* los contenidos de esta presentación se basan en los materiales del iii taller de...

* Los contenidos de esta presentación se basan en los materiales del III Taller de Georreferenciación de GBIF, Madrid, Mayo de 2008

Georreferenciación de ocurrencias de organismos

Introducción a mejores prácticas*

Oscar OrregoInvestigador

Equipo Coordinador del Sistema de Información sobre Biodiversidad de ColombiaInstituto Alexander von Humboldt - Entidad Coordinadora

Taller "Provisión de datos colombianos al GBIF en el marco del SIBColombia“ Mayo 27-29 de 2008, Pontifica Universidad Javeriana

Propósitos de la presentación

• Introducir el tema de la georreferenciación de ocurrencias de organismos

• Dar a conocer lineamientos para el manejo de información geográfica asociada a ocurrencias de organismos

• Presentar herramientas útiles en los procesos de georreferenciación

• Propiciar el uso de buenas prácticas en los procesos de georreferenciación

• Ilustrar la importancia de lograr descripciones apropiadas de localidades asociadas a ocurrencias de organismos

CONTEXTOCONTEXTO

Información geográfica

Información GeográficaInformación Geográfica es la información utilizada para distinguir un es la información utilizada para distinguir un lugar de otrolugar de otro– Qué hace único a cada sitio Qué hace único a cada sitio – Información donde la ubicación de un fenómeno de interés sea Información donde la ubicación de un fenómeno de interés sea

importanteimportante

Localización (coordenadas)

Atributos (características de un sitio)

Relaciones (arreglo espacial)

Tiempo (cuándo fue creada)

Adaptado de: Presentación Introductoria de Geomática. Andrés Guhl, CIDER, Universidad de los Andes. 2007

Tiene 4 componentesTiene 4 componentes

Tipos de información geográfica

Puntos: Localización de fenómenos que ocurren solo en un lugar del paisaje

Líneas: Fenómenos que se encuentran en más de un lugar a lo largo de 1 dimensión

Los símbolos y sombreados describen las características de la información geográfica en el mapa

Áreas: Regiones que comparten una misma característica.


Localización

Se refiere a la posición de un objeto en un sistema de coordenadas Se refiere a la posición de un objeto en un sistema de coordenadas predefinido.predefinido.

Latitud y Longitud

N

32 ° N, 100° W

400000

400000

600000

600000

800000

800000

1000000

1000000

1200000

1200000

1400000

1400000

1200000 1200000

1400000 1400000

1600000 1600000

Coordenadas planas

1.000.000 m, 1.200.000 m


Sistemas de coordenadas

Sistemas angulares:Sistemas angulares:– Diseñados para un objeto tri-dimensionalDiseñados para un objeto tri-dimensional

Como una esfera que representa la superficie de la tierra. Ej.: Como una esfera que representa la superficie de la tierra. Ej.: Latitud y LongitudLatitud y Longitud

Sistemas rectangulares o planosSistemas rectangulares o planos– Diseñados para un objeto bi-dimensionalDiseñados para un objeto bi-dimensional

Como una hoja plana de un mapa. Ej.: UTM - GKComo una hoja plana de un mapa. Ej.: UTM - GK

AmbosAmbos proporcionan guías horizontales y verticales para ubicar proporcionan guías horizontales y verticales para ubicar posiciones en un mapaposiciones en un mapa

Adaptado de: Conceptos generales de geo-referenciación y cartografía. Gustavo Iglesias, Sistema de Información sobre Biodiversidad, Administración de Parques Nacionales – Argentina. 2007

Geocéntrico: usa el centro de masa de la tierra como orígen (WGS 84, NAD83)

Locales: alinea su elipsoide lo más próximo a la superficie de la tierra y en un área en particular (OBSERVATORIO BOGOTÁ, NAD27)

Datum geogéntrico Datum localFuente Fig. Arq. Mercedes Frassia


Tipos de Datum

Concepto de Datum

Cada país trata de que la superficie de su elipsoide coincida con el geoide

El ajuste se hace determinando el llamado punto fundamental donde se hace coincidir el geoide con el elipsoide elegido llamado elipsoide de referencia.

Al conjunto de parámetros que definen ese punto fundamental se lo llama Datum

Un Datum define entre otras cosas, la posición de origen y la orientación de las líneas de latitud y longitud del sistema de coordenadas.

Todos los Datum están basados sobre un elipsoide, los cuales se aproximan a la forma de la tierra.


PREGUNTASPREGUNTAS

¿Qué es una georreferencia?

Una descripción numérica de un lugar que puede ser mapeadaUna hipótesis

¿Qué es una ocurrencia?

El registro de la presencia de un organismo

¿Qué es una evidencia?

El medio a través del cual se logró el registro de la presencia de un organismo en un lugar y un momento determinados

Preguntas

Especímenes/observaciones con localidades en forma de texto

ID_especie Nombre Localidad

1 Meriania albertiae Antioquia, Municipio Guatape, Vereda Santa Rita, Bosque humedo. ca. 1850 mts.

2 Meriania antioquiensis Antioquia: Medellin, alto de Las Palmas, caminito de penetracion hacia el sur; en cañadas hondas y humedas. alt. 2500

3 Meriania antioquiensis ANTIOQUIA. Municipio de Caldas, Vereda La Corrala

4 Meriania hernandii comisaria Putumayo: Carretera Sibundoy Mocoa, Cordillera de Portachuelo. Alt. 2200

5 Meriania nobilis CAUCA: Popayan, estribaciones del Purace. CAUCA Alt. 2000-2100m.

6 Meriania peltata Valle: Tulua.

7 Meriania sanguinea Nariño-Putumayo: mun. Santiago, Vereda San Antonio de Bellavista. Par. Boronoilb

8 Meriania splendens Provincia de Popayan, rio Quilcace. Alt. 2000

9 Meriania grandidens Depto del Cesar, Mp La Jagua de Ibirico, Cgt La Victoria de san isidro, Vda Alto de las Flores. Escuela Nueva de Flores, Subida de la casa de la Finca El paraiso. 1420 m. alt.

10 Meriania hexamera COLOMBIA

11 Meriania huilensis Huila. Rio Villalobos: Region of the confluence of Rios Villalobos and Cauchos.

12 Meriania longifolia Provincia de Mariquita. La Palmilla en el Qundio.

Fuente: Herbario Nacional Colombiano. Búsqueda realizada a través del Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia

Qué tenemos

Qué se necesita

¿Qué es una georreferencia aceptable?

Una descripción numérica de un lugar que pueda ser mapeadaY que describa la extensión espacial de una localidad y sus incertidumbres asociadas

¿Qué es una georreferencia ideal?

Una descripción numérica de un lugar que pueda ser mapeadaY que describa la extensión espacial de una localidad y sus incertidumbres asociadasTan bien como sea posible

¿Qué es una georreferencia?Una descripción numérica de un lugar que puede ser mapeadaUna hipótesis

Preguntas

INCERTIDUMBREINCERTIDUMBRE

“Davis, Yolo County, California”

“método del punto”Coordenadas: 38.5463 -121.7425Datum geodético horizontal: NAD27

Adaptado de la presentación: Georeferencing:Collaboration to Automation. John Wieczorek. Museum of Vertebrate Zoology. University of California, Berkeley. 2007

“método de la caja límite”

Coordenadas: 38.5486 -121.754238.545 -121.7394

Datum geodético horizontal : NAD27



“método del punto-radio”

Coordenadas: 38.5468 -121.7469Datum geodético horizontal : NAD27Máxima incertidumbre: 8325 m



“método de la forma”



Punto+ Fácil de producir- No dice acerca de la calidad

Caja límite+ Consultas espaciales simples- Dificil para medir la calidad

Punto-radio+ Fácil para medir la calidad- Dificil para realizar consultas espaciales

Forma+ Representación completa- Complejo

Comparación de métodos

“Darwin Core es una especificación de conceptos y estructura de datos destinada a apoyar la recuperación y la integración de los datos primarios que documentan la ocurrencia de organismos en espacio y tiempo y la ocurrencia de los organismos en colecciones biológicas.”

Fuente: Purpose and design goals of the Darwin Core. TDWG. http://wiki.tdwg.org/twiki/bin/view/DarwinCore/DesignAndPurpose

Darwin Core

“Darwin Core es un conjunto no ordenado de elementos simples.”

“Darwin Core no es un modelo completo o una estructura de datos para el manejo de datos primarios, tal como una base de datos de una colección.”

DARWIN COREDARWIN CORE

Extensión Geoespacial de Darwin CoreDecimalLatitude

DecimalLongitude

GeodeticDatum

CoordinateUncertaintyInMeters

PointRadiusSpatialFit

VerbatimCoordinates

VerbatimLatitude

VerbatimLongitude

VerbatimCoordinateSystem

GeoreferenceProtocol

GeoreferenceSources

GeoreferenceVerificationStatus

GeoreferenceRemarks

FootprintWKT

FootprintSpatialFit

Latitud decimal

Longitud decimal

Datum

Incertidumbre

Ajuste al punto-radio

Coordenadas originales

Latitud original

Longitud original

Sistema de coordenadas original

Protocolo de georreferenciación

Fuentes de georreferenciación

Verificación

Observaciones aclaratorias

Perfil de la forma de la localidad

Ajuste al perfil

EL

EM

EN

TO

S

Latitud decimal

Longitud decimal

Datum

Incertidumbre

Ajuste al punto-radio

Coordenadas originales

Latitud original

Longitud original


Protocolo de georreferenciación

Fuentes de georreferenciación

Verificación

Observaciones aclaratorias

Perfil de la forma de la localidad

Ajuste al perfil

Georreferencia propuesta

Información original

Fuentes

Verificación

Aproximación a la forma

Extensión Geoespacial de Darwin CoreG

RU

PO

S D

E E

LE

ME

NT

OS

LocalityID

Country

State

Speclocality

DeterminationRef

Coordinate System

Coordinate Precision

Distance Precision

DecLat

DecLong

Datum

MaxErrorDistance

MaxErrorUnits

Extent

Named Place

LatLongRemarks

LocalityAnnotation

OrigCoordSystem

NoGeorefBecause

Campos de una base de datos – Ejemplo de Herpnet

Identificador de la localidad

País

Estado/Departamento

Localidad específica

Referencia para la georreferenciación

Sistema de coordenadas

Precisión de las coordenadas

Precisión de distancia

Latitud decimal

Longitud decimal

Datum

Máximo error - distancia

Máximo error - unidades

Extensión

Lugar con nombre

Observaciones aclaratorias de la georreferenciación

Anotaciones particulares acerca de la localidad


Por qué no se georreferenció

Georreferencia propuesta

Fuentes

Verificación

Información original

Descripción *

¿Qué es una descripción de una localidad?Es el texto a mediante el cual es posible ubicar una sitio de ocurrencia de organismos

Para lograr una buena descripción tenga en cuenta:

• Vaya desde lo específico hasta lo general

• Proporcione una descripción de la localidad aún si tiene las coordinadas del sitio

• Incluya referencias a sitios conocidos (con nombre)

• Incluya unidades administrativas

• Evite ambigüedades que den lugar a la interpretación

Ejemplo

Refugio de Vida Silvestre Nacional Modoc, 2,8 kilómetros al Sur y 1,2 kilómetros al Este del cruce de las rutas 299 y 395. Alturas, Modoc Co, California.

Lat/Long/Datum: 41,45063 N; 120,50763 O (WGS84)

Elevación: 400 metros Exactitud del GPS: 7 metros Extensión: 50 metros

Referencias: GPS Garmin Etrex Summit para coordenadas y exactitud. Altímetro-barómetro para la elevación.

HERRAMIENTASHERRAMIENTAS

Herramientas disponibles en línea para georreferenciar

http://herpnet.org/herpnet/Gazetteer/GeorefEspanol.html

National Imagery and Mapping Association (Geographic Names Server National Imagery and Mapping Association (Geographic Names Server

(GNS), datos para todo el mundo)(GNS), datos para todo el mundo)

Todos los datos en grados munutos y segundos, con precisión próxima Todos los datos en grados munutos y segundos, con precisión próxima

al minutoal minuto

El Datum es WGS84El Datum es WGS84

Es usada como fuente para muchos gaceterosEs usada como fuente para muchos gaceteros

Ejemplo: Girón, SantanderEjemplo: Girón, Santander

Base de datos de NIMA

http://earth-info.nga.mil/gns/html/

Statoids

Información de las unidades administrativas de los países (incluye Información de las unidades administrativas de los países (incluye

códigos de país, etc) códigos de país, etc)

No contiene coordenadas, sólo información relacionada con nombresNo contiene coordenadas, sólo información relacionada con nombres

Se usa con los datos de NIMA, SIG, etc.Se usa con los datos de NIMA, SIG, etc.

Ejemplo: Caldas, AntioquiaEjemplo: Caldas, Antioquia

http://www.statoids.com

Maporama

Se usa para encontrar direcciones alrededor del mundoSe usa para encontrar direcciones alrededor del mundo

Mide la extensión en pantallaMide la extensión en pantalla

No proporciona el Datum, por lo que es necesario enviar un correo No proporciona el Datum, por lo que es necesario enviar un correo

electrónico a Maporama para obtenerloelectrónico a Maporama para obtenerlo

Ejemplo: Calle 12 carrera 3 Yopal, CasanareEjemplo: Calle 12 carrera 3 Yopal, Casanare

http://world.maporama.com

Falling Rain

Muy bueno para encontrar cualquier localidad, especialmente aquellos Muy bueno para encontrar cualquier localidad, especialmente aquellos

sitios difíciles de encontrar (localidades fuera de Norteamérica)sitios difíciles de encontrar (localidades fuera de Norteamérica)

Usa datos de NIMAUsa datos de NIMA

Proporciona las ubición de poblaciones cercanas en millas náuticas Proporciona las ubición de poblaciones cercanas en millas náuticas

(nm)(nm)

Se puede usar la calculadora de georreferenciación para convertir Se puede usar la calculadora de georreferenciación para convertir

millas náuticas en kilómetrosmillas náuticas en kilómetros

Ejemplo: San Bernardo, CórdobaEjemplo: San Bernardo, Córdoba

http://www.fallingrain.com/world/

Fuzzy G

Puede buscar nombres de localidades conocidas, incluso si el nombre Puede buscar nombres de localidades conocidas, incluso si el nombre

no está correctamente escritono está correctamente escrito

Tiene cobertura mundialTiene cobertura mundial

Usa los datos de NIMA, entonces usa grados, minutos y segundos con Usa los datos de NIMA, entonces usa grados, minutos y segundos con

una precisión cercana al minutouna precisión cercana al minuto

Se pude controlar la cantidad de “difusión”Se pude controlar la cantidad de “difusión”

Ejemplo: Biyeta, ColombiaEjemplo: Biyeta, Colombia

Ejemplo: Jenerico, Boyacá, ColombiaEjemplo: Jenerico, Boyacá, Colombia

http://tomcat-dmaweb1.jcr.it/fuzzy/query

Getty Thesaurus

Se usa para encontrar información alternativa, nombres antiguosSe usa para encontrar información alternativa, nombres antiguos

Tiene una gran cantidad de información, pero no se usa para Tiene una gran cantidad de información, pero no se usa para

determinar coordenadasdeterminar coordenadas

Proporciona nombres recientes para localidadesProporciona nombres recientes para localidades

Usa el Datum WGS 84Usa el Datum WGS 84

Ejemplo: Comisaría del Guaviare, ColombiaEjemplo: Comisaría del Guaviare, Colombia

http://www.getty.edu/research/conducting_research/vocabularies/tgn/

Biblioteca Digital de Alejandría

La base de datos mLa base de datos máás grande para buscar cualquier tipo de atributo s grande para buscar cualquier tipo de atributo

geográficogeográfico

Incluye nombres antiguos y alternativos de sitiosIncluye nombres antiguos y alternativos de sitios

Usa los datos de la base de datos de NIMA, entonces estUsa los datos de la base de datos de NIMA, entonces estáá en grados, en grados,

minutos y segundos, con el Datum WGS84. minutos y segundos, con el Datum WGS84.

Ejemplo: Apulo, CundinamarcaEjemplo: Apulo, Cundinamarca

http://webclient.alexandria.ucsb.edu/client/gaz/adl/index.jsp

GeoLocate

Herramienta de escritorioHerramienta de escritorio

Programa para georreferenciar de forma automatizadaPrograma para georreferenciar de forma automatizada

Bueno para intersecciones de vías y ríosBueno para intersecciones de vías y ríos

Tiene utilidades que serán incorporadas en el nuevo BioGeomancer Tiene utilidades que serán incorporadas en el nuevo BioGeomancer

para buscar localidadespara buscar localidades

Demo sólo para Norteamérica y España, por ahora (algunos ensayos Demo sólo para Norteamérica y España, por ahora (algunos ensayos

con localidades colombianas han sido exitosos)con localidades colombianas han sido exitosos)

Se puede “mover” el punto que da como resultado donde se cree que Se puede “mover” el punto que da como resultado donde se cree que

debería ser y proporciona las coordenadas de la nueva ubicacióndebería ser y proporciona las coordenadas de la nueva ubicación

Ejemplo: Potomac River near Bethesda, MarylandEjemplo: Potomac River near Bethesda, Maryland

http://www.museum.tulane.edu/geolocate/default.aspx

Calculadora de Georreferenciación de MaNIS

Ejemplo: 5 km al NE de Apulo, Cundinamarca, ColombiaEjemplo: 5 km al NE de Apulo, Cundinamarca, Colombia

ApuloApulo

Coordenadas: 04° 31' 18“ N 74° 35' 50" WCoordenadas: 04° 31' 18“ N 74° 35' 50" W

Fuente: NIMAFuente: NIMA

Extensión: 1 kmExtensión: 1 km

Precisión: cercana al minutoPrecisión: cercana al minuto

Datum: WGS 84Datum: WGS 84

Se requiere calcular el error como medida de la incertidumbreSe requiere calcular el error como medida de la incertidumbre

http://manisnet.org/gci2.html

Actividades principales

1) Desarrollar estándares para datos espaciales de biodiversidad

2) Integrar datos espaciales relevantes

3) Continuar con el desarrollo de herramientas de escritorio existentes

4) Crear una plataforma de trabajo para georreferenciación automatizada, edición y validación

Prototipo de BioGeomancer

En conclusión

La información geoespacial proporciona un mayor espectro de uso

potencial a los datos de ocurrencias de organismos

El nivel de precisión de la información geoespacial depende del propósito

Existen múltiples iniciativas globales y regionales que permitirían avanzar

más rápidamente en la georreferenciación de ocurrencias

Es necesario introducir buenas prácticas para el registro de la

información geoespacial asociada a ocurrencias de organismos

El incremento en la calidad de los datos aumenta las posibilidades de

uso de los mismos

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