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Respiraciones anaeróbicas Bacterias sulfato reductoras.

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Respiraciones anaeróbicas

Bacterias sulfato reductoras.

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Metabolismo asimilativo y desasimilativo

Reducción de compuestos NO3-, SO4

2-, CO2

Metabolismo

Asimilativo

-NH2, -SH

Integración al metabolismo

Metabolismo

Desasimilativo

Respiración anaerobia

Eliminación

Bacterias, arqueas, hongos, algas y plantas

Procariotes

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Reducción del

nitrato Compuesto Estado de

oxidación

Nitrógeno

orgánico (R-NH2)

-3

Amonio (NH3) -3

Nitrógeno gas

(N2)

0

Oxido nitroso

(N2O)

+1

Oxido nítrico

(NO)

+2

Nitrito (NO2-) +3

Dióxido de

nitrógeno (NO2)

+4

Nitrato (NO3-) +5 Genes involved in the sequential reduction of

nitrate. http://www.geosc.psu.edu/~mbachmann/

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Reducción asimilativa y

desasimilativa del nitrato

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Reducción del nitrato

•Metabolismo desasimilativo

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Desnitrificación

•Complejo NADH deshidrogenasa (DH).

•Nitrato reductasa (NAR).

•Nitrito reductasa (NIR).

•NO reductasa (NOR).

•N2O reductasa (N2OR).

N03- → NO2

- → NO → N2O → N2

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Bacterias desnitrificantes totales

o verdaderas

•Paracoccus denitrificans

Bacteria quimiolitótrofa del hidrógeno que puede emplear también compuestos de

azufre. Crece autotróficamente en CO2 y

como metilotrofo en compuestos de C1 como metanol y metalamina.

•Pseudomonas stutzeri

Bacteria Gram negativa quimioheterótrofa no

fermentadora , no fluorescente,se encuentra

en el suelo y puede vivir de manera saprófita en los humanos, no patógena.

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Respiración

con nitratos

N03- + 2e- + 2H+ → NO2

- + H2O

Fp NADH + H+ 2 H+

Fe-S

Q 2 H+

Cyt b556

2 H+

NO3- + 2 H+

H+ H+

ADP + Pi

ATP

ATPasa

Fuera Citoplasma

2e-

2e-

NO2- + H2O

Nitrato reductasa

•Nitrato reductasa.

•Presente en bacterias

aerobias facultativas.

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Reducción del

sulfato Compuesto Estado de

oxidación

Azufre en

compuestos

orgánicos (R-SH)

-2

Sulfuro (H2S) -2

Azufre elemental

(Sº)

0

Tiosulfato (S2O32-) +2

Dióxido de azufre

(SO2)

+4

Sulfito (SO32-) +4

Sulfato (SO42-) +6

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Reducción

del sulfato

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Reducción del

sulfato. Enzimas. •Reducción desasimilativa

SO42- → APS → SO3

2- → H2S

ATP → PPi. ATP sulfurilasa.

2e-. APS reductasa

6e-. Sulfito reductasa •Reducción asimilativa

SO42- → APS → PAPS → SO3

2- →

H2S ATP → PPi. ATP sulfurilasa.

ATP → ADP. APS cinasa.

2e-. PAPS reductasa.

6e-. Sulfito reductasa.

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Respiración con sulfatos.

•LDH. Lactato deshidrogenasa

•H2asa. Hidrogenasa. •Hmc. Complejo acarreador

de electrones.

•APS. Adenosin fosfosulfato.

Los electrones son donados

por el H2 y por compuestos

orgánicos como por ejemplo: •Lactato

•Acetato

•Piruvato

•Alcoholes •Ácidos grasos

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Producción de energía

•El principal acarreador de

electrones es el cit C3 que

acepta los electrones de la

H2asa y los transfiere al Hmc, que a su vez

proporciona los electrones

a la APS red y Sulfito red.

•La H2asa oxida al H2

atmosférico y el que

procede de la formación

de acetato a partir de piruvato y que difunde a

través de la membrana.

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Acetato como donador de e-

CH3COO- + SO42- + 3H+ → 2CO2 + H2S + H2O

El acetato es oxidado a CO2 por la vía del Acetil-CoA

empleando reacciones reversibles que emplean algunos anaerobios para la síntesis u oxidación del acetato.

Desulfobacter oxida el acetato a través de la vía del ácido

cítrico ya que carece de las enzimas de la vía del Acetil-CoA.

Autotrofía Crecimiento en medio mínimo en condiciones anaerobias

•H2 como donador de electrones.

•SO42- como aceptor de electrones.

•CO2 como fuente de carbono que se asimila por la vía del Acetil-CoA.

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Reducción desproporcionada

HPO3- + SO4

2- + H+ → 4HPO42- + HS-

Desulfotignum phosphitoxidans, anerobio extricto, autótrofo que emplea

el fosfito como única fuente de energía. Acopla la oxidación del fosfito a

la reducción del sulfato en condiciones anaerobias. Se propone que la

fuente de fosfato puede ser orgánica.

Emplea compuestos de azufre en estados de oxidación intermedios.

Implica la descomposición de un compuesto en dos, uno más oxidado y

otro más reducido que el compuesto original.

S2O32- + H2O → SO4

2- + H2S

En la reacción, la oxidación del tiosulfato por Desulfovibrio sulfodismutans

genera la fuerza protón motriz para la producción de ATP. El sulfito y el Sº

también son empleados por la bacterias sulfato reductoras que coexisten

en el mismo hábitat con las bacterias quimiolitótrofas.

Oxidación del fosfito

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Bacterias sulfato reductoras •Grupo I. Sulfato reductores, no oxidantes de acetato.

•Grupo II. Sulfato reductores, oxidantes de acetato.

•Sulfato reductores desasimilativos.

Desulfovibrio.

Bacteria Gram

negativa

termofílica.

Desulfobacter. Bacteria

Gram negativa, emplea

acetato como único

donador y lo oxida por

el ciclo del ácido cítrico.

Desulfuromonas.

Reduce Sº,

anaerobio

obligado.

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Reducción asimilativa de

sulfatos

El sulfato es transportado dentro de la célula por una permeasa y

reducido a sulfito por la vía de sulfato reducción. La síntesis de cisteína a partir de la serina requiere de dos pasos. La serina es

combinada con el Acetil-CoA para formar O-acetilserina y seguido reacciona con el sulfuro para formar cisteína.

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Acetogénesis

•Homoacetógenos.

4H2 + H+ + 2HCO3

- → CH3COO- + 4H2O

Donadores de electrones: compuestos de C1, azúcares,

aminoácidos, ácidos orgánicos y ciertas bases nitrogenadas. Algunos homoacetógenos también reducen NO3

- y S2O3-.

Fuerza protón motriz o fuerza sodio motriz o fosforilación a

nivel de sustrato → ATP.

Acetobacterium woodii Clostridium aceticum

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Rutas de la acetogénesis

•Vía del Acetil-CoA, ruta principal para los microorganismos

homoacetogénicos.

•Algunos microorganismos pueden crecer heterotróficamente por la fermentación de azúcares o

como quimiolitótrofos a través de la reducción de CO2 a acetato con H2 como donador de electrones .

C6H12O6 → 3CH3COO- + 3H+

2HCO3

- + 4H2 + H+ → CH3COO- + 4H2O

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Vía del Acetil-CoA •Monóxido de carbono deshidrogenasa. Complejo enzimático

que tiene como cofactores a los metales Ni, Zn y Fe. Cataliza la

reacción de reducción de CO2 a CO que será el carbonil del

acetato :

CO2 + H2 → CO + H2O

•El grupo metil del acetato se

origina por la reducción del

CO2 por una serie de

reacciones en las que participa

la coenzima Tetrahidrofolato.

Cuando es formado el grupo metilo se transfiere a una

proteína que contiene

Vitamina B12 como cofactor.

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Vía del

Acetil-CoA

•El CH3 es anclado a un

átomo de Ni en la CO-

deshidrogenasa y se

combina con el CO que

también se encuentra

anclado al Fe de la

enzima y con la ~SCoA.

•La formación del Acetil-

CoA produce un

gradiente de protones

para formar ATP y también se forma ATP en la

conversión de Acetil-CoA

a Acetato.

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Fijación del CO2 por la vía del

Acetil-CoA I Síntesis de acetato como

resultado del metabolismo energético

Acetonaerobium noterae

Acetobacterium woodii

Acetobacterium wieringae

Acetogenium kivui

Acetitomaculum ruminis

Clostridium aceticum

Clostridium thermoaceticum

Clostridium formiaceticum

Desulfotomaculum orientis

Sporomusa paucivorans

Eubacterium limosum (butirato)

Treponema primita (intestino de termitas)

Eubacterium limosum

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Fijación del

CO2 por la vía

del Acetil-CoA

II Síntesis de acetato en el metabolismo autótrófico

Bacterias autotróficas homoacetogénicas

Metanógenos autótrofas

Bacterias sulfato reductoras autotróficas

III Oxidación de acetato en el metabolismo energético

Reacción: Acetato + 2H2O → 2CO2 + 8H

Bacterias sulfato reductoras del grupo II (diferentes a Desulfobacter)

Reacción: Acetato → CO2 + CH4

Metanógenos acetogénicos (Methanosarcina, Methanosaeta)

Methanosarcina (cocos) y

Methanosaeta (filamentos)

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Metanogénesis

I Sustratos del tipo CO2

CO2 (cuando el donador es el H2,

ciertos alcoholes o piruvato)

Formato, HCOO-

Monóxido de carbono CO

II Metil sustratos

Metanol, CH3OH-

Metilamina, CH3NH3+

Dimetilamina, (CH3)2NH2+

Trimetilamina, (CH3)3NH+

Metilmercaptano, CH3SH

Dimetilsulfuro, (CH3)2S

III Sustratos acetotróficos

Acetato, CH3COO-

Piruvato, CH3COCOO-

Material orgánico

Monómeros

Acidos grasos,

alcoholes

Compuestos

de C1, H2 Acetato

CH4, CO2

1

1 1 1

2

3 4 4

1. Bacterias hidrolíticas y

fermentadoras.

2. Bacterias sintróficas

3. Homoacetogénicas

4. Metanogénicas

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Sustratos en la metanogénesis

•I. Sustratos del tipo CO2

CO2 + 4H2 → CH4 + 2H2O

•II. Sustancias metiladas

CH3OH + H2 → CH4 + H2O

4CH3OH → 3CH4 + CO2 +2H2O

•III. Sustratos acetotróficos

CH3COO- + H2O → CH4 + HCO3-

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Coenzimas de arqueas

metanogénicas •Acarreadores de C1

Las que transportan la unidad C1 desde el sustrato inicial, el CO2 hasta el sustrato final, CH4. Las marcas en amarillo

en las moléculas indican el lugar donde el C1 se une

durante la reducción de CO2 a CH4.

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Coenzimas de arqueas

metanogénicas

•Acarreadores de C1

Metanofurano (MF), une al CO2

en el primer paso de la

metanogénesis.

Metanopterina (MP) es la portadora de los C1 durante la

reducción.

Coenzima M (CoM), interviene en nel paso final de CH3 a CH4.

Coenzima F430 (CF430), no es un

acarreador pero participa en la parte final de la metanogénesis

en el complejo metilreductasa.

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Coenzimas de arqueas

metanogénicas •Coenzimas de Oxido-

Reducción

Las que en la reacción redox

suministran los electrones

necesarios para la reducción

de CO2 a CH4.

Coenzima F420. Participa en

varias reacciones durante la

reducción donando los

electrones.

Coenzima B (CoB) participa

en la parte final de la

metanogénesis en el complejo metilreductasa.

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Reducción de

CO2 a CH4. 1. CO2 es activado por la E-MF y

reducido a formilo.

2. El grupo formilo estransferido por el

MF a E-MP, deshidratado y

reducido a metileno y después a

metilo.

3. El grupo metilo es transferido por la

MP a la E-CoM.

4. Metil-CoM es reducido a metano

por el sistema metilreductasa. F430

remueve el CH3 formando un

complejo Ni2+-CH3 y este es

reducido por los electrones de CoB.

5. CoM y CoB son regenerados por la

reducción de Com-S-S-CoB con H2.

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Conversión de

Metanol a

Metano

El metanol es catabolizado

transfierendo el grupo metilo a una proteína corrinoide

formando CH3-corrinoide

que cede el CH3 a CoM

para formar CH3-CoM y posteriormente CH4.

Si no se cuenta con poder

reductor como H2 para el paso final, una parte del CO2

es oxidado para producir

electrones.

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Conversión

de Acetato

a Metano

El acetato es activado y

se forma Acetil-CoA que

interacciona con la CO-

deshidrogenasa de la vía del Acetil-CoA.

El grupo metilo del

acetato se transfiere a la

E-corrinoide formando

CH3-corrinoide que cede

el CH3 a CoM para

formar CH3-CoM y

posteriormente CH4.

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Producción de la energía

La producción de ATP está ligada al

ultimo paso de la Metilreductasa en la

metanogénesis.

La asociación de CoB con CH3-CoM

forma en el paso final forma CH4 y un

heterodisulfuro CoM-S-S-CoB.

El heterodisulfuro es reducido por la

Heterodisulfuro reductasa con los

electrones que provienen de la F420

formando CoM-SH y CoB-SH.

La tranferencia de electrones provoca la extrusión de protones y se crea una

fuerza protón motriz donde participa una proteina transportadora la

metanofenazina (MPH).

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Hábitat de las arqueas

metanogénicas. •Sedimentos anóxicos: suelo húmedo,

fango y lagos. •Tracto digestivo de animales: rumen

en animales rumiantes (ganado

vacuno, ovejas, cabras, camellos, etc.);

intestino ciego de caballos o conejos; intestino largo de animales

monogástricos como humanos, cerdos

y perros, intestino de insectos

celulolíticos (temitas). •Fuentes geotermales de H2 + CO2:

chimeneas hidrotermales. •Lodos activados: tratamiento de

aguas residuales. •Como endosimbiontes de

protozoarios.