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Digitalización de objetos de
colecciones de ciencias
naturales en el Museu de
Ciències Naturals de Barcelona
Jordi AgullóGestión Científica de colecciones, MCNB
23 de septiembre de 2021
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23 de septiembre de 2021
Proceso de digitalización: fases
Ejemplos de colecciones de imágenes
Ejemplo práctico: Atlas osteológico 3D
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23 de septiembre de 2021
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23 de septiembre de 2021
Digitalización de objetos de colecciones de ciencias naturales
Digitalización
Objeto de colección : Elemento que se custodia
Global Trade Review~ Imaging
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23 de septiembre de 2021
Beneficios de la digitalización
Información testimonial.
Favorece la conservación.
Aumenta la capacidad de estudio
Incrementa tu perfil de colección/Institución en internet.
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23 de septiembre de 2021
Proceso de digitalización
• Frazier, C.K., Wall, J., and S. Grant. (2008). Initiating a Natural History Collection Digitisation Project, version 1.0. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility.
• Chavan, V., Berents, P. & Hamer, M. (2010). Towards Demand Driven Publishing: Approaches to the Prioritisation of Digitization of Natural History Collections Data. Biodiversity Informatics, 7
• Huxley, R., Quaisser, C., Butler, C.R., & Dekker, R.W. (2020). Managing Natural Science Collections: A Guide to Strategy, Planning and Resourcing (1st ed.). Routledge.
PLANIFICACIÓN
-Identificar objetivos
-Plan de acción
DOCUMENTACIÓN
-Guias y protocolos
-Estándard de Metadatos
CUSTODIA DIGITAL
Digital AssetManagement
EVALUACIÓN
-Métricas
-Feedback de los usuarios
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23 de septiembre de 2021
• INVENTARIO• INVESTIGACIÓN
o TIPOSo PETICIONES INVESTIGADORESo LÁMINA DELGADAo MICROFORAMINÍFEROSo Etc.
• TEMÁTICOSo Meteoritos o Gemas o Gabinet Salvadoro Atlas 3D o Colección de referenciao Etc.
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23 de septiembre de 2021INVENTARIO
COLECCIÓN TÉCNICA
VERTEBRADOS y INVETREBRADOSNO ARTRÓPODOS
Cámara reflex digital
Autor: Jordi Vidal
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23 de septiembre de 2021INVENTARIO
COLECCIÓN TÉCNICA
MINERALOGÍA, PETROLOGÍA Y PALEONTOLOGÍ
Cámara reflex digital con ópticas macro
Autor: Joan Rosell
Autor: Joan Rosell
Autor: Jordi Vidal
Autor: Jordi Vidal
Autor: Jordi Vidal
Autor: Jordi VidalAutor: Jordi Vidal
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23 de septiembre de 2021INVENTARIO
COLECCIÓN TÉCNICA
MOLUSCOS y ARTRÓPODOS
Cámara de reflex digital y stacking
- Lens: Canon EF 100 mm f/2.8 Macro USM- Flash: Macro ring lite Canon MR14EX- Color reference target: X-RiteColorChecker Passport- First images: RAW, at 1/125 s,f/5.6 and ISO 100- Software to adjust RAW files andsave as Tiff: Canon Digital PhotoProfessional.- FS software: Helicon Focus
Autor: Miguel Prieto
Autor: Sergi Gago
Autor: Sergi Gago
Autor: Sergi Gago
Autor: Sergi Gago
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23 de septiembre de 2021INVENTARIO
COLECCIÓN TÉCNICA
HERBARIO Digitalización de pliegos: Escáner invertido Herbscan 300 dpi
Digitalización de herbarios históricos :Escáner Copybook a 300dpi
Autor: Jordi Pallàs y Eduard Farràs
Autor: Jordi PallàsAutor: Jordi Pallàs
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23 de septiembre de 2021INVENTARIO
COLECCIÓN TÉCNICA
BANCO DE SEMILLAS
Digitalización con escáner sobre papel milimetrado
Autor: Míriam Aixart
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23 de septiembre de 2021Consulta
https://www.bioexplora.cat/es/colecciones-abiertas
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23 de septiembre de 2021Tipos
Häuser, C.L., Steiner, A., Holstein, J. & Scoble, M. J. (eds.) 2005. Digital Imaging of Biological TypeSpecimens. A Manualof Best Practice. Results from a study of the European Network for Biodiversity Information. Stuttgart.
Autor: Neus Ibáñez
Autor: Neus Ibáñez
COLECCIÓN TÉCNICA
HERBARIO Digitalización de pliegos te tipos: Escáner invertido Herbscan 600 dpi
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23 de septiembre de 2021Consulta
https://doi.org/10.15468/dl.jbdpf7TIPOS Institut Botànic de Barcelona
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23 de septiembre de 2021Tipos
Häuser, C.L., Steiner, A., Holstein, J. & Scoble, M. J. (eds.) 2005. Digital Imaging of Biological Type Specimens. A Manualof Best Practice. Results from a study of the European Network for Biodiversity Information. Stuttgart. 304 pp.
Autor: Amador Viñolas
Autor: Sergi Gago
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23 de septiembre de 2021Consulta
https://doi.org/10.15468/dl.kxw9jyTIPOS Colecciones Zoológicas
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23 de septiembre de 2021Consulta
https://www.bioexplora.cat/WIKICOLLECTA/index.php/es/especimens-tipusTIPOS Colecciones Zoológicas
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23 de septiembre de 2021Consulta
https://www.icgc.cat/es/Administracion-y-empresa/Servicios/Geologia/Base-de-datos-de-holotipos-y-otros-tipos-nomenclaturales
TIPOS Colección Paleontología
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23 de septiembre de 2021Investigación
COLECCIÓN USO TÉCNICA
MINERALOGÍA y PETROLOGÍA. Colección de LÁMINA DELGADA. Cortes transversales micrométricos 30 µm.) de muestras de minerales y rocas en preparaciones para microscopio.
Para documentación e investigación. Interpretaciones texturales y genéticas de las rocas (identificación de compuestos minerales).
A través del microscopio petrográfico de luz polarizada, acoplando cámara digital Deltapix al microscopio. Software DeltaPix InSight.
Lámina delgada: Olivina. Autor: Marc Campeny
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23 de septiembre de 2021Investigación
COLECCIÓN USO TÉCNICA
ARTRÒPODOS. Preparaciones de genitalias de Artrópodos
Para documentación e investigación. Permite el estudio taxonómico y sistemático del espécimen
Se adquiere con una cámara acoplada al triocular del microscopio óptico o lupa binocular con iluminación de fibra de óptica.
Genitalia de Holocnemus aurouxi Barrientos, 2019. Autor: Jorge Mederos
Genitalia: bulbo copulador de Linyphiidae.Autor: Jorge Mederos
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23 de septiembre de 2021Temáticos
https://www.bioexplora.cat/WIKICOLLECTA/index.php/es/briozous
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23 de septiembre de 2021Ejemplo Atlas 3D
Objetivo inicial : Atlas osteológico de vertebrados principalmente autóctonos.
Compra de instrumentación Depuración de la técnica Documentación del objeto digital Visualización del modelo 3d en web Consulta web Métricas del uso en internet
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23 de septiembre de 2021Ejemplo Atlas 3D
Compra de instrumentación
http://www.nextengine.com/products/scanner/specs#
Software: ScanStudio ProScan http://www.nextengine.com/products/scanstudio-hd-pro/specs/overviewMesahLab (freeware) https://www.meshlab.net/
![Page 25: Digitalización de objetos de colecciones de ciencias](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022072518/62dde567112f1874271a8eba/html5/thumbnails/25.jpg)
23 de septiembre de 2021Ejemplo Atlas 3D
Depuración de la técnica, Documentación y Custodia digital
©MCNB/Jordi Cadevall
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![Page 26: Digitalización de objetos de colecciones de ciencias](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022072518/62dde567112f1874271a8eba/html5/thumbnails/26.jpg)
23 de septiembre de 2021Ejemplo Atlas 3D
Depuración de la técnica :Fotogrametría
©MCNB/Jordi Cadevall
©MCNB
©MCNB
Agisoft Metashape https://www.agisoft.com/
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23 de septiembre de 2021Ejemplo Atlas 3D
Visualización del modelo 3d en web
©MCNB/Jordi Cadevall
https://sketchfab.com/
![Page 28: Digitalización de objetos de colecciones de ciencias](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022072518/62dde567112f1874271a8eba/html5/thumbnails/28.jpg)
23 de septiembre de 2021Ejemplo Atlas 3D
Consulta web
©MCNB/Jordi CadevallQuesada, J., Aurell-Garrido, J., Gago, S., Boet, O & Garcia-Franquesa, E. 2016. Measurements errors in 3D models used in osteometric data research withfreeware: a test using skulls of the Algerian hedgehog (Atelerix algirus). Vertebrate Zoology , 66 (3): 411-418.
![Page 29: Digitalización de objetos de colecciones de ciencias](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022072518/62dde567112f1874271a8eba/html5/thumbnails/29.jpg)
23 de septiembre de 2021Métricas
©MCNB/Jordi Cadevall
Métricas del uso en internet
![Page 30: Digitalización de objetos de colecciones de ciencias](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022072518/62dde567112f1874271a8eba/html5/thumbnails/30.jpg)
23 de septiembre de 2021Métricas
©MCNB/Jordi Cadevall
![Page 31: Digitalización de objetos de colecciones de ciencias](https://reader035.vdocumento.com/reader035/viewer/2022072518/62dde567112f1874271a8eba/html5/thumbnails/31.jpg)
©MCNB/Jordi Cadevall
Jordi AgullóGestión Científica de colecciones, MCNB