmente se alcanza por todos los

    eventos catastrficos (como por ejemplo lavarse el cabello). Las comunidades clmaxson difcilmente de alcanzar en la prctica y es cuando todas las poblaciones se

    encuentran en equilibrio.

    Este es el ejemplo de la sucesin

    primaria, que es la forma en que se va

    poblando el intestino de un ratn recin

    nacido. Primero llegan los

    flavobacterium y viven hasta los 10

    das, una vez que se forman los

    flavobacterium llegan los coliformes

    que alcanzan un nmero muy grande

    pero despus llegan a su nivel normal,y los que predominan despus en la

    comunidad clmax son los bacteroides

    que llegan a poblar hacia el da 18, que

    son los anaerobios estrictos y las

    bacterias del cido lctico. Lactobacilius, Streptococcus y Bacteroides son los que

    predominan en el intestino en equilibrio.

    Entonces como vern, hubo varias sucesiones, fueron evolucionando las comunidades

    microbianas.

    Esto es lo que pasa con el lavado del

    cabello, esto es lo que hay previo al

    lavado, y luego del lavado se modifican

    los niveles de los distintos

    microorganismos que habitan el cuero

    cabelludo, se dispara el

    propionibacterium acnes, bajan los

    aerobios, pero luego vuelven por

    homeostasis, que es el mecanismo que

    permite recomponer la estructura de

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    esta comunidad. Entonces anaerobios vuelven a su nivel normal, al igual que los

    corineiformes y pityrosporum. Ac no se forma una comunidad clmax diferente como

    en la sucesin primaria, ac se recompone la misma que estaba al principio de la

    catstrofe.

    Un ejemplo sper tpico de comunidades

    microbianas son los biofilms. Las biopelculases una comunidad microbiana cuya dinmica,

    estructura y formacin ha sido muy estudiada.

    Hay distintas etapas en la formacin de

    biopelculas; estas se forman en ambientes

    naturales, se forman tambin en el cuerpo

    humano, en los dientes, en el tracto intestinal.

    Lo primero que sucede es el

    acondicionamiento fsico de la superficie, lo

    primero que va a pasar es la deposicin de

    distintas sustancias que van a hacer atractivas

    y hacen que los microorganismos vayan a

    colonizar esas superficies. Luego va a ocurririnvasin y una adhesin de los

    microorganismos a la superficie. Luego va a haber un crecimiento de los

    microorganismos donde comienzan a sintetizar polmeros, los distintos

    microorganismos sintetizan distintos polmeros. Un biofilm bien conocido y de

    importancia clnica es el que forma la pseudomona aeruginosa en pacientes con fibrosis

    qustica, estos pacientes tienen una alteracin en su sistema de clearence de bacterias y

    de la humedad, lo que lo hace muy propicio para que se forme un biofilm, la

    pseudomona forma un biofilm con un polmero que se llama alginato, y ella vive en esa

    masa de polmero, y una ves que ya est el biofilm es muy difcil de sacar.

    Esta capa es reversible, la primera capa de microorganismos es fcil de remover, pero

    una vez que se estableci el biofilm es muy difcil de sacar porque los organismos se

    quedan dentro de l y se hacen resistentes, pueden soportar muchas variaciones. Y laltima etapa es la dispersin, donde pedazos de biofilm se pueden desprender para ir a

    colonizar otros vectores y el biofilm no es una simple capa microorganismos, est

    organizado en capas, donde microorganismos con distintos requerimientos estn en

    distintas capas, se forman canales dentro del biofilm por donde fluye el agua y

    desarrollan un sistema de comunicacin entre ellos; entonces el biofilm es una

    estructura sper compleja.

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    Las biopelculas tienen un impacto negativo. Disminuyen el dimetro de las tuberas y

    filtros de agua porque se depositan en las paredes. Las placas dentales, son tambin

    corrosivas. Y lo que tiene esto es que cuando una bacteria est dentro del biofilm es

    mucho ms resistente a los tratamientos que las cepas planctnicas (cepas libres),

    tambin contaminan lentes de contacto, marcapasos y catteres.

    Pero tambin tienen efectos aprovechados para obtener beneficios de esta estructura tancompleja que es el biofilm. Para el tratamiento de aguas de desechos, donde entran

    trayendo oxigeno y nutrientes que son los desechos, y sale el dixido de carbono cuando

    pasa por las plantas de tratamiento; el biofilm est alrededor de estas partculas. Para el

    reciclaje de materiales y el control de infecciones. El control de infecciones se refiere a

    los biofilms naturales, por ejemplo en los dientes (cuando no es una placa como la de la

    foto anterior) impide implantacin de microorganismos patgenos, lo mismo con el

    biofilm que se forma en el tracto genitourinario femenino, donde se metaboliza

    glicgeno produciendo cido, lo que baja el pH y hace que el ambiente sea poco

    atractivo para los patgenos.