colección biológica clobber informe pasantía administrativa
TRANSCRIPT
1
Colección Biológica Clobber: Informe Pasantía Administrativa
Lerma Muñoz Angie Carolina
Universidad de Santander
Facultad de Ciencias Médicas y de la Salud
Bacteriología y Laboratorio Clínico
Bucaramanga
2021
2
Colección Biológica Clobber: Informe Pasantía Administrativa
Lerma Muñoz Angie Carolina
Trabajo de Grado Para Optar por el Título de
Bacteriólogo y Laboratorista Clínico
Directora
Trejos Suárez Juanita
Msc. Ciencias Biomédicas
Universidad de Santander
Facultad de Ciencias Médicas y de la Salud
Bacteriología y Laboratorio Clínico
Bucaramanga
2021
3
4
Dedicatoria
Dedico este trabajo, a mis padres por permitirme cumplir este sueño y apoyarme durante este
largo camino de manera incondicional, a mi hermano por sus sabios consejos. A Rodolfo por su
amistad y paciencia en estos años y por los que ya no están.
5
Agradecimientos
A Dios, por permitirme llegar hasta acá dándome sabiduría y entendimiento para realizar este
proyecto, también por hacerme ver que sus tiempos son perfectos.
A mi tutora Juanita Trejos Suárez, por permitirme estar en su equipo de trabajo, su ayuda,
dedicación y paciencia fueron fundamentales para la realización de esta Pasantía.
A los demás docentes de las diferentes sedes por su dedicación y colaboración.
6
Tabla de Contenido
Introducción .................................................................................................................................. 12
Marco Referencial ......................................................................................................................... 15
Estado del Arte .............................................................................................................................. 15
Marco Legislativo ......................................................................................................................... 19
Objetivos ....................................................................................................................................... 22
Objetivo General ........................................................................................................................... 22
Objetivos Específicos.................................................................................................................... 22
Metodología .................................................................................................................................. 23
Resultados ..................................................................................................................................... 24
Discusión....................................................................................................................................... 33
Conclusión .................................................................................................................................... 35
Recomendaciones ......................................................................................................................... 36
Referencias Bibliográficas ............................................................................................................ 37
Anexos .......................................................................................................................................... 42
7
Lista de Tablas
Tabla 1 Principales Colecciones Biológicas de Universidades en Colombia .............................. 19
Tabla 2 Actividades Planteadas en la Pasantía Administrativa ................................................... 23
Tabla 3 Capacitaciones del SiB ................................................................................................... 26
8
Lista de Figuras
Figura 1 Distribución Geográfica de las Colecciones Biológicas Registradas en el Centro
Mundial de Datos de Microorganismos. El Color Naranja Representa la Presencia de la
Colección(8) .................................................................................................................................. 16
Figura 2 Introducción Protocolo de Manejo de la Colección Biológica Clobber ......................... 24
Figura 3 Formato de Registro Físico de Visitas de la Colección Biológica Clobber ................... 29
Figura 4 Formato de Constancia de Depósito ............................................................................... 29
Figura 5 Formulario de Solicitud .................................................................................................. 30
Figura 6 Formato de Transferencia ............................................................................................... 30
Figura 7 Definiciones de las Extensiones Darwin Core de la Plantilla de la Información Asociada
a Especímenes del IAvH ............................................................................................................... 31
Figura 8 Plantilla de la Información Asociada a los Especímenes del Instituto de Investigación de
Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt ........................................................................... 32
9
Lista de Anexos
Anexo 1. Términos de Referencia del IAvH para la Elaboración de los Protocolos de Manejo de
Colecciones Biológicas ................................................................................................................. 42
Anexo 2. Formato de Registro Físico de Visitas de la Colección Biológica Clobber .................. 43
Anexo 3. Formato de Constancia de Depósito.............................................................................. 44
Anexo 4. Formulario de Solicitud ................................................................................................. 45
Anexo 5. Formato de Transferencia.............................................................................................. 46
Anexo 6. Plantilla de la Información Asociada a los Especímenes del Instituto de Investigación
de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt ...................................................................... 47
10
Resumen
Título
Colección Biológica Clobber: Informe Pasantía Administrativa
Autores
Lerma Muñoz Angie Carolina
Palabras Clave
Biodiversidad, Colección Biológica, Pasantía Administrativa.
Descripción
La Colección Biológica Bacteriología “CLOBBER” de los programas de Bacteriología y Laboratorio
Clínico multicampus de la Universidad de Santander UDES, reúne el depósito microbiano sistemático,
que otorga referencias sobre el origen, colecta y caracterización de todos sus especímenes y constituye en
parte la memoria epidemiológica de los departamentos del Cesar, Santander y Norte de Santander.
Para la realización de esta Pasantía Administrativa se realizó una revisión bibliográfica, se asistió a
capacitaciones virtuales del sistema de información sobre biodiversidad “SiB” se diseñaron y adaptaron
los formatos y registros correspondientes a los términos de referencia del Instituto de Investigación de
Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt (IAvH).
Así como, la recopilación y registro de 1000 microorganismos de los 3029 especímenes en la Plantilla de
la información asociada a los especímenes del (IAvH) El aprendizaje adquirido en esta Pasantía
administrativa ha sido de gran trascendencia, debido a que se hizo evidente los procesos que se tienen que
realizar para generar una colección biológica a partir de su normativa, instituciones gubernamentales y no
gubernamentales que la vigilan y coordinan, su documentación, en los que se pueda garantizar la
viabilidad, pureza y estabilidad genética de estos y a su vez, sumando vivencia en esta área como una
elección más a las competencias laborales de egreso.
11
Abstract
Title
Clobber Biological Collection: Report Administrative Internship
Authors
Lerma Muñoz Angie Carolina
Key Words
Biodiversity, Biological Collection, Administrative Internship.
Description
The Biological Collection Bacteriology "CLOBBER" of the Bacteriology and Multicampus Clinical
Laboratory programs of the University of Santander UDES, brings together the systematic microbial
deposit, which provides references on the origin, collection and characterization of all its specimens and
constitutes in part the epidemiological memory of the departments of Cesar, Santander and Norte de
Santander.
For the realization of this Administrative Internship, a bibliographic review was carried out, virtual
trainings of the biodiversity information system "SiB" were attended, the formats and records
corresponding to the terms of reference of the Alexander Von Humboldt Biological Resources Research
Institute (IAvH) were designed and adapted.
As well as the collection and registration of 1000 microorganisms of the 3029 specimens in the template
of the information associated with the specimens of the (IAvH). The learning acquired in this
administrative Internship has been of great importance, because it became evident the processes that have
to be carried out to generate a biological collection from its regulations, governmental and non-
governmental institutions that monitor and coordinate it, its documentation, in which the viability, purity
and genetic stability of these can be guaranteed and in turn, adding experience in this area as one more
choice to the work skills of graduation.
12
Introducción
La biodiversidad es esencial para el funcionamiento de los ecosistemas y sus servicios
ecosistémicos derivados, que son críticos para el bienestar humano(1), el cambio global respecto
a problemas ambientales afectan significativamente la biodiversidad y los recursos naturales, lo
cual limita los datos biológicos de los especímenes de una región(2).
Bajo esta premisa las colecciones biológicas son de gran importancia y a su vez hacen parte del
patrimonio biológico de la humanidad, es su misión el promover el conocimiento y la
conservación de la biodiversidad, además, es un apoyo para las investigaciones científicas a
futuro en el que se provee información como la filogenia y diversidad genética, lo que aumenta
el conocimiento que se puede utilizar tambien en docencia donde se les enseña a los estudiantes
la importancia de las microbiotas, la riqueza ambiental y la conservación biológica desde
diferentes puntos de vista(3). Es por esto, por lo que es necesario asegurar la preservación de las
características de los especímenes de manera que la información que se maneja de estas sea
fiable y de alta calidad para los fines académicos para los que se dispongan.
En lo que respecta a la colección biológica CLOBBER de los programas de Bacteriología y
Laboratorio Clínico multicampus de la Universidad de Santander, UDES, es un importante
depósito microbiano sistemático, que proporciona referencias sobre la procedencia, colecta y
caracterización de cada uno de sus especímenes y constituye la memoria epidemiológica a lo
largo del tiempo de los departamentos de la región principalmente del Cesar, Santander y Norte
de Santander. Si bien su establecimiento como Colección Biológica bajo los parámetros de
regulación del Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible se realiza finalizando el año
2020, la preservación y conservación de los microorganismos que en ella están depositados data
del año 2010.
13
La creación de una colección biológica con lleva diferentes procesos dentro de los cuales se debe
elaborar unos Protocolos de manejo de Colecciones biológicas como lo expide el Decreto 1375
del 2013 por parte del Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible(4), en el que debe
consignarse toda la información solicitada según el Registro nacional de Colecciones biológicas,
el cual se fundamenta en los estándares Darwin Core, que además, da la pauta para los
mecanismos de conservación e intercambio de especímenes con diferentes instituciones tanto a
nivel nacional como internacional y así fortalecer y aumentar el catálogo de estos(5).
Dentro de la creación de las colecciones biológicas, otro proceso importante a llevar a cabo es la
creación de los distintos formatos en base guía a la información que proporciona el Instituto de
Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt (IAvH) en el que debe
sostenerse los diversos procesos de referenciación, descripción, conservación y demás registro
fisico asociado a los especímenes de la colección. De allí nace la importancia de la incorporación
de un pasante del Programa de Bacteriología y Laboratorio Clínico, para iniciar una ruta de
aprendizaje sobre las colecciones biológicas y la relevancia para la biodiversidad la conservación
del microbiota de la región.
Este informe de la pasantía administrativa para la creación de la colección biológica CLOBBER,
describe cuál fue la participación de la auxiliar estudiantil en la generación de formatos que
cumplieran con la normatividad del Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible, además, de
la recopilación de la información y registro de esta, en la Plantilla de la información asociada a
los especímenes (IAvH) de las cepas de bacterias y hongos que fueron recolectados en procesos
de investigación y docencia por los profesionales de los programas de Bacteriología y
Laboratorio Clínico de los campus Bucaramanga, Cúcuta y Valledupar de la Universidad de
14
Santander, UDES, así como la participación como asistente en los procesos de capacitación
virtual brindados por el Sistema de información sobre biodiversidad de Colombia.
15
Marco Referencial
Estado del Arte
El aumento de la necesidad en diferentes enfoques de las biologías, como, por ejemplo, la
molecular, junto con la disminución de los recursos naturales y las preocupaciones medio
ambientales hacen que se aumente el valor de las colecciones biológicas. La conservación de los
recursos genéticos y la biodiversidad proporciona un medio de vida esencial para las industrias
ecológicas emergentes y los productos basados en la biotecnología en los países desarrollados y
en desarrollo. Por lo que se hace necesaria para el desarrollo de la bioeconomía basada en el
conocimiento(6).
Por lo tanto, con la presentación de esta gran problemática, muchos países e incluso instituciones
individuales han establecido colecciones de microorganismos para que sea un apoyo para el país
o región en sus investigaciones, sin embargo, para lograr los Objetivos de Desarrollo Sostenible
(ODS) además de consolidar las capacidades existentes se debe enfrentar a retos tales como el
cambio climático, escasez de recursos naturales y la contaminación ambiental en los que deben
converger políticas para fomentar la conservación y la utilización sostenible de la biodiversidad
y a su vez adoptar procedimientos adecuados para la evaluación de proyectos propuestos en los
que posiblemente exista algún efecto considerable sobre la biodiversidad de la región(7).
A nivel mundial, para el año 2021, se encuentran registradas en el Centro Mundial de Datos de
Microorganismos (WDCM, de sus siglas en inglés), 805 colecciones microbianas de
especímenes como virus, bacterias, hongos y levaduras provenientes de 78 países, de las cuales
los mayores registros se encuentran en países desarrollados de Europa, América del Norte y Asia
Oriental (figura 1)(8)
16
Figura 1
Distribución Geográfica de las Colecciones Biológicas Registradas en el Centro Mundial de
Datos de Microorganismos.
Nota. El color naranja representa la presencia de la colección(8). Tomado de Global Catalogue
of Microorganisms. 2021.
Muchos países a pesar de tener gran diversidad no cuentan con una colección registrada por lo
cual deben depender de otras regiones, en estos casos existe la Organización internacional sin
fines lucrativos, CABI.org, en los que ofrece servicios de depósito a nivel mundial y actúan
como custodios de recursos genéticos microbianos de países con bajos y medianos ingresos de
África, Asia y el Caribe. Esta colección cuenta con 30.000 cepas de diversas regiones
geográficas y de más de 140 países(9).
La United States Culture Collection Network (USCCN), tiene como finalidad el reunir a los
científicos para facilitar la utilización segura y responsable de los recursos microbianos para la
investigación, la educación, la industria, la medicina y la agricultura para el mejoramiento de la
17
humanidad, esta asociación estadounidense, recolecta los datos de las diferentes colecciones
biológicas de este país (10).
En latinoamérica y el Caribe se destacan los casos exitosos de México, Brasil y Argentina. En
México, el manejo, análisis y divulgación de información sobre la biodiversidad biológica es
dada por parte de la Comisión Nacional para el Conocimiento y uso de la Biodiversidad
(CONABIO) en el que actualmente se encuentran registrados 747 colecciones científicas de 237
instituciones nacionales(11).
En Brasil, en la Fundación Oswaldo Cruz a principios del siglo 20, se empezó a organizar las
colecciones en las que se recolectaron y depositaron especímenes de diferentes regiones de
Brasil. Actualmente existen 31 colecciones reconocidas por la institución y que cuentan con el
apoyo de la Fiocruz. En ellas se pueden encontrar cuatro categorías como las colecciones
zoológicas, microbiológicas, histopatológicas y botánicas(12).
En Argentina, el Sistema Nacional de Datos Biológicos (SNDB) corresponde a una iniciativa por
parte del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación cuya misión radica en la unificación de
información biológica, con base en diferentes datos como los taxonómicos, geográficos y demás,
para así, crear la base de datos en el que finalmente puedan intercambiar este tipo de información
a través de la red nacional de este país; en el que cuenta con 95 colecciones de las cuales 54 no
pueden ser mapeadas(13).
Las colecciones biológicas cumplen un papel fundamental en la conservación del patrimonio
biológico del país, en Colombia, el primer registro de un inventario de biodiversidad fue en el
año 1783, realizado por José Celestino Mutis en la Real Expedición Botánica del Nuevo Reino
de Granada, viaje que finalizó después de treinta años y la información de más de 20.000
muestras vegetales y 7.000 de animales, generando una de las investigaciones biológicas más
18
grandes de la historia del país pues de allí partieron los estudios de los beneficios nutricionales y
medicinales de los especímenes recolectados(14).
Un siglo más tarde, se tomó la decisión de crear la primera colección biológica del país,
denominada Museo de Historia Natural La Salle (1904), la cual sufrió una gran pérdida de sus
especímenes por un incendio generado en 1948 durante el Bogotazo, y fue recuperado
parcialmente en 1975, para así continuar con la actual colección del Museo(15).
Desde la creación de la primera colección biológica, hasta la década de los 90, muchos
inventarios de la megadiversidad de Colombia fueron creados en instituciones educativas y de
investigación del País, sin embargo, gracias al Decreto 1375 de 2013, por el cual se reglamentan
las colecciones biológicas, empezaron a regir las normativas anteriores a esta, mucho más
consolidadas y se generó el Registro Nacional de Colecciones Biológicas (RNC) coordinado por
el Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible, el Instituto de Investigación de Recursos
Biológicos Alexander Von Humboldt y el Sistema de Información sobre Biodiversidad de
Colombia(4,14,16). El RNC, a la fecha, cuenta con 247 colecciones biológicas registradas, 5
millones de ejemplares catalogados en 109 organizaciones de 27 departamentos del país(17).
Por su parte Colombia es uno de los países con mayor riqueza en cuanto a biodiversidad en el
mundo, sin embargo, el estudio de esta gran diversidad se ve afectada por múltiples factores
como la destrucción acelerada de nuestro ecosistema y el limitado número de científicos activos
en los diversos campos(18).
El préstamo e intercambio de especímenes, es uno de los objetivos misionales de las colecciones
biológicas y así fortalecerse entre las mismas. En lo que respecta a nivel nacional se puede
encontrar como modelo a seguir las siguientes Colecciones Biológicas (tabla 1).
19
Tabla 1
Principales Colecciones Biológicas de Universidades en Colombia
Universidad Colección Biológica Enlace
Universidad Nacional de Colombia Instituto de Ciencias Naturales http://www.biovirtual.unal.edu.co/es/colecc
iones/
Universidad de los Andes Museo de Historia Natural
ANDES
https://museo.uniandes.edu.co/
Pontificia Universidad Javeriana Colección de Microorganismos
(CMPUJ)
https://ciencias.javeriana.edu.co/investigaci
on/colecciones-biologicas/microorganismos
Universidad de Antioquia Colecciones Zoológicas https://www.udea.edu.co/wps/portal/udea/w
eb/inicio/patrimonio/ambiental/colecciones-
zoologicas
Universidad de la Salle Museo de Historia Natural de La
Salle
https://www.lasalle.edu.co/Museo-de-La-
Salle
Universidad Industrial de Santander Colección Cepario del Laboratorio
de Microbiología y Mutagénesis
Ambiental
http://biologia.uis.edu.co/museo/coleccion_
cepario.html
Nota. Además de estas, el principal referente nacional es el Instituto de Investigación de
Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (http://www.humboldt.org.co/es/boletines-y-
comunicados/itemlist/category/11-colecciones-biologicas)(16).
Marco Legislativo
Decreto 309 de 2000. Por el cual se reglamenta la investigación científica sobre
diversidad biológica. Este decreto indica que se deberá obtener permiso de estudio con fin
investigativo donde se involucren actividades de recolecta, manipulación de recursos biológicos
y movilización de estos recursos(19).
Decreto 1375 de 2013. Por el cual se reglamentan las colecciones biológicas. Este
documento legislativo dispone toda la información sobre la creación y funcionamiento de las
Colecciones Biológicas, además, la información mínima asociada a los especímenes recolectados
tales como taxonomía, coordenas geográficas, fecha de colecta y recolector entre otras(4).
Decreto 1376 de 2013. Por el cual se reglamenta el permiso de recolección de
especímenes de especies silvestres de la diversidad biológica con fines de investigación científica
20
no comercial. En este texto se puede encontrar toda la información relacionada con el permiso de
recolección de especímenes de especies silvestres de la diversidad biológica en Colombia con
fines de investigación científica no comercial, en pro de autorizar la recolección de este tipo
especímenes(20).
Decreto 3016 de 2013. Por el cual se reglamenta el permiso de estudio para la
recolección de especímenes de la diversidad biológica para elaboración de Estudios de Impacto
Ambiental. En él se decreta los trámites para la solicitud del permiso de estudios en el que se
pretenda realizar actividades de recolección de especímenes de la diversidad biológica del
territorio nacional con fines de estudios ambientales(21).
Decreto 1076 de 2015. Por medio del cual se expide el Decreto Único del Sector
Ambiente y Desarrollo Sostenible. En este documento en el Capítulo 9, se regulan la
administración y funcionamiento de las colecciones biológicas, derechos y obligaciones y
finalmente el registro de estas en el IAvH(22)
Decreto 1080 de 2015. Por medio del cual se expide el Decreto Único Reglamentario del
Sector Cultura. Este decreto enuncia la normativa para realizarse la gestión documental que se
implementa entre otros, en las colecciones biológicas, además, todo lo relacionado a la
planeación, producción, gestión y trámite, organización, transferencia, disposición de
documentos, valoración y finalmente la preservación a largo plazo de ellos(23).
Ley 1955 de 2019. Por el cual se expide el Plan Nacional de Desarrollo 2018-2022. A
partir de la vigencia de esta Ley, toda persona natural o jurídica, nacional o extrajera que se
encuentre realizando actividades de investigación de prospección biológica sin permiso del
Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible tendrá dos años para solicitar ante esta, el
21
Contrato de Acceso a Recursos Genéticos y sus productos derivados, Contrato en el que se
requiere el depósito de los especímenes en una Colección Biológica(24).
22
Objetivos
Objetivo General
Participar en la creación de la colección biológica CLOBBER como Auxiliar estudiantil,
(Pasantía administrativa) del programa de Bacteriología y Laboratorio Clínico de la Universidad
de Santander campus Bucaramanga.
Objetivos Específicos
• Objetivo Específico 1. Realizar una revisión del estado del arte referente a las
colecciones biológicas y sus normativas nacionales e internacionales como antecedentes para la
colección biológica CLOBBER.
• Objetivo Específico 2. Participar en los procesos de capacitación virtual del
Sistema de información sobre biodiversidad de Colombia en calidad de asistente.
• Objetivo Específico 3. Crear los formatos de Registro fisico de visitas,
Constancia de depósito, Formulario de solicitud y el de Transferencia según las directrices
requeridas por Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt
(IAvH).
• Objetivo Específico 4. Registrar información recopilada de los especímenes de
bacterias y hongos que fueron recolectados en procesos de investigación y docencia en la
Plantilla de la información asociada a los especímenes del Instituto de Investigación de Recursos
Biológicos Alexander Von Humboldt (IAvH).
23
Metodología
De acuerdo con los objetivos propuestos para esta pasantía se plantearon una serie de actividades
con sus respectivas evidencias entregables según se observa en la tabla 2.
Tabla 2
Actividades Planteadas en la Pasantía Administrativa
Objetivos
Específicos
(OE)
Actividad Evidencia
OE 1
Revisión del estado del arte referente a las colecciones
biológicas y sus normativas nacionales e
internacionales.
Capítulo Marco Referencial del
Informe Final de la Pasantía.
OE 2
Asistencia a las Capacitaciones del Sistema de
información sobre biodiversidad de Colombia
Vídeos observados en las reuniones
con la Tutora.
OE 3
Crear los formatos de Registro según las directrices
requeridas por Instituto de Investigación de Recursos
Biológicos Alexander Von Humboldt (IAvH).
Formatos solicitados en los Términos
de Referencia del Instituto de
Investigación de Recursos
Biológicos Alexander Von
Humboldt (IAvH).
OE 4
Registrar información recopilada de al menos 1000
especímenes de bacterias y hongos que fueron
recolectados en procesos de investigación y docencia
en la Plantilla de la información asociada a los
especímenes del IAvH.
Plantilla registrada con la
Información recopilada.
24
Resultados
Objetivo Específico 1
Realizar una revisión del estado del arte referente a las colecciones biológicas y sus normativas
nacionales e internacionales como antecedentes para la colección biológica CLOBBER.
Resultado. Se analizaron 25 documentos y 10 vídeos para la redacción del Estado del
Arte y Marco Normativo, además, de algunos capítulos del Protocolo general de la Colección
Biológica CLOBBER, como la Introducción, lo que permitió consolidar la información dada por
los investigadores de los programas de Bacteriología y Laboratorio Clínico, además de validar el
cumplimiento de las normativas nacionales e internacionales según los Términos de Referencia
del IAvH para para la elaboración de los Protocolos de manejo de Colecciones Biológicas
(Anexo 1).
Evidencia
Figura 2
Introducción Protocolo de Manejo de la Colección Biológica Clobber
Nota. Tomado de Universidad de Santander
25
Objetivo Específico 2
Participar en los procesos de capacitación virtual del Sistema de información sobre biodiversidad
de Colombia en calidad de asistente.
Resultado. Se participaron en 10 jornadas de capacitación de aproximadamente una hora
cada una en donde además de observar el vídeo, se realizó un análisis de este, con las siguientes
temáticas:
Ciclo 2020.
1. Capítulo 1. Una iniciativa nacional para la publicación, acceso y uso de datos sobre
biodiversidad.
2. Capítulo 2. ¿Qué datos sobre nuestra biodiversidad se pueden publicar a través del SiB
Colombia?
3. Capítulo 3. Aprendiendo un nuevo idioma, Darwin Core.
4. Capítulo 4. Crear, compartir, transformar: ¿Cómo publicar a través del SiB Colombia?
5. Capítulo 5. Artículos de datos.
6. Capítulo 6. Mejores datos, mejores decisiones.
7. Capítulo 7. Validación y limpieza de datos sobre biodiversidad.
8. Capítulo 8. Acceso y uso de datos abiertos publicados a través del SiB Colombia.
Ciclo 2021.
1.Webinar junio 3. Construyendo colaborativamente: Listas de especies de referencia
para la toma de decisiones.
2. Webinar junio 10. Extensiones Darwin Core: ¿qué son y cómo funcionan?
26
Evidencia
Tabla 3
Capacitaciones del SiB
Portada Vídeo Enlace
Ciclo 2020. Capítulo 1
https://www.youtube.com/watch?v=ImptmviMXgI
Ciclo 2020. Capítulo 2
https://www.youtube.com/watch?v=_f4gGfIBN3U&t=37s
Ciclo 2020. Capítulo 3
https://www.youtube.com/watch?v=nYGu8KY_K6U&t=14s
Ciclo 2020. Capítulo 4
https://www.youtube.com/watch?v=Q83XpNQwyEc
27
Tabla 4 (Continuación)
Portada Vídeo Enlace
Ciclo 2020. Capítulo 5
https://www.youtube.com/watch?v=z0JhWOdJKpI
Ciclo 2020. Capítulo 6
https://www.youtube.com/watch?v=_JBbEjG1wAU
Ciclo 2020. Capítulo 7
https://www.youtube.com/watch?v=M8AgoWnLkrg
Ciclo 2020. Capítulo 8
https://www.youtube.com/watch?v=4x8ReO55d2s
28
Tabla 3 (Continuacion)
Portada Vídeo Enlace
Ciclo 2021. Webinar junio 3
https://www.youtube.com/watch?v=xNcnhItgK7w
Ciclo 2021. Webinar junio 10
https://www.youtube.com/watch?v=Gu7Z8irxW7k
Objetivo Específico 3
Crear los formatos de Registro físico de visitas, Constancia de depósito, formulario de solicitud y
el de transferencia según las directrices requeridas por Instituto de Investigación de Recursos
Biológicos Alexander Von Humboldt (IAvH).
Resultado. Se generaron los siguientes formatos:
1. Registro físico de visitas (Anexo 2).
2. Formato de constancia de depósito (Anexo 3).
3. Formulario de solicitud (Anexo 4).
4. Formato de transferencia (Anexo 5).
29
Además, se reconoció y analizaron las extensiones del Estándar Darwin Core para el
diligenciamiento de la Plantilla de la información asociada a especímenes del IAvH.
Evidencia.
Figura 3
Formato de Registro Físico de Visitas de la Colección Biológica Clobber
Nota. Tomado de Universidad de Santander
Figura 4
Formato de Constancia de Depósito
Nota. Tomado de Universidad de Santander
30
Figura 5
Formulario de Solicitud
Nota. Tomado de Universidad de Santander
Figura 6
Formato de Transferencia
Nota. Tomado de Universidad de Santander
31
Figura 7
Definiciones de las Extensiones Darwin Core de la Plantilla de la Información Asociada a
Especímenes del IAvH
Nota. Tomado de Clobber – Universidad de Santander.
Objetivo Específico 4
Registrar información recopilada de los especímenes de bacterias y hongos que fueron
recolectados en procesos de investigación y docencia en la Plantilla de la información asociada a
los especímenes del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt
(IAvH).
Resultado. Se registraron 1000 microorganismos de los 3029 especímenes por consignar
en la Plantilla (Anexo 6), donde se diligencio los campos relacionados con Id de registro
biológico, tipo de registro, nombre de la entidad, nombre de la colección, número de catálogo,
titular de derechos y acesso, citación bibliográfica, referencia, NIT, comentarios del registro
biológico, nombre del colector, identificado por, cantidad de organismo, nombre del organismo,
32
condición reproductiva, medios de establecimiento, estado, preparación, disposición, protocolo
de muestreo, esfuerzo de muestreo, hábitat, geografía, continente, país, provincia, municipio,
nombre científico, año de publicación, categoria del taxón,clasificación por Reino, Filo, Clase,
Orden, Familia, Género y Especie, además de la georreferenciación.
Evidencia.
Figura 8
Plantilla de la Información Asociada a los Especímenes del Instituto de Investigación de
Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt
Nota. Tomado de Clobber – Universidad de Santander.
33
Discusión
La destrucción acelerada de nuestro ecosistema crea una necesidad urgente de preservar la
biodiversidad de nuestro país por esto, las colecciones biológicas son patrimonio biológico y de
la humanidad esto, a su vez, construye la base para el estudio de los especímenes en los que se
llevan procesos como la recolecta, preparación, identificación y mantenimiento de los
especímenes(16).
Para poder mantener la preservación de los especímenes, deben cumplir con un buen método de
conservación debido a que deben garantizar la viabilidad, pureza y estabilidad genética de los
cultivos. También es importante mencionar el costo que conlleva la conservación como son
costos del personal, equipos y el mantenimiento de estos mismos. “La administración debe estar
soportada a largo plazo, de tal manera que se pueda garantizar la permanencia, el mantenimiento
y suministro de microorganismos”(3).
Por otro lado, la documentación de cada espécimen debe estar detallada en registros, como
también diferentes procesos en lo que respecta a la adquisición, canje y transferencias de estos
mismos, por esto, la participación en la elaboración de los formatos y consignación de la
información de los especímenes de la Colección Biológica es de gran importancia debido a que
se toma conciencia del valor de estos inventarios y de la preservación de estos y a su vez conocer
todo los requerimientos necesarios para la consignación de información y continuidad de
ellas(25).
La creación de las colecciones biológicas es de gran importancia para el Programa de
Bacteriología y Laboratorio Clínico de la Universidad de Santander en sus diferentes campus, ya
que permitirá a un futuro posicionarse como un referente en el nororiente colombiano de la
34
preservación y protección a la biodiversidad y a su vez permitirá a la Universidad realizar
intercambios con instituciones importantes en el país.
35
Conclusión
Las colecciones biológicas representan el patrimonio y la diversidad a nivel nacional siendo asi
una fuente de información a lo largo de los años en el cual el cuidado, manejo y conservación
radica de manera importante para que esta siga cumpliendo su objetivo como colección.
Finalmente, el aprendizaje adquirido en esta pasantía administrativa fue de gran importancia, ya
que se evidenció los procesos que se deben llevar a cabo para poder crear una colección
biológica desde su normativa, instituciones gubernamentales y no gubernamentales que la vigilan
y coordinan, su documentación, sumando experiencia en esta área como una alternativa más a las
competencias laborales de egreso.
36
Recomendaciones
Se recomienda a los estudiantes y docentes del programa de Bacteriología y Laboratorio Clínico
recordar la importancia de la biodiversidad en el país y la conservación de los especímenes, por
otra parte, que los estudiantes del programa de Bacteriología y Laboratorio Clínico puedan
realizar algún tipo de práctica en la Colección Biológica CLOBBER, para que adquieran
conocimientos de cómo se debe realizar la preservación, conservación y transferencia de los
especímenes que hacen parte de la biodiversidad de la región.
También se recomienda tomar las capacitaciones que ofrece el SiB como alternativa de
aprendizaje en cuanto a los datos que se manejan en esta, utilización del Darwin Core,
publicación de datos en el SiB Colombia y demás.
37
Referencias Bibliográficas
1. Convention on Biological Diversity, GreenFacts. Biodiversidad (CBD): 1. ¿Por qué
preocupa la pérdida de biodiversidad? [Internet]. 2021 [citado 21 de junio de 2021].
Disponible en: https://www.greenfacts.org/es/biodiversidad-perspectiva-mundial/l-2/1-
perdida-biodiversidad.htm
2. Acosta Rosado I, Avendaño Reyes S. Las colecciones biológicas, tesoros que debemos
conservar. Inecol, el Instituto de la ecología [Internet]. 17 de abril de 2021 [citado 19 de
abril de 2021]; Disponible en: https://www.inecol.mx/inecol/index.php/es/ct-menu-item-
25/ct-menu-item-27/17-ciencia-hoy/902-las-colecciones-biologicas-tesoros-que-
debemos-conservar
3. Gil DMG, Quiceno JNJ. Colecciones microbianas: Importancia, establecimiento y
regulación. Hechos Microbiológicos. 2013;4(1):23-33.
4. República de Colombia. Decreto 1375 de 2013. Por el cual se reglamentan las
colecciones biológicas [Internet]. jun 27, 2013 p. 33. Disponible en: http://www.suin-
juriscol.gov.co/viewDocument.asp?ruta=Decretos/1275749
5. Sistema de información sobre biodiversidad de Colombia. Estándares [Internet]. SiB
Colombia. [citado 21 de junio de 2021]. Disponible en:
https://sibcolombia.net/estandares/
6. Organisation for Economic, Co-operation and Development. OECD Best Practice
Guidelines for Biological Resource Centres - OECD [Internet]. 2007 [citado 21 de junio
de 2021]. Disponible en: https://www.oecd.org/sti/emerging-
tech/oecdbestpracticeguidelinesforbiologicalresourcecentres.htm
38
7. Hodson de Jaramillo E. Bioeconomía: el futuro sostenible. Rev Acad Colomb Cienc Ex
Fis Nat. 3 de octubre de 2018;42(164):188.
8. Global Catalogue of Microorganisms. Global Catalogue of Microorganisms [Internet].
2021 [citado 21 de junio de 2021]. Disponible en: http://gcm.wfcc.info/
9. Centre for Agricultural Bioscience International. Bioscience services [Internet].
CABI.org. [citado 21 de junio de 2021]. Disponible en: https://www.cabi.org/products-
and-services/bioscience-services/
10. USCCN. United States Culture Collection Network [Internet]. 2021 [citado 21 de junio
de 2021]. Disponible en: https://usccn.org/
11. CONABIO. Colecciones biológicas científicas de México | Biodiversidad Mexicana |
Conabio [Internet]. 2012 [citado 21 de junio de 2021]. Disponible en:
https://www.biodiversidad.gob.mx/especies/colecciones/
12. FIOCRUZ. Colecciones biológicas [Internet]. Fiocruz. 2021 [citado 21 de junio de 2021].
Disponible en: https://portal.fiocruz.br/es/colecciones-biologicas
13. Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación de Argentina. Colecciones de Historia
Natural | Portal de Datos del Sistema Nacional de Datos Biológicos [Internet]. 2021
[citado 21 de junio de 2021]. Disponible en: https://datos.sndb.mincyt.gob.ar/collectory/
14. Sistema de información sobre biodiversidad de Colombia. Catálogo de colecciones en
línea [Internet]. SiB Colombia. [citado 19 de abril de 2021]. Disponible en:
https://sibcolombia.net/proyectos/colombiabio/coleccionesenlinea/
15. Museo de La Salle. Historia [Internet]. 2018 [citado 21 de junio de 2021]. Disponible en:
https://www.lasalle.edu.co/Museo-de-La-Salle/el-mls/detalle/historia/!ut/p/z1/xVbfU-
IwEP5X8IHHTNKmpeERAe0hRTis0L4waZtCnP5AGvHOv_4SR7m5EaiKOfuybbr7Zff
39
bbzaBIZzDsKBbvqSClwXN5HcQthaXY3Tpuha6JqMLA02m_qTXub3CrbYJZ88O6MD
TQTB8T_wBh6tz52h8vwVvYQhDwUXGYODySpQbTtXSOuYJDFI7ZRZrI5AmMQZ
WZCaARIgCG1MDY0KIYzLlHRdiLVYweCh4RbOMgfyhYiVIGMgoeF5poj1LLAN5
VjVRXBaCFaKJVq8ZHC1L5X0KLcohPM76TFWlEIye6VrXaIT8GxNNflhjm3QuXF8
1pg4jrOM-kEk6Bx18WcWWs0foF-Uml1qaKsRZ11tM_P5PGfvStU7MNjFtJCxreIpi-
dYY0sZUUfy3k8iiLZQ4GMROagILmQS0WZQAx2aJYxvUplEbuqguJ3tfTh_YoQbe0
QpvWHrh9ZIjm_O_9VCTUEtvvZrp1Ku19qlaG9RND3m08Lv7-7Ajx6-
an78EnH9y_lYsVudVpTDNjdf1ljJVKlaAF2kJ57vfx0seW-
8T6CePmZrNjcN8fwU81gpvI73w5jd2xtZL3fA7VTfUq7qhXup6elXXM0-
EH9Td8r5wBL69gu6fhbvf69z3c4Jz4M8RH-fdgGArGGyfzkdgZ-
6e0rwbkcebnZkRIa2bL7w-tpevZvwS47F_nKX5jbPl2dkfVJugXw!!/
16. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt. Las
Colecciones Biológicas, ¡fundamentales para la conservación de la Biodiversidad!
[Internet]. 2020 [citado 19 de abril de 2021]. Disponible en:
http://www.humboldt.org.co/es/noticias/actualidad/item/999-colecciones-conservacion-
biodiversidad
17. Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible, Instituto de Investigación de Recursos
Biológicos Alexander Von Humboldt. Registro Nacional de Colecciones Biológicas
[Internet]. RNC. [citado 18 de abril de 2021]. Disponible en:
http://rnc.humboldt.org.co/wp/
18. Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible. Colombia, el segundo país más
biodiverso del mundo, celebra el Día Mundial de la Biodiversidad | Ministerio de
Ambiente y Desarrollo Sostenible [Internet]. 2019 [citado 21 de junio de 2021].
40
Disponible en: https://www.minambiente.gov.co/index.php/noticias-minambiente/4317-
colombia-el-segundo-pais-mas-biodiverso-del-mundo-celebra-el-dia-mundial-de-la-
biodiversidad
19. República de Colombia. Decreto 309 de 2000. Por el cual se reglamenta la investigación
científica sobre diversidad biológica. [Internet]. mar 1, 2000. Disponible en:
https://corponarino.gov.co/expedientes/juridica/2000decreto309.pdf
20. República de Colombia R. Decreto 1376 de 2013. Por el cual se reglamenta el permiso de
recolección de especímenes de especies silvestres de la diversidad biológica con fines de
investigación científica no comercial. [Internet]. jun 27, 2013. Disponible en:
https://www.redjurista.com/Documents/decreto_1376_de_2013_presidencia_de_la_repub
lica.aspx
21. República de Colombia. Decreto 3016 de 2013. Por el cual se reglamenta el permiso de
estudio para la recolección de especímenes de la diversidad biológica para elaboración de
Estudios de Impacto Ambiental. [Internet]. dic 27, 2013. Disponible en:
https://www.minambiente.gov.co/images/normativa/decretos/2013/dec_3016_2013.pdf
22. República de Colombia. Decreto 1076 de 2015. Por medio del cual se expide el Decreto
Único del Sector Ambiente y Desarrollo Sostenible. [Internet]. may 26, 2015. Disponible
en: https://www.funcionpublica.gov.co/eva/gestornormativo/norma.php?i=78153
23. República de Colombia. Decreto 1080 de 2015. Por medio del cual se expide el Decreto
Único Reglamentario del Sector Cultura. [Internet]. may 26, 2015. Disponible en:
https://www.funcionpublica.gov.co/eva/gestornormativo/norma.php?i=76833
41
24. República de Colombia. Ley 1955 de 2019. Por el cual se expide el Plan Nacional de
Desarrollo 2018-2022. [Internet]. may 25, 2019 p. 198. Disponible en:
https://www.funcionpublica.gov.co/eva/gestornormativo/norma.php?i=93970
25. Simmons JE, Muñoz-Saba Y, Conservation International. Cuidado, manejo y
conservación de las colecciones biológicas. Bogotá: Universidad Nacional de Colombia :
Conservación Internacional; 2005.
42
Anexos
Anexo 1. Términos de Referencia del IAvH para la Elaboración de los Protocolos de
Manejo de Colecciones Biológicas
Nota. Tomado de https://investigacion.unal.edu.co/fileadmin/recursos/unsib/docs/propuesta-
iavh-tr-protocolos-manejo-colecciones.pdf.
43
Anexo 2. Formato de Registro Físico de Visitas de la Colección Biológica Clobber
Nota. Tomado de Universidad de Santander
44
Anexo 3. Formato de Constancia de Depósito
Nota. Tomado de Universidad de Santander
45
Anexo 4. Formulario de Solicitud
Nota. Tomado de Universidad de Santander
46
Anexo 5. Formato de Transferencia
Nota. Tomado de UDES.
47
Anexo 6. Plantilla de la Información Asociada a los Especímenes del Instituto de
Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt
Nota. Tomado de Clobber – Universidad de Santander