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CURRICULUM VITAE Valeria Francisca Eugenia Leopoldina de María de Guadalupe Souza Saldivar

Octubre 2018 1. Datos generales 1.1 Lugar y fecha de nacimiento: 28 abril, 1958 México Distrito Federal 1.2 Nacionalidad: Mexicana 1.3 Registro federal de contribuyentes: SOSV-580428PR3

1.4 Domicilio: Iglesia 270, Torre 3 dept 2601, La otra Banda, Álvaro Obregón, Ciudad de México 01090. curp SOSV580428MDFZLL05 Teléfonos: 5622 9006 oficina 5555 3360 casa 5513848568 cel. mail. souza@unam.mx

ORCID number 0000-0002-2992-4229, Scopus: 7006367707 2. Formación académica 2.1 Estudios profesionales Licenciatura: Lugar: Facultad de Ciencias, UNAM Periodo de estudios: 1979-1983 Grado obtenido: Bióloga Promedio: 9.7

Tesis profesional: Inducción de intercambios de cromátidas hermanas por alcohol furfurílico y furfural en linfocitos humanos, un estudio in vivo e in vitro.

2.2 Estudios de posgrado. Maestría Lugar: Facultad de Ciencias, UNAM Periodo de estudios: 1983-1985 Grado obtenido: Maestría en Ciencias (Biología) Promedio: 9.7

Tesis profesional: Inducción de intercambios de cromátidas hermanas en cultivo de linfocitos humanos por diversos compuestos de níquel y su relevancia en la carcinogénesis.

Doctorado Lugar: Centro de Ecología, UNAM Periodo de estudios: 1985-1990 Grado obtenido: Doctor en Ecología .Cédula profesional 1694823 Promedio: 9.7

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Tesis profesional: Genética y ecología de poblaciones de Rhizobium leguminosarum biovar phaseoli asociado a Phaseolus vulgaris y a P. coccineus cultivado y silvestre, en Morelos, México.

3. Experiencia 3.2. Investigación

1. Estancia postdoctoral en el Departamento de Ecology and Evolutionary Biology, University of California in Irvine, USA. Laboratorio del Dr. R. Lenski, de Septiembre 1990 hasta julio 1992.

2. Estancia postdoctoral en el Center for Microbial Ecology. Michigan State University. USA. En el laboratorio del Dr. R. Lensky de agosto 1992 hasta febrero 1993.

3. Investigadora Asociada “C” de Tiempo Completo, Centro de Ecología UNAM, Departamento de Ecología Evolutiva. Laboratorio de Evolución molecular y experimental desde mayo de 1993 hasta diciembre de 1997.

4. Investigadora Titular “A” de Tiempo Completo, Instituto de Ecología UNAM, Departamento de Ecología Evolutiva. Laboratorio de Evolución molecular y experimental, desde mayo de 1997 hasta diciembre 2001.

5. Investigadora Titular “B” de Tiempo Completo, Instituto de Ecología UNAM, Departamento de Ecología Evolutiva. Laboratorio de Evolución molecular y experimental desde diciembre de 2001 a 2006.

6. Investigadora Titular “C” Tiempo Completo, Instituto de Ecología UNAM, Departamento de Ecología Evolutiva. Laboratorio de Evolución molecular y experimental desde noviembre de 2006 a la fecha.

3.3 Docencia Escuela Nacional de Antropología e Historia

1. Ayudante de profesor de Genética y Bioquímica, primero y segundo semestre 1982.

2. Profesor de Bioquímica, primer semestre 1983. Facultad de Ciencias, UNAM

3. Ayudante de profesor en biología de campo sobre Citogenética Vegetal como sistema de prueba biológico. Primero y segundo semestre 1983.

4. Profesor de biología de campo sobre Citogenética Vegetal como sistema de prueba biológico, de 1984 a 1986.

5. Profesor de biología de campo sobre Genética de Poblaciones Bacterianas de 1986 a 1988.

6. Profesor de Sistemática Molecular en el segundo semestre 1994. Diplomado en biología comparada contemporánea, CONABIO-Fac. de Ciencias, UNAM.

7. Profesor de Genética Evolutiva segundo semestre 1995 Centro de Ecología - Facultad de Ciencias, UNAM.

8. Profesor titular de Biología de Procariontes, de 1996 a la fecha (un curso al año). 9. Coordinadora de Biología de Procariontes, desde febrero 1997 a enero 2003 y de

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nuevo de 2013 a la fecha. 10. Profesor del taller genética evolutiva de diciembre 2000 a la fecha.

Escuela Nacional de Salud Pública

11. Profesor de Ecología, primer semestre 1988. Instituto de Ecología, UNAM

12. Profesor de "Seminario sobre genética de poblaciones y técnicas electroforéticas aplicadas a insectos sociales" verano 1990.

13. Profesor de Evolución Molecular en el primer semestre 1994, Posgrado de Ecología UACPyP, del CCH.

Posgrado en Ciencias biológicas y Ciencias Biomédicas

14. Profesor de Genética Evolutiva desde el segundo semestre 1995 hasta la fecha, tanto en el Posgrado de Ecología UACPyP, del CCH, como en el Posgrado de Ciencias Biomédicas y el de Ciencias Biológicas.

15. Biología de interacciones: Microorganismos vs. macroorganismos. septiembre 2000.

16. Curso avanzado de Ecología Evolutiva. Septiembre 2002, 2005, 2007, 2008 17. Evolución básica septiembre 2003, septiembre 2004, 2006. 18. Comunidades. 2do semestre 2004

__________________

19. Profesor de asignatura "Genómica Evolutiva y de Poblaciones " en los posgrados de Ciencias Biomédicas y Ciencias Biológicas, UNAM, del 27 de enero al 23 de mayo del 2014, 64 horas.

20. Profesor de asignatura “Interacciones Poblacionales: de las bacterias al hombre” en los posgrados de Ciencias Biomédicas y Ciencias Biológicas, UNAM, del 26 de enero al 22 de mayo del 2015, 64 horas

21. Profesor de asignatura "Evolución avanzada" en los posgrados de Ciencias Biomédicas y Ciencias Biológicas, UNAM, del 2 de febrero al 27 de mayo del 2016, 64 horas

22. Profesor de asignatura "Genética de la conservación" en los posgrados de Ciencias Biomédicas y Ciencias Biológicas, UNAM, del 30 de enero al 26 de mayo del 2017, 64 horas.

23. Tutora del Posgrado de Ciencias Biomédicas y el de Ciencias biológicas 4.-Cargos honoríficos.

1. Nombramiento de Secretaria Académica del Instituto de Ecología UNAM de marzo de 2005 a junio 2008.

2. Miembro electo de la Comisión Dictaminadora de Biología en la Facultad de Ciencias, UNAM 2006-2008.

3. Profesor asociado adjunto de la Universidad de Houston de mayo 2005 a la fecha.

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4. Jurado del Premio Silares en Ciencias Biomédicas 2010, 2011. 5. Jurado Premio Universidad Nacional y Jóvenes a la Investigación 2012 6. Asesor para el tema “El hombre y el ambiente” Museo Papalote del Niño. 7. Editora asociada PeerJ desde finales 2012 8. Asesora científica de la compañía de probioticos Encore Biotecnology

5. Distinciones académicas y becas. 5.1. Distinciones.

1. Fellowship de la fundación MacArthur de julio 1994 hasta junio 1997. 2. Nivel de PRIDE “C” de 1997 a Septiembre 2003. 3. Nivel PRIDE “D” de 2003 a la fecha. 4. Miembro del Sistema Nacional de Investigadores SNI desde junio 1990,

(candidato) 5. Nivel uno de julio de 1996 a septiembre de 2002. 6. Nivel II del SNI de septiembre 2002 a 2010. 7. Nivel III de 2011 a la fecha. 8. Premio Sor Juana Inés de la Cruz, Instituto de Ecología 2006, otorgado por UNAM 9. Premio Nacional de Conservación Categoría de Investigación 2006 otorgado por

SEMARNAT 10. Premio VW por Amor al planeta 2010. 11. Aldo Leopold Fellow 2011 12. Premio mentes Quo, Discovery. embajadora de la categoría, mente y vida 2012 13. Representante de México ante de North America Parthernship for Phosphorous

Sustentability (NAPPS). 14. Medalla al merito profesional del biólogo otorgada por el Colegio de Biólogos de

México AC. 26 de abril, 2016. 15. Coorganizadora del foro science for biodiversity en la COP 13-Cancun, diciembre

2016 16. Presidenta de la Sociedad Científica Mexicana de Ecología 2016-2018 17. Member of Board of Advisors Leopold Leadership Program

5.2 Revisión de proyectos 1995 Revisión de proyectos de CONACyT 1996 Revisión de proyectos de CONACyT 1997 Revisión de proyectos de CONACyT 1998 Revisión de proyectos de la NSF, USA 2000 Revisión de proyectos de CONACyT 2000 Revisión de proyectos de DGAPA 2001 Revisión de proyectos de Foncyt-Argentina 2001 Revisión de proyectos de CONACyT 2002 Revisión de proyectos fondos sectoriales CONACYT 2002 Revisión de proyectos DGAPA 2003 Revisión de proyectos fondos sectoriales CONACYT

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2003 Revisión de proyectos FONDECYT Chile 2003 Revisión de proyectos FONCYT Argentina 2004 Revisión de proyecto NSF, USA. 2004 comisión de becas CONACyT 2005 Revisión de proyectos CONACyT y PAPIIT 2006 Revisión de proyectos CONACyT 2007 Revisión de proyectos CONACyT y PAPIIT 2008-2015 Revisión de Proyectos CONACYT, PAPIIT, NSF, NAI-NASA 5.3Organización de eventos científicos. 2004. Organizador, junto con Luis Eguiarte del Simposio “Evolución Molecular en plantas

Mexicanas: más allá de las filogenias”, dentro del Congreso Mexicano de Botánica, del del 17 al 22 de Octubre del 2004, en Oaxaca, México.

2006 Organizador, junto con Luis Eguiarte (Instituto de Ecología, UNAM), Susana Magallón, Mark Olson, (Instituto de Biología, UNAM) del Simposio “Las Radiaciones Adaptativas: procesos ecológicos y patrones filogenéticos”. Dentro del Congreso Mexicano de Ecología, 28 de Noviembre del 2006, Morelia, Michoacán, México.

2008: Organizador, junto con Luis Eguiarte, de la Mesa Redonda: El futuro de la ecología y la biología evolutiva: nuevas herramientas, nuevos paradigmas. Domingo 16 de noviembre. Dentro del Segundo Congreso Mexicano de Ecología 2008, Mérida Yucatán, México. Evento conjunto del Chapter México de la Ecological Society of America (ESA) y la Sociedad Científica Mexicana de Ecología. Seis ponentes: Jorge Soberón, Michael T. Clegg, Mark Olson, Valeria Souza, Mike Travisano, Carlos Herrera. Asistencia: ca. de 200.

2008: Organizador, junto con Luis Eguiarte y Luisa Falcón del Simposio Cuatrociénegas como ejemplo de cooperación científica México-USA: Problemas sociales, ambientales y científicos. Miércoles 19 de noviembre. Dentro del Segundo Congreso Mexicano de Ecología 2008, Mérida Yucatán, México. Evento conjunto del Chapter México de la Ecological Society of America (ESA) y la Sociedad Científica Mexicana de Ecología. Siete ponentes: Valeria Souza, Mike Travisano, Janet Siefer, Gabriela Olmedo, Luisa Falcón, Jim Elser y Luis Eguiarte. Asistencia: ca. de 60.

2013 Organizador del Taller: Avances y perspectivas del uso de métodos de secuenciación próxima generación en el estudio de la genética de poblaciones y su empleo en problemas ambientales. 24 al 25 de enero del 2013. Auditorio del Instituto de Ecología, CU, UNAM. Apoyado por la CONABIO. 12 ponentes: Dr. Brandon S. Gaut. University of California, Irvine, USA. Dr. Jean Bousquet. Université Laval, Quebec, Canadá, Dr. Rodrigo Vega Bernal. Cornell University e Instituto de Ecología, UNAM, Dr. Mattew Hufford. University of California, Davis, USA., Dra. Angélica Cibrián. LANGEBIO, Irapuato, México, Dr. Cei Abreu. LANGEBIO, Irapuato, México, Dr. Juan Pablo Jaramillo-Correa, Dra. Valeria Souza,

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Dr. Luis David Alcaraz, Dra. Ana Escalante, Dra. César Domínguez y Dr. Luis Eguiarte, Instituto de Ecología, UNAM. Asistencia: 120 personas, más 40 conexiones en línea.

2015 Organizador, junto con Luis Eguiarte, del Simposio “Inventarios de la diversidad ecológica y genética del Churince en Cuatro Cienegas, Coahuila ” dentro del V Congreso Mexicano de Ecología: Fronteras de la ecología en un mundo globalizado, Centro Cultural Bicentenario, San Luis Potosí, México, del 19 al 24 de abril, 2015. 6 ponentes. Asistencia: 100 personas.

2016 Organizador, junto con Luis Eguiarte y Gabriela Olmedo del Simposio-Taller Sustentabilidad y conservación: de Cuatrociénegas al mundo. Cuatro Ciénegas, Coahuila, México, del 18 al 20 de marzo, 2016. 15 ponentes. Asistencia: 200 personas.

2016 Co-organizador, junto con Luis Eguiarte, ambos por parte de la Sociedad Científica Mexicana de Ecología, del Third Science for Biodiversity Forum: Mainstreaming Biodiversity for well-being: Contributions form Science. 1 y 2 de diciembre del 2016, Centro Internacional de Convenciones, Cancún, Quintana Roo, México. Asistencia 300 personas.

2017 Organizador, junto con Luis Eguiarte y Gabriela Olmedo, del VI Congreso Mexicano de Ecología, de la Sociedad Científica Mexicana de Ecología, celebrado el 30 de Julio al 4 de Agosto del 2017 en el Polifroum de la ciudad de León, Gto., México. 1,500 asistentes.

2018 Organizadora junto con Jeannine Cavendish, del simposio Science without Borders en la Ecological Society of America, Metting Nueva Orleans Agosto. 2000 asistentes.

5.4 Becas

1. Becaria de posgrado de la UNAM, DGAPA, para obtener el grado de Maestría 1983-1985.

2. Becaria de posgrado de CONACYT, para obtener el grado de doctorado 1985-1987.

3. Becaria de posgrado de la UNAM, DGAPA, para obtener el grado de Doctorado 1987-1990.

4. Becaria de postdoctorado de la UNAM, DGAPA, para una estancia de dos años en el Dep. of Ecology and Evolutionary Biology, University of California in Irvine. USA.

5. Becaria para estancia sabática por parte de DGAPA y CONACYT 1999-2000 y 2009-2010

5.4.2 Proyectos y financiamiento Responsable de proyecto

1. Mujeres campesinas y frijol financiado por la Fundación MacArthur, programa de población y ambiente con $75,000 USD por tres años.

2. Efecto de las cepas de Rhizobium etli en la productividad del frijol en México. Fertilizantes Fluidos S.A. de C.V., desde marzo 1998 con V. Souza como responsable y con un gasto de $471,000 pesos por dos años.

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3. Análisis filogenético de Escherichia coli y Helicobacter pylori para el diseño de marcadores epidemiológicos y diseño de vacunas. Financiado por CONACYT, desde noviembre 1998 hasta 2001, responsable V. Souza, con un gasto de $896,288 pesos por tres años.

4. Evolución de la patogénesis en Escherichia coli y Helicobacter pylori: un estudio comparativo, financiado por la DGAPA desde noviembre 1998 hasta 2001, responsable V. Souza, con un gasto de $709,311 pesos por tres años.

5. Evolution in microbe-based ecosystems: Desert springs as analoges for early development and stabilization of ecologIcal systems. Financiado por NASA (USA) en colaboración con la Universidad estatal de Arizona, desde julio 2000 hasta julio 2003 con V. S. de responsable por parte de la UNAM, con un gasto de $ 102,467 dólares.

6. Ecología de comunidades microbianas en aguas subterráneas de Cuatro Ciénegas Coahuila. CONABIO, de septiembre 2002 a enero 2004. Con un gasto aprobado de $100,000 pesos.

7. Epidemiología molecular de Escherichia coli. Financiado por la DGAPA desde noviembre de 2001 hasta 2004, responsable V. Souza, con un gasto de $578,000 pesos por tres años.

8. Ecología microbiana en Cuatro Ciénegas, Coahuila. financiado por SEMARNAT-CONACyT desde agosto 2003 a julio 2006 con un gasto de $3;007,000 pesos.

9. Abriendo la caja negra del ecosistema, financiado por SEP CONACYT desde septiembre 2004 a agosto 2007, con un gasto de $2;700,000 pesos.

10. Papel de la transferencia horizontal en la organización genómica de bacterias entéricas diarreicas y su trascendencia en la evolución de la patogénesis, de diciembre 2004 a noviembre 2007, con financiamiento por $600,000 pesos.

11. Cuatro Ciénegas Coahuila como sistema modelo para determinar el efecto de cambio climático global en los ciclos de C y N. responsable V. Souza apoyado por SEMARNAT CONACyT con un gasto de 2,800,000 pesos desde enero 2007 a dic 2010 (los recursos fueron aportados hasta marzo 2008). Proyecto 2006-C01-23459

12. Metagenómica de un tapete microbiano en Cuatro Ciénegas. Apoyado por CONACYT-SEP como proyecto de grupo con 5,000,000 de pesos desde diciembre 2007 hasta 2010. Proyecto 50507

13. Responsable Mexicana del proyecto con Nasa Institute of Astrobiology en conjunto con Arizona State University Proposal to NAI: Follow the Elements. 35,000 $US por año por 5 años, iniciando en 2009.

14. Evaluación de marcadores genéticos para un microarreglo diagnóstico de enfermedades diarreicas en el Pacífico Mexicano utilizando metagenómica. Apoyado por PAPIIT-UNAM por 600,000 pesos iniciando en 2009-2011.

15. Conocimiento y conservación de la biodiversidad del Churince, Cuatro Ciénegas, Coahuila, apoyado por la alianza WWF-Slim por 19 millones de 2010 a 2016

16. Coexistencia de diferentes linajes de Pseudomonas en Cuatro Ciénegas (Coahuila): ¿Carrera armamentista o cooperación? PAPIIT-UNAM, 800,000 pesos por 3 años iniciando en 2011.

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17. Convenio de colaboración de servicios que celebran, ecología, unam y el comité nacional sistema producto camarón de cultivo, AC, por 1 millón de pesos en 2014 y con viáticos en 2015.

18. El ciclo del azufre en los tapetes microbianos de Cuatro Ciénegas Coahuila. Proyecto 238245 aceptado en la convocatoria SEP CONACyT 2014. 2,700,000 pesos por 3 años iniciando en 2015.

19. Pangenoma de la familia Vibrionacea en México: estructura genética, clonalidad y evolución de la pathogenesis. Apoyado por PAPIIT-UNAM 2015-2018 con 1,700,000.00 pesos.

20. Convenio de codesarrollo de la patente “macroarreglo de diagnóstico” con la empresa Encore Biotecnology, quienes están comprando el desarrollo tecnológico a la UNAM. 1,000,000.

21. Convenio con CIBIOGEM "Diagnóstico, recopilación y análisis de la experiencia en el uso de algodón GM en México (2005-2015)", 1,300,000 pesos en 2016.

Corresponsable en los siguientes proyectos:

1. Evolución y Adaptación de Escherichia coli a vertebrados silvestres. CONACYT, aprobado el 13 de mayo 1994, responsable Dr. Luis Eguiarte. Con un gasto aprobado de $288,607 pesos por dos años.

2. Diversidad genética en plásmidos de Escherichia coli y su papel en la evolución y adaptación bacteriana. DGAPA 1995, responsable Dr. Alejandro Cravioto. Con un gasto aprobado de $480, 544 pesos por tres años.

3. Ecología conductual de reproducción y de alimentación del murciélago zapotero (Artibeus jamaisesis) en Yucatán. DGAPA 1995, responsable Dr. Héctor Arita. Con un gasto aprobado de $248,544 pesos por dos años.

4. Genómica de Rhizobium. Proyecto aprobado por CONACYT, responsable Dr. Julio Collado. Con un gasto aprobado de 20 millones de pesos.

5. Follow the elements. Proyecto aprobado por NASA por 36 millones de dolares, colaboracion con Arizona State. 2009-2014

6. Biological stoichiometry of microbes under severe P-limitation. Proyecto aprobado por NSF por 1.6 millones de dólares, colaboración con Arizona State. 2010-2013

6. Sociedades Científicas 1) Society for the Study of Molecular Evolution 2) American Society for Microbiology 3) American Association for the Advancement of Science 4) The Genetics Society of America 5) Sigma Phi 6) Sociedad Mexicana Científica Ecológica

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7) Biogeographical Society 8) American Geophysics Union 9) Evolution Society 10) Academia Mexicana de Ciencias 11) Sociedad Bioquímica Mexicana 7. Producción científica: Artículos de investigación en revistas arbitradas internacionales. Estos artículos han acumulado 2800 citas hasta ahora (ISI) *indica que VS es “corresponding author”

1. Gomez-Arroyo S. and V. Souza (1985) In vitro occupational induction of sister chromatid exchanges in human lymphocytes with furfural and furfurilic alcohol. Mutation Research, 156, 233-238 (13 citas). Impacto revista 1.868.

2. *Souza, V. and M. Puig (1987) Cytogenetic study in a group of workers exposed to thinner. Mutation Research, 189, 357-362. (4 citas) Impacto revista 1.868.

3. Souza, V., T. T. Nguyen, D. Hudson, D. Piñero and R. E. Lenski (1992). Hierarchical analysis of linkage disequilibrium in Rhizobium populations: Evidence for sex?. Proceedings of the National Academy of Science USA, 89, 8389-8393. (111 citas). Impacto revista 10.7.

4. *Souza, V., L.E. Eguiarte, G. Avila, C. Gallardo, R. Capello, J. Montoya and D. Piñero (1994). Genetic structure of Rhizobium associated with wild and cultivated beans. Applied and Environmental Microbiology. 60, 1260-1268. (45 citas). Impacto revista 3.691.

5. Lenski, R., V. Souza, L. P. Duong, Q. G. Phan, Thrinh, N. M. Nguyen, and K. P. Beltran (1994). Epistatic effects of promoter and repressor functions of the Tn10 tetracycline resistance operon on the fitness of Escherichia coli K12. Molecular Ecology 3, 127-135. (11 citas). Impacto revista 3.014.

6. Turner, P., V. Souza y R. Lenski (1996) Test of ecological mechanisms promoting the stable coexistence of recombinant bacterial genotypes. Ecology 77: 2119-2129. (36 citas), Impacto revista 3.918.

7. Souza, V., P. Turner and R. Lenski. (1997) Long-term experimental evolution in Escherichia coli IV: effects of recombination with exogenous genotypes on evolutionary dynamics. Journal of Evolutionary Biology 10: 743-769. (7 citas) Impacto revista 2.658.

8. *Souza, V., J. Bain, C. Silva, V. Bouchet, E. Márquez y L. Eguiarte (1997). Etnomicrobiology: do agricultural practices modify the population structure of the nitrogen fixing bacteria Rhizobium etli? Journal of Etnobiology. 17: 249-266. (8 citas). No indexada.

9. *Souza, V., and L. Eguiarte (1997) Bacteria gone native vs. bacteria gone awry?: Plasmidic transfer and bacterial evolution. Proceedings of the National Academy of Science USA, 94: 5501-5503. (16 citas). Impacto revista 10.7.

10. García-Franco, J. G., V. Souza, L. E. Eguiarte and V. Rico- Gray (1998) Population genetics of the tropical holoparasitic endophyte Bdallophyton bambusarum. Plant Systematics and Evolution.210: 271-288. (1 cita) Impacto revista 1.114.

10

11. *C. Silva, L. Eguiarte and V. Souza. (1999) Spatial analysis of Rhizobium etli biovar phaseoli in a traditionally mananged locality in Mexico. Molecular Ecology 8: 277-288. (24 citas). Impacto revista 3.014.

12. *Souza, V. M. Rocha, A. Valera and L.E. Eguiarte (1999) Genetic structure of natural populations of Escherichia coli in wild hosts on different continents. Applied and Environmental Microbiology 65: 3373-3385 (91 citas). Impacto revista 3.691

13. *Souza, V. M. Rocha, A. Valera and L.E. Eguiarte (2000) Letter to the editor concerning the publication "Genetic structure of natural populations of Escherichia coli in wild hosts on different continents." Applied and Environmental Microbiology. 66(11):5104-5105. Impacto revista 3.691

14. Peek A. S., V. Souza, L. E. Eguiarte and B. S. Gaut (2001) Selection and recombination at the type 1-fimbrial major subunit (fimA) in natural isolates of Escherichia coli. Journal of Molecular Evolution. 52: 193-204 Impacto revista 3.401 (21 citas).

15. *Sandner, L., L. Eguiarte, A. Navarro, O. Rodríguez, A. Cravioto and V. Souza. (2001) An analysis of the elements of the locus of enterocyte effacement in human and wild mammal isolates of Escherichia coli: evolution by assemblage or deconstruction? Microbiology 147: 3149-3158. Impacto revista 2.897.(6 citas)

16. *V. Souza, A. Castillo, L. Sandner, M. Rocha, C. Silva, E. Mancera y L. E. Eguiarte. (2001) Ecología evolutiva de Escherichia coli. Interciencia 26: 513-517. Impacto revista 0.125 (2 citas)

17. Solís-Guzmán G., J. Ramírez-Santos, V. Souza and M. C. Gómez-Eichelmann (2001) Analysis of the regulatory region of gene rpoH of Escherichia coli strains isolated from different non-human hosts. Fems microbiology Letters 205: 191-196. Impacto revista 1.804

18. *V. Souza, M. Travisano, P. Turner & L. E. Eguiarte (2002). Does experimental evolution reflect patterns in natural populations? Comparison of E. coli strains from long-term studies to those from wild isolates. Antoine van Leeuwenhoek. 81: 143-153. Impacto revista 0.988.

19. C. Mesa-Arango, M. R. Reyes-Montes, A. Perez-Mejia, H. Navarro-Barranco, V. Souza, G. Zúñiga y C. Toriello (2002). Pheno and genotyping of Sporonthrix schenckii according to the geographic origin of isolates and clinical form of Sporotrichosis. Journal of Clinical Microbiology 40 (8): 3004-3011. Impacto revista 3.565 (14 citas)

20. *V. Souza, A. Castillo and L. E. Eguiarte, 2002. Evolutionary ecology of Escherichia coli. American Scientist 90: 332-341. Impacto revista 1.337 (2 citas).

21. *C. Silva, P. Vinuesa, L. E. Eguiarte, E. Martínez-Romero and V. Souza. 2003. Rhizobium etli and Rhizobium gallicum nodulate common bean in a traditionally managed milpa plot in Mexico: population genetics and biogeographic implications. Applied and Environmental microbiology 69: 884-893. Impacto revista 3.691. (15 citas)

22. L. E. Eguiarte, A. Castillo y V. Souza. 2003. Evolución molecular y genómica en angiospermas, Interciencia 28: 1-8. Impacto revista 0.125

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23. Ivana Bjedov1, Olivier Tenaillon, Bénédicte Gérard, Valeria Souza, Erick Denamur, Miroslav Radman, François Taddei, and Ivan Matic. 2003. Stress-Induced Mutagenesis in Bacteria. Science 300: 1404-1409. Impacto revista 26.682.

24. P. Maravilla, V. Souza, A. Valera, Y. López-Vidal, J. Ambrosio S. Kawa, J.L. Dominguez-Alpizar and A. Flisser. 2003. Genetic variation in Taenia solium isolates. J. Parasitology. 89: 1250-1254. Impacto revista 1.828

25. P. Maravilla, V. Souza, A. Valera, Y. López-Vidal, M. Matínez-Gordillo and A. Flisser. 2003. Isozyme analysis in Taenia solium isolates from Mexico and Colombia. Memorias do instituto Oswaldo Cruz. 98: 1049-1050. Impacto revista 0.828

26. *Amanda Castillo-Cobián, Luis E. Eguiarte, and Valeria Souza. 2005 A genomic population genetics analysis of the pathogenic LEE island in E. coli: in search of the unit of selection. Proceedings of the National Academy of Science. 102: 1542-1547. Factor de impacto 10.5 (23 citas)

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107. Martha G. Rocha, , Luis E. Eguiarte, Alejandra Bravo, Mario Soberón, Saul Castañeda, Esteban Niaves, Enrique Scheinvar, David Mota-Sanchez, Enrique Rosales Robles, Jose Luis Martinez, Carlos Blanco, Urbano Nava-Canberros and Valeria Souza*. (2018) Evaluation of the impact of genetically modified cotton after 20 years of cultivation in Mexico" submitted to Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, section Biosafety and Biosecurity. In press

108. Velez Patricia; Espinosa-Asuar, Laura; Figueroa, Mario; Gasca-Pineda, Jaime; Aguirre-von-Wobeser, Eneas; Eguiarte, Luis; Hernandez-Monroy, Abril; Souza, Valeria (2018) Microfungi and bacteria from an oligotrophic desert oasis. PeerJ, en prensa

109. Patricia Velez, Margarita Ojeda, Laura Espinosa-Asuar, Tila M. Perez, Luis E. Eguiarte and Valeria Souza, 2018, Experimental and molecular approximation to microbial niche: trophic interactions between oribatid mites and microfungi in an oligotrophic freshwater system. PeerJ DOI 10.7717/peerj.5200

110. V. Souza, A. Moreno-Letelier, M. Travisano, L. D. Alcaraz, G. Olmedo-Alvarez, L. E. Eguiarte (2018). The lost world of Cuatro Cienegas Basin, a relictual bacterial niche in a desert oasis. eLife https://doi.org/10.7554/eLife.38278

111. Valerie De Anda Jazmín Blaz Cesar Poot-Hernandez5 Imarcos, maribel Hernandez; Luis Eguiarte1 Bruno Contreras Moreira3 and lcoquih Zapata-Peñasco6 Valeria Souza (2018). Temporal network dynamics of microbial mats from an ultraoligotrophic shallow lake in response to a deep aquifer depletion by agriculture special issue “Characterizing Modern Microbialites and The Geobiological Processes Underlying Their Formation” Frontiers in Microbiology, section Aquatic Microbiology.

112. Teresa Aguirezabala-Campano Oscar Gerardo-Nieto, Rodrigo Gonzalez-Valencia, Valeria Souza, Gabriela Olmedo-Alvarez, Frederic Thalasso (2019) Methane dynamics in the subsaline ponds of the Chihuahuan Desert: a first assessment. Science of the Total Environment. In press

113.

Artículos arbitrados no indexados

1. Rodriguez M. J. M. Souza V. Arriga Diaz de León L. E. 2007. Effect of overexploitation of the aquifer of the Hundido valley and the impact

20

on the ecological reserve of the Cuatro Ciénegas valley of Coahuila Mexico. Ciencia Fic. 1: 32-38.

2. Bonilla-Rosso, G., V. Souza y L. E. Eguiarte. 2008. Metagenómica, genómica y ecología molecular: la nueva ecología en el bicentenario de Darwin. TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas, 11(1):41-51.

3. Souza V, L. I. Falcón, J. J. Elser Y L. E. Eguiarte. 2007. Protecting a window into the ancient Earth: Towards a Precambrian Park at Cuatro Cienegas, Mexico. Evolutionary-Ecology.com/citizen page.

4. Eguiarte, Luis E., Jonás A. Aguirre-Liguori, Lev Jardón-Barbolla, Erika Aguirre-Planter y Valeria Souza. 2013. Genómica de poblaciones: nada en evolución va a tener sentido si no es a la luz de la genómica, y nada en genómica tendrá sentido si no es a la luz de la evolución. TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas, 16(1):42-56. ISSN 1405-888X.

Trabajos enviados y en revisión final.

1. Jordan G. Okie, A.T. Poret-Peterson, Zarraz M.-P. Lee ,Chris L. Dupont, Luis D.Alcaraz-Peraza, Luis E. Eguiarte, Janet L. Siefert, Valeria Souza, and James J. Elser. Metagenomic signatures of microbial growth and trophic strategy in a replicated whole-ecosystem nutrient enrichment experiment. Sometido a Limnology and Oceanography

2. Mirna Vazquez-Rosas-Landa1, Jonás Aguirre-Ligori1, Gabriel Yaxal Ponce-Soto1, Shalabh Thakur2, Enrique Scheinvar1, David Guttman2, Luis E. Eguiarte1 and Valeria Souza. Insights on the role of recombination and effective population size in pangenome. Lessons from Vibrionaceae within an endangered oasis. Revisando para reenviarse.

3. In vitro interactions among saprotrophic microfungi from a phosphorous-poor desert oasis in the Chihuahuan Desert: Implications for nutrient uptake Marini, Constanza; Muñoz, Luis; Gonzalez-Rubio, Aldo; Eguiarte, Luis; Souza, Valeria; Velez, Patricia. Canadian Journal of Microbiology. Enviado Junio 27 2018

4. Andrea González-González, Luna L. Sánchez-Reyes, Gabriela Delgado Sapien, Luis E. Eguiarte and Valeria Souza. Genome size variation of Escherichia coli associated to different ecological backgrounds in Mexico. Por enviarse.

7.1 Libros

1. Eguiarte L, V. Souza y X. Aguirre. editores, 2007. Ecología Molecular, INE, Mexico DF.

2. Souza, V. Eguiarte L. E., Espinoza-Asuar L. y Equihua C. Biología, Texto 5º preparatoria, editorial Macmillan, 2013, 50,000 ejemplares primera edición.

3. Souza, V. Eguiarte L. E., Espinoza-Asuar L. y Equihua C. Biología, Texto 5º

21

preparatoria, editorial Macmillan, 2019, segunda edición bajo el programa nuevo UNAM.

4. V. Souza y L.E. Eguiarte editores, serie de 7 libros: Cuatro Cienegas Basin: An endangered hyperdiverse oasis, Springer. Primeros 2 libros en revisión por la editorial, mayo 2018.

7.2 Capítulos en libros.

1. Eguiarte, L. E., y V. Souza (1993). Evolución experimental en bacterias: Diez mil generaciones del experimento de Irvine, California. Tópicos de Biología Evolutiva. J. Nuñez-Farfán and C. Cordero (eds.) Centro de Ecología UNAM. México D. F. pp 129-153.

2. Eguiarte L. E. , V. Souza, J. Nuñez-Farfán y B. Hernández-Baños (1997) El análisis filogenético: Métodos, problemas y perspectivas, en Michán A. L y J.E. Llorente-Bousquet (compiladores), La taxonomía en México en la segunda mitad del siglo XX, págs 326 a 338 (reimpresión del artículo aparecido en el Boletín de la Sociedad Botánica de México 60: 169-181).

3. Souza, V. y L. Eguiarte (2001) Evolución experimental en bacterias: Objetivos y Perspectivas. Tópicos de Biología Evolutiva II. J. Nuñez-Farfán y J. C. Zamora (eds.) Co-edición instituto de Ecología UNAM. México D.F.

4. Valeria Souza, Martha Rocha, Luisa Sander y Luis E. Eguiarte (2001) Historia natural, ecología y evolución de la patogenicidad en Escherichia coli. En: Microbios en línea. E. Martinéz Romero y J. Martínez Romero (eds). Libro virtual editado por UNAM. ISBN:968-36-8879-9. http://biblioweb.dgsca.unam.mx/libros/microbios/ pp. 69-89.

5. Evan Carson, Tom Dowling, Luis E. Eguiarte, Jim Elser, Ana Escalante, Jack Farmer, Ferran García-Pichel, Peter Roopnarine, Valeria Souza, Carol Tang y Brian Wade (por orden alfabetico). 2004. Cuatro Ciénegas: un laboratorio vivo para el estudio de la biosfera actual y la del pasado. Bajo el desierto: el misterio de las agues de Cuatro Ciénegas. edición La venta, exploring team books. traducido en 4 idiomas: español, inglés, francés e italiano. 88-96. Tintoreto editione. Italia.

6. Valeria Souza, Ana Escalante, Ana Noguez, Laura Espinosa, René Cerritos y Luis E. Eguiarte. Ecología microbiana: una nueva ciencia para un nuevo siglo. 2004. Ecología Microbiana. UNAM/CONABIO. INE ISBN: 968-817-707-5, México.

7. Souza, V. A. Escalante, A. Noguez, L. Espinosa, R. Cerritos y L.E.Eguiarte (2005) La Ecologia microbiana: una nueva ciencia para un nuevo siglo. I. Rosas, A. Cravioto y E. Ezcurra, compiladores Microbiología ambiental. Semarnat, INE y PUMA- UNAM, México, D.F., México. ISBN 968-817-707-5. Págs. 107-134.

8. Eguiarte L.E. y V. Souza. Historia natural del Agave y sus parientes: Evolución y Ecología. En P. Colunga-García Marín, A. LarquéSaavedra, L. E. Eguiarte, y D Zizumbo-Villareal, eds., 2007. En lo ancestral hay futuro: del tequila, los mezcales y otros agaves. Cicy, Mérida, Yucatán, México. ISBN 978-968-6532-18-0. págs. 3-21. 2 citas.

22

9. V. Souza, 2007, Recursos Naturales y desarrollo sustentable. En: Recursos naturales y sustentabilidad ed. Juan Manuel Alcocer González (comp.) Fondo editorial de Nuevo León, Monterrey Mexico

10. Piñero, D., J. Caballero-Mellado, Luis E. Eguiarte, V. Souza,... et al. (50 coautores). (2008). La diversidad genética como instrumento para la conservación y el aprovechamiento de la biodversidad: estudio en especies mexicanas. En J. Soberón, G. Halffer y J. Llorente-Bousquets. Compiladores, Conocimiento actual desde la biodiversidad, Capital Natural de México Volumen 1, CONABIO, Méx, D.F., México, ISBN 978-607-7607-03-8. Págs. 437-494.

11. Eguiarte, L.E., J. Nuñez-Farfán, V- Souza, C. Domínguez y C. Cordero (2009) La reproducción en las angiospermas: Perspectivas ecológicas y evolutivas en el bicentenario de Darwin. En J.J. Morrone y P. Magaña, editores. Evolución Biológica. Una visión actualizada de la revista Ciencias. Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México, México, D.F., México. ISBN 978-607-0711-2. Págs. 135- 165.

12. Eguiarte LE, Souza V y Guarner V. (2012) Evolución y salud. En Gustavo Sánchez Torres y Verónica Guarner Lans eds. Cardiología Evolutiva. Instituto Nacional de Cardiología “Ignacio Chávez”, México D.F., México, ISBN: 978-1-105-51702-0. Págs. 1-15.

13. Luna Sánchez, Andrea González, Valeria Souza y Luis E. Eguiarte (2012) Patogénesis Bacteriana: Ecología y Evolución. En Gustavo Sánchez Torres y Verónica Guarner Lans eds. Cardiología Evolutiva. Instituto Nacional de Cardiología “Ignacio Chávez”, México D.F., México, ISBN: 978-1-105-51702-0. Págs. 157-166.

14. Eguiarte, Luis E., Erika Aguirre-Planter, Enrique Scheinvar, Andrea González González y Valeria Souza (2012) Diferenciación, flujo génico y estructura genética de las poblaciones, con énfasis en especies de plantas mexicanas. En América N. S. , A. Becerra y D. Piñero, eds. Evolución. Facultad de Ciencias, UNAM. En revisión.

15. Souza Valeria, Eria Rebollar, Germán Bonilla-Rosso, Laura Espinosa-Asuar, Nguyen E. López Lozano, Morena Avitia, Andrea González y Luis E. Eguiarte (2012) ¿Por qué hay tantas especies de microbios? En: Biodiversidad Microbiana de México. Ed. Javier Álvarez Sánchez, Dra. Pilar Rodríguez Guzmán y Alejandro Alarcón. SAGARPA, Colegio de Postgraduados y Facultad de Ciencias, UNAM, México.

16. Luis David Alcaraz, Varinia López-Ramírez, Alejandra Moreno-Letelier, Luis Herrera-Estrella, Valeria Souza y Gabriela Olmedo-Alvarez. 2012. Genomics of bacteria from an ancient marine origin: clues to survival in an oligotrophic environment. Chapter XX. Genomics and Geology.

17. German Bonilla, Valeria Souza. 2014 Functional and Taxonomic Diversity of the Nitrogen Cycling Guild in the Sargasso Sea Metagenomes. En: Metagenomics of the Microbial Nitrogen Cycle: Theory, Methods and Applications; Caister Academic Press / Horizon Scientific Press, Norwich,

18. Valeria Souza, Silvia Pajares y Luis Eguiarte, Ecología y evolución de bacterias, tapetes microbianas y estromatolitos: bioindicadores de la historia de la vida en la

23

tierra. Capítulo 5 en González Zuarth , C. A., A. Vallarino, J. C. Pérez Jiménez y A. M. Low Pfeng (eds.). 2015. Bioindicadores: guardianes de nuestro futuro ambiental. Instituto Nacional de Ecología y Cambio Climático (INECC) - El Colegio de la Frontera Sur (ECOSUR). México. ISBN 978-607-8429-05-9 .

19. Eguiarte, Luis E., Erika Aguirre-Planter, Enrique Scheinvar, Andrea González González y Valeria Souza (2015) Diferenciación, flujo génico y estructura genética de las poblaciones, con énfasis en especies de plantas mexicanas. En A. Becerra, A. Castañeda Sortibrán y D. Piñero, eds. Evolución orgánica. Facultad de Ciencias, UNAM. ISBN: 978-607-02-6738-3. Págs. 77 a 110. 450 págs.

20. Valeria Souza, Alejandra Moreno, Gabriela Olmedo, Luis Eguiarte and Michael Travisano (2017) A microbial lost world that still lives in an very endangered oasis in the Chihuahuan desert. Capítulo por invitación para el libro: Sustainable future of life in the desert. Editado por UNESCO. ISBN: 978-607-9376-47-5

21. Olmedo-Alvarez, Gabriela, Valeria Souza, Luis Eguiarte, Silvia Pajares, Felipe García-Oliva, Yunuen Tapia-Torres (2017) Cuatro Cienegas, example of non-sustainable agriculture. Capítulo por invitación para el libro: Sustainable future of life in the desert. Editado por UNESCO. ISBN: 978-607-9376-47-5

22. L. E. Eguiarte, V. souza. Origen y evolución de la producción de alimentos. Editado por UNESCO. En revision, enero 2016.

23. Valeria Souza, Gabriela Olmedo Alvarez y Luis E. Eguiarte. 2017. Diversidad genética microbiana en Cuatro Ciénegas. En La biodiversidad en Coahuila. Estudio de Estado, Vol. II. Conabio/Gobierno del Estado de Coahuila de Zaragoza, México.

24. Valeria Souza, Gabriela Olmedo Alvarez y Luis E. Eguiarte. 2017. Genómica ambiental y metagenómica para describir la diversidad microbiana en Cuatro Ciénegas. En La biodiversidad en Coahuila. Estudio de Estado, Vol. II. Conabio/Gobierno del Estado de Coahuila de Zaragoza, México.

25. V. Souza y L.E. _Eguiarte, 2017, Bacterias, estromatolitos y tapetes microbianos de cuatro cienegas: un oasis donde se guardo la vida. “Cuatro Ciénegas y su estado de conservación a través de sus peces. editado por Mauricio de la Maza. Editorial Pronatura Noreste, pp26-31

26. Luis E. Eguiarte y Valeria Souza. Origen y evolución de la producción de alimentos. Nuria Sanz, editora. Producción de alimentos en México y en el mundo. Unesco México.

27. Valeria Souza, Luis E. Eguiarte James J. Elser, Michael Travisano and Gabriela Olmedo. 2018 A microbial saga: How to study an unexpected hot spot of microbial bio-diversity from scratch? En: Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology. Springer

28. Valeria Souza, Luis E. Eguiarte 2018. In the beginning, there was fire: Cuatro Ciénegas Basin (CCB) and the long history of life on Earth En: Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology. Springer

29. Isa,P Taboada B., Gutiérrez A.L., Chávez, P. del Ángel R.M., Ludert J.E., Espinosa A.C.,Eguiarte L. E., Garrido E, López S, Souza V, Arias C. 2018. Hyper-diverse viral communities in an oligotrophic oasis (Cuatro Ciénegas): marine affinities and micro-geographic differentiation, En: Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History

24

and Microbiology. Springer 30. Zulema Gomez-Lunar, Mirna Vázquez-Rosas-Landa, Gabriel Yaxal Ponce-Soto,

Alejandra Moreno-Letelier, Luis E. Eguiarte and Valeria Souza y Gabriela Olmedo-Alvarez 2018. How divergent is the Cuatro Ciénegas oasis? Genomics studies of microbial populations and niche differentiation. En: Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology. Springer

31. Patricia Vélez Laura Espinosa-Asuar, Michael Travisano, Luis E. Eguiarte and Valeria Souza.2018. The niche at the edge of life, or the microbial ecology (including microfungi) of Cuatro Ciénegas: mutualisms with locals, antagonisms against foreigners. En Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology. Springer.

32. Nguyen E. López-Lozano, Silvia Pajares, Gabriela Olmedo, Ana Escalante, Luis Eguiarte and Valeria Souza. 2018 Microcosms and mesocosms: a way to test resilience of microbial communities CCB. En Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology. Springer.

33. Maria Dolores Rodriguez Torres, Luis David Alcaraz, Valeria Souza, Gabriela Olmedo Alvarez. 2018.Single genus approach to understanding bacterial diversity, niche, distribution and genomics: the Bacillus in Cuatro Ciénegas. En Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology. Springer.

34. Héctor Arocha-Garza, Hamlet Avilés-Arnaut, Nahui Olin Medina-Chávez, Mario Figueroa, Valeria Souza and Susana De la Torre-Zavala. 2018. Bioprospecting in Cuatro Cienegas, a set of open possibilities to save the ecosystem. En Cuatro Ciénegas Ecology, Natural History and Microbiology. Springer.

35. Yunuen Tapia-Torres, Patricia Vélez, Felipe García-Oliva, Luis E. Eguiarte and Valeria Souza. 2018. How to understand the effect of nutrients availability on the ecological role of filamentous microfungi: lessons from elemental stoichiometry. En Ecosystem ecology and geochemistry of Cuatro Cienegas: How to survive in an extremely oligotrophic site. Editors: Jim Elser, Felipe Garcia Oliva and Valeria Souza. Springer.

36. Jorge Valdivia-Anistro, Luis Eguiarte and Valeria Souza (2018).Ecological adaptability of Bacillus to the extreme oligotrophy of the Cuatro Cienegas Basin. En Ecosystem ecology and geochemistry of Cuatro Cienegas: How to survive in an extremely oligotrophic site. Editors: Jim Elser, Felipe Garcia Oliva and Valeria Souza. Springer.

37. Valerie De Anda, Icoquih Zapata-Peñasco and Valeria Souza (2018) Towards a comprehensive understanding of environmental perturbations in microbial mats from the Cuatro Cienegas Basin by network modeling. En Ecosystem ecology and geochemistry of Cuatro Cienegas: How to survive in an extremely oligotrophic site. Editors: Jim Elser, Felipe Garcia Oliva and Valeria Souza. Springer.

38. Icoquih Zapata-Peñasco, Santiago Bautista-López, Valeria Souza (2018) The magnetotactic bacteria of the Churince Lagoon at Cuatro Cienegas Basin. En Ecosystem ecology and geochemistry of Cuatro Cienegas: How to survive in an extremely oligotrophic site. Editors: Jim Elser, Felipe Garcia Oliva and Valeria Souza. Springer.

25

39. James Elser1,2, Jordan Okie1, Zarraz Lee1 and Valeria Souza (2018). The effect of nutrients and N:P ratio on microbial communities: testing the Growth Rate Hypothesis and its extensions in Lagunita Pond (Churince). En Ecosystem ecology and geochemistry of Cuatro Cienegas: How to survive in an extremely oligotrophic site. Editors: Jim Elser, Felipe Garcia Oliva and Valeria Souza. Springer.

40. Valerie De Anda, Icoquih Zapata-Peñasco, and Valeria Souza (2018). The sulfur cycle as the gear of the “clock of life”: the point of convergence between geological and genomic data in the Cuatro Cienegas Basin. En Ecosystem ecology and geochemistry of Cuatro Cienegas: How to survive in an extremely oligotrophic site. Editors: Jim Elser, Felipe Garcia Oliva and Valeria Souza. Springer.

3 7.3 Artículos en revistas nacionales y de difusión

1. L. E. Eguiarte, V. Souza A. Silva-Montellano (2000) Evolución de la familia Agavaceae: filogenia, Biología reproductiva y genética de poblaciones. Boletín de la Sociedad Botánica de México. 66: 131-150 (4 citas).

2. L. Eguiarte, V. Souza, J. Núñez-Farfán y B. Hernández-Baños (1997). El análisis filogenético: Métodos, problemas y perspectivas. Boletín de la Sociedad Botánica de México. 60: 169-181.

3. L. E. Eguiarte, V. Souza, J. Núñez-Farfán (1998) La revolución Darwiniana y la evolución molecular. TIP Revista especializada en Ciencias Químico Biológicas, UNAM, Facultad de Estudios superiores Zaragoza. 1: 8-16.

4. Valeria Souza, Ana Escalante, Laura Espinosa, Ferrán García-Pichel , Jim Elser, Aldo Valera, Antonio Cruz y Luis E. Eguiarte. 2004. Los microbios de Cuatro Ciénegas: un laboratorio natural para el estudio de la Astrobiología. Ciencias 75: 4-12.

5. Luisa I. Falcón, Luis E. Eguiarte y Valeria Souza. 2005. Microbiologia evolutiva: los estromatolitos de Cuatro Ciénegas. Scientific American Latinoamérica. año 3 num. 32, pp30-31

6. Laura Espinosa, Ana Escalante y Valeria Souza. 2005. El mar en el desierto y su relevancia para la conservación. Revista Biodiversitas CONABIO. 7-15.

7. Amanda Castillo, Luisa I. Falcón y Valeria Souza. 2005. El mar, el origen y la evolución de la vida. Revista Ciencia y Desarrollo de CONACyT. Septiembre. 51-53.

8. V. Souza y L. Falcón 2006.Las bacterias, clave de la evolucion. Revista Ciencia y Desarrollo de CONACyT.junio 33-37.

9. Eguiarte L.E. y Valeria Souza. 20 años de Genética Evolutiva en México: Estudios en plantas y bacterias. Ciencias, revista de difusión. Número especial Ecología, 2006. R. Dirzo y H. Arita, eds.

10. V. Souza y L. Eguiarte (2006) Cuatrociénegas Coahuila está muriendo. En la revista electrónica del Cinvestav: CienciaVivaW3.. http://www.cienciavivaw3.net/cvw3/ index.php?option=com_content&Itemid=2&task=view&id=71.

26

11. Valeria Souza y Laura Espinosa-Asuar 2007 Cuatro Ciénegas: un ecosistema para entender el pasado, en peligro de extinción. Revista Especies, abril.

12. Valeria Souza. Desert Dessert, end paper Natural History septiembre 2011. 13. Gene pool offers way to save Mexican oasis. Nature, 3 August 2011 | Nature 476,

19 (2011) | doi:10.1038/ entrevista por Nicola Jones 14. Gabriela Olmedo, Valeria Souza y Luis Eguiarte. 2013. Las bacterias

extraordinarias de las pozas de Cuatrociénegas, Coahuila: como saber quién vive ahí, de dónde vinieron y qué son capaces de hacer.Revista ciencia y desarrollo CONACYT.

15. V. Souza y M. Viladomat, 2016, La larga marcha del oxígeno en la Tierra: mortal para unos, indispensable para otros. Oikos=, septiembre 2016

16. V. de Anda y V. Souza, 2016 Azufre, el elemneto incomprendido de la biogeoquímica planetaria. Oikos=, Septiembre 2016.

7.4 Trabajos no arbitrados y memorias de congresos.

1. Gómez-Arroyo, S. y V. Souza Inducción de ICH en linfocitos humanos por alcohol furfurílico y furfural in vitro e in vivo. IX Congreso Nacional de Genética Humana, Zacatecas.1984

2. Souza,V.,M. Puig y S. Gomez-Arroyo. Monitoreo genético de una población ocupacionalmente expuesta a solventes. III Simposio Anual de ciencias y sistemas biológicos, UNAM.1985

3. Puig, M., V. Souza y S. Gómez-Arroyo. ICH provocados por tiner en linfocitos humanos en cultivo y en poblaciones ocupacionalmente expuestas. III Simposio Anual de ciencias y sistemas biológicos, UNAM.1985

4. Eguiarte, L., A. Búrquez, C. Martínez del Río, H. Arita y V. Souza. Estudios de plantas polinizadas por murciélagos. III Simposio Anual de ciencias y sistemas biológicos, UNAM.

5. Eguiarte, L., A. Búrquez y V. Souza. Pollination and reproductive biology of Manfreda brachystachia (Cav.) Rose. 36th Annual AIBS Meeting,Gainesville Florida.1985

6. Souza, V. y S. Gomez-Arroyo. Inducción de ICH por diversos compuestos de níquel en cultivo de linfocitos humanos y su relevancia en la carcinogénesis. X Congreso Nacional de Genética Humana, Oaxaca.1985

7. Puig, M., S. Gomez-Arroyo, V. Souza y M. Reyes. Efecto citogenético del tiner y el Ad-Acryl en poblaciones ocupacionalmente expuestas. X Congreso Nacional de Genética Humana, Oaxaca.

8. Souza, V., L. Eguiarte,E. Solis, y M.Cevallos. Leguminosas y Rhizobiaceae: Estudio de poblaciones naturales en Chamela Jalisco. X Congreso de Botánica, Guadalajara. 1987

9. López-Portillo, J., y V. Souza. Variación en la abundancia de estomas y glándulas de tres especies de mangles en un gradiente salino de la Laguna de Sontecomapan, Veracruz. X Congreso de Botánica, Guadalajara. Octubre 1987 .

10. Piñero, D., A. Valdez, V. Souza, R. Selander, R. Palacios y E. Martínez. Population genetic structure in Rhizobium leguminosarum biovar phaseoli: evolutionary and

27

biotechnological consecuences. IV International Symposium on Molecular Genetics of Plant-Microbe Interactions, Acapulco. Junio 1988.

11. Ávila, G., C. Martínez, R. Capello y V. Souza. Genética de poblaciones y ecología de Rhizobium leguminosarum biovar phaseoli asociado al frijol ayocote Phaseolus coccineus en Morelos. XI Congreso de Botánica Morelos. Octubre 1990.

12. Turner,P., V. Souza y R. Lenski. Fitness effects due to recombination in otherwise clonal populations of bacteria. Annual Meeting of the Society for the Study of Evolution. Hawaii. Julio 1991.

13. Souza, V., T. Nguyen, D. Hudson, D. Piñero and R. Lenski. A hierarchical analysis of linkage disequilibrium in Rhizobium associated with bean plants. The Gordon Conference on Population Biology and Evolution of Microorganisms. New Hampshire julio 1991.

14. Souza, V., P. Turner and R. Lenski. Paradoxical fitness effects due to recombination in bacteria. Reunión anual del California population genetics (CALPEG). San Francisco Diciembre 1991.

15. Souza, V., P. Turner and R. Lenski. Long-term experimental evolution in Escherichia coli: effects of recombination with exogenous genotypes on evolutionary dynamics. II Forum of the Center for Microbial Ecology. E. Lansing Octubre 1991.

16. Souza, V., P. Turner and R. Lenski. Effects of recombination with exogenous genotypes on evolutionary dynamics in a long-term experimental evolution in Escherichia coli: The Gordon Conference on Population Biology and Evolution of Microorganisms. New Hampshire. julio 1993.

17. Souza, V., L. Eguiarte, P. Turner and R. Lenski. Genetic analysis of recombination with exogenous genotypes in a long-term experiment in Escherichia coli The Evolution Meeting, Athens, Georgia junio 1994.

18. Souza, V., Claudia Silva, V. Bouchet, E. Márquez y L. Eguiarte. Rhizobium etli in three localities of central Mexico: Is the population structure influenced by the agricultural practices. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire Julio.

19. Souza V., M. Rocha y L. Eguiarte. Escherichia coli is more variable and less clonal than what we thought. Evidence from a large collection of wild mammals. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire julio 1995.

20. Souza V. C. Silva, V. Bouchet y E. Márquez. Estructura genética de Rhizobium etli y de su planta hospedera Phaseolus vulgaris y P. coccineus en dos comunidades en Puebla. XIII Congreso Mexicano de Botánica, Morelos. Mex. noviembre 1995.

21. Souza V. Sandner L. Rocha, M. y Eguiarte, L. The genetic structure of wild E. coli and the evolution of pathogenicity. I International Workshop on molecular epidemiology and evolutionary genetics of pathogenic microorganisms. Atlanta, Georgia. junio, 1996.

22. Souza V. Gordon D. Sandner L. Rocha, M. y Eguiarte, L. The genetic structure of wild E. coli at the chromosomal and plasmidic level. Annual meeting of The Society for the Study of Evolution. St. Louis, Missouri. junio 1996.

28

23. Souza V., M. Rocha y L. Eguiarte Linkage disequilibrium and effective population size in natural populations of Escherichia coli from wild mammals.Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire julio 1997.

24. Luisa Sandner, L. Eguiarte Luis Eguiarte, Armando Navarro, and Alejandro Cravioto. Evolution of pathogenicity and antibiotic resistance in E. coli from wild mammals. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire julio 1997

25. Claudia Silva, Valeria Souza and Aldo Valera. Spatial genetic structure of R. etli associated to indigenous culivars of the common bean. Gordon Conferences in Population Biology of Microorganisms. Plymouth, New Hapshire julio 1997.

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125. Eneas Aguirre-von-Wobeser, Gloria Soberón-Chávez, Gabriel Yaxal Ponce-Soto, Mirna Vázquez, Luis E. Eguiarte, Valeria Souza. 2013. Antagonism networks from gamma proteobacteria from Cuatro Ciénegas, and the rock, paper and

scissors theory.Presentación oral. Third Meeting of Biochemistry and Molecular Biology of Bacteria, Sociedad Bioquímica Mexicana, Cuatro Ciénegas, Coahuila. Octubre 3 - 7, 2013.

126. Morena Avitia Cao Romero, Ana E. Escalante Hernández, Eria Alaide Rebollar Caudillo, Alejandra Moreno Letelier, Luis Enrique Eguiarte Fruns and Valeria Souza Saldívar. 2013. Demographic expansion in sympatric bacterial lineages revealed by coalescent analyses. Poster. Third Meeting of Biochemistry and Molecular Biology of Bacteria, Sociedad Bioquímica Mexicana, Cuatro Ciénegas, Coahuila. Octubre 3 - 7, 2013.

127. Eguiarte Fruns Luis E. y Valeria Souza. 2013. The evolution of biodiversity in plants: Classic questions - new approaches and paradigms, with special reference to studies of Mexican diversity. Simposio Plant molecular systematics and biodiversity, dentro del XV Congreso Nacional de Bioquímica y Biología Molecular de Plantas y 8vo. Simposio México-Estados Unidos. Hotel Occidental Grand Xcaret de la Riviera Maya, del 21 al 25 de octubre de 2013

128. Y. TAPIA TORRES, D. Rodríguez Torres, A. Islas, H. Cadillo, V. Souza, J. Elser, G. Olmedo, F. Garcia Oliva;Diversity of P Acquisition Strategies by Soil Bacteria in an Oligotrophic Ecosystem.114th general meeting ASM. Boston Massachusetts 17-20 de mayo 2014

129. Valeria Souza, Luis Enrique Eguiarte et al.,The total inventory of Cuatro Ciénegas (Coahuila, Mexico): Patterns and evolutionary causes of high diversity of an oligotrophic aquatic ecosystem. Evolution meeting 2014, Raleigh North Carolina, USA junio 20-24, 2014.

130. Luis Enrique Eguiarte, Jonas Aguirre, Valeria Souza. Population genetics and phylogeography of wild maize along environmental gradients. Evolution meeting 2014, Raleigh North Carolina, USA junio 20-24, 2014.

131. Pedro Márquez-Zacarías, Jorge Valdivia-Anistro, Gabriela Delgado-Sapien, Luis Eguiarte, Valeria Souza. Variability of rRNA operon number and its effect in the growth parameters of Bacillus isolates from an oligotrophic ecosystem. Evolution meeting 2014, Raleigh North Carolina, USA junio 20-24, 2014.

38

132. The role of recombination in the evolution and ecology of pathogenesis inVibrio: population studies in shrimp farms in Mexico North PAcific. Alain Heres, Luis E. Eguiarte, Valeria Souza and Luis David Alcaraz Gordon Conference sobre Microbial Populations en Proctor Academy Julio 19 a 24, 2015

133. Comparative and population genomics of Vibrio: High clonality and local adaptation in Cuatro Cienegas. Mirna Vazquez-Rosas, Valeria Souza, Gabriel Yaxal Ponce and Luis E. Eguiarte Gordon Conference sobre Microbial Populations en Proctor Academy Julio 19 a 24, 2015

134. Metagenomics as a conservation tool of Cuatro Cienegas Basin; the case of sulfur cycle. Valerie Yselle De Anda Torres, Valeria Souza Saldivar, Luis Eguiarte Fruns Gordon Conference sobre Microbial Populations en Proctor Academy Julio 19 a 24, 2015

135. A lost world. Microbial hiper diversity in Cuatro Cienegas Coahuila. Valeria Souza, Alejandra Moreno Letelier, Michael Travisano, Luis Eguiarte. Gordon Conference sobre Microbial Populations en Proctor Academy Julio 19 a 24, 2015.

136. Valeria Souza y Luis E. Eguiarte. 2015. Cuatro Ciénegas: La paradoja del agua en el desierto. Conferencia Magistral por invitación. XXII Reunión anual de la Sociedad de Ecología de Chile. Hostería El Copihue, Olmúe, Chile. Del 03 al 06 de Noviembre de 2015.

137. Valeria Souza y Luis E. Eguiarte. 2015. Cuatro Ciénegas: La paradoja del agua en el desierto. Seminario Institucional Facultad Ciencias Naturales y Exactas. Universidad de Playa Ancha, Valparaíso, Chile. 16 de noviembre del 2015.

138. Luis E. Eguiarte. 2016. Ecología, ecologismo y conservación: bases científicas de la sustentabilidad. Simposio-Taller Sustentabilidad y conservacion: de Cuatrociénegas al mundo. 18 al 20 de marzo, 2016. Cuatro Cíenegas Coahuila.

139. Luis E. Eguiarte, Valeria Souza, Mirna Vázquez, Alan Heres, Luis David Alcaraz 2016. Mexican Pacific shrimp farms survey: microbial diversity, molecular markers of the water quality, and vibriosis. ASLO Summer meeting. Santa Fe, New Mexico, EUA. 5 al 10 de junio del 2016. Presentación oral.

140. Souza, V., Eguiarte, L.E., Moreno-Letelier, A., Travisano, M., Olmedo, G. 2016. Cuatro Cienegas basin, an ancestral refugia and a hyperdiverse oasis in the Chihuahuan desert, Coahuila Mexico. ASLO Summer meeting. Santa Fe, New Mexico, EUA. 5 al 10 de junio del 2016. Presentación oral .

141. Valeria Souza y Luis E. Eguiarte. 2016. Envrionmental DNA and Molecular Ecology: Methods and andvances illustrated with examples from Cuatro Ciénegas and shrimp farms. En el “Workshop on Forensinc Acarology and Taphonomy”, organizado por la Bangor Unive.rsity y la Universidad Autónoma de Querétaro. Querétaro, Querétaro, México, del 13 al 17 de septiembre, 2016.

142. Valeria Souza, Luis E. Eguiarte, Alejandra Moreno- Letelier, Michael Travisano, Gabriela Olmedo. THE LONGEST EVOLUTIONARY EXPERIMENT CUATRO CIENEGAS BASIN, AN ANCESTRAL REFUGIA in COAHUILA MEXICO. Beacon Meeting Evolution in Action, Michigan State University. Agosto 5-10, 2016

39

143. Luis E. Eguiarte y Valeria Souza. 2016. Evolución de plantas en México. Conferencia magistral por invitación. V Congreso de Ecología de la Universidad Estatal de Sonora, Hermosillo, Sonora, México, del 2 al 4 de noviembre del 2016.

144. Valeria Souza, Luis Eguiarte, Gabriela Olmedo, Alejandra Moreno, Cuatro Cienegas, el paraiso perdido Conferencia magistral por invitación. V Congreso de Ecología de la Universidad Estatal de Sonora, Hermosillo, Sonora, México, del 2 al 4 de noviembre del 2016

145. Valeria Souza, Mirna Vazquez Landa, Gabriel Yaxal Ponce Soto y Luis E. Eguiarte. 2017. Vibrio comparative genomics from an extraordinary oasis in Mexico: Can we explain the origins of pathogenicity?,10th Global Microbial Identifier Meeting 2017, 15- 17 de Mayo 2917, Cabo San Lucas, Baja California Sur, México.

146. Valeria Souza y Luis E. Eguiarte. 2017. La importancia de la biodiversidad en las zonas áridas en el cumplimiento de los objetivos de desarrollo sustentable. Conferencia Magistral en el Encuentro internacional para las sustentabilidad de las zonas áridas. Instituto Potosino de investigación científica y tencológica A.C. 22-26 de mayo 2017. San Luis Potosí, México

147. Margarita Ojeda, Luis E. Eguiarte y Valeria Souza. 2017. Diversidad y abundancia de los microartrópodos edáficos en Cuatro Ciénegas, Coahuila y su importancia como bioindicadores. Cartel. VI Congreso Mexicano de Ecología, 30 de Julio al 4 de Agosto del 2017, Poliforum, León, Gto.

148. Vazquez-Rosas-Landa, M; Thakur, S; Ponce-Soto, GY; Ibarra-Laclette, E; Eguiarte, LE; Guttman, D. y Souza, V. 2017. High clonality and local adaptation shapes Vibrionaceae lineages within an endangered oasis. Presentación oral. VI Congreso Mexicano de Ecología, 30 de Julio al 4 de Agosto del 2017, Poliforum, León, Gto.

149. Luis E. Eguiarte, Jonás Aguirre Liguroi, Margaux-Alison Fustier, Alejandra Gutiérrez Estrada, Alejandra Moreno-Letelier, Salvador Montes-Hernández, Valeria Souza , Brandon S. Gaut, Maud I. Tenaillon. 2017. Genómica de poblaciones y recursos genéticos del teosinte. Simposio “Ecología genética: genómica y agrobiodiversidad”. Presentación oral por invitación. VI Congreso Mexicano de Ecología, 30 de Julio al 4 de Agosto del 2017, Poliforum, León, Gto.

150. Luis E. Eguiarte, Valeria Souza, Gabriela Castellanos Morales, Erika Aguirre Planter y Rafael Lira. 2017. Recursos genéticos de plantas Mexicanas: poblaciones silvestres, razas criollas, cambio climático y mejoramiento. Simposio “Agricultura después de la Revolución Verde: ¿Cuál será el papel de los ecólogos?” Presentación oral por invitación. VI Congreso Mexicano de Ecología, 30 de Julio al 4 de Agosto del 2017, Poliforum, León, Gto.

151. Valeria Souza, Gabriela Olmedo, Valerie de Anda, Mirna Rozas Landa, Gabriel Yaxal Ponce-Soto y Luis E. Eguiarte. 2017. Ecología microbiana en Cuatro Ciénegas Coahuila. Simposio “Ecología microbiana”. Presentación oral por invitación. VI Congreso Mexicano de Ecología, 30 de Julio al 4 de Agosto del 2017, Poliforum, León, Gto.

40

152. Luis E. Eguiarte y Valeria Souza. 2017. Agaves y murciélagos: polinización, producción de mezcal y tequila y conservación. Conferencia de la Cátedra Gustavo Aguirre Benvides, Secretaria del Medio Ambiente de Coahuila, en la Expo Agro Industrial y Ganadera, Canacintra, Centro de Exposiciones Canacintra, Saltillo, Coahuila, 16 de junio del 2017.

7.5 Conferencias Internacionales y Nacionales por invitación. 1. Souza V. Is sex in E. coli really necessary: experiments and future research.

Zoology Department seminar, Universidad de Texas en Austin, septiembre 1994. 2. Souza V. Session leader and introduction to the clonality and recombination in

microbial populations. Gordon Conferences in Population Biology of 3. Souza V, V. Bouchet, M. Rocha, D. Gordon, L. Eguiarte. Linkage desequilibrium

and effective population size in natural populations of Escherichia coli from wild mammals. Sesión plenaria, II International Workshop on molecular epidemiology and evolutionary genetics of pathogenic microorganisms. Montpellier, Francia. Mayo 1997.

4. Souza V. Do we know who is E. coli ¿ UCI, Irvine California Seminario departamental Septiembre 1999.

5. Souza V. y L. E. Eguiarte ¿Sabemos quien es Escherichia coli? Un estudio de genética de poblaciones y evolución molecular. Invitada al simposio "Ecologia tropical para el siglo XXI" Caracas, Venezuela noviembre 2000.

6. Souza. V. Ecologia, y Evolución de la patogénesis en E. coli. como parte de los ciclos en Ciencia Genómica organizada por el Centro de Fijación de Nitrógeno, UNAM. 29 de enero 2001.

7. V. Souza, L. Sandner, A. Castillo y L. E. Eguiarte. Some ideas on the evolution of a pathogenic island in Escherichia coli. International symposium: Rhizobium etli genome project. Cuernavaca, Mor. 28 febrero a 2 de Marzo, 2001.

8. V. Souza, M. Travisano, P. Turner and L. E. Eguiarte. Is experimental evolution relevant? Wild populations of E. coli vs. long term experimental evolution studies. Ninth International Symposium on Microbial Ecology. Amsterdam, 26 al 31 de agosto 2001.

9. V. Souza, M. Travisano, P. E. Turner & L. E. Eguiarte. Does experimental evolution reflect patterns in natural populations? An E. coli story and why this is relevant for the origin of life. Invited speaker. Gordon Conference in Origin of life. Ventura CA. USA. Enero 2002

10. V. Souza, A. Castillo, L. Sandner and L. E. Eguiarte Molecular Evolution of LEE Locus in Escherichia coli: Preliminary ideas from population genetics. EPEC international symposium. Puerto Vallarta, octubre 2002.

11. Valeria Souza, Claudia Silva, Aldo Valera y Luis Eguiarte. Ecologia evolutiva de Rhizobium etli en poblaciones naturales de puebla, mexico. XXI Reunión Latinoamericana de Rhizobiología (XXI RELAR) y VI Congreso Nacional de la Fijación Biológica de Nitrógeno, Oaxtepec, octubre 2002

41

12. V. Souza, A. Castillo, L. Sandner and L. E. Eguiarte Molecular Evolution of LEEE Locus in Escherichia coli: a genomic approach. “Genómica evolutiva y comparada, XXI Congreso nacional de la sociedad mexicana de bioquímica, A.C. Puerto Vallarta, noviembre 2002

13. V. Souza. Introducción a la sección de genes, species and populations y coordinadora de sesión en la Gordon Conference on Microbial population. Proctor Academy, NH. Julio, 2003.

14. V. Souza. Invitada por el comité organizador del ISME Microbial Ecology conference en Cancún México para organizar simposio en ecología evolutiva de bacterias. y como ponente en fronteras de la microbiología, reunión conjunta del ISME con la asociación latinoamericana de microbiología.

15. V. Souza. ISME The stories that bacteria tell., Session on the frontiers of Science. Cancún Agosto 2004

16. V. Souza. Jurassic Marine Karts in CCB. Conferencia Mexicana de Microbiología. Cancún Agosto 2004

17. V. Souza. El uso del agua en el desierto y el mar de Cuatro Ciénegas. Invitada por el Maestro Francisco Toledo para hablar a un grupo de ambientalistas en Oaxaca, Oaxaca enero, 2005.

18. V. Souza. Marine Jurassic microbes in a continental karst setting and their implications for ecosystem conservation.Valeria Souza. Invitada al seminario de Astrobiología, Pennsilvania State University. US. Febrero 2005

19. The clonal paradigm in Bacteria….or the search for the unit of selection. Valeria Souza, invitada a Masatoshi Nei seminar series, Pennsilvania State University. US. Febrero 2005.

20. Marine Jurassic microbes in a continental karst setting and their implications for ecosystem conservation.Valeria Souza. Invitada por el Venter Institute, Rockville Maryland. Febrero 2005.

21. Valeria Souza, Ana Escalante, René Cerritos, Laura Espinosa-Asuar, Luisa Falcón, Juan Manuel Rodríguez y Luis Eguiarte. Controversia cuatro Ciénegas vs el Hundido. El uso del agua en el desierto. Simposio de Biodiversa la laguna. 9 al 11 de junio 2005

22. El uso del agua en el desierto y el mar de Cuatro Ciénegas. Invitada por el Maestro Juan Torres para exponer nuestros trabajos ante el pueblo de Cuatro Ciénegas Coahuila.

23. Valeria Souza, Ana Escalante, René Cerritos, Laura Espinosa-Asuar, Luisa Falcón, Juan Manuel Rodríguez y Luis Eguiarte . El uso del agua en el desierto y el mar de Cuatro Ciénegas. Conferencia Magistral del Simposio internacional de agronomía del 5 al 9 de septiembre 2005 en Gómez Palacios, Durango.

24. Coordinadora del simposio de Ecologia evolutiva en el XXXV congreso nacional de microbiologia en Oaxtepec abril 2006. Presentación de la conferencia por invitación: Por qué hay tantas especies bacterianas. Valeria Souza.

25. Co coordinadora del simposio Las Radiaciones Adaptativas: procesos ecológicos y patrones filogenéticos. Organizadores: Luis E. Eguiarte y Valeria Souza (Instituto de Ecología, UNAM), Susana Magallón, Mark Olson. Presentación de Valeria

42

Souza, Laura Espinoza, Luisa Falcón, Ana Escalante y Ana Noguez.. Las bacterias también tiene ecología: I. Patrones y procesos que generan y mantienen la diversidad en procariontes.

26. V. Souza. Ecología microbiana o porque hay tantas especies? congreso RELAB Rosario argentina 20-23 marzo 2007.

27. Valeria Souza, Cuatro Cienegas; las Galapagos Mexicanas, invitación al Colegio Nacional México.

28. Valeria Souza , Cuatro Cienegas a microbial Galapagos Departamental Seminar Institute Pasteur, Paris, junio 2007

29. Valeria Souza, Are bacteria exceptional creatures? Invitada como ponente a Gordon Conference on Microbial Populations, New Hampshire USA 22-28 de Julio 2007.

30. Valeria Souza , Cuatro Cienegas a microbial Galapagos Departamental Seminar Michigan State University. Lansing, Sept. 2007

31. Valeria Souza, Cuatro Ciénegas Coahuila a true window to our bacterial past. Workshop on Microbial diversity in the biosphere: trends and new prespectives” Baeza, España, 3-8 octubre 2007.

32. V. Souza. Existe el desarrollo sustentable? Foro de las naciones Monterrey octubre 2007.

33. V. Souza, Cuatro Ciénegas, an endagered oasis of biodiversity. Departamental Seminar, Wyoming State University in Laramy , April 2008.

34. V. Souza. The nightmare of microbiol taxonomy: Do we know what is a species? Invited as speaker in a Symposia on biodiversity in Arizona State University, March 2008.

35. V. Souza. Why so many species in a place without food? Can we understand the origin of species? University of Georgia, December 2008.

36. Organización del simposio Cuatrociénegas como ejemplo de cooperación científica México-USA: Problemas Sociales, Ambientales y Científicos por Valeria Souza, Luis Eguiarte y Luisa Falcón.

37. V. Souza y L. Eguiarte. Does Darwinian evolution apply only to plants and animals or does it work for all life on earth? Valeria Souza y Luis Eguiarte, Invitados a una mesa redonda sobre Darwin a la 109th ASM general meeting en Phyladelphia USA del 17 al 22 de mayo.

38. V. Souza American Academy of Microbiology Colloquium: Microbes in a Changing World: Translations from Darwin. Galapagos Agosto 28-30. 2009

39. V. Souza, Cuatro Ciénegas a Prrecambrian park. Universidad de Minessota, Ecology, Evolution and Behavior department.7 de Octubre, 2009.

40. V. Souza. Cuatro Cienegas, mucho mas que una Galapagos, una maquina del tiempo. Feria del Libro, 20 de febrero 2010.

41. V. Souza. Food, Sex and Travel, the life of a microbe. Universidad de California en Irvine, Ecology and Evolutionary Biology department, 28 de mayo, 2010

42. Conferencia sobre conservación de Cuatro Ciénegas en el grupo de conservación de Orange County. 2 de junio Irvine California.

43. Souza V. Eguiarte L. E., Garcia-Oliva F., Olmedo G., Travisano M., Elser J.,Siefert J.

43

Cuatro Cienegas: A Living Ancient World Dominated by Microbialites. Astrobiology Science Conference 2010, Clear Lake, Texas April 24-29. Por invitación.

44. Souza V. Breitbart M., Hollander D., Elser J., Meadows V., Siefert J. Cuatro Ciénegas, a Desert Oasis with Active Stromatolites: An Astrobiological Projec. Astrobiology Science Conference 2010, Clear Lake, Texas April 24-29. Por invitación

45. Souza, V.; Eguiarte, L. E.; Elser, J. J.; Travisano, M. 2010 . The role of food, sex and travel in the diversity of our planet. Platica Invitada, American Geophysical Union, Fall Meeting 2010, San Francisco, EUA, del 13 al 17 de diciembre del 2010.

46. Souza, V.; Eguiarte, L. E.; Sierfert, J. 2010. Cuatro Ciénegas Basin an analog of precambrian Earth and possible early Mars scenario. Platica Invitada. American Geophysical Union, Fall Meeting 2010, San Francisco, EUA, del 13 al 17 de diciembre del 2010.

47. Valeria Souza y Luis E. Eguiarte. 2011. Why so many bacterial species? The roles of food, sex and travel in determining the microbial diversity of our planet. Conferencia inagural por invitación. Second Meeting of Biochemistry and Molecular Biology of Bacteria. Sociedad Mexicana de Bioquímica, A. C. Huatusco, Veracruz, México, del 7 al 11 de noviembre, 2011.

48. Valeria Souza, Alejandra Moreno-Letelier, Gabriela Olmedo y Luis Enrique Eguiarte. 2011. Comparative genomics of Firmicutes from the Cuatro Cienegas Basin: a window to the Precambrian shallow ocean. Presentación oral por invitación. American Genetic Association Annual Symposium 2011 “Genomics and Biodiversity” del 23 al 26 de julio, Langebio y Hotel Camino Real, Guanajuato, México.

49. Valeria Souza y Luis E. Eguiarte. 2011. Why so many bacterial species? The roles of food, sex and travel in determining the microbial diversity of our planet. Conferencia inagural por invitación. Second Meeting of Biochemistry and Molecular Biology of Bacteria. Sociedad Mexicana de Bioquímica, A. C. Huatusco, Veracruz, México, del 7 al 11 de noviembre, 2011.

50. Valeria Souza y Luis E. Eguiarte. 2012. ¿Porque es importante salvar Cuatro Ciénegas? en el Foro Binacional “El problema ambienta y herramients fiancieras para su sutentabilidad”, Campeche, Campeche, México, del 9 a 10 de febrero del 2012.

51. Souza, V. y L.E. Eguiarte Fruns. 2012. Porque la comida, el sexo y los viajes nos explican porque hay tantas especies bacterianas. Conferencia por invitación. Simposio “Nuevas perspectivas en biología”. XV Congreso latinoamericano de Genética. ALAG Argentina 2012. Rosario, Argentina, del 28 al 31 de octubre del 2012

52. Souza V. Food Sex travel and the origin of species. Seminario Departamental, Department of microbiology, jueves 29 de noviembre, del 2012.University of Georgia, Athens, Georgia.

53. Souza V El origen de las especies microbianas. Conferencia magistral Congreso de Microbiologia Rosario, Argentina.

44

54. Souza V. Biotecnologia para la conservación en Cuatro Ciénegas Coahuila, Reunión para America Latina en Lima Peru, Access and Benefit Sharing, organizado por Diversitas UNESCO, ponente invitada, noviembre 19-23, 2013.

55. Valeria Souza, como leer la vida. Biblioteca J. Vasconcelos. 56. Valeria Souza Comparative metagenomics as an open door for both basic science

and bio-prospections in CuatroCienegas Coahuila, Mexico. III CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS conferencia magistral. Santos Brazil. 19-21 noviembre 2014.

57. Valeria Souza Metagenomics a key to open de door of microbial biodiversity. Panelista en el workshop III CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS. Santos Brazil. 19-21 noviembre 2014.

58. Valeria Souza. A Lost World, Por invitación en el Congreso de la Society for General Microbiology, realizado en Birminghan, UK del 30 de marzo al 3 de abril, 2015.

59. Valeria Souza. A Lost World, Cuatro Cienegas Basin an extraordinary oasis in Coahuila, México. Conferencia por invitación en el Instituto Gulbenkian de Ciencias en Lisboa, Portugal el 6 de abril 2015.

60. Valeria Souza. A Lost World, Cuatro Cienegas Basin an extraordinary oasis in Coahuila, México. Conferencia por invitación en el Instituto Cavanillas, Valencia España, abril 9, 2015.

61. Valeria Souza. A Lost World, Cuatro Cienegas Basin an extraordinary oasis in Coahuila, México. Conferencia por invitación en la Université Diderot, Paris 7-INSERNM, el 16 de abril, 2015.

62. V. Souza, El paradigma del agua en el desierto. Conferencia magistral en el VI Congreso Nacional de Ecología en San Luis Potosí 21 de abril, 2015.

63. V. Souza y L:E. Eguiarte. El paradigma del agua en el desierto. Conferencia magistral en el Congreso de la Sociedad de Ecologia Chilena

64. Organizador del simposio “Inventario total del Churince en Cuatro Cienegas Coahuila, genética y conservación del ecosistema” con 3 presentaciónes en coautoria y 1 de primera autora en el VI Congreso Nacional de Ecología en San Luis Potosí, 22 abril 2015.

65. Organizadora del simposio Ecologia y conservación en la Sociedad Ecologica Chilena, Olmué, chile 3-5 noviembre 2015.

66. Souza V. Eguiarte L.E. El paradigm del agua en el desierto. Conferencias impartidas por invitación en 2016 en:el consejo consultivo del agua, Tecnológico de Monterrey, campus Coapa y campus Santa Fe, Universidad Anahuac Norte.

67. Sustentabilidad en los desiertos, el caso de Cuatro cienegas. reunion UNESCO, Saltillo 25 de mayo 2016

68. Aldea Digital. conferencia: Cuatro Cienegas y sus maravillas, en el Zocalo. Ciudad de México, 1 agosto 2016.

69. El paradigma del agua en el desierto, magistral por invitación a en la Prepa 5 de la UNAM.

70. V. Souza y L. E. Eguiarte. El paradigma del agua en el desierto, magistral por invitación al IV congreso de Ecología organizador por los alumnos de la

45

Universidad Estatal de Sonora. Hermosillo, Noviembre 2-4, 2016-11-25 71. V. Souza y L. E. Eguiarte. El erase una vez: La historia de la vida que nos cuenta

Cuatro Ciénegas magistral por invitación de la Fundación Colosio en Saltillo, Coahuila. Nov. 17, 2016.

72. El mundo perdido de Cuatro Ciénegas, Club de industriales 2 febrero 2017 73. The lost world of Cuatro Cienegas, presented in departamental Seminar at

University of Minnessota in Twin cities, EEB, September 2017 74. The lost world of Cuatro Cienegas, presented in departamental Seminar at

Michigan State University, EEB, October 2017 75. The lost world of Cuatro Cienegas, presented at Tinker Symposium on Latin

American Research for Biodiversity, Stanford University, march 2018. 76. Primera Jornada Argentina de Evaluación Integrada de la

Desertificación: Enfoques y Metodologías Socioambientales. Mendoza Argentina. Septiembre 2018, Ponencia magistral: Como salvar un mundo perdido, lecciones que nos dan los niños.

77.

8.-Formación de recursos humanos 8.1 Tesis dirigidas a) Tesis concluidas 1) Nivel licenciatura,

1. Martha Rocha Munive. Bióloga. "Estructura genética de poblaciones naturales de Escherichia coli en mamíferos silvestres". Facultad de Ciencias. soy su directora de tesis Abril, 1996.

2. Valérie Béatrice Bouchet López. Bióloga. “ Estructura genética de Rhizobium etli, durante un ciclo de siembra (1994), en Calpan, Puebla.”. Mención honorífica, Facultad de Ciencias. soy su directora de tesis Enero, 1997.

3. Aldo Valera Vázquez “Influencia de las actividades agrícolas sobre la estructura genética de Rhizobium etli en simbiosis con Phaseolus vulgaris y P. coccineus”. Facultad de Biología de la Universidad Autónoma de Michoacán, soy su directora de tesis Agosto, 1997.

4. René Cerritos Flores. “Análisis jerárquico en la estructura genética de Escherichia coli asociada a murciélagos de la república Mexicana. Facultad de Ciencias. Directora de tesis Enero, 1998.

5. Antonio Cruz Diversidad genética de E. coli en ambientes secundarios en la república mexicana. licenciatura en Biología, Facultad de Ciencias, UNAM, soy su directora de tesis, Enero, 2002.

6. Jaime Gasca. Genética de poblaciones de dos variedades de Rhizobium etli asociado a frijol en Michoacán. Noviembre 2004.

7. Lucianna Raggii. Diversidad microbiana en la chapopotera de Campeche. Licenciatura en Ciencias Biomédicas Básica. Septiembre 2005.

8. María Rebolledo. Evolución experimental en Pseudomonas de Cuatro Ciénegas.

46

Se puede cambiar el nicho? F. Ciencias. UNAM. Julio 2011. 9. Víctor Manuel Sosa Jiménez. Diversidad de linajes de bacterias cultivables en dos

comunidades contrastantes en Cuatro Ciénegas Coahuila. noviembre 2011. 10. Pedro Márquez Zacarias. PArametros de crecimiento de Bacillus aislados del

sistema oligotrófico de Cuatro Ciénegas. Lic. En investigación Biomédica Básica. Octubre 17, 2016.

11. Paola Angélica Vázquez. diversidad en fototrofas anaerobicas cultivables de Cuatro ciénegas Coahuila. inició en julio 2012, se recibe de licenciatura el 23 de agosto, 2017.

12. Liliana Rodríguez García. Diversidad de Vibrio en Churince Cuatro Ciénegas. UAM Xochimilco. Se recibe de licenciatura en agosto, 2017.

13. 2) Nivel Maestría

1. Claudia Verónica Silva Romero. "Estructura genética de Rhizobium etli en San Miguel Acuexcomac, Puebla, México". Maestría en Ciencias (Ecología y Ciencias ambientales) Facultad de Ciencias Septiembre 1998. Directora de tesis

2. Marta Graciela Rocha Munive. "Plásmidos en Escherichia coli y su importancia en la evolución de la patogénesis" Maestría de la Facultad de Ciencias (Ecología y Ciencias ambientales) UNAM, Febrero 1999.

3. Luisa Sandner. Evolución del locus LEE en Escherichia coli asociada a humanos y mamíferos silvestres. Maestría de la Facultad de Ciencias (Ecología y Ciencias ambientales) UNAM, 27 septiembre 2001.

4. Gloria Solís. Análisis del gen regulador de la respuesta a estres por calor rpoH en cepas de Escherichia coli aisladas de diferentes hospederos. Maestría de la Facultad de Ciencias (Ecología y Ciencias ambientales) UNAM, soy su coautora junto con la Dra. Carmen Gómez Eicheman. Enero 2002.

5. Laura Espinosa. Estructura de las comunidades de clonas ambientales en Cuatro Ciénegas Coahuila. Maestría en Ciencias Biomédicas. Enero 2005.

6. Antonio Cruz. Biogeografía de islas en la microbiota cultivable de Cuatro Ciénegas, Coahuila, Maestría de Ciencias Biológicas, Marzo 2009.

7. Carlos Moreno Montalva. Ecología de las interacciones entre bacterias en Cuatro Ciénegas Coahuila, México. Maestría bi nacional Universidad de Sevilla-Ciencias Biológicas, abril 2017.

3) Nivel Doctorado 1. Claudia Verónica Silva Romero. "Genética de poblaciones y evolución molecular

de Rhizobium etli y Rhizobium galicum". Doctorado en Biomédicas. Julio 2003. Directora de tesis.

2. Amanda Castillo. Evolución molecular del Locus LEE en E. coli. Estudiante de Doctorado en Ciencias Biomédicas. Noviembre 2005. Directora de tesis.

3. Ana Escalante ¿Por qué hay tantas especies microbianas en el agua de Cuatro Ciénegas Coahuila, análisis multi-escalar de Pseudomona spp. agosto 2008. Directora de tesis.

4. René Cerritos. Por una definición de especie microbiana: el caso de Bacillus en

47

Cuatro Ciénegas Coahuila. Julio 2008. Directora de tesis. 5. Eria Rebollar Caudillo. aceptada agosto 2007 doctorado. Exiguobacterium como

modelo para entender la relación del ambiente con los procesos evolutivos en bacterias en el valle de Cuatro Ciénegas, Coahuila. Agosto 2012. Directora de tesis.

6. German Bonilla Rosso. diversidad y función en metagenomas. Octubre 2012. Soy su directora de tesis, posgrado en biomédicas.

7. Ngyugen Esmeralda López-Lozano. Efecto de la perturbación en la resiliencia de la microbiota del suelo del Churince, Cuatro ciénegas Coahuila. Enero 2013. Soy su directora de tesis, posgrado en biomédicas.

8. Andrea González. Estructura poblacional de Escherichia coli en México. Soy su directora de tesis, posgrado en biomédicas. Mayo 2013

9. Gabriela Delgado aceptada agosto 2002 doctorado ciencias biomédicas con sede en Medicina e inicialmente con el Dr. Alejandro Cravioto de Tutor. Citrobacter un genoma dinámico, transferida de tutor en agosto 2007. Recibio el doctorado el 12 de noviembre 2014.

10. Morena Avitia Cao aceptada agosto 2007 doctorado ciencias biomédicas. Estructura genética de Bacillus coahuilensis y especies cercanas en el Valle de Cuatro Ciénegas, Coahuila. Recibió el grado el 20 de abril 2015.

11. Laura Espinosa Asuar. Ecología molecular microbiana: estudios de comunidades y biogeografía en sistemas acuáticos. Recibió el doctorado el 22 de mayo, 2015.

12. Jorge Antonio Valdivia. Aceptado en el posgrado de Biológicas con la tesis. Respuesta evolutiva del grupo Bacillus a la escasez de fósforo. ¿Tiene razón la teoría estequiométrica de optimización de la tasa de crecimiento? Obtiene el grado de doctor el 22 de Noviembre 2016.

13. Gabriel Yaxal Ponce Soto. Carrera armamentista o cooperación en Pseudomonas de Cuatro Cienegas. Ciencias Biológicas 2011 Obtiene el grado de doctor en abril 25, 2017

14. Mirna Vázquez Rosas. Procesos de diversificación y adaptación de la familia Vibrionaceae. El caso de Cuatro Ciénegas. Ciencias biomédicas 2012. Obtiene el grado de doctor el 15 de diciembre 2017.

15. Valerie Yselle de Anda Torres. ciclo del azufre. metagenomica de la conservación en cuatro cienegas Coahuila. Ciencias biomédicas 2013, obtiene el grado de doctor con mención honorífica en junio 2018.

16.

b) Tesis dirigidas en proceso 1) Nivel licenciatura 2) Nivel Maestría

1. Alan Enrique Heres Rojas. Estudio comparativo de la diversidad microbiana en cultivos de camarón en el Pacífico Norte, México. inicio agosto 2014.

2. Benjamin Christian Correa. Biodiversidad de la familia Vibrionacea en las Américas. inicio en agosto 2016.

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3) Nivel Doctorado 1. Manuel García Ulloa-Gamis. Evolución in situ de PSeudomona a lo largo de 13

años de cambios en el humedal del Churince. ingresó en agosto Ciencias Biomédicas, 2015.

2. Mariette Viladomat Jasso. Caracterización de la poza de genes fotosintéticos en Cuatro Ciénegas. Inicia en agosto 2016, Doctorado en Ciencias Biomédicas.

9. Idiomas. 100% Francés, Inglés y Español.