qu´ımica computacional: introduccion a´ linux y...

Post on 10-Jun-2020

11 Views

Category:

Documents

0 Downloads

Preview:

Click to see full reader

TRANSCRIPT

Linux & G09 Intro/JHT 1 / 10

Quımica computacional: Introduccion a

Linux y Gaussian09

Jesus Hernandez Trujillo

Agosto de 2014

Sistema operativo Linux

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 2 / 10

Algunas caracterısticas de Linux:

Sistema operativo portable.

Sistema operativo Linux

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 2 / 10

Algunas caracterısticas de Linux:

Sistema operativo portable.

Multiusuarios.

Sistema operativo Linux

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 2 / 10

Algunas caracterısticas de Linux:

Sistema operativo portable.

Multiusuarios.

Multitareas.

Sistema operativo Linux

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 2 / 10

Algunas caracterısticas de Linux:

Sistema operativo portable.

Multiusuarios.

Multitareas.

Hay gran cantidad de software disponibles.

Sistema operativo Linux

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 2 / 10

Algunas caracterısticas de Linux:

Sistema operativo portable.

Multiusuarios.

Multitareas.

Hay gran cantidad de software disponibles.

Soporte para muchos dispositivos perifericos.

Sistema operativo Linux

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 2 / 10

Algunas caracterısticas de Linux:

Sistema operativo portable.

Multiusuarios.

Multitareas.

Hay gran cantidad de software disponibles.

Soporte para muchos dispositivos perifericos.

Desarrollo de software.

Sistema operativo Linux

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 2 / 10

Algunas caracterısticas de Linux:

Sistema operativo portable.

Multiusuarios.

Multitareas.

Hay gran cantidad de software disponibles.

Soporte para muchos dispositivos perifericos.

Desarrollo de software.

GRATIS.

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 3 / 10

Estructura de Linux:

Fuente: M. G. Sobell,

A practical Guide to Linux, 2nd edn.

Prentice Hall, 2010

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 4 / 10

Lınea de comandos.

Shell: Interprete de comandos y lenguaje de programacion.

Ejemplos:

1. Bourne Again Shell (bash).

2. TC Shell (tcsh).

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 4 / 10

Lınea de comandos.

Shell: Interprete de comandos y lenguaje de programacion.

Ejemplos:

1. Bourne Again Shell (bash).

2. TC Shell (tcsh).

Interfaz grafica (GUIs).

Administradores de ventanas (ej. Gnome, KDE)

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 4 / 10

Lınea de comandos.

Shell: Interprete de comandos y lenguaje de programacion.

Ejemplos:

1. Bourne Again Shell (bash).

2. TC Shell (tcsh).

Interfaz grafica (GUIs).

Administradores de ventanas (ej. Gnome, KDE)

Diversas distribuciones (ej. Ubuntu, Fedora, KDE).

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 4 / 10

Lınea de comandos.

Shell: Interprete de comandos y lenguaje de programacion.

Ejemplos:

1. Bourne Again Shell (bash).

2. TC Shell (tcsh).

Interfaz grafica (GUIs).

Administradores de ventanas (ej. Gnome, KDE)

Diversas distribuciones (ej. Ubuntu, Fedora, KDE).

Administracion del sistema.

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 5 / 10

Sistema de archivos jerarquico:

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 6 / 10

Algunos comandos utiles:

ls muestra el contenido de un directorio.

cp nombre1 nombre2 copia el archivo nombre1 a nombre2.

mv nombre1 nombre2 mueve el archivo nombre1 a nombre2.

cat nombre muestra el contenido del archivo nombre.

ps Muestra las tareas en ejecucion.

gedit Se trata de un editor de texto.

tail nombre muestra las 10 ultimas lıneas del

archivo nombre.

man ls manual en lınea del comando ls.

Introduccion al uso de Gaussian09

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 7 / 10

Las instrucciones para ejecutar un calculo de estructura electronica

se escriben en un

archivo de texto.

Introduccion al uso de Gaussian09

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 7 / 10

Las instrucciones para ejecutar un calculo de estructura electronica

se escriben en un

archivo de texto.

Para ejecutar el programa Gaussian09 con las especificaciones en

el archivo input.com:

g09 input &

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 8 / 10

Se puede monitorear el uso de recursos del servidor

(comando top):

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 8 / 10

Se puede monitorear el uso de recursos del servidor

(comando top):

– Los resultados se encuentran en el archivo input.log

–Se puede seguir desarrollo del calculo:

tail -f input.log

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 9 / 10

Existen interfases graficas para algunos programas (ej. molden,

gaussview).

Sistema operativo Linux

Introduccion al uso de

Gaussian09

Linux & G09 Intro/JHT 10 / 10

top related