Los dos son pasado o pretrito, "estaba haciendo" se define como imperfectivo, pues la accin del verbo es durativa o imperfectiva, es decir, no acaba y termina en un momento dado del pasado, su referencia temporal es ms amplia y abarca en su transcurso los momentos a los que se refiere el pretrito "estuve haciendo"."Estuve haciendo" se define como perfectivo, puntual o terminativo y seala el fin o consumacin de la accin.

Estaba haciendo marca una diferencia en cuanto al tiempo transcurrido. Uno dice yo estaba en China desde el ao 1989 hasta el 2002.Eso marca un periodo de tiempo en el que realizaste la accin.En cambio, con Estuve es una accin de un momento especifico. Yo estuve en frica el ao pasado. No marca un periodo de tiempo especfico, solo una accin concreta...

Imperfecto + GerundioEstaba haciendo ejercicios, cuando me llamasteQu estabas haciendo?

Pretrito + GerundioEstuve haciendo ejerciciosQu estuve haciendo?

Perfecto + GerundioHe estado haciendo memoria, y nada no me acuerdo donde est.Y encontraste la fotografa?

No creas que es tan fcil, para nosotros los hispanos, pero ante la duda es mejor usar el imperfecto, porque describe una accin interrumpida por otra.La segunda opcin se usa, pero no es muy frecuente, y se usa ms para describir una sola accin.

Estuve haciendo, es una accin pasada. Que ya termin. Estaba haciendo yo lo uso ms cuando haca dos cosas simultneamente: "Estaba haciendo... cuando..." o... "Estaba haciendo... mientras..." (Obviamente, tambin es pasado)

"Estuve haciendo": Alguna cosa que hemos hecho en pasado

"Estaba haciendo: Alguna cosa que hemos hecho en pasado mientras ocurra otra cosa.

Ejemplos:

Yo estuve haciendo windsurf este verano.

Yo estaba haciendo windsurf mientras t dormas.

Espero haberte ayudado

Estuve haciendo es un pasado ms lejano que estaba haciendo. Estaba haciendo puede aplicarse a: ayer estaba haciendo una comida, pero si dices estuve haciendo implica que ha pasado ms tiempo. Por ejemplo hace un ao estuve haciendo esto.