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4.1 Tipos y funciones de RNAs

Ricardo Márquez Gómez 205258

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Índice1. Estructura química del RNA2. Características generales3. Propiedades de RNA en E. coli4. Tipos de RNA• mRNA• tRNA• rRNA5. RNAs reguladores• siRNA• miRNA• son RNA

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Estructura química

• Azúcar β-D-ribosa• Grupo fosfato• Bases nitrogenadas• Cadena polinucleotídicasimple

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• Bases nitrogenadas

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Características generales

• Cada tipo de RNA presenta varias formas moleculares.

• 11% núcleo• 15% mitocondrias• 50% ribosomas• 24% citosol• Posé estructura primaria y secundaria.

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Propiedades de RNAs de E. coli

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Tipos de RNAs

• mRNA• tRNA• rRNA• siRNA• miRNA• snoRNA

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mRNA

• Contiene información genética procedente del DNA.

• Se origina a partir del proceso de transcripción.

• Funciona como plataforma para la síntesis de proteínas.

• Contiene una larga cadena de poli A (200 restos sucesivos) en 3´ y un CAP en 5´.

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tRNA

• Actúa como transportador de aa. individuales específicos durante la síntesis proteica.

• Algunos aa. tienen mas de un tRNA.• Estructura de hoja de trébol.• Anticodón descifra el código del mRNA

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• Poseen un resto de Guanina terminal 5´ y en le otro extremo la secuencia CCA 3´.

• Un grupo hidroxilo libre del grupo adenilico terminal es acilado enzimáticamente por su α aminoácido específico para dar la forma cargada de tRNA (aminoacil tRNA).

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rRNA

• Constituye el 65% de la masa de los ribosomas.

• En células eucarióticas existen 4 tipos de rRNA:

5S, 7S, 18S, 28S

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• Participa en el proceso de traducción

• Involucrado en la formación del enlace peptídico.

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RNAs reguladores

• La expresión genética puede ser regulada por moléculas de RNA no codificadoras.

• Inhiben la traducción por interferencia de RNA y degradación de mRNA.

• Pueden inducir modificaciones en las histonas lo que provoca condensación de cromatina y formación de heterocromatína.

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siRNAsmall interfering RNA

• Interfiere con la expresión de un gen específico, reduciéndola.

• Doble cadena, 20-21 nucleótidos• Se origina de dsRNA (double strand RNA) y

degradan un mRNA específico.• Promueven el silenciamiento de cromatina.

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miRNAMicro RNA

• Regiones no codificantes• 20-25 nucleótidos• Se asocia con el RNA-induced silencing

complex (RISC) con lo que separan y marcan mRNA para su corte.

• En la represión transcripcional se una RITS (RNA induced transcriptional silencing) propiciando la formación de heterocromatina.

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snoRNAsmall nucleolar RNA

• 60-300 nt• Forma parte de la biosíntesis de los

ribosomas.• Guía la modificación nucleica y los cortes del

precursor del rRNA.• Se encarga de cortar y unir los fragmentos 5S y

28S del rRNA.

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Metilación de ribosa Isomerización de U a pseudouridina (Ψ)

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C/D BOX

• Cada snoRNA guía una modificación para un RNA objetivo.

• Se une con 4 proteínas para formar un complejo RNA/proteína (snoRNP).

• Contiene un serie de bases (10-20 nt) complementarias a la secuencia que rodea al nucleótido a modificar.

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H/ACA BOX• Estructura secundaria que contiene dos

horquillas y dos regiones sencillas.• Contiene H box (horquilla) y ACA box (3 nt

antes de 3´terminal.• Las horquillas contiene bucles de

reconocimiento que guían hacia el RNA objetivo.

• Une a 4 proteínas y forma H/ACA snoRNP.

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Resumen • El RNA es una molécula compuesta por un cadena simple de

nucleótidos compuesta por 4 bases nitrogenadas (A,G,C,U).• Forma estructuras primarias (mRNA) o secundarias (tRNA,

rRNA).• Posee variabilidad • Todos su tipos son indispensables para que la síntesis proteica

pueda llevarse a cabo correctamente, desde la transducción (mRNA), traducción (mRNA, tRNA, rRNA) y como reguladores de la expresión genética por interferencia(siRNA), transcripcional (miRNA) y nucleolar (snoRNA), los cuales en conjunto median la homeostasis celular de la síntesis proteica.

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Bibliografía

• Cooper G., Hausman R. 2007, The Cell, A Molecular Approach, cap. 7, pags: 287-291, 370,378,379

• Lehninger A., 1980, Bioquímica, cap. 12 pags. 326-328

• I.J. MacRae, K. Zhou, F. Li, A. Repic, A.N. Brooks, W.Z. Cande, P.D. Adams, and J.A. Doudna, "Structural basis for double-stranded RNA processing by dicer," Science 311, 195 (2006).


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