clase biomoléculas 2010
TRANSCRIPT
La entalpía de combustión, en condiciones estándar de la glucosa es –2813,1 Kj/mol.
C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O
∆∆∆∆Hºf (Kj/mol): O = 0 ; H O = - 285,8 ; CO = - 393,3 ; ∆∆∆∆Hºc glucosa = - 2813,1 Kj/mol
∆∆∆∆Hºc glucosa = 6∆∆∆∆Hºf CO2 + 6∆∆∆∆Hºf H2O – (∆∆∆∆Hºf glucosa + 6∆∆∆∆Hºf O2) = - 2813,1 Kj/mol
a)
–285,8 Kj/mol y –393,3 Kj/mol, respectivamente.
Las entalpías de formación estándar del agua líquida y del anhídrido carbónico son
Calcular: a) La entalpía de formación estándar de la glucosa.
b) El calor producido en la combustión de 500 gramos de glucosa.(Datos: Masas atómicas C=12; H=1; O=16 )
∆∆∆∆Hºf (Kj/mol): O 2 = 0 ; H2O = - 285,8 ; CO2 = - 393,3 ; ∆∆∆∆Hºc glucosa = - 2813,1 Kj/mol
6 x -393,3 Kj/mol + 6 x -285,8 Kj/mol –∆∆∆∆Hºf glucosa -0000 = - 2813,1 Kj/mol
-2359,8 Kj/mol – 1714,8 Kj/mol –∆∆∆∆Hºf glucosa = - 2813,1 Kj/mol / x (-1)
∆∆∆∆Hºf glucosa = 2813,1 Kj/mol – 4074,6 Kj/mol
∆∆∆∆Hºf glucosa = – 1261,5 Kj/mol
2359,8 Kj/mol + 1714,8 Kj/mol + ∆∆∆∆Hºf glucosa = 2813,1 Kj/mol
4074,6 Kj/mol + ∆∆∆∆Hºf glucosa = 2813,1 Kj/mol
b) 180 gramos de glucosa corresponden a 1 mol
500 gramos de glucosa corresponden a x moles
x = 2,77 moles
La entalpía de combustión, en condiciones estándar de la glucosa es –2813,1 Kj/mol.
–285,8 Kj/mol y –393,3 Kj/mol, respectivamente.
Las entalpías de formación estándar del agua líquida y del anhídrido carbónico son
Calcular: a) La entalpía de formación estándar de la glucosa.
b) El calor producido en la combustión de 500 gramos de glucosa.(Datos: Masas atómicas C=12; H=1; O=16 )
Con 1 mol de glucosa se produce - 2813,1 Kj
x = 2,77 moles
Con 2,77 moles de glucosa se produce x
x = - 7792,3 Kj
∆∆∆∆Hºc glucosa = -2813,1 Kj/mol
La transferencia de electrones en la cadena respiratoria mitocondrial se puede representar
mediante la ecuación de la reacción neta:
NADH + H+ + ½ O2 H2O + NAD+
NAD+ + H+ + 2e- NADH ∆∆∆∆Eº’= -0,320 V
½ O2 + 2H+ + 2e- H2O ∆∆∆∆Eº’= 0,816 V
a) Calcular el valor de ∆∆∆∆Eº’ de la reacción neta de la transferencia electrónica mitocondrial.
b) Calcular ∆∆∆∆Gº’ de esta reacción.
c) ¿ Cuántos moles de ATP se pueden generar teóricamente por esta reacción si la
energía libre estándar de la síntesis de ATP es 30,5 kJ/mol ?
a) ∆∆∆∆Eº’= 0,320 V
½ O2 + 2H+ + 2e- H2O ∆∆∆∆Eº’= 0,816 V
∆∆∆∆Eº’= 1,136 Vb) ∆∆∆∆Gº’= -nF∆∆∆∆Eº’ n = 2 F= 96,485 kJ/V . mol
∆∆∆∆Gº’= -2 x 96,485 kJ/V . mol x 1,136 V
∆∆∆∆Gº’= -219,2 kJ/mol
c) Con 30,530,530,530,5 kJ se sintetiza 1 mol de ATP
NADH NAD+ + H+ + 2e-
Con 219,2219,2219,2219,2 kJ se sintetiza x moles de ATPx = 7,19 moles de ATP
x ≈ 7 moles de ATP
Si se incuba una solución 0,1 M de glucosa-1-fosfato con una cantidad catalítica de
fosfoglucomutasa, la glucosa-1-fosfato (G-1-P) se transforma en glucosa-6-fosfato (G-6-P)
hasta que se establece el equilibrio.
4,5 x 10-3 M 9,6 x 10-2 M
Calcular K’eq y ∆∆∆∆Gº’ para esta reacción a 25ºC.
glucosa-1-fosfato glucosa-6-fosfato
Las concentraciones en el equilibrio son:
K’eq[glucosa-6-fosfato][glucosa-1-fosfato]=
K’eq 9,6 x 10-2 M=K’eq 9,6 x 10-2 M
4,5 x 10-3 M=
K’eq = 2,13 x 101
K’eq = 21,3
∆∆∆∆Gº’ = - RT ln K’eq
∆∆∆∆Gº’ = - 2,3 RT log K’eq
∆∆∆∆Gº’ = - 2,3 x 8,315 J/mol . 298ºK x log 21,3
R = 8,315 J/mol . ºKT = 298ºK
∆∆∆∆Gº’ = 7579,8 J/mol = 7,6 kJ/mol
ln = 2,3 log
D I P L O M A D I P L O M A D I P L O M A D I P L O M A
EN CIENCIAS DE LA ACTIVIDAD FISICA
UNIVERSIDAD DE CHILE
2009
Aspectos generalesClasificación
Prof. BQ Jorge Soto LabbéProf. BQ Jorge Soto LabbéProf. BQ Jorge Soto LabbéProf. BQ Jorge Soto Labbé
FACULTAD DE MEDICINA UNIVERSIDAD DE CHILE
CARBOHIDRATOS
LÍPIDOS
PROTEÍNAS
ÁCIDOS NUCLEICOS
ClasificaciónIsomeríaDerivados de monosacáridos: polisacáridos
Aspectos generalesClasificaciónÁcidos grasos y triacilglicerolesFosfolípidos
AminoácidosEnlace peptídicoEstructura de proteínas
NucleótidosDNARNA
H
CH
HH
2S22S1 2px1 2py
1 2pz1
2S px
py pz
sp3
2px1 2py
1 2pz0
1S
4 orbitales híbridos sp3
1S2
ENERGÍAS DE ENLACE PROMEDIO(kJ/mol)
CH
HH
H
H
CH
HH
H
CH
HH
C _ C
C _ N
C _ H
C _ O
Si _ Si
Si _ N
Si _ H
Si _ O
607
754
416
336
230
470
323
368
H
CH HCH
HH
CnH2n+2ALCANOSHCH HH
HCH CH
HH
H
HCH CH
HC
H
HH
H
HCH CH
HC
H
HC
H
HH
H
CH4
HCH CH
HC
H
HC
H
HC
H
HH
H
metano etano propano butano
CH3CH3 CH3CH2CH3 CH3CH2CH2CH3
pentano
CH3CH2CH2CH2CH3
CnH2nALQUENOSH H H H H H H H H H H H H HHCH C
HH
HCH C
HCH
HH
HCH CH
HCH
CH
HH
HCH CH
HCH
CH
CH
HH
Heteno propeno 2-buteno 2-penteno
CnH2n-2ALQUINOS
etino (acetileno)
CH C H CH C CH
HH
propino
HCH CH
C CH
HH
2-butino
HCH CH
C CH
CH
HH
H2-pentino
GLÚCIDOS
ASPECTOS GENERALES
ASPECTOS GENERALESGlúcidos,
Griego glicos Latín sacarosÁrabe hispano assúkkar
azúcares, sacáridos, carbohidratos o hidratos de carbono
D U L C E
Cn(H2O)n
C OH
C O
Radical hidroxilo
Radical carbonilo
Alcohol
Aldehido
C O
H
C Cetona
C O
C
C
gliceraldehido
C OH
C
C
H
OHH2
O
H C OH
C
C
H
OHH2
O
H
C OH
C
C
H
OHH2
O
H
C OHH
C OH
C
C
H
OHH2
O
H
C OHH
eritrosa
C OH
C
C
H
OHH2
O
H
C OHH
C OHH
C OH
C
C
H
OHH2
O
H
C OHH
C OHH
ribosa
C OH
C
C
H
OHH2
O
H
C OHH
CHO H
C OHH
C OH
C
C
H
OHH2
O
H
C OHH
CHO H
C OHH
glucosa
P O L I H I D R O X I A L D E H I D O S
ASPECTOS GENERALES
gliceraldehido
dihidroxicetona
C O
C
C
OH
OH
H2
H2
C O
C
C
OH
OH
H2
H2
eritrosa ribosa glucosa
C O
C
C
OH
OH
H2
H2
C OHH
C O
C
C
OH
OH
H2
H2
C OHH
eritrulosa
C O
C
C
OH
OH
H2
H2
C OHH
C OHH
C O
C
C
OH
OH
H2
H2
C OHH
C OHH
ribulosa
C O
C
C
OH
OH
H2
H2
C OHH
C OHH
CHO H
C O
C
C
OH
OH
H2
H2
C OHH
C OHH
CHO H
fructosa
P O L I H I D R O X I C E T O N A S
CLASIFICACIÓN
MONOSACÁRIDOS O
OLIGOSACÁRIDOS
gliceraldehido dihidroxiacetona
maltosa sacarosa lactosa
eritrosa
ribosa
glucosa, galactosa, manosa
ribulosa
fructosa
sedoheptulosa
eritrulosaAZÚCARES SIMPLES
POLISACÁRIDOS O GLUCANOS
HOMOPOLISACÁRIDOS celulosa almidón glucógeno
HETEROPOLISACÁRIDOS
quitina
GLUCOSAMINOGLUCANOS ácido hialurónico condroitinsulfato dermatansulfato
queratansulfato heparina
PEPTIDOGLUCANOS
PROTEOGLUCANOS
heparansulfatoO MUCOPOLISACÁRIDOS
ISOMERÍA DE CARBOHIDRATOSCHO
C
CH2OH
OHH
CHO
C
CH2OH
OHH
CHO
C
CH2OH
HO H
CHO
C
CH2OH
HO H
CHO
CHO H
CHO
CHO H
CHO
C OHH
CHO
C OHH
Fórmulas de proyección de Fisher
D-gliceraldehido L-gliceraldehido
CH2OHCH2OHCH2OHCH2OH
Fórmulas de perspectiva
D-gliceraldehido L-gliceraldehido
1
2
3
4
5
6
4
2
D-glucosa D-galactosaD-manosa
Epímeros
Carbono asimétrico o centro quiral
Isomería óptica
Enantiómeros
Estereoisomería
Nº de estereoisómeros = 2n
C OH
C
CH2OH
H O
H
C OHH
CHO H
C OHH
C OH
C
CH2OH
H O
H
C OHH
CHO H
C OHH
C OH
C
CH2OH
H O
H
C OHH
CHO H
CHO H
C OH
C
CH2OH
H O
H
C OHH
CHO H
CHO H
C H
C
CH2OH
H O
C OHH
CHO H
CH OH
HO C H
C
CH2OH
H O
C OHH
CHO H
CH OH
HO
Diasteroisómeros
Racemización
FORMAS CÍCLICAS
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2OH
C OH
C
CH2OH
H
CH
CHO H
C OHH
OH
O
H
αααα-D-glucopiranosa
Fórmulas de proyección de Haworth
H
H
H
H
H
HO
OH
OH
oCH2OHHO
H
H
H
H
H
HO
OH
OH
ooCH2OHHO
ooo
C OH
CH O
H
CHO H
C OH
CH O
H
CHO H
(1/3)
HEMIACETAL
PIRANO
FURANO
oH
H
H
H
H
OH
OH
OH
OH
CH2OH
oH
H
H
H
H
OH
OH
OH
OH
CH2OH
C OH
C
CH2OH
H
CH
CHO H
C OHH
HO
O
H
C OH
C
CH2OH
H
CH
CHO H
C OHH
HO
O
H
ββββ-D-glucopiranosa
D-glucosa
ANÓMEROS
Fórmulas de proyección de Haworth
o
H
H
H
H
H
HO
OHOH
oCH2OHHO
H
H
H
H
H
HO
OHOH
ooCH2OHHO
CH2OH
C OHH
CHO H
C OHH
CH2OH
C OHH
CHO H
C OHH
mutarrotación
(2/3)
HEMIACETAL
DERIVADOS DE MONOSACÁRIDOS
C OH
C
C
H
H2
O
H C OH
C
C
H
OH2
O
H
P
C OH
C
C
H
H2
O
H C OH
C
C
H
OH2
O
H
P
C OH
C
C
H
OHH2
O
H C OH
C
C
H
OHH2
O
H
C O
C
C
OH
OH
H2
H2
C O
C
C
OH
OH
H2
H2
oCH OH OHooCH OH OH oCH OH OHooCH OH OH
C O
C
C
OHH2
H2
C
C
C
OH
O
H2
H2 P
C
C
C
OHH2
H2
C
C
OH
O
H2
H2
C
C
C
OHH2
H2
C
C
C
OH
O
H2
H2 P
C
C
C
OHH2
H2
C
C
OH
O
H2
H2
oCHOP OHooCHOP OH
Gliceraldehido Gliceraldehido-3-P
Dihidroxicetona Dihidroxicetona-P
H
oCH2OH
H
HO
OH
H
OH
OH
H
ooCH2OH
H
HO
OH
H
OH
OH
H
oCH2OH
H
HO
OH
H
OH
H
H
ooCH2OH
H
HO
OH
H
OH
H
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2OH
ββββ-2-deoxirribosa
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2O P
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2O P
Glucosa-6-P
Ribosa-5-P
H
oCH2
H
HO
OH
H
OH
OP OH
H
ooCH2
H
HO
OH
H
OH
OP OH
Ribosa
Glucosa
OLIGOSACÁRIDOS
αααα-D-Glucopiranosil-(1,4)-D-glucopiranosa
Maltosa
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OHOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
OH
CH2OH
O
oH H
H
H
H
OH
OHOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
OH
CH2OH
O
CH2OHCH2OH OHHCH2OH OHHCH2OH OHH OHH
Extremo reductorEnlace O-glucosídico
ACETAL
oOH OH
H
H
H
H
OH
HOH
CH2OH
oOH OH
H
H
H
H
OH
HOH
CH2OH
O
OH
HH
H
H
OHOH
H
CH2OH
O
oOH
H
H
H
H
OH
HOH
CH2OH
O
OH
HH
H
H
OHOH
H
CH2OH
OO
oOH
H
H
H
H
OH
HOH
CH2OH OH
HH
OHH
H
OHOH
H
CH2OH
O
OH
HH
OHH
H
OHOH
H
CH2OH
OO
ββββ-D-Galactopiranosil-1,4-D-glucopiranosa
Lactosa
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
OHOH
CH2OH
CH2OH
oCH2OH
H
HO
OH
H
OH
H
CH2OH
ooCH2OH
H
HO
OH
H
OH
H
αααα-D-Glucopiranosil-(1,2)-ββββ-D-fructofuranosa
Sacarosa
oH
H
H
H
OH
OH
OH
CH2OH
CH2OH
oCH2OH
HO
OH
H
H
H
O
Ho
H
H
H
H
OH
OH
OH
CH2OH
CH2OH
ooCH2OH
HO
OH
H
H
H
O
H
Extremo reductor
POLISACÁRIDOS O GLUCANOSHOMOPOLISACÁRIDOS
oH
H
H
H
OH
OOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
CH2OH
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
O
H
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
O
oH
H
H
H
OH
OOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
CH2OH
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
O
H
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
O
HH
O
H
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
O 25%AMILOSA
ALMIDÓN
75%
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
oH
H
H
H
OH
OOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
CH2
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
O
H
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
O
O
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
oH
H
H
H
OH
OOH
CH2OH
oH H
H
H
H
OH
OH
CH2
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
O
H
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
O
HH
O
H
O
oH
H
H
H
OH
OH
CH2OH
H
O
O
AMILOPECTINA
POLISACÁRIDOS O GLUCANOSHOMOPOLISACÁRIDOS GLUCÓGENO
POLISACÁRIDOS O GLUCANOSHOMOPOLISACÁRIDOS CELULOSA
O
OH
H
H
H
OH
H
CH2OH
O
o
H
H
H
OH
HOH
CH2OH
O
HH O
OH
H
H
H
OH
H
CH2OH
O
o
H
H
H
OH
HOH
CH2OH
O
H
O
H
LÍPIDOSLÍPIDOS
colesterol
ácido taurocólico
CH3-(CH2)n-COOH
CH3-(CH2)n-COOCH2
CH3-(CH2)n-COOCH
CH3-(CH2)n-COOCH2
CH3-(CH2)n-COOCH2
CH3-(CH2)n-COOCH
R-O3P-OCH2
ácidos grasos
triacilgliceroles fosfolípidos
CH2OH
CHOH
CH2OH
glicerol
COOH
CH
diacilglicerol (DAG)
inositoltrifosfato (IP 3)
ácido taurocólico
testosterona estradiol
ácido glicocólico
progesterona
1,25-dihidroxicolecalciferol
CH3
ácido araquidónico
• prostaglandinas
• leucotrienos
• tromboxanos
R CO O CH2
CH + 3NaOHOCOR
CH2OCOR
3 R-COONa + HOCH
CH2OH
CH2OH
R CO O CH2
CH + 3NaOHOCOR
CH2OCOR
3 R-COONa + HOCH
CH2OH
CH2OH
C
H
C CH
H
O
H
OH
H
H
HO
Glicerol
Carbono
Hidrógeno
Oxígeno
Fósforo
Glicerol-3-P
C C C C C C C C CH
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H
H O
OH
Acido graso
C
H
H
Acido graso
Nº de carbonos
Nº de dobles enlaces
O OH
18
1
Oleico
O OH
18
2
Linoleico
O OH
18
3
αααα-linolénico γγγγ-homolinolénico
20
3
Araquidónico Eicosapentaenoico
20
4
Docosahexaenoico
20 22
5 6
O OH O OH
O OHO OH
Estructura
COOH
ω3
ω6
Linolénico
Araquidónico
COOH
COOH
COOH
ω9
ω6
Oleico
Linoleico
Linolénico
Omega 3
Ácido α-linolénico, 18:3(9,12,15)
Ácido eicosapentaenoico, 20:5(5,8,11,14,17)
Ácido docosahexaenoico, 22:6(4,7,10,13,16,19)
ÁCIDOS GRASOS ESENCIALES
Omega 6
Ácido linoleico, 18:2(9,12)
Ácido γ-linolénico, 18:3 (6,9,12)
Ácido araquidónico, 20:4(5,8,11,14)
Ácido docosahexaenoico, 22:6(4,7,10,13,16,19)
R-COOR’ + H2OR’-OH + R-COOH R-COOR’ + H2OR’-OH + R-COOH
Monoacilglicerol-3-fosfatoMonoacilglicerol-3-fosfatoDiacilglicerol-3-fosfatoDiacilglicerol-3-fosfatoFosfatidatoFosfatidatoDiacilglicerolDiacilglicerolTriacilglicerol
CO O
CH3 (CH2)14 CO O (CH2)15 CH3
CO O
CC
CC
HH
HH
CCHH
HH
HH OHOH
OHOH
OHOH
CC
CC
HH
HH
CCHH
HH
HH OHOH
OHOH
OHOH
OO CC (CH(CH22))nn
OO
CHCH33
OO CC (CH(CH22))nn
OO
CHCH33CC
CC
HH
HH
CCHH
HH
HH
OO PP O RO ROO
OO
OO CC (CH(CH22))nn
OO
CHCH33
OO CC (CH(CH22))nn
OO
CHCH33
OO CC (CH(CH22))nn
OO
CHCH33
CC
CC
HH
HH
CCHH
HH
HH
+ - - -COO-
+ - - -COO- CH2
CHO
OCO
O
R
COR'
CH2
CHO
OCO
O
R
COR'+NH3-CH-CH2-OH+NH3-CH-CH2-OH
CH2
CH
CH2
O
OCO
O P
O
O
O-
R
COR' OH OH
OH
OH
OH
CH2
CH
CH2
O
OCO
O P
O
O
O-
CH2 CH2 NH3+
R
COR'
CH2
CH
CH2
O
OCO
O P
O
O
O-
CH2 CH2 N+
CH3
CH3
CH3
R
COR'
CH2
CH
CH2
O
OCO
O P
O
O
O-
CH2 CH
NH3+
COO-
R
COR'
CH
CH2
O
O P
O
O
O-
H
COR' CH
CH2
O
O P
O
O
O-
H
COR'
Fosfatidilcolina
Fosfolipasa A2 Ca++
Ácido araquidónicoÁcido araquidónico
Fosfatidilinositol-4’,5’-bisfosfato (PIP2)
Fosfolipasa C
1,2-diacilglicerol (DAG) Inositol trifosfato (IP3)
Diacilglicerol lipasa
Ácido araquidónico Monoacilglicerol
OH
C
H
OH
CH2N H
CH2OHEsfingosina
C
CH
CH2
NH
O P
O
O
O-
CH2 CH2 N+
CH3
CH3
CH3
H
OH
CO
Esfingomielina
ColesterolColesterolEster de colesterolColesterolColesterolEster de colesterol
PROTEÍNAS
SIMPLES
CONJUGADAS
GLOBULARES
FIBROSAS
COMPOSICIÓN
clasificación
FORMA
ENZIMÁTICA
TRANSPORTADORA
ESTRUCTURAL
CONTRÁCTIL
REGULADORA
DEFENSIVA
FUNCIÓN
Hemoproteínas
Lipoproteínas
Glucoproteínas
Fosfoproteínas
PROTEÍNAS
COOHCOOH
ácido
aminoácidos
carbono αααα
CCHH 2NN
RR
HHaminoradical sustituyente
αααα-L-aminoácidosCHO
C
CH2OH
OHH
CHO
C
CH2OH
OHH
PROTEÍNASaminoácidos
CCNN
COOCOO
HH
HH
HHHH+
PUNTO ISOELÉCTRICO (pI o pHi)
pH en que el aa está como zwiterion
pI : 2,8 – 3,2CCNN
RR
HHHH2HH3+
zwitterion(carga eléctrica neta = 0)
pI aa ácidos : 2,8 – 3,2
pI aa neutros : 5 – 6,3
pI aa básicos : 7,5 – 11,2
aa monoamino dicarboxílicos
aa monoamino monocarboxílicos
aa diamino monocarboxílicos
Aminoácidos Glucogénicos CetogénicosGlucogénicos y cetogénicos
No esenciales TirosinaAlanina
Arginina
Aspartato
Cisteína
Glutamato
Asparragina
Esenciales Leucina
Fenilalanina
Triptofano
Lisina
Histidina
Metionina
Treonina
Valina
Glutamato
Glutamina
Glicina
Prolina
Serina
Isoleucina
PROTEÍNASel enlace peptídico
CCHH2NN
COOHCOOH
RR11
HHCCHH2NN
COOHCOOH
RR11
HH + CCHH2NN
COOHCOOH
RR22
HHCCHH2NN
COOHCOOH
RR22
HH
aa1 aa2
CCHH2NNOHOH
RR22
HHCC
OO
HH
NNCC
HH
RR22
CC
OO
CCHH2NNOHOH
RR22
HHCC
OO
HH
NNCC
HH
RR22
CC
OO
H2Oaa1 aa2
dipéptido
PROTEÍNASel enlace peptídico
SISI
NO
PROTEÍNASpéptidos
tyr ser
tyr ser met
tyr ser met glu
tyr ser met glu his
tyr ser met glu his
dipéptido
tripéptido
(100 y más aa)
proteínas
tyr ser met glu his phe
tyr ser met glu his phe arg
tyr ser met glu his phe arg trp
tyr ser met glu his phe arg trp gly
tyr ser met glu his phe arg trp gly lys
tyr ser met glu his phe arg trp gly lys ala
tyr ser met glu his phe arg trp gly lys ala leu
oligopéptidos
polipéptidos
(4 a 10 aa)
(10 a 100 aa)
PROTEÍNASestructura
PROTEÍNASEstructura primaria
ser gly cys ala gly
PROTEÍNASEstructura secundaria
PROTEÍNASEstructura terciaria
PROTEÍNASEstructura cuaternaria
NUCLEÓTIDOSYÁCIDOS NUCLEICOS
Los nucleótidos de Adenina son constituyentes de tres importantes co-enzimas: FAD, NAD y Co-A
Los nucleótidos son reguladores metabólicos:
- AMPc : Activador de proteína quinasa A- ATP: fosforilación de enzimas y proteínas
N
N
NH
N
NH2
N
NH
NH
N
NH2
O
Adenina Guanina
N
NH
NH2
ONH
NH
O
O
CH3
NH
NH
O
O
Timina Citosina Uracilo
Adenina Adenosina
ESTRUCTURA DE NUCLEÓTIDOS
(nucleósido)Adenina
Ribosa
Fosfato
(nucleósido)
Adenosina-trifosfato (ATP)(nucleótido)
(base nitrogenada)
(azúcar)
Nucleósidos y NucleótidosNucleósidos y Nucleótidos
Base Nucleósido NucleótidoAdenina (A)
Guanina (G)
AdenosinaDesoxiadenosina
Guanosina
Ácido adenílico (AMP)Ácido desoxiadenílico (dAMP)
Ácido guanílico (GMP)
Nomenclatura de BasesNomenclatura de Bases
Guanina (G)
Citosina (C)
Timina (T)
Uracilo (U)
GuanosinaDesoxiguanosina
CitidinaDesoxicitidina
TimidinaDesoxitimidina
UridinaDesoxiuridina
Ácido guanílico (GMP)Ácido desoxiguanílico (dGMP)
Ácido citidílico (CMP)Ácido desoxicitidílico (dCMP)
Ácido timidílico (TMP)Ácido desoxitimidílico (dTMP)
Ácido uridílico (UMP)Ácido desoxiuridílico (dUMP)
H++ e-NADH + H+NAD+
FAD (FMN)
FADH. (FMNH.)
2H++ 2e-
H++ e-
FADH2 (FMNH2)
Acetil-CoA
3’-fosfoadenosina difosfatoácido pantoténico vit B5ββββ-mercapto-etilamina
CH3 CO
S CoAAcetil-CoA
ORGANIZACIÓN DEL MATERIAL GENÉTICO
Hebra continua o líder
Hebra discontinua o rezagada
Horquilla de replicación
(fragmentos de Okasaki)
REPLICACIÓN DEL DNA
3’ 5’3’5’
Semiconservadora (Meselson y Stahl, 1957)Comienza en un origen y es bidireccionalSentido 5’ → 3’ y es semidiscontinua Gran exactitud (un error cada 10 9- 1010 nucleótidos)Tres etapas: iniciación, elongación y terminación
(NMP)n + NTP (NMP)n+1 + PPiRNA polimerasa
Misma polaridad de síntesis
Mg+2
TRANSCRIPCIÓN DEL DNA
No requiere primer
Involucra sólo algunos segmentos del DNA
Usa como templado sólo una hebra del DNA
Misma polaridad de síntesis
Usa como templado DNA
Mismas etapas: iniciación, elongación y terminación
Prim
era
letr
a (e
xtre
mo
5’) Tercera letra (extrem
o 3’)
Segunda letra
U
C A GUU
U
C
C
AG
UUUUUCUUAUUG
CUUCUC
UCUUCCUCAUCG
CCUCCC
UAUUACUAAUAG
CAUCAC
UGUUGCUGAUGG
CGUCGC
phe
leuser
pro
tyr
stopstop
his
cys
stoptrp
Prim
era
letr
a (e
xtre
mo
5’) Tercera letra (extrem
o 3’)
C
A
G
U
U
C
C
C
A
A
A
G
G
G
CUCCUACUG
AUUAUCAUAAUG
GUUGUCGUAGUG
CCCCCACCG
ACUACCACAACG
GCUGCCGCAGCG
CACCAACAG
AAUAACAAAAAG
GAUGACGAAGAG
CGCCGACGG
AGUAGCAGAAGG
GGUGGCGGAGGG
leu
ileu
met
val
pro
thr
ala
his
gln
asn
lys
asp
glu
arg
gly
ser
arg
tRNA
mRNA
aminoácido
(74 – 95 nucleótidos)
mRNA
brazo anticodón
brazo aceptor de aa
brazo DHU
brazo extra
brazo TψψψψC
Activación de aminoácidos
Iniciación
Elongación
T R
A D
U C
C I
Ó N
20 aa 20 aa-tRNA sintetasas 32 ó más tRNA ATP Mg+2
mRNA (codón AUG) tRNAfmet 30S y 50S GTP Mg+2 IF-1 IF-2 IF-3
Elongación
Terminación y liberaciónT R
A D
U C
C I
Ó N
Plegamiento y modificaciones postraduccionales
RF-1 RF-2 RF-3
Complejo de iniciación tRNAaa EF-Tu EF-Ts GTP Mg+2EF-G
Codón UAG, UAA o UGA
Múltiples factores
Aminoácido + ATP Aminoácido adenilado + PPi
Aminoácido adenilado + tRNA Aminoacil-tRNA + AMP
aminoacil-tRNA sintetasa
Aminoacil tRNASubunidad ribosomal 30S Subunidad ribosomal 50S
IF3IF2
IF2IF2IF2
IF1
IF3IF3IF3
codón de iniciocodón de término
5’ 3’mRNA
IF2IF2IF2
IF2IF2IF2
IF2IF2IF2
GTPGTP
IF3IF3
IF2IF2
PiPi
GDPGDP
IF3
IF1
IF3IF3
IF1IF1
IF3
IF1
IF3IF3
IF1IF1
IF3
IF1IF3IF3
IF1IF1
IF3
IF1
IF3IF3
IF1IF1 IF1IF1
GTPGTPEF-TuEF-Tu
GTPGTP
EF-TuEF-Tu
5’ 3’
GTPGTP
EF-TuEF-Tu GDPGDP
EF-TuEF-Tu
Peptidil-transferasa (23S)
GDPGDPTsTsEF-TuEF-Tu
TsTs
GTPGTPGTPGTP
EF-TuEF-Tu
GTPGTP
EF-TuEF-Tu
GDPGDP
EF-TuEF-Tu
GTPGTP
EF-GEF-G
RF-1RF-1RF-2RF-2RF-3RF-3